函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具，一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN：对行或列，或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一，通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一行的均值，MARGIN=1，对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一，通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一列的均值，MARGIN=2，对列做操作 sweep(M,2,
参考文章http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/342计算FPKM值，发现计算完每个基因下所有外显子的总长度后，记录的都是ENSEMBL gene id，而我需要的是...奇怪的是GenomicFeatures既然把GTF文件读取进去了还抽取基因id了，但它就是不提供抽gene symbol的功能。...尝试使用clusterProfiler包装的转换器进行转换，发现基因丢了一半，这可不行。谷歌了一波没有发现满意的答案，有个refGenome包好像可以做，但读取文件半天卡死了，特别奇怪。...最后还是自己动手，完成了6万个gene feature的转换。 整个提取操作包装为函数了，输入可以是文件名或已经导入的gtf文件数据框（最好还是文件吧）。由data.table包支持，速度杠杠的！
在上篇谈到匿名函数和回调函数的基础上，我们接着介绍javascript中的即时函数，内部函数，返回函数的函数，能重写自身的函数等几种常见的函数类型及使用方法。...所以，一般来说即时函数通常用来执行一次性的操作或者异类初始化的任务。 内部函数 从上一篇文章中，我们显然知道，在javascript中，函数与其他类型的值在本质上是一样的，函数本身也是一种值。...所以，我们自然就可以在一个函数内部定义另外一个函数，这样的函数就叫做内部函数。...} } 上面这段代码，在函数a中的返回了一个匿名函数。 我们调用这个函数 a(); a()(); 直接调用a会返回a中返回的函数 a()();的意思是调用a，在调用a的返回的函数。...能重写自己的函数 我们可以在一个函数的内部重定义该函数。
img 公式保存了创建它的环境 使用到 R 的朋友几乎都用过公式，它在统计建模方面给了我们极大的方便。不过，公式相比于数值、逻辑值这些数据类型，有什么特点吗？...")= 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它的环境。...基本用法 假设我们要对 df 中的 x 和 y 列进行归一化处理，在不使用 scale() 函数的情况下，我们可能会手写一个函数： scale2 <- function(x) { (x - mean...替换 .x 进一步简化编写。...在公式中，我们可以直接使用前面已经定义的变量，这里是 cfs。
R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数，结合正则表达式。...，我们知道组织病理分期分成stage I，stage II，stage III和stage IV四个分期 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组，并转换成因子 我们使用gsub函数...*","stage I/II",stage) #转换成因子 stage=factor(stage) stage 可以得到下面这个两分组的因子 接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成三个组...，并转换成因子 我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A，B或者C等字母，例如Stage IIIA，Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage
搭集群最麻烦的就是修改配置文件，如果只用修改一个机器上的配置文件，然后用一个脚本就可以把配置文件同步到其他机器上，岂不快哉！...编写一个名为xsync的脚本文件： 作用： 将当前机器的文件，同步到集群所有机器的相同路径下！...hadoop102:/A/a , 执行脚本后，将此文件同步到集群中所有机器的 /A/a 用户在使用xsync时，只需要传入要同步的文件即可 xysnc a 不管a是一个相对路径还是绝对路径，都需要将...exit; fi #获取分发文件的绝对路径 dirpath=$(cd `dirname $1`; pwd -P) filename=`basename $1` echo 要分发的文件的路径是:$dirpath...bin目录，如果没有就新建一个bin目录，因为这目录是在全局环境变量中，放进去后无论在哪个目录下都可以执行这个脚本文件!
