当前时间为:2018-11-27 10:41:47 当前时间为:2018-11-27 10:41:47.392
which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素 sort 升序排列元素 rev 反转所有元素 order 获取排序后的索引...table 返回频数表 cut 将数据分割为几部分 split 按照指定条件分割数据 rbind 行合并 cbind 列合并 merge 按照指定列合并矩阵或者数据框 一、数据合并 1、merge(...2 7 2 其中，all=T代表全连接，all.x=T代表左联结；all.y=T代表右连接 2、dplyr包 dplyr包的数据合并， 一般用left_join(x,y,by="name") 以x...—————————————————————不等长合并 #如何解决合并时数据不等长问题——两种方法：do.call函数以及rbind.fill函数（plyr包） #rbind.fill函数只能合并数据框格式...#do.call函数在数据框中执行函数（函数，数据列） library("plyr") #加载获取rbind.fill函数 #第一种方法 list1<-list() list1[[1]]=data.frame
，d表示数据框格式，l表示列表，a表示数组，_则表示没有输出。...参数注释： data：函数处理的数据框； variables：要进行拆分的变量名称，传递变量的格式是：....tidyr包主要涉及：gather（宽数据转为长数据），spread（长数据转为宽数据），separate（多列合并为一列）和unite（将一列分离为多列） （1）gather 使用gather()函数实现宽表转长表...（3）unite tidyr包中提供了unite函数，可以将列，变量以某种形式合并为一列，一个变量 unite语法如下： unite(data, col, sep = "_", remove = TRUE...日期值通常以文本的形式输入到R中，然后转化为以数值形式存储的日期变量。
1、获取数据 从 QQ 消息管理器中导出消息记录，保存的文本类型选择 txt 文件。这里获取的是某群从 2016-04-18 到 2016-05-07 期间的聊天记录，记录样本如下所示。...result3) <- c('hour','minutes','second')# 合并数据 newdata <- cbind(data,result1,result2,result3) # 转换日期为时间格式...newdata$date <- ymd(newdata$date) # 提取星期数据 newdata$wday <- wday(newdata$date)# 转换数据格式newdata$month...第一列是 IDtempdf <- data.frame(time=ymd(names(online.day)),online.day ) qplot(x=time,y=online.day ,ymin=...# 连续对话的次数，以三十分钟为间隔 newdata$realtime <- strptime(newdata$time,'%Y-%m-%d %H:%M')# 时间排序有问题，按时间重排数据
02 — tibble：高级数据框（data.frame升级版） ——数据（列）类型一目了然 tibble是R语言中一个用来替换data.frame类型的扩展的数据框，tibble继承了data.frame...，会自动添加列名 tibble，类型只能回收长度为1的输入 tibble，会懒加载参数，并按顺序运行 tibble，是tbl_df类型 tibble是data.frame的进化版，有如下优点：生成的数据框数据每列可以保持原来的数据格式...例如：x %>% f(y) 等价于 f(x,y) Rstudio中快捷键： ctrl+shift+m 以R中自带的iris（鸢尾花数据集）为例： > head(iris,n=3) Sepal.Length...这些函数允许在长数据格式（long data）和宽数据格式（wide data）之间进行转换（功能类似于reshape包，但是比reshape更好用，并且可以用于管道%>%连接）。...key #value：将原数据框中的所有值赋给一个新变量value #…：可以指定哪些列聚到同一列中 #na.rm：是否删除缺失值 widedata <- data.frame(person=c('Alex
对于data.frame大家应该很熟悉，它可以存储不同数据类型的向量数据。今天给大家介绍一个升级版的data.frame，其不仅可以存储不同数据类型还可以进行多列的并行运算。...首先看下此格式数据的生成： fread 自带的读入数据的函数，可以直接将txt,csv读入并生成相应的data.table格式数据。...as.data.table 将R对象转化为data.table格式的数据，其对象可以为列表，向量，data.frame。...列的选取也发生了改变，其中引入了list的别名 .() 进行数据筛选： DT[,y] DT[,.(y)] ?...其中数据各列的增加，删除，修改，用到的函数是:=。 DT[,y1:=y] DT[,y:=NULL] DT[,y:=(y+1)] ?
