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读取文件大坑(pythonscanpy库)

基于《pythonscanpy库读取几种常见格式单细胞数据文件汇总》文章,不知道有没有细心小伙伴发现,在使用scanpy读取单细胞数据txt文件或者其他格式文件,得到AnnData数据对象有点奇怪...注意,上面的data_1是我们GEO数据库下载并使用read_text()进行读取得到Anndata数据对象,而data_2是读取scanpy内置数据后正常Anndata数据对象,两者不要混淆...在使用scanpyread_text()进行读取txt文件,要注意了哦!...注意:如果你使用scanpy其他读取文件函数进行读取不同格式文件,一定要小心了哦,一定要查看读取后Anndataobs是不是存储细胞信息,var是不是存储基因信息!..."填坑" 如果你也使用scanpyread_text()这个函数来读取txt文件,或使用scanpy别的读文件函数读取别的格式文件读取AnnData也出现上述这种情况,别慌!

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tensorflowckpt和.pb文件读取变量值方式

最近在学习tensorflow自带量化工具相关知识,其中遇到一个问题是tensorflow保存好ckpt文件或者是保存后.pb文件(这里pb是把权重和模型保存在一起pb文件)读取权重,查看量化后权重是否变成整形...(1) 保存ckpt读取变量值(以读取保存第一个权重为例) from tensorflow.python import pywrap_tensorflow import tensorflow....pb文件读取变量值(以读取保存第一个权重为例) import tensorflow as tf from tensorflow.python.framework import graph_util...(graph_def, name='') print(sess.run('Variable_1:0')) 补充知识:如何已存在检查点文件(cpkt文件)种解析出里面变量——无需重新创建原始计算图...和.pb文件读取变量值方式就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考。

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详解Pandas读取csv文件2个有趣参数设置

导读 Pandas可能是广大Python数据分析师最为常用库了,其提供了数据读取、数据预处理到数据分析以及数据可视化全流程操作。...其中,在数据读取阶段,应用pd.read_csv读取csv文件是常用文件存储格式之一。今天,本文就来分享关于pandas读取csv文件2个非常有趣且有用参数。 ?...01 sep设置None触发自动解析 既然是csv文件(Comma-Separated Values),所以read_csv默认sep是",",然而对于那些不是","分隔符文件,该默认参数下显然是不能正确解析...此时,当然可以简单通过传入正确分隔符作为sep参数来实现正确加载,但如果文件分隔符是未知呢?实际上,我们可以无需传入分隔符,而交由解析器自动解析。...; 传入嵌套列表,并尝试将每个子列表中所有列拼接后解析为日期格式; 出啊如字典,其中key为解析后新列名,value为原文件待解析列索引列表,例如示例中{'foo': [1, 3]}即是用于将原文件

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【说站】Javaresources读取文件内容方法有哪些

本文主要介绍是java读取resource目录下文件方法,比如这是你src目录结构 ├── main│ ├── java│ │ └── com│ │  └── test│ │   └── core...bean│ │     ├── Test.java│ └── resources│  └── test│   ├── test.txt└── test └── java 我们希望在Test.java中读取...test.txt文件内容,那么我们可以借助Guava库Resource类 示例代码如下 public class TestDemo { public static void main(String...", resourceName); return url;} 上述代码核心逻辑很简单,即通过获取classloader来获取resource文件 如果想引入googleguava库,如果你采用是maven...resource目录下文件全部内容了,希望本文内容对大家学习或者工作能带来一定帮助,如果有疑问大家可以留言交流。

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盘点一个文件读取utf-8错误解决办法

一、前言 前几天在Python白银交流群有个叫【大侠】粉丝问了一个Python读取文件时候报错问题,这里拿出来给大家分享下,一起学习下。 二、解决过程 看上去代码有报错,截图如下。...这个错误倒是很常见,因为数据没有给utf-8编码,或者读取时候,没有指定utf-8编码,都会报类似的错。 上图是他代码,15行那里指定一下编码就可以了。 指定编码之后,就完美解决啦!...这篇文章主要分享了一个文本文件读取utf-8错误解决办法,针对该问题给出了具体解析和代码演示,帮助粉丝顺利解决了问题。 最后感谢粉丝【大侠】提问,感谢【dcpeng】给出具体解析和代码演示。

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Apache Hudi 0.11.0版本重磅发布!