你保存的结果也可以很方便的分享给其他人，保证结果的一致性。那么在R里面怎么来保存和加载计算结果呢？ 在R里面有两个函数save()和load()分别用来保存和加载计算结果。...接下来我们通过save()保存一下这三个数值向量到一个本地文件中 save(count, age, circumference, file = "mydata.rda") 这个时候你会在你的当前工作路径中发现多了一个新的文件...刚才的三个变量的值就已经保存到这个文件中了。 接下来我们从R中先删掉这三个变量 rm(age, circumference, count) 你会发现变量区清空了 ?...最后我们再通过load()函数来加载我们保存的文件来恢复这三个变量 load(file = "mydata.rda") 你会发现这三个变量又重新出现在了变量区 ?...你还可以轻松的将这个mydata.rda文件分享给你的同事或者朋友，这样他们也能通过load来加载这个文件，从而获取这三个变量的值，继续做后续的分析。
我们用R做数据处理的时候，经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框（dataframe）转换成列表（list），或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。 这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠，就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢？下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息，将第一列的数据划分到各个组，是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子 例如现在我们手上有一个数据框，里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容，第一列是重量，第二列是不同的处理方式...，后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例，敬请期待。
在R中，expand.grid()函数可以返回几个元素所有可能的组合，使我们免于多层遍历的苦恼。...其实这个就是我们提供的sex，age，major中的变量分别组合起来得到的，类似于，遍历三层循环得到所有的排列组合。
方案 在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...#> [19] "package:datasets" "package:methods" #> [21] "Autoloads" "package:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist <- objects(packageName)...移除包含箭头 <- 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version
在日常数据分析的过程中，我们经常需要在一个字符串或者字符串向量中查找是否包含我们要找的东西，或者向量中那几个元素包含我们要查找的内容。...这个时候我们会用到R中最常用的两个函数，grep和grepl。...其实grep这个函数也并非是R所特有的，在linux中模式匹配也用grep这个函数，前面我就给大家简单介绍过☞Linux xargs grep zgrep命令。...我们先来看看grep和grepl这两个函数的用法。 这两个函数最大的区别在于grep返回找到的位置，grepl返回是否包含要查找的内容。接下来我们结合具体的例子来讲解。...☞讨论学习R的grepl函数 参考资料： ☞Linux xargs grep zgrep命令 ☞讨论学习R的grepl函数
# 比较简单的内部函数 # 代码部分 class Cat: def __init__(self, new_name): self.name = new_name...return "我是小猫{}".format(self.name) # 如果定义为__secret则为私有方法 def secret(self): print("{}的年龄是...__age)) tom = Cat("Tom") tom.secret() print(tom) # 运行结果 Tom来了 Tom的年龄是18 我是小猫Tom Tom 我去了
函数对比 SQL中窗口函数语句中over语句中两个关键词：partition by和order by，R语言中也有与之一一对应的函数： ?...1 row_number函数 R语言中的row_number函数与sql中的row_number函数相同，对group_by后面字段进行分组，按照order_by后面字段排序，生成一个连续不重复的编码...2 min_rank函数 R语言中的min_rank函数与sql中的rank函数相同，row_number函数对order_by后面字段相同的记录编码是不同的，min_rank就是解决这个问题，对相同的记录编码相同...同样得到与sql中相同的输出结果： ? 4 ntile函数 R语言中的ntile函数与sql中的ntile函数相同，把每一组分成几块，块数由参数n决定： ?...总结 简单介绍R语言中4个排名窗口函数，函数名几乎与sql中的4个排名窗口函数一样（除了min_rank与rank）,但R语言的排名窗口函数的输出结果与sql中的输出结果有点不同：R语言的数据结果不改变原来的数据顺序
