save(a,file="test.RData")代码报错“object a not found”,说明未找到a数据框,可能时因为未将数据框赋值为a,可运行a<-,右上方环境窗口中出现a即可将a导出。
摘自【生信星球】的总结,我觉得对于我这种生信小白来说很有帮助,包括一些易错点,以及需要注意的地方。
(1)R的规范赋值符号是<-,也可以用=代替 (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。 (4)显示工作路径 getwd() (5)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。 (6)表格在R语言中称为数据框^_^ (7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。 (8)数据类型(重点只有两个)
tip:运行项目时需要将文件放置于工作目录下;R中严格区分大小写;改错变量可以重新赋值覆盖;可以使用并保存脚本文件,文件格式为R
上次我们介绍了几个pandas函数,如nlargest()、pct_change()和explode(),《学会这些好用的pandas函数,让你的数据处理更快人一步》让大家可以更快的求取前N组数据、计算数据之间变化率以及将列表元素数据展开为一列等等。
新手攻略: (1)R的赋值符号不是等号,而是<- (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。 (4)显示工作路径 getwd(
数据类型:向量(vector);数据框(Data Frame);矩阵(Matrix);数组(Array);List。
save(a,file="test.RData") 这句代码如果报错object a not found,是为什么,应该怎么解决?
GLSL基本的运算符和表达式使用方法。 运算符 优先级 运算符说明 运算符 结合性 1 括号 ( ) 无 2 数组下标函数调用、构造函数变量选择器后置++、后置-- . ++ -- 从左往右 3 前置++、前置--一元运算符 ++ -- + - ~ ! 从右往左 4 乘除法 * / % 从左往右 5 加减法 + - 从左往右 6 位操作 << >> 从左往右 7 大小关系 > >= < <= 从左往右 8 相等性 = != 从左往右 9 位操作 与 & 从左往右 10 位操作异或 ^ 从左往右 11
> (7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,可用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
read.table(file"mingzi",sep="\t",header=T)
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
初印象:变量、一串数字、一串字符、不止一个、数据分析的直接对象。(不一定是正确的,仅本人粗显的理解)
(1)R的赋值符号不是等号,而是<- (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。 (4)显示工作路径 getwd() (5)向量
有几个问题,如果数据没处理完,或者a还没被赋值的时候,save a 会报错,提示找不到a;最后的plot,即是以R内置的iris数据中的两列数据作散点图,出现一个最基础的、x轴y轴一一对应的图像。
(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
理解向量之前,需要知道元素的概念。元素指的是数字或字符串,根据它可以区分标量和向量
eg: 数字:A(1,2,3)/字符串:A("hi","hello","ha")
sep='\s+': 指代\f\n\t\r\v这些,分别为换页符,换行符,制表符,回车符,垂直制表符。
read.table() #从文件中读取数据,sep表示文件中的分隔符,header表示第一行是否为标题行
约等于表格 但是:列有要求(同一列只允许同一种数据类型);不是文件(可以导出来成为一个文件);
R语言中的数据类型包括数值型(numeric)、字符型(character+"")、逻辑型(logical)
引用自微信公众号生信星球 小白 (1)R的赋值符号不是等号,而是<- (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 #左侧控制台 (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。 (
一个向量是一排有序排列的元素。使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”即赋予变量一个数值 <-
dplyr包在数据变换方面非常的好用,它有很多易用性的体现:比如书写数据内的变量名时不需要引号包裹,也不需要绝对引用,而这在多数baseR函数中都不是这样的,比如:
在第二章介绍了 R 语言中的基本数据类型,本章会将其组装起来,构成特殊的数据结构,即向量、矩阵与列表。这些数据结构在社交网络分析中极其重要,本质上对图的分析,就是对邻接矩阵的分析,而矩阵又是由若干个向量构成,因此需要熟练掌握这些特殊的数据结构。
数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列
matrix 矩阵-二维,只允许一种数据类型;data.frame数据框-二维,每列只允许一种数据类型。
df1 <- data.frame(gene=paste0("gene",1:4),
