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如何随机选择vcf文件的变异位点

现在做群体基因组的论文大部分会公开自己论文分析的变异检测结果,通常是vcf文件,我们自己可以把vcf文件下载下来试着复现论文中的内容,有时候vcf文件过大,每一步处理起来都会花费比较长的时间。...有时候就想把这个vcf文件缩小,随机选择一部分。 查了一下,没有找到现成的工具或者脚本。尝试自己写脚本,没有思路。...这个函数随机生成一个小于1的数,如果我们想要随机取vcf文件的10%,就设置random.random()<0.1,符合这个条件就输出行。最后输出的行就是所有的行的10%左右。...如果想要每次都输出相同的内容,就设置随机数种子 random.seed(123)。...运行 python randomSelectRowsFromVCF.py tiny.vcf tiny.out.vcf 1 123 四个位置参数分别是 输入文件 输出文件 随机选取的比例(0-100)

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19.JAVA-文件解析json、并写入Json文件(详解)

//name为名称,值对为"john"字符串 值对类型共分为: 数字(整数或浮点数) 字符串(在双引号) 逻辑值(true 或 false) 数组(在方括号[]) 对象(在花括号{}) null...包使用 在www.json.org上公布了很多JAVA下的json解析工具(还有C/C++等等相关的),其中org.jsonjson-lib比较简单,两者使用上差不多,这里我们使用org.json,org.json...q=g:org.json%20AND%20a:json&core=gav 3.json解析 3.1解析步骤 首先通过new JSONObject(String)来构造一个json对象,并将json字符串传递进来...对象 JSONObject obj = new JSONObject(text.substring(text.indexOf("{"))); //过滤读出的utf-8前三个标签字节,{...,则通过JSONObject .accumulate (key,value)来写入 最后通过JSONObject .toString()把数据导入到文件. 4.2写示例如下: @Test public

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使用生成式对抗网络随机噪声创建数据

你可以给它一点点的随机噪声作为输入,它可以产生卧室,鸟类或任何它被训练产生的真实图像。 所有科学家都同意的一件事是我们需要更多的数据。...然而,为了有用,新的数据必须足够现实,以便我们生成的数据获得的任何见解仍然适用于真实的数据。如果你正在训练一只猫来捕捉老鼠,而你正在使用假老鼠,那么最好确保假老鼠看起来像老鼠。...为什么选择GAN?...训练一个单一的神经网络可能是困难的,因为涉及的选择的数量:体系结构,激活函数,优化方法,学习率和辍学率,仅举几例。 GAN将所有这些选择加倍,并增加新的复杂性。...我们可以尝试从未经训练的GAN和训练良好的GAN添加生成的数据,以测试生成的数据是否比随机噪声好。

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Excel实战技巧:Excel预测的正态分布返回随机

但与大多数在Excel创建的模型不同,蒙特卡罗分析使用随机数来生成关键假设。 例如,如果你一个月的最佳销售量是120,而最坏的销售量是80,你将使用随机数在这些限制之间进行选择。...或者,如果你的最高可能销售成本是40%,而最低可能成本是30%,将使用另一个随机数在这些限制之间进行选择。 使用这种方法,每次重新计算工作簿时,模型都会为你提供修改后的预测。...图3 也就是说,一旦我们定义了假设的边界,就通常希望随机数是中心加权的。那么,如何才能做到这一点呢?如何正态分布返回一个随机数?...因此,这是均值为95且标准差为12.5的正态分布返回随机数的公式: =NORM.INV(RAND(), 95, 12.5) 现在让我们检查一下这个公式是否提供给了我们预期的结果。...该图表很容易证明我们已经通过组合NORM.INV函数和RAND函数完成了我们想要的:我们现在有一种方法可以正态分布返回随机数。

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.net 温故知新:【8】.NET 的配置xml转向json

目前.NET 的配置是使用一个或多个配置提供程序执行的。...配置提供程序使用各种配置源键值对读取配置数据,这些配置程序稍后我们会看到,读取的配置源可以是如下这些: 设置文件,appsettings.json 环境变量 Azure Key Vault Azure...使用json提供程序读取json配置 new一个ConfigurationBuilder,添加json配置,AddJsonFile是在包的IConfigurationBuilder扩展方法,其它配置提供程序也是用这种扩展方法实现...; Console.ReadLine(); } 可以看到已经取到json配置文件的值了,配置值可以包含分层数据。 分层对象使用配置键的 : 分隔符表示。...里面已经读取了json的数据存储在Data数组

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在Scrapy如何利用CSS选择网页采集目标数据——详细教程(下篇)

点击上方“Python爬虫与数据挖掘”,进行关注 /前言/ 前几天给大家分享了Xpath语法的简易使用教程,没来得及上车的小伙伴可以戳这篇文章:在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据...——详细教程(上篇)、在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据——详细教程(下篇)、在Scrapy如何利用CSS选择网页采集目标数据——详细教程(上篇)。...之前还给大家分享了在Scrapy如何利用CSS选择网页采集目标数据——详细教程(上篇),没来得及上车的小伙伴可以戳进去看看,今天继续上篇的内容往下进行。...只不过CSS表达式和Xpath表达式在语法上有些不同,对前端熟悉的朋友可以优先考虑CSS选择器,当然小伙伴们在具体应用的过程,直接根据自己的喜好去使用相关的选择器即可。...CSS选择网页采集目标数据——详细教程(上篇) 在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据——详细教程(下篇) 在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据——详细教程

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在Scrapy如何利用CSS选择网页采集目标数据——详细教程(上篇)

点击上方“Python爬虫与数据挖掘”,进行关注 /前言/ 前几天给大家分享了Xpath语法的简易使用教程,没来得及上车的小伙伴可以戳这篇文章:在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据...——详细教程(上篇)、在Scrapy如何利用Xpath选择网页采集目标数据——详细教程(下篇)。...今天小编给大家介绍Scrapy另外一种选择器,即大家经常听说的CSS选择器。.../CSS基础/ CSS选择器和Xpath选择器的功能是一致的,都是帮助我们去定位网页结构的某一个具体的元素,但是在语法表达上有区别。...4、根据网页结构,我们可轻易的写出发布日期的CSS表达式,可以在scrapy shell先进行测试,再将选择器表达式写入爬虫文件,详情如下图所示。 ?

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使用Django数据库随机取N条记录的不同方法及其性能实测

是的,你派mysql创建一百万个随机数,这要点时间:) 几个小时或几天后,当他干完这活,他要排序。是的,你排mysql去排序一个一百万行的,最糟糕的表(说他最糟糕是因为排序的键是随机的)。...;) 注意:只是稍微说一句,得注意到mysql一开始会试着在内存创建临时表。当内存不够了,他将会把所有东西放在硬盘上,所以你会因为近乎于整个过程的I/O瓶颈而雪上加霜。...这样如果你result = random.sample(Record.objects.all(),n) 这样做的话,全部的Queryset将会转换成list,然后从中随机选择。...你是打算把它存储在一个有百万元素的list,还是愿意一个一个的query? ” 在上边Yeo的回答,freakish回复道:“.count的性能是基于数据库的。...先写了个脚本 在manage.py shell调用了下 结果让我震惊了。

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