如果被赋值的元素原来不存在，则列表延伸以包含该新 元素。...其中：paste之后会有如vector一般的格式，可以用[i]来调用。...#如何解决合并时数据不等长问题——两种方法：do.call函数以及rbind.fill函数（plyr包） #rbind.fill函数只能合并数据框格式 #do.call函数在数据框中执行函数（函数，数据列...） library("plyr") #加载获取rbind.fill函数 #第一种方法 list1<-list() list1[[1]]=data.frame(t(data.frame(Job_Pwordseg.ct...(data.frame(t(data.frame(Job_Pwordseg.ct[1]))),data.frame(t(data.frame(Job_Pwordseg.ct[2])))) 得到了数据之后
电子版可在此处获取：http：//r4ds.had.co.nz/ 上面的不整齐数据是不整齐的，因为两个变量（Wins和Losses）存储在一列（Category）中。这是数据不整齐的常见方式。...您应该将包含多个变量的列的名称传递给key，并将包含多个变量值的列的名称传递给value。...gather()获取名称是值的列，key和valueas为两个参数。这次key是变量的名称，其值为列名，而value是值的名称，其值分布在多个列上。...如果您的数据以整齐的格式存储，您会发现分析单细胞RNA-seq数据要容易得多。幸运的是，我们通常用于促进单细胞RNA-seq分析的数据结构通常鼓励以整齐的方式存储您的数据。 ?...这是每个细胞中每个基因的读数，除以每个细胞的文库大小（以百万计）。 tpm：每百万的转录本。这是每个细胞中每个基因的转录物数量除以该细胞中转录物的总数（以百万计）。
data.frame生成指定数据框的列名及列的内容，如代码所示，此时列名不需添加""，df1为变量名，格式为列名=列的向量*matrix矩阵与向量一样只允许同一种数据类型，否则会被转换，可以理解为二维的向量...，data.frame数据框允许不同列不同的数据类型，但同一列只允许一种数据类型*数据框中括号内行在列前df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4),...""#直接读取如果失败，需要指定参数#ex1 <- read.table("ex1.txt") #读入该文件后会发现原文件被认为没有列名，列名被当作第一行，字符型与数值型在一起会将所有数值型改为字符型以满足向量同一类型...，需要分别指出作为公共列的列名也可以借助dplyr包中的函数test1 <- data.frame(name = c('jimmy','nicker','Damon','Sophie'),...test2,by="name") #取左边的右边没有的数据框的导出write.csv(soft,file = "soft.csv") #导出数据框为csv的函数,此处soft为变量名，soft.csv应该写全以提示阅读者
先看一个数据， data为data.frame格式 ? 进行转置 t(data) ? 数值型数据全部变成了字符型，怎么回事？其实是因为cluster那一列数据并不是数值型，而是字符型。...因为这一列代表某一群细胞，如cluster0.所以才会出现这个情况。 转置会先将data.frame用as.matrix()转成矩阵格式，然后再转置，最终得到一个矩阵。...因为data.frame可以存放多个类型的数据，但matrix只能存放同一种数据类型，对于输入的data.frame而言,如果有字符型数据，那么整个data.frame的数值型数据都会被转成字符型·。
数据框有两个维度，分别表示行数和列数，可以用dim()函数来获取。数据框中的每个向量可以有一个名称，可以用names()函数来获取或设置。...若为TRUE，则会检查数据框中变量的名称，以确保它们是符合语法规范的变量名称且不重复。必要时，会进行调整（通过make.names函数）。...可以用dim()函数获取。...而数据框的行名和列名分别对应着数据框的行和列的标识符，可以用row.names()和colnames()函数来获取和设置。 行名：数据框的每一行都有一个行名，用于标识不同的行。...行名是一个字符向量，可以通过row.names()函数获取或设置。 列名：数据框的每一列都有一个列名，用于标识不同的列。列名是一个字符向量，可以通过colnames()函数获取或设置。