列统计索引包含所有/感兴趣统计信息,以改进基于写入器和读取器中键和列值范围文件裁剪,例如在 Spark 查询计划中。 默认情况下它们被禁用。...• 没有日志文件 MOR 查询(增量查询除外)表现为在读取数据利用矢量化 Parquet 读取器,这意味着 Parquet 读取器现在能够利用现代处理器矢量化指令来进一步加快数据解码速度。...指定 SQL 选项 index.type 为 BUCKET 以启用它。 Google BigQuery集成 在 0.11.0 中,Hudi 表可以作为外部表 BigQuery 中查询。...Bucket 索引 0.11.0增加了一种高效、轻量级索引类型Bucket index。它使用基于记录键散列函数将记录分配到存储桶,其中每个存储桶对应于单个文件组。...这在HoodieDeltaStreamer拖尾 Hive 表而不是提供 avro 模式文件很有用。 迁移指南 Bundle使用更新 不再正式支持 3.0.x Spark Bundle包。

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2018年7月24日 Go生态洞察:Go Cloud实现便携式云编程

引言 在当今这个云计算日益盛行时代,Go语言已成为众多重要云基础架构项目的核心。Kubernetes到Docker,Go语言效率、生产力、内置并发性和低延迟特性,使其成为云开发首选。...它当前支持Google Cloud Platform (GCP)和Amazon Web Services (AWS),并计划很快扩展到更多云服务商。...Go Cloud工作原理 Go Cloud通过一系列通用API实现了便携式云编程。以blob存储为例,你可以使用*blob.Bucket类型来实现从本地磁盘到云提供商文件复制。...类似地,你可以更换为Google Cloud Storage,而无需更改使用bucket逻辑: func setupBucket(ctx context.Context) (*blob.Bucket,...= nil { return nil, err } c, err := gcp.NewHTTPClient(gcp.DefaultTransport(), gcp.CredentialsTokenSource

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R中读取包含中文字符文件这个诡异错误你见过吗?

我们有一个文件,里面写了一些中文信息,命名为chinese.txt,内容为 Train Time 转录组开课时间 2021/10/29-2021/10/31 临床基因组学开课时间 2021/11/...宏基因组开课时间 2021/11/19-2021/11/21 扩增子开课时间 2022/01/07-2022/01/09 尝试读入R,报错 line 2 did not have 2 elements 很诡异提示...如果我们一直去数列数,这是怎么都不会发现问题。考虑到大多数程序语言对非英文支持不好,考虑是编码格式问题。..., what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 2 did not have 2 elements 解决方案1:指定编码格式 正确读了进来...有时在read.table中即使指定了fileEncoding = "utf-8"参数后依然解决不了问题文件,用readr毫无压力。

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实用:如何将aop中pointcut值配置文件读取

背景 改造老项目,须要加一个aop来拦截所web Controller请求做一些处理,由于老项目比较多,且包命名也不统一,又不想每个项目都copy一份相同代码,这样会导致后以后升级很麻烦,不利于维护...这种方式原则上是没有办法可以进行改变。但是我们又要实现这将aop中切面值做成一个动态配置,每个项目的值都不一样,该怎么办呢?...等配置文件。...这样,各项目只须要引用该jar,然后在配置文件中指定要拦截pointcut就可以了。 ---- 大黄:本文主要为抛砖引玉,提供一个思路。...比如,我们定时器采用注解方式配置时候,cron表达式也是注解里面的一个字符串常量,那么,我们能不能通过配置文件方式来配置这个cron呢?原理都是一样

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Botb:容器分析和漏洞利用工具

BOtB是一个CLI工具,你可以执行以下操作: 利用常见容器漏洞 执行常见容器后期利用操作 当某些工具或二进制文件在容器中不可用时提供功能 使用BOtB功能与CI/CD技术来测试容器部署 以手动或自动方式执行以上操作...payload劫持主机二进制文件 以CI/CD模式执行操作,仅返回> 0退出代码 GCP元数据端点中抓取元数据信息 将数据推送到s3 bucket 突破特权容器 强制BOtB始终返回Exit代码0(对非阻塞...CI/CD有用) CLI参数或YAML配置文件执行以上操作 获取 BOtB BOtB在发行版中以二进制形式提供。...以下用法示例在检测到异常默认情况下将返回退出代码> 0,这由“echo $?”表示。显示最后执行命令退出代码。 查找 UNIX 域套接字 #....Valid HTTP Socket: /var/run/docker.sock [+] Finished GCP 元数据实例中抓取数据 # .

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Apache Hudi 0.11 版本重磅发布,新特性速览!

