Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理,并且已经包含了Python和相关的配套工具。...设置国内镜像源 由于 conda默认是官网的镜像源,某些大包下载速度感人,再加上不确定的墙,雪上加霜,依赖很多的包下载不仅速度差,往往还会导致下载失败 conda config --add channels...安装py3.5 |激活环境(指定系统默认版本py) linux mac :source activate py35 (py35是刚起的名,不是填python的版本) windows: activate...image.png 安装 py包 安装 virtualenv conda install virtualenv 查看 已经安装的包列表 conda list 查看 指定环境下的py包 conda...安装virtualenv 会像pip install 一样自动安装依赖 修改python的path vim ~/.bash_profile
新建conda环境并激活进入 因为conda环境还挺大,所以我在空间大的地方,新建文件夹R4.1_and_Rstudio 「新建环境:」 conda create -p /mnt/data/R4.1_and_Rstudio...其它人用Rstudio-server安装R包 因为现在Rstudio-server用的是conda环境中的R4.1,它会在conda环境中有一个library,普通用户没有写入的权限,安装R包时会在自己的路径下自动新建一个...如果安装包出错,就进入conda的环境,安装即可,绝对可以成功。 特别好使! 10....总结 1,conda新建环境安装R4.1.0,因为是全新的环境,可以安装任何包都不会报错,如果报错了,就分开安装,然后再安装,一般都能解决问题。...2,外部是可以用conda环境中的程序的,指定路径就行。
但是写教程的时候,发现自己没有conda,默认的Python版本也太低了,很多教程都没办法复现。...打开conda官方网站,查看版本和下载链接:https://repo.anaconda.com/miniconda/ 安装conda的方法代码如下: # 首先下载文件,20M/S的话需要几秒钟即可 cd...,记得是一路yes下去 bash Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh # 安装成功后需要更新系统环境变量文件 # source ~/.bashrc source ....这个最新版,默认安装的软件也是很新: ## Package Plan ## environment location: /Users/jmzeng/miniconda3 added / updated...第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我。
官网: https://www.anaconda.com/ conda的安装 下载安装包 -- bash 安装 -- 接受协议 -- 选择默认安装路径(回车) -- 重新激活环境 -- 调用帮助文档 #...conda 的帮助文档 conda --help 配置镜像 我们使用 conda 安装软件时,conda 会去 channel 中搜索软件,如果使用的服务器是在国内,channel 就选择国内的,推荐清华...=3的软件作为依赖 # 查看当前conda环境 conda info -e conda env list # 每次运行前,激活创建的小环境rna conda activate rna # 退出小环境...conda deactivate 在小环境中安装生信软件 注:软件都要安装在小环境中,不要安装在 base # 激活环境 conda activate rna # 安装 fastqc 软件 conda...f rna.yaml conda env create -n R4 -f R4.yaml 或者试试导入下面这个新的配置文件: 从钉钉群里下载RNA.env.txt conda create --name
什么是conda? conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装多个版本的软件包及其依赖关系,并在它们之间轻松切换。...通过conda安装软件 1.省时省力省bug 2.方便管理和更新 3.安装时不用配置环境变量 01 安装anaconda/miniconda 首先进入anaconda的网址 https://www.anaconda.com...,软件会询问安装路径,如果是个人使用,默认安装路径就可;如果你是管理员,最好自己创建一个公共的文件夹。...02 添加环境变量 如果在安装conda的最后一步时,你选择了yes,那么它会自动给你环境变量,直接source一下即可使用。...install r -y # -y表示yes,安装过程中所有的提示统统帮你yes 3.卸载软件 conda remove r -y 4.查看conda已安装的软件 conda list 因为我用的
软件列表: ntfs-3g 如果你的文件硬盘是ntfs格式,那么你需要ntfs-3g才可以顺利访问。...安装教程 sshfs 如果你使用远程服务器工作,并且涉及到代码编写等工作,使用SSH协议 将远程目录映射到本地似乎是一个不错地选择。sshfs可以做到这一点。...安装教程 如果你对centos古老的软件源感到不满,可以参考升级教程对sshfs进行升级。 升级教程 update gcc centos7 的gcc版本不支持C++11, 需要手动升级。...使用conda管理python环境 update git 系统自带的git有些旧,可以考虑从源码安装新版本git。安装过程很顺利,没有坑。...update fuse 在2中升级sshfs时谈到了fuse的升级。
在安装pytorch的时候因为源的问题折腾了非常久,在这记录以下。...During handling of the above exception, another exception occurred: 我大概就截图这么多吧,大概就这种类型的错误。...网上的办法 设置源: conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda.../anaconda/cloud/pytorch/ 执行安装命令 conda install pytorch-cpu==1.1.0 torchvision-cpu==0.3.0 cpuonly 注意:在执行的安装...pytorch的命令的最后,一定要将 -c pytorch 删除掉 大概就这样。
Conda主要是解决软件安装的问题1.1 下载Condawget 相当于Linux上的迅雷wget -c 断点续传 - - continue1.2 安装Miniconda3安装后需要重新加载查看conda...常用conda install (主命令+子命令)1.3 配置频道要配置好conda的频道才能用conda安装该频道的软件1.找到需要添加的频道2.复制链接地址3.添加conda频道的命令:conda...1.conda会改变原来设置好的环境2.不同的软件的依赖会互相冲突3.方便项目管理:基因组、转录组、Chip-seq……不要往base环境里安装任何软件包1.4.2 如何创建独立小环境conda create...list/conda info --env列出已经存在的小环境1.4.3 小环境的修改与删除1.4.4 使用conda安装软件1.4.4.1 需要安装哪些软件?...1.4.4.2 哪些软件可以使用conda来安装?在安装之前确保小环境被激活conda可以一次安装多个软件,但是容易遇到报错1.4.4.3 如何指定安装的软件的版本?