版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。...可见它是属于data.table和data.frame类，并且取列，维数，都可以采用data.frame的方法。...，而是允许处理的字符串在本机编码; quote,默认"""，如果以双引开头，fread强有力的处理里面的引号，如果失败了就会用其它尝试，如果设置quote="",默认引号不可用 strip.white...输出文件名,""意味着直接输出到操作台； append，如果TRUE,在原文件的后面添加； quote，如果"auto",因子和列名只有在他们需要的时候才会被加上双引号，例如该部分包括分隔符，或者以"...，写出去时list成员间以sep2分隔，它们是处于一列之内，然后内部再用字符分开； eol，行分隔符，默认Windows是"\r\n",其它的是"\n"； na,na值的表示，默认""； dec，
常规聚类热图绘制 无分类信息热图 无聚类热图 分割聚类树热图 多分组聚类热图 分组调色 显示文本 去除描边 字体相关 调整聚类树高 聚类方法选择 保存为图片 详细参数设置说明 设置工作目录 载入数据 获取数据子集...fontsize_number = 8, # 设置字体大小 number_color = '#4a4a4a', #设置颜色 number_format = '%.2f' # 设置显示格式...选择合适的文件格式，调整合适长宽，印刷或投稿选PDF，TIFF，EPS就好 文件默认存储在刚刚设置的工作目录里 ?...获取数据子集 # 截取表达矩阵的一部分数据来绘制热图 exp_ds = dataset[c(1:60),c(1:10)] 原始数据： ?...如果获取前5个基因和cell1与cell2的前3个样本，只需要执行 exp_ds = dataset[c(1:5),c(1:3,6:8)] ?
落在 TSS 区域的峰将在我们带注释的 GRanges 对象的注释列中标记为“启动子”。...annotatedPeaksGR_TSS$geneId) genesWithPeakInTSS[1:2] genesWithPeakInTSS 接下来，我们可以提取包含在 TxDb 对象中的所有基因，以用作我们用于通路富集的基因域...TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene) allGeneGR[1:2, ] allGeneGR allGeneIDs <- allGeneGR$gene_id 一旦我们有了相同格式的基因列表和基因域...在这里，我们将使用 msigdbr 包从 MSigDB 获取基因集。我们还可以运行 msigdbr_collections 函数来查看将用于访问基因集的类别和子类别代码。...这里我们将使用“H”来访问 Hallmark 基因集，最后我们需要得到一个数据框，其中第一列包含基因集的名称，第二列包含基因 ID。
其一是shiny+shinydashboard+诸多可视化系统及组件（图表、表格、文本信息），shinydashboard是相当于前端UI模板化的R语言api接口，你可以以R语法的格式去配置交互控件以及组织页面逻辑...（docx、pdf、及各种tex格式），而且可以输出html网页。...Page Navigation——导航页支持二级菜单选择 Multiple Columns 当然flexdashboard可以支持多列布局，只需要在代码中声明列参数即可，而且可以自定义各列的列宽。...Row Orientation 多行布局也多列布局很相似，仅需将声明列改为声明行即可。 ?...这里的icon支持直接从在线ui库中获取： Icon Sets You can specify icons from three different icon sets: Font Awesome——https
