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R语言-03数据、矩阵和列表

“向量”——一维“表格”——二维matrix 矩阵-二维,只允许一种数据类型data.frame 数据-二维,每列只允许一种数据类型list列表:可装万物1.数据来源(1)用代码新建(2)由已有数据转换或处理得到...(3)读取表格文件(4)R语言内置数据(没有赋值就可以直接使用数据,例如iris)2.新建数据*读取文件df2<-read.csv("gene.csv")df2#读取"gene.csv"文件,赋值df23...<- c("r1","r2","r3","r4") #修改全部行名#只修改某一行/列名colnames(df1){2} <- "CHANGE" #修改一个列名6.两个数据连接按照共同列名取交集...= F,cluster_rows = F) #修改默认聚类列表新建和取子集(列表可装万物)x[[1]]x$m1 #列表取子集元素“名字”-names()后置难点 数据按照逻辑值取子集#将逻辑值赋值给...k,按逻辑值在df1取子集**实战中会经常遇到删除变量数据结构总结以上来源,生信技能树

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R语言 数据、矩阵、列表创建、修改、导出

数据数据创建数据来源主要包括用代码新建(data.frame),由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作),读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...tsv改变文件名而来,此时用csv打开会报错,该知识点用于防止部分代码错误应用csv套用tsv等#文件读写部分(文件位于R_02Rproject)#1.读取ex1.txt txt用read.table...= ls())load(file = "soft.Rdata") #使Rdata向量出现在环境内,本身有名称,无需赋值矩阵和列表矩阵矩阵内所有元素数据类型必须相同*警惕因数据类型不同导致矩阵强制转换引起报错...#取子集方法同数据t(m) #转置行与列,数据转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据列表列表内有多个数据或矩阵,可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1...不支持l$m1 #取出名为m1成分变量删除rm(l) #删除列表lrm(df1,df2) #删除变量df1与df2rm(list = ls()) #清空所有变量附作业答案及解释# 练习3-1# 1

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【Python】基于某些列删除数据重复值

subset:用来指定特定列,根据指定列对数据去重。默认值为None,即DataFrame中一行元素全部相同时才去除。...结果知,参数为默认值时,是在原数据copy上删除数据,保留重复数据第一条并返回新数据。 感兴趣可以打印name数据,删重操作不影响name值。...结果知,参数keep='last',是在原数据copy上删除数据,保留重复数据最后一条并返回新数据,不影响原始数据name。...结果知,参数keep=False,是把原数据copy一份,在copy数据删除全部重复数据,并返回新数据,不影响原始数据name。...如需处理这种类型数据去重问题,参见本公众号文章【Python】基于多列组合删除数据重复值。 -end-

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R语言】根据映射关系来替换数据内容

前面给大家介绍过☞R替换函数gsub,还给大家举了一个临床样本分类具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据数据进行替换。...例如将数据转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体例子来进行分享。...接下来我们要做就是将第四列注释信息,转录本ID替换成相应基因名字。我们给大家分享三种不同方法。...=1) #读入CDs区域坐标文件 bed=read.table("5gene_CDs.bed",sep="\t") #第四列提取转录本信息,这里用了正则表达式, #括号匹配到内容会存放在\\1...参考资料: ☞R替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA反向互补序列

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R语言基础-向量、矩阵、数据列表相关操作

三个a分别对应了k1,12个随机数前三个值,那条线是三个值中位数(不是平均值哦)3.向量、数据、矩阵、列表#先简单介绍下这些名字吧。# 1.向量是组成数据以及矩阵基本单位。...3.1 数据来源# (1)用代码新建# (2)由已有数据转换或处理得到# (3)读取表格文件# (4)R语言内置数据3.1.1 新建和读取数据df1 <- data.frame(gene = paste0...# 1.用‘数据’$+tab#如果没反应就手动敲一下列名,然后删掉再tab。df1$score #代码意思是:df1这个数据取score那列。...# 2.用坐标df1[2,2] #取数据第2行、第2列## [1] "up"df1[2,] #取数据第2行,由于取行会保留数据一部分属性,因此行名和列名会反馈给你。...','r2','r3','r4')colnames(df1)[2] = 'CHANGE' 3.1.6 两个数据链接#随便建两个数据test1 <- data.frame(name = c('jimmy

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R语言之数据合并

1.纵向合并:rbind( ) 要纵向合并两个数据,可以使用 rbind( )函数。被合并两个数据必须拥有相同变量,这种合并通常用于向数据添加观测。...横向合并:cbind ( ) 要横向合并两个数据,可以使用 cbind( ) 函数。用于合并两个数据必须拥有相同行数,而且要以相同顺序排列。这种合并通常用于向数据添加变量。...v.names:这是一个字符串,表示要重塑值变量名称。在这种情况下,"conc"表示原始数据浓度变量。 idvar:这是一个字符串或向量,表示标识变量名称或变量列表。...在对医学数据进行分析之前,通常情况下应先把数据集转换为长格式,因为 R 大多数函数都支持这种格式数据。...tidyr 包 gather() 和 spread() 同样可以用于长型、宽型数据类型转换,详见 Cookbook for R