安装 Anaconda 1)打开terminal; 2)打开下载文件的位置 3)运行 .sh 文件:bash (AnacondaXXXXX-Linux-x86_64.sh 用table键代码补全即可)...比如我是 bash Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh 进入注册信息页面,输入yes; 阅读注册信息,然后输入yes;查看文件即将安装的位置,按enter,即可安装, 安装完成后...,收到加入环境变量的提示信息,输入yes 我们执行: sudo gedit ~/.bashrc 然后在打开的文件最后加两行命令,用于配置环境 export PATH="~/anaconda3/bin":...重启终端,会看到命令行前面出现(base)环境,即可默认使用Anaconda3; 可以使用conda -V验证是否安装完毕,若安装完成,则会出现版本号。...conda -V
一、引言在 Linux 系统中安装 conda 环境可以为您提供便捷的 Python 环境管理和包管理功能。本教程将详细介绍在 Linux 系统中安装 conda 的步骤。...三、安装 Miniconda访问 Miniconda 的官方下载页面(https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html ),选择适合您 Linux 系统的版本...--version ,如果能正确显示 conda 的版本信息,则说明安装成功。...六、创建和管理 conda 环境创建新环境: conda create --name myenv python=3.8 (创建名为 myenv 的 Python 3.8 环境)激活环境: conda...activate myenv安装包: conda install numpy (在当前激活的环境中安装 numpy 包)退出环境: conda deactivate七、总结通过以上步骤,您已经成功在
conda安装Tensorflow2.9的GPU版本 1、新建环境 2、激活环境 3、cuda与cudnn的版本选择 4、安装tensorflow2.9-gpu 5、验证是否安装成功 6、安装ipykernel...7、镜像 7.1 conda镜像 7.2 conda中配置pip镜像 有的API只有高版本的tensorflow有,所以这里再装个tensorflow2.9,我看了下,官网最新版本是2.10...1、新建环境 conda create -n tf2.9 python
一、前言 Pycharm是Python的集成开发环境,本文将介绍如何安装Pycharm并使用学生邮箱免费激活。 二、实验环境 本实验是在Windows 10系统下进行Pycharm的安装与激活。...这里专门强调实验环境的原因是市面上不仅有Windows操作系统,还有Linux以及IOS等操作系统,在不同的操作系统下的步骤是略有不同的,软件的兼容性是不同的。...步骤六:选择软件安装路径,这里选择的是D盘,选一个存储空间大一些磁盘作为安装目录,建议不要选择系统盘,比较占空间,另外需要注意的是,为了避免一些不必要的错误,对于一些国外的软件,安装路径一定要写成全英文...步骤二十三:返回Pycharm,点击Activate,显示激活成功,免费使用日期从2021.12.31至2022.12.29,期限为1年,假如1年的期限到了,使用学生邮箱再次激活即可。...五、总结与展望 本文介绍了Pycharm的安装与激活,如果只是为了完成毕业设计或者做论文的实验,社区版的功能就足够了,只需要安装社区版的Pycharm就可以了,社区版的Pycahrm不需要激活,所以激活步骤可以省略
conda自动开启/关闭激活 参考:https://www.cnblogs.com/clemente/p/11231539.html conda activate #默认激活base环境 conda...activate xxx #激活xxx环境 conda deactivate #关闭当前环境 conda config --set auto_activate_base false #关闭自动激活状态...conda config --set auto_activate_base true #关闭自动激活状态 Conda 安装本地包 有时conda或pip源下载速度太慢,install a过程中会中断连接导致压缩包下载不全...xxx #删除xxx包 pip show xxx #展示指定的已安装的xxx包 pip check xxx #检查xxx包的依赖是否合适 pip和conda批量导出、安装组件(requirements.txt...问题出现的主要原因:用户没有对.conda文件夹的读写权限,造成其原因是由于在安装conda时使用了管理员权限。
之前我们在教程:为什么要用conda来安装一个R包 提到过常规的conda命令 都是基于Linux 操作平台,比如Linux各个用户里面安装自己的conda,每个用户独立操作,安装方法代码如下: #...安装aspera,新建download子环境,然后在该环境下面安装指定软件 ,就可以高速下载 不同 数据集的fastq文件 ,代码如下: conda create -n download conda...,每次运行都需要激活不同环境,也是很麻烦,所以我们就会把十几款软件都放在rna这个小环境里面。...查看自己的镜像 代码 conda config --get channels 可以看到自己的镜像配置,相当于修改~/.condarc里面内容,目前不同地区镜像效果大家最好是实时查询一下。...把安装好的环境导出成为yaml文件 前面的RNA-seq数据处理环境,我顺利安装了十几个软件而且没有冲突,就可以 conda env export - 成为一个yaml文件,如下所示: conda env