新手的小本本: (1)R的赋值符号不是等号,而是<- (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 (3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。 (4)显示工作路径 getw
上一年由于备战考研,最近论文答辩结束,计划重启公众号。本篇文章主要是记录总结毕业论文中使用Pandas模块的常用操作,感兴趣的可以作为参考。
官方文档:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/user_guide/index.html
R是现今最受欢迎的数据分析和可视化平台之一。它是自由的开源软件,并同时提供Windows、Mac OS X和Linux系统的版本。在接下来的时间,我将把掌握、精通这个软件所需的技能学习过程以系列文章的形式发表,记录我的学习过程,供大家参考,一起有效地使用它分析自己的数据。工欲善其事必先利其器,学习R语言数据分析,第一步自然是R安转。R可以在CRAN上免费下载,安装过程可以参考我前面的视频教程
sep 分隔数据值的分隔符。默认值为sep =“ ”,表示一个或多个空格、制表符、换行符或回车符。使用sep =“,”来读取被逗号","分隔的文件,使用sep =“\t”来读取制表符分隔的文件
(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,使用?+命令
(https://developer-private-1258344699.cos.ap-guangzhou.myqcloud.com/column/article/9169440/20231123-6874b036.png?x-cos-security-token=XazQOQwryFdEOouJEjBgSnkh2WyvnG3a264790de313e55f7686759f352702ba1YFMBVZ3wQVjBNpoW_KMfN2RC09s6PfwdOqDcowZ3P-Vo0Am9BunZ4nJYzYFXBf7u5rLlbzzjf41n21RTMIwKezXvMcE1s1nu1XTwH40V-DUB5mvNVBS6Bm8IYnyNX0zL_zY5mhgTsz0r_8dGULdfm8LSH9IHSFVgbXJsp5awVI2M84NA1XvBQ8tBIgS2jmm6qxLuMN2l0tUqTy9WDGKMqUFoexOHq2yg8EFWKgBi3uk4Mrtui9aj_Wbq4J9lTTsUD-BMNKfc0Jr7Ati8vUiANTLmPVb1uu6KzMi1QSPo2E_uGWrQUoGWn8Pw0qeotVWz4Ur-1-g1dM5lcMdqieKVDGWR_yM2MiMKjPZrjhj3Kx-ANwjikSRCC9ysRJ9q7qC6k0yM-TFgjEcggJkh6gtkNQ&q-sign-algorithm=sha1&q-ak=AKIDMiVx-3J5YWwEhf0th4uVCL7ZvzqP09bV-5qP2bqgBShA0eG8ZY90NNuTSACMQNFO&q-sign-time=1700710846%3B1700718041&q-key-time=1700710846%3B1700718041&q-header-list=host&q-url-param-list=x-cos-security-token&q-signature=3f3721451993df5289443555b48f4af347e00707)
awk的工作过程是这样的:按行读取输入(标准输入或文件),对于符合模式pattern的行,执行action。当pattern省略时表示匹配任何字符串;当action省略时表示执行'{print}';它们不可以同时省略。 每一行输入,对awk来说都是一条记录(record),awk使用$0来引用当前记录:
PS:好长时间不写博客了,起初是不知道写些什么,后来接触了到了很多东西,原本看似简单的东西,背后都隐藏着巨大的秘密,想handler的使用,一般情况下会引起内存泄漏问题,想着找到方法结局不就得了吗,可是谁想查阅资料发现,这个东西没想到牵扯的这么深, Activity -> handler -> message -> queue -> UI线程作为GC Root引用链,看都看懵逼了,赶紧看一些稍微简单的UI 实现,突发奇想,RecyclerView的混合布局界面的实现。如下图
之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways,能够在多个数据集中识别到显著富集的通路,包括那些在单个数据集中不明显的通路。今天来介绍一下这个R包的使用方法和使用输出文件进行Cytoscape绘制网络图。
将"huahua.txt"文件保存到工作目录(Rproject管理项目的工作目录)
HBase的名字的来源于Hadoop database,即hadoop数据库,不同于一般的关系数据库,它是非结构化数据存储的数据库,而且它是基于列的而不是基于行的模式。
背景:由于工作原因,需要根据excel表格里的不同数据,配置不同颜色或样式给领导,由于excel有多张表格,并且是每个月都要做的工作,故考虑用Python实现。
数据框来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
第一自变量h与与第二自变量sex是等长的, 对应元素分别为同一人的身高和性别, tapply()函数分男女两组计算了身高平均值
修改行名和列名,其实就是修改向量,要修改全部行名就给全部赋值,如果要改一个列名就给取子集赋值。如:修改第二列的列名,就是修改【列名这个向量】的第二个元素
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