函数语法 函数名<-function(parameters){ statemens return(expression)} printLine <- function () { print("---...-----------------------------------------"); } #函数的调用 printLine(); #错误：无参函数，有参调用 printLine("parameter...function (n) { for(i in 1:n) { print("--------------------------------------------"); } } #错误：有参函数...，实现了summary函数的加强版功能！...更多自编函数，参见Erin的自编函数整理，直接调用帮助你的数据分析工作事半功倍哦！
前言下面是内部存储的路径，也就是手机系统自带的文件管理所能使用的路径/storage/emulated/0/还有一些软连接指向这个路径/sdcard/,这个目录链接至下面那个目录/storage/self...这个目录下放了一个.nomedia文件，对系统说明扫描媒体文件（图片音乐视频之类的）时不要扫描该目录，从而避免将其中的文件添加到媒体库中。...据说是设备的唯一标识符（Device Unique Identifier）但是我不这样认为，设备标识符这种重要的东西肯定是放在内部的，总之看起来没那么离谱了，但是估计大概率还是错的。...根据很多文件夹下都没有文件(说明大多数应用自己指定了文件存放规则)就可以看出，安卓的文件管理是很混乱的，应用产生或者存放的文件并没有制定强制的标准，系统用一段时间就可以在文件管理里面找到很多不认识的文件...这种情况只能说是有好有坏，比如微云直接把下载的文件放在中文路径下，很多不懂手机的用户就可以轻松找到文件目录（中文好认而且一般位于内部存储的最底部），而且下载文件几乎不需要考虑中文兼容性的问题（又不是搞代码
如果需要输出多次，是否意味着要编写这块代码多次呢？ 小总结: 如果在开发程序时，需要某块代码多次执行。为了提高编写的效率以及更好的维护代码，需要把具有独立功能的代码块组织为一个小模块，这就是函数。...函数定义和调用 一、定义函数 定义函数的格式如下： def 函数名(): 代码 示例： # 定义一个函数，能够完成打印信息的功能 def printInfo(): print('----...调用函数很简单的，通过 函数名() 即可完成调用。...# 定义完函数后，函数是不会自动执行的，需要调用它才可以 printInfo() 三、注意: 函数定义好以后，函数体里的代码并不会执行，如果想要执行函数体里的内容，需要手动的调用函数。...每次调用函数时，函数都会从头开始执行，当这个函数中的代码执行完毕后，意味着调用结束了。 当然了如果函数中执行到了return也会结束函数。
Objective-C中编写省略参数的多参数函数 引语： 在Object-C中，我们会遇到很多像NSLog这样的函数，其中参数的个数不确定，由程序员自由控制，在初始化数组，字典等方面应用广泛，那么，这类的函数是如何实现的呢...我们怎么编写我们自己的省略参数的函数呢？当然，这不是唯一的多参函数的处理方法，你也可以通过一个字典或者数组传递参数。但C为我们提供的这样的一种机制，无疑是最方便的。...va_end(ap) 这个宏用于关闭取参列表 二、多参函数的取参原理 在编写我们自己的多参函数之前，明白函数的取参原理是十分重要的，首先，函数的参数是被放入我们内存的栈段的，而且放入的顺序是从后往前放入...而上面介绍的几个宏，就是帮助我们做这些的。 三、声明与实现省略参数的多参函数 "..."这个符号就是我们用来实现省略参数函数的符号。...",@"321", nil];//必须有nil 四、一点补充 细心的你可能发现了，这里的nil是我们在调用函数时手动加上的，可是系统的许多函数在我们调用时，系统直接帮我们加上了参数结尾的那个nil，例如
下面的例子说明匿名内部类的匿名构造函数的用法 例2.7.2 interface FigureMark_to_win { void whoAmI(); } public class Test {...FigureMark_to_win() { private String msg = "三角形"; {//马克-to-win： 匿名构造函数
有时候我们想提取PDF中的文本不得不借助一些转化软件，本次教程给大家介绍一下如何简单从pdf文件中提取文本的R包。 安装R包： install.packages("pdftools")。...当然如果在Windows以外的环境安装需要部署 poppler 环境。...读取文本的命令： txt=pdf_txt(“文件路径”)。 获取每页的内容，命令：txt[n] 获取第n页的内容。 获取pdf文件目录： doc=pdf_toc(“文件路径”)。...当然doc变量中的目录还不是标准化的格式，那么我们需要一个通用json格式，需要安装R包jsoblite。...再利用函数fromJSON(json)，我们就会把目录转化成为向量。也就拿到了文档的整个目录。 综上步骤，我们便可以随便获取任意章节的任意内容。那么接下来就是对这些文字的应用，各位集思广益吧。
对此，我们可以在R中调用相应的概率分布函数并进行可视化，可以非常直观的辅助学习。...R中拥有众多的概率函数，既有概率密度函数，也有概率分布函数，可以调用函数，也可以产生随机数，其使用规则如下所示： [dpqr]distribution_abbreviation() 其中前面字母为函数类型...，含义如下： d=密度函数（density） p=分布函数（distributionfunction） q=分位数函数（quantilefunction） r=生成随机数（随机偏差） distribution_abbreviation...为概率分布名称的缩写，R中的概率分布类型如下所示： 对于概率密度函数和分布函数，其使用方法举例如下：例如正态分布概率密度函数为dnorm()，概率分布函数pnorm()，生成符合正态分布的随机数rnorm...R也可以产生多维随机变量，例如MASS包中的mvrnorm()函数可以产生一维或者多维正态分布的随机变量，其使用方法如下所示： mvrnorm(n=1, mu, Sigma...)
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