一.列表 列表就是信息资源的一种展示形式 1.列表及其应用 1)无序列表 无序列表由标签和标签组成,使用标签作为无序列表的声明,使用标签作为每个列表项的起始....定义列表的语法相对于有序和无序列表不太一样,它使用标签作为列表的开始,使用标签作为每个列表项的起始,而对于每个列表项的定义则使用标签来完成 语法: ...: >在video中虽然可以使用src属性链接视频路径,可是只能链接一种格式的视频,很难让每种浏览器都支持这种格式.所以就出现了source元素来解决这一问题,source元素嵌套在video...里面,并且可以出现多次,每个source元素对应一种格式的视频,这样,浏览器会在这些格式中选择自己可以识别的一种来进行播放 2)在video元素中指定controls属性可以在页面上以默认的方式进行播放控制... 3.经验: 1)通过source引入的视频文件的格式至少包括WebM和MPEG4 或 Ogg和MPEG4 2)通过source引入的音频文件的格式至少包括WAV和MP3 或 Ogg和MP3
这些数据可以让Excel或者VBA程序使用，方便完成一些高级操作，例如检查用户输入是否存在错误、存储数据有效性列表项、计算的中间值、特殊的常量，等等。...图1 其中： 1.在列A中，存放着设置数据有效性的列表项，这是一个级联列表，也就是说，在列D中的列表项为类别中的“水果、蔬菜”，在列E中的列表项根据列D中的数据显示水果列表“苹果、香蕉、桔子、梨”或者蔬菜列表...3.选择单元格区域D3:E12，设置条件格式如下图2所示。 ?...图2 也就是说，当单元格区域D3:E12所在单元格对应的列B中的单元格的值为True时，应用格式，即设置单元格背景色为红色，否则，正常显示。...小结 上面的示例利用隐藏区域（程序列）： 1.实现了数据有效性级联列表项目的存储。 2.判断数据是否满足工作表中设置的规划，利用条件格式设置进行提示，从而实现了对用户输入数据的自动检查。
> test <- data.frame(x = c( "a,b", "a,d", "b,c"));test x 1 a,b 2 a,d 3 b,c 使用separate，便可以对一列中的数据达到...对于待分离的对象（col），不必加上引号；但对于即将创建的新列（into），需要使用引号，由于是两列，这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。...使用，获取指定组别不同类型内容的统计数值。...（以小数点为分隔符）然后合并 head(iris) # 错误答案由于sep 会识别正则（....,Petal.Length_2, sep='.') tail(iris_unite) str(iris_unite) # 这里发现Petal.Length 格式为
获取相应散列桶槽分区上的BufMappingLock共享锁。 查找标签为'Tag_C'的条目，并从条目中获取buffer_id。本例中buffer_id为2。...第一，创建所需页面的buffer_tag（本例中buffer_tag为'Tag_E'）并计算其散列桶槽。 第二，以共享模式获取相应分区上的BufMappingLock。...从freelist中获取空缓冲区描述符，并将其钉住。在本例中所获的描述符：buffer_id=4。 以独占模式获取相应分区的BufMappingLock（此锁将在步骤（6）中被释放）。...以排他模式获取缓冲区表中旧表项所在分区上的BufMappingLock。...第二，以独占模式获取新表项所在分区上的BufMappingLock。 第三，将新表项插入缓冲区表中。 从缓冲表中删除旧表项，并释放旧表项所在分区的BufMappingLock。
我们可以看到里面有很多数据，我们挑选RSEM gene和Gene definitions (GENCODE19, GTEx7)(这个用来获取基因ID) 点击下载就可以哈。 ?...- fread("gencode.v19.genes.v7_model.patched_contigs.gtf.gz",data.table = F)#这一步至关重要，大家可以尝试变成T 然后看看数据格式...id$V9 这里我们发现第九列内容很多，然后画红线的就是我们需要获取的数据。 ? 看一下第三列 table(id$V3) 第三列有3种，我们这里需要的是GENE ?...获取只有gene的所有行 id1<- id[grepl("gene",id$V3),] 然后我们处理第九列 library(stringr) options(stringsAsFactors = F)...(x3))) 将细胞的名字全部取出来，变成数据框 因为我喜欢处理数据框 w3<- data.frame(n=colnames(x3), n2=rep(1,1021)) #建立相匹配的列
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