列统计索引包含所有/感兴趣统计信息,以改进基于写入器和读取器中键和列值范围文件修剪,例如在 Spark 查询计划中。 默认情况下它们被禁用。...没有日志文件 MOR 查询(增量查询除外)表现为在读取数据利用矢量化 Parquet 读取器,这意味着 Parquet 读取器现在能够利用现代处理器矢量化指令来进一步加快数据解码速度。默认启用。...指定 SQL 选项 index.type 为 BUCKET 以启用它。 集成 Google BigQuery 在 0.11.0 中,Hudi 表可以作为外部表 BigQuery 中查询。...Bucket 索引 0.11.0增加了一种高效、轻量级索引类型bucket index。它使用基于记录键散列函数将记录分配到存储桶,其中每个存储桶对应于单个文件组。...这在HoodieDeltaStreamer拖尾 Hive 表而不是提供 avro 模式文件很有用。 迁移指南 Bundle使用更新 不再正式支持 3.0.x Spark 捆绑包。

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《Scikit-Learn、Keras与TensorFlow机器学习实用指南(第二版)》第19章 规模化训练和部署TensorFlow模型

GCP每个资源都属于一个项目。包括所有的虚拟机,存储文件,和运行训练任务。创建账户GCP会自动给你创建一个项目,名字是“My First Project”。可以在项目设置改名。...所有的文件会存入一个或多个bucket中。点击Create Bucket,选择bucket名(可能需要先激活Storage API)。...要这么做,在GCS Browser,点击bucket,拖动my_mnist_model文件夹到bucket中(见图19-4)。...如果一个notebook写入了文件,其它notebook就能读取这个文件。如果运行黑客文件,可能读取隐私数据。密码也会泄露给黑客。...笔记:AI Platform还可以用于在大量数据上执行模型:每个workerGCS读取部分数据,做预测,并保存在GCS上。

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不要以平台治理牺牲开发者体验

IaC 开发者体验需要重新设计 当我们谈及 IaC 与开发者体验(DX)之间脱节时,是指许多开发者应用开发转向基础设施供应和管理感受到断层。传统 IaC 工具虽然强大,但学习曲线往往很陡峭。...无论是 AWS 身份和访问管理(IAM)角色复杂性,GCP 网络规则还是 Azure 存储配置,魔鬼总是藏在细节中。这种复杂性使我们团队无法专注于提供核心业务价值。...这里有一段代码,让用户可以存储桶中获取下载 URL: import { api, bucket } from "@nitric/sdk"; const photoApi = api('photos'...更重要是,它也帮助解决基础设施漂移问题。每当我们变更应用程序代码,无论是在部署还是本地运行时,资源规范都会自动更新,以添加/删除/修改资源,使其与应用程序需求保持一致。...", err, ) } return nil } 注意:Nitric 框架是开源,提供商用 Go 语言编写,使用为 AWS、GCP 和 Azure 打包 Pulumi 自动化引擎,遵循最佳实践

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如何使用Domain-Protect保护你网站抵御子域名接管攻击

该工具支持实现以下两个目标: · 扫描一个AWS组织中Amazon Route53,并获取存在安全问题域名记录,然后尝试执行域名接管检测; · 可以通过Domain Protect for GCP检测...S3CNAME记录; · Azure资源中存在安全问题CNAME记录; · 缺少Google云存储BucketCNAME记录; 可选额外检测 这些额外检测功能默认是关闭,因为可能在扫描大型组织时会导致...Lambda超时,比如说扫描缺少Google云存储BucketA记录。...如需启用,请在你tfvars文件或CI/CD管道中 创建下列Terraform变量: lambdas = ["alias-cloudfront-s3", "alias-eb", "alias-s3",...AWS帐户都具有相同名称安全审核只读角色; · 针对Terraform状态文件Storage Bucket; · Terraform 1.0.x; 工具源码获取 广大研究人员可以通过下列命令将该项目源码克隆至本地

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T Wiki 云安全知识库 5 月份更新汇总

前言 T Wiki 在 4 月 16 日上线,5 月份以来依然收到不少师傅支持与反馈,此时正好到月末,特此整理下这段时间来 T Wiki 上所更新内容,如果你还不知道 T Wiki 是什么,可以查看这篇文章...T Wiki 云安全知识文库上线,或者访问 T Wiki 地址:wiki.teamssix.com 感谢你们 自 5 月 1 日至 5 月 31 日,T Wiki 总共收到了 4 位师傅补充,分别为...StackRox Idle Life 开源云原生安全防护平台 neuvector da Vinci【达文西】 云安全态势管理工具 CloudSploit Azure 红队利用工具 Stormspotter GCP...IAM 权限提升方法 GCP-IAM-Privilege-Escalation tanger 腾讯云轻量服务器管理工具 TeamsSix 云服务安全漏洞汇总 基于终端 UI k8s 集群管理工具...》 《S3 任意文件上传》 《Bucket Object 遍历》 《RDS 信息收集》 《MSSQL 读取实例信息》 《PostgreSQL 数据库 SSRF》 《利用 IAM 进行权限提升》 《利用

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