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R安装方式以及Github安装报错解决

写在开头 最近在疯狂补数据挖掘课以及跟着生信技能树整理的#R语言在补充R语言基础知识 恰好看到了无法在线下载安装GitHub?...R安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R。...) #安装R 括号里面写入需要安装的名字 2....GithubR 如果是github上的,可以采用输入作者名以及R名字之后使用命令进行安装 安装Github上的 #使用devtools安装 install.packages('devtools...() #查看已安装R search() #查看已载入的R 查看已经安装R 查看已经载入的R R安装成功的唯一标准:library()没有error——小洁老师

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安装GitHubR困难解决方案

比如安装GitHubR,因为并不是所有的R都会被正式的发布在CRAN或者bioconductor,所以对于简简单单分享在GitHubR一般我们搜索到如下代码: library(devtools...image-20191120214502005 其实还可以先下载GitHub的这个R的项目文件: ?...image-20191121170459162 然后再本地安装,这个时候install_github函数可能是有问题的啦,所以需要谷歌搜索,考验大家搜索能力的时候到了,主要是关键词寻找:install...image-20191121222747036 另外一个小技巧 实际上,非常多的时候,我们只是记住了R的名字,而不知道作者,所以下载的时候给出作者+R名字有点困难,一个 githubinstall...当然了,我觉得没啥意思,我通常是连R都不记得名字,就是复制粘贴嘛!

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批量安装一系列github上面的R

最近在我的授课电脑上面一股脑更新了全部的R套件,包括R和rstudio,以及rtools,还有几百个r文件夹都删除了。...('satijalab/seurat-data') 这样的代码进行安装,但是我因为电脑在长城内部,所以没办法访问github,会得到如下所示的报错: > devtools::install_github...安装方法也是有两个: ## 使用devtools::install_local自动安装SCP及相关依赖(这种安装过程可以自动寻找安装依赖): devtools::install_local("SCP...-0.5.1.tar.gz") ### 或使用install.packages安装SCP(如果缺失依赖会报错,需要再根据提示手动逐一安装依赖): install.packages("SCP-0.5.1....tar.gz", repos = NULL, type = "source") 这里,我们建议是使用 devtools::install_local 安装这一系列,但是我批量安装的代码没有写好:

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R安装

2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。...R,使用 “BiocManager::install()来安装 (3)github网站,是R作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github...几乎不使用,使用时需要写明R的作者,就是指明选择谁写的R。...4、如何安装 安装如上 安装后需加载才能使用,加载的函数“library()”,“require()” 一次安装,每次打开新的窗口(重启Rstudio)都需要加载。...说人话,智能手机安装的腾讯视频,只要你不卸载,就一直在你的手机里,需要看电视剧是打开APP,看完电视了你退出APP,再次看电视还需要再次打开APP。所有“加载”R就相当于打开APP。

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R语言 | R安装及向量

关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了,网上有很多相关内容,如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R安装及初识向量。 ? PART2 R安装 问:什么是R?...答:R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...(对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象,但是没关系,我们会在后续的学习中慢慢了解R的概念) 1.R安装:第一次安装一个,使用命令install.packages()即可。...#示例:安装ggplot2 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是,的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R载入:安装完成后,想要调用这个中的命令、数据等信息,就需要先载入这个,需要用到的命令为library()。

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R来源及安装指定版本R方法

说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R的几种来源以及安装指定版本R的几种方法。 R来源及安装方法 1....Github 部分作者在写好R以后还没来得及上传到CRAN上,便可通过其Github进行安装,通过devtools::install_github("用户名/pkg_name")安装。...安装指定版本R 复现文章或R的更新与当前的R版本或R代码不兼容,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R历史版本。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实,在实际操作我发现能不能装上还得看是什么R以及你的网络情况。

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R问题|如何本地安装R

简介 平常在各种R语言群里,总会遇到关于安装R的问题,例如:搭载在github上的R,由于网速(外网)原因而无法下载该怎么办?...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载,通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的,但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例: 教程 使用bing搜索该,找到相应网站[1]。 关键词:R名称+R,或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧:R名称+R 找到Downloads板块,下载对应的压缩 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖可能会很头疼,就怕安装完成,他还说你有其他安装,那你只能“将错就错”了!

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R来源及安装

说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R的几种来源以及安装指定版本R的几种方法。 R的来源 1....CRAN网站 可以理解为R的官网,凡是需要通过CRAN下载的R,都可以通过install.packages("名")来安装 2....部分作者在写好R以后还没来得及上传到CRAN上,便可以在其Github安装,通过devtools::install_github("用户名/名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R 复现文章或R的更新与当前的R版本或R代码不兼容,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R的方法供大家参考。...CMD INSTALL limma_1.8.10.tar.gz 但其实,在实际操作我发现能不能装上还得看是什么R以及你的网络情况。

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R语言入门之R安装

通常来说,R安装主要有四种方法,包括:1)R语言官网上直接下载相关R安装;2)Bioconductor上下载R安装;3)Github上下载R安装;4)手动安装R。...接下来我将和大家分享R的具体安装: 1)首先获取下载的R的名字,比如下载metafor这个R,可以先在官网(https://www.r-project.org/)上找到这个,了解一下这个的详细内容和使用说明...2)如果所要下载的R不在R语言官网上,那它极有可能在Bioconductor或者Github上,可以先登录Bioconductor官网(http://www.bioconductor.org/)搜索相关...3)接下来便是安装源自Github(https://github.com/)的R包了,它的步骤和安装源自Bioconductor的R类似,需要先安装devtools,然后用devtools里的install_github...,github中的R需要在其前面加上该所在的库名,否则无法进行下载安装

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