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【Python】基于多列组合删除数据重复值

最近公司在做关联图谱项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据重复值,两列中元素顺序可能是相反。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据重复值问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列数据,希望根据列name1和name2组合(在两行顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据重复值') #把路径改为数据存放路径 df =...由于原始数据hive sql跑出来,表示商户号之间关系数据,merchant_r和merchant_l存在组合重复现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据重复值问题,只要把代码取两列代码变成多列即可。

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Day5:R语言课程(数据、矩阵、列表取子集)

学习目标 演示如何现有的数据结构取子集,合并及创建新数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...关键是要写逗号,让R知道你正在访问二维数据结构: metadata[3, ] # vector containing all elements in the 3rd row 如果数据中选择特定列...在某些情况下,如果使用脚本添加或删除列,则变量列号可能会更改。因此,最好使用列名来引用特定变量,这样可以使代码更易于阅读,并且您意图更加清晰。...metadata列表组件中提取celltype列。celltype值仅选择最后5个值。 ---- 为列表组件命名有助于识别每个列表组件包含内容,也更容易列表组件中提取值。...random列表中提取向量 age第三个元素。 random列表数据 metadata中提取基因型信息。 ---- 3.导出文件 到目前为止只修改了R数据; 文件保持不变。

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python:删除列表特定元素几种方法

,这个列表只由连续字母和空字符组成,然后把列表所有空字符删除,最后把列表最后一项长度返回即可; 所以现在问题就转化为:如何删除一个列表特定元素,这里的话,就是删除列表空字符,即...== "": del temp[i] return len(temp[-1]) 方法4: 拷贝原列表,然后遍历拷贝列表来找出空字符,最后再原列表删除空字符...新列表元素与原列表完全相同 然后遍历新列表,当遇到某个元素值为1时,就在原列表把这个元素删掉(使用列表remove方法删除),因为remove在删除元素时,只会删掉遇到第一个目标元素,所以我们继续遍历新列表...,如果再遇到1,就继续在原列表删除 最终遍历完新列表,也就会在原列表把所有1都删掉了 上述代码temp[:]是拷贝原列表得到新列表一个方法,也可以通过如下方法复制得到一个新列表 1...new_temp = list(temp) 3 >>> new_temp = temp*1 4 >>> import copy >>> new_temp = copy.copy(temp) 关于原地删除列表特定元素方法

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基因集合数据列表和对象形式

通常拿到了上下调差异基因列表,然后说GO/KEGG数据库注释,指的是超几何分布检验。...这些都离不开生物学功能数据库,但是数据库不仅仅是GO/KEGG哦,目前最齐全应该是属于 MSigDB(Molecular Signatures Database)数据定义了已知基因集合:http...,因为数据不能是不整齐,所以没办法是宽,每个基因集合里面的基因个数不一样,大概率都是不整齐。...(glist)) 这样列表如果想转换成为前面的数据也很容易: TERM2GENE = do.call(rbind, lapply(names(genes_to_check), function(...x){ data.frame(gs_name=x,gene_symbol=glist[[x]]) })) 对象(遵循MSigDBgmt文件标准) 前面的数据或者列表,要弄成对象就比较麻烦了,需要做一些转换

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VBA实战技巧16:用户窗体文本复制数据

有时候,我们需要从用户窗体文本复制数据,然后将其粘贴到其他地方。下面举例说明具体操作方法。 示例一:如下图1所示,在示例窗体中有一个文本和一个命令按钮。...当用户窗体被激活时,文本自动显示文字“完美Excel”,单击“复制”按钮后,文本数据会被复制到剪贴板。 ? 图1:带有文本和命令按钮用户窗体 首先,按图1设计好用户窗体界面。...CommandButton1_Click() With myClipboard .SetText Me.TextBox1.Text .PutInClipboard End WithEnd Sub 在图1所示用户窗体添加一个文本...,上述代码后面添加一句代码: Me.TextBox2.Paste 运行后结果如下图2所示。...图2 示例二:如下图3所示,在用户窗体中有多个文本,要求单击按钮后将有数据文本数据全部复制到剪贴板。 ? 图3:带有6个文本和1个命令按钮用户窗体 首先,按图3设计好用户窗体界面。

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seaborn可视化数据多个列元素

seaborn提供了一个快速展示数据列元素分布和相互关系函数,即pairplot函数,该函数会自动选取数据中值为数字列元素,通过方阵形式展现其分布和关系,其中对角线用于展示各个列元素分布情况...函数自动选了数据3列元素进行可视化,对角线上,以直方图形式展示每列元素分布,而关于对角线堆成上,下半角则用于可视化两列之间关系,默认可视化形式是散点图,该函数常用参数有以下几个 ###...# 1. corner 上下三角矩阵区域元素实际上是重复,通过corner参数,可以控制只显示图形一半,避免重复,用法如下 >>> sns.pairplot(df, corner=True) >>...#### 3、 x_vars和y_vars 默认情况下,程序会对数据中所有的数值列进行可视化,通过x_vars和y_vars可以用列名称来指定我们需要可视化列,用法如下 >>> sns.pairplot...通过pairpplot函数,可以同时展示数据多个数值型列元素关系,在快速探究一组数据分布时,非常好用。

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