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R安装方式以及Github安装报错解决

写在开头 最近在疯狂补数据挖掘课以及跟着生信技能树整理的#R语言在补充R语言基础知识 恰好看到了无法在线下载安装GitHub?...R安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R。...来自github 有些软件会放在Github上,版本可能更新的比较及时,因为上传到Bioconductor需要审核 我们下载的时候用Bing搜索相应的R的名字,然后跳转到Github上面找到下载的方法...Github上R 如果是github上的,可以采用输入作者名以及R名字之后使用命令进行安装 安装Github上的 #使用devtools安装 install.packages('devtools...') devtools::install_github('kevinblighe/PCAtools') devtools安装 但是GitHub直接安装的话有时候会报错,往往都是打不开网址。

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python安装安装制作

虽然Python的模块可以拷贝安装,但是一般情况下推荐制作一个安装,即写一个setup.py文件来安装。...使用者拿到这个后,解压,到foo-1.0目录下执行:python setup.py install,那么,foo.py就会被拷贝到python类路径下,可以被导入使用(如果安装是egg文件,会把egg...安装文件: (1).假设你要分发mypackage,将文件放在script目录下 那么setup.py内容如下: from distutils.core import setup #from setuptools...使用者拿到这个后,解压,到mypackage-1.0目录下执行:python setup.py install,那么,foo.py就会被拷贝到python类路径下,可以被导入使用(如果安装是egg文件...具体细节,参考otpauth-1.0.1.tar.gz的模板 python 安装没有这么复杂,参考 https://www.cnblogs.com/maociping/p/6633948.html

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通过 GitHub 学生申请 JetBrains 学生

学生里的比较有用的内容: - http://name.com域名商可免费申请一个域名(没有注明免费期限),包括SSL证书等。 - namecheap域名商为期一年的.me域名和1年的SSL证书。...具体内容包括: 使用方法:绑定Github带有学生的账户 提示:Jetbrains本身也提供学生版订阅的申请,不一定需要通过Github Student Developer认证。...操作方法 1、打开 JetBrains 登录网址:https://account.jetbrains.com/login,选择github登录: 2、登录github账号,如果提前登录了github,...选择github,并点击“使用github授权” 5、再次使用github授权,登录后显示已经成功: 6、填写以上页面的信息后,界面: 7、邮箱中会收到一封邮件,教育绑定邮箱,点击链接: 收到一封邮件...获取途径 获取github学生的途径: 1、国内部分高校的带有edu的邮箱 2、国外著名大学的带有edu的邮箱 3、特定格式的高等学校学生证 4、填写表单申请:https://forms.office.com

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pipz: PyPI安装任何Python软件作为Rez软件

大家早上好 今天要为大家带来的是如何通过从PyPI的方式安装任何Python软件作为Rez软件 虽然rez官方也提供了工具可以把PyPI上面的python作为rez 但是它在把PyPI上面的转成...rez的软件的时候是以哈希值命名的 安装pipz 今天我们的分享的工具叫pipz, 作者是mottosso 由于pipz依赖于bleeding-rez 所以我们需要先安装bleeding-rez...rez找到了 通过下面命令我们可以检查是不是bleeding-rez是否运行正常 rez env bleeding_rez -- where rez 通过git克隆rez的仓库 下面https://github.com.cnpmjs.org...的前缀是一个镜像源用于克隆加速 git clone https://github.com.cnpmjs.org/loonghao/rez-pipz.git 我这个分支做了一些调整,所有的pip都是统一小写...rez env中默认带了python-3的环境所以当我不指定python版本去安装python-2的的时候会出现类似下面的冲突 我们只需要指定对应的python版本就可以了 默认安装好了的pip的路径在你本地用户下的

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安装GitHub的R困难解决方案

比如安装GitHub的R,因为并不是所有的R都会被正式的发布在CRAN或者bioconductor,所以对于简简单单分享在GitHub的R一般我们搜索到如下代码: library(devtools...image-20191120214502005 其实还可以先下载GitHub的这个R的项目文件: ?...image-20191121170459162 然后再本地安装,这个时候install_github函数可能是有问题的啦,所以需要谷歌搜索,考验大家搜索能力的时候到了,主要是关键词寻找:install...image-20191121222747036 另外一个小技巧 实际上,非常多的时候,我们只是记住了R的名字,而不知道作者,所以下载的时候给出作者+R名字有点困难,一个 githubinstall...当然了,我觉得没啥意思,我通常是连R都不记得名字,就是复制粘贴嘛!

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npm与gem--在线&离线安装

比如内网环境下,需要进行离线安装NPM 离线安装的方法无非就是先行下载相应的文件,再从本地加载安装 1....直接去线上下载 在NPM网站上搜索到相关的文件,但站点上似乎不提供直接的下载保存服务,可以前往它的github库,再下载 ? 2....线上安装后再从安装目录获取相关文件 上述方法虽然可行,但有些存在非常多的依赖,一个个下载依赖未免太过冗杂 可以在支持线上安装的机子安装之后,安装目录中获取文件,传到内网机安装 典型的例子是Babel...从缓存中获取 线上安装gem包成功之后,相关的依赖都会下载保存至 ruby安装路径的cache目录 下 ?...我们只要将这个cache目录传到另一台机子,进入这个目录,再用 -l 参数 执行本地安装即可 gem install -l compass-1.0.3.gem

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发布NpmGitHub Packages

发布NpmGitHub Packages Github集成了GitHub Packages功能,目前提供了Npm、Docker、Maven、NuGet、RubyGems的包管理工具,可以通过Github...管理开源,本文主要介绍使用GitHub Packages发布Npm。...这是已经发布好的package.json文件,作为示例,需要注意的是name字段、publishConfig字段与repository字段的配置,在GitHub Packages发布的属于作用域,需要使用...npm publish --access=public 安装 需要注意的是,无论发布还是安装都需要授权,也就是上述生成Token以及配置的过程,否则无法安装指定的,以我发布的为例,执行安装。...安装Npm很慢的话,可以考虑配置代理,同样是在~/.npmrc文件中加入配置。

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批量安装一系列github上面的R

最近在我的授课电脑上面一股脑更新了全部的R套件,包括R和rstudio,以及rtools,还有几百个r文件夹都删除了。...('satijalab/seurat-data') 这样的代码进行安装,但是我因为电脑在长城内部,所以没办法访问github,会得到如下所示的报错: > devtools::install_github...安装方法也是有两个: ## 使用devtools::install_local自动安装SCP及相关依赖(这种安装过程可以自动寻找安装依赖): devtools::install_local("SCP...-0.5.1.tar.gz") ### 或使用install.packages安装SCP(如果缺失依赖会报错,需要再根据提示手动逐一安装依赖): install.packages("SCP-0.5.1....tar.gz", repos = NULL, type = "source") 这里,我们建议是使用 devtools::install_local 安装这一系列,但是我批量安装的代码没有写好:

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R安装

2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。...3、在哪可以找R: (1)官方网站CRAN网站下载,使用“install.packages()”函数来安装 (2)Bioconductor网站下载,主要是生物生信相关的...R,使用 “BiocManager::install()来安装 (3)github网站,是R作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github...说人话,智能手机安装的腾讯视频,只要你不卸载,就一直在你的手机里,需要看电视剧是打开APP,看完电视了你退出APP,再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R就相当于打开APP。...5、如何实现快速下载 如果官网速度慢,请使用镜像网站 图片 图片 官方网站CRAN网站的镜像使用方法1,Bioconductor网站的镜像使用方法2,方法2也适用CRAN 三、安装R会遇到问题

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