从Eclipse启动Tomcat时出现"SetPropertiesRule"警告消息

警告消息为：/webapps/manager/WEB-INF/web.xml: SetPropertiesRule: Failed to set properties: [SetPropertiesRule{condition=Agent property 'java.util.logging.config.file' cannot be 'file:/home/ec2-user/tomcat/conf/logging.properties}', action='PropertiesConfig$Builder.build()}

根据给出的错误信息，问题出在Tomcat的logging.properties文件的位置不正确。

当从Eclipse启动Tomcat时，会先加载classpath下的所有文件，然后在/WEB-INF中查找配置文件。在Tomcat的默认配置中，logging.properties文件应该放在/home/ec2-user/tomcat/conf目录下，但是在这个例子中，文件被放到了/home/ec2-user/tomcat/conf/logging.properties下面。

解决这个问题的办法就是将logging.properties文件移动到正确的位置，例如/etc/tomcat/目录下，或者/server/tomcat目录下。此外，也可以在LoggingContextListener中添加一段代码，手动设置logging.properties文件的位置。

希望这些信息能够帮助到你！