许多Python项目中都包含了requirements.txt文件,该文件记录了当前程序的所有依赖包及其精确版本号。...生成requirement.txt文件 pip freeze > requirements.txt 安装requirement.txt文件依赖 pip install -r requirements.txt...除了使用pip命令来生成及安装requirement.txt文件以外,也可以使用conda命令来安装。...conda install --yes --file requirements.txt 但是这里存在一个问题,如果requirements.txt中的包不可用,则会抛出“无包错误”。...| pip install 也可以这样子操作 导出到.yml文件 conda env export > freeze.yml 直接创建conda环境 conda env create -f
这是我写Ng的dp作业做的准备,好像需要安装特定版本的tensorflow 根据https://blog.csdn.net/ccgcccccc/article/details/89058445的配置要求来配置文件...因此注意: pip list 查看pip的安装目录 然后会找到名字里有tensor的一堆东西都卸载了,还有要卸载protobuf,之后再重装tensorflow即可。...tensorflow -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple conda安装tensorflow稍微麻烦一点 打开anaconda prompt,要在conda...anaconda navigator,将base改为tensorflow 以下是以后会用到的对虚拟环境的操作: 查看虚拟环境 conda env list conda info -e 使用虚拟环境 Linux...conda] deactivate 删除虚拟环境 conda remove -n env_name --all pycharm中使用特定的conda虚拟环境 Pycharm找到设置: 参考链接
本文就分享一下怎么用激活布丁全版本激活JetBrains产品!很香~ 先看效果 安装 这里以WebStorm为例,其他软件都一样的。...进入官网下载安装包 官网:https://www.jetbrains.com/webstorm/ 开始安装 双击下载好的程序 点击下一步 选择你喜欢的位置,然后点击下一步 确认一下变量选项,不知道咋选的话就都选上...激活 正戏开始了,该部分激活插件、激活码地址获取方式:https://code.jiumoz.com/buy/11 下载与运行激活插件 打开获取到的网址,点击压缩包地址开始下载 解压下载的压缩包...打开安装好的软件,会提示激活,不要慌,往下看 使用激活码激活 打开上面获取的地址,在对应的软件下进行激活码的获取。 返回软件,点击激活码,然后将复制的激活码粘贴进去点击激活即可。...这就激活完成啦,点击Continue就行了 配置 汉化 汉化就很简单了,主要是官方有了插件,不用费尽心思去找插件,最后还各种问题了。 点击插件选项,搜索插件,点击安装,安装后重启即可。
安装conda--linux 的应用商店anaconda=miniconda+150 high quality packages=conda+Python+base packages安装步骤搜索“miniconda...source ~/.bashrc #激活conda添加镜像conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda.../anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes使用condaconda list #查看安装的软件conda install fastqc...info --envsconda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y #建立rnaseq的conda环境,指定python版本是3,安装软件...fastqc、trimmomatic(这两个可以一步完成)conda activate rna-seq #激活新的conda环境conda deactivate #退出当前环境
语法高亮、Project 管理、代码跳转、智能提示、自动完成、单元测试、版本控制等 安装 我们从PyCharm 官网下载 PyCharm 的安装包,这里我们下载专业版,专业版是收费的(可以使用激活码激活...),社区版是免费的 双击进行安装,第一步直接 NEXT 就行了 第二步:选择你的安装目录 选择安装目录 第三步:选择 PyCharm 作为打开.py 文件的默认安装程序,以及安装的位数,我选择 64 位...,我们要进行配置 默认点击 OK 这里的话我们就直接点击 Ok 就行了 激活 第七步:也就是比较重要的激活了 这里我们使用激活码激活,之前有一篇文章IntelliJ IDEA PhpStorm 2017.1...”添加到 hosts 文件中,然后点击 OK 我们就激活成功了~ 安装成功 其他的直接右下角就行,开始奔放使用吧 沈唁志|一个PHPer的成长之路!...原创文章采用CC BY-NC-SA 4.0协议进行许可,转载请注明:转载自:Windows下PyCharm的安装配置与激活码激活
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