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利用R绘制venn图（VennDiagram、eulerr、venneuler、limma）

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 最近对利用R绘制venn图进行了一些学习。...参考了网上很多资料： 【R作图】在R中绘制韦恩图的几种方法 和 一些漂亮的venn图 如何使用R来绘制韦恩图（Venn Diagram） venn.diagram: Make a Venn Diagram...另外再推荐一个在线绘制venn图的网站（除了广告较多都挺好的）：https://www.meta-chart.com/venn 具体包括下面三个包： limma、venneuler、VennDiagram...---- venneuler 接着是venneuler，这个包绘制出来的图案就比上一个包要漂亮了许多，如下图所示： vd venneuler(c(A=0.3, B=0.3, C=1.1, "A&C...（这里不将所有的图贴上来，因为贴上来的图总是图裂显示不出来，所以只是将代码copy过来，具体可以自己运行参照着语句进行对比） setwd('D:\\Pictures\\Blog\\venn') library

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    这就是传说中你不了解的的气泡图

    今天我们来聊一聊传说中的气泡图，气泡图是散点图的一种形式，是预测数据趋势的一种图形，一般在大量的数据调研和数据分析的时候会用到散点或者气泡，但是散点和气泡的区别是，气泡图在分析的时候维度更加的多，有...气泡图的制作中，对于接对象的选择是通过颜色的不同来区分的，在我们的案例中，我们有员工，主管，经理，总监，这个几个角色的的气泡图的制作中是通过数据的编辑，一个一个进行添加的，如下图： 在我们L1-2 人力资源数据分析...- 进阶版的 训练营中，有几个同学对案例的气泡图进行了提问，我们来分享下： Q1：在人员离职的数据分析中，我们的 几个维度是怎么选的，我可以通过这几个维度来分析离职人员哪个维度是最重要的吗？...A1: 人员离职的气泡图是对离职人员的画像，我们希望通过画像来分析离职最多的人员是哪类人，所以我们在选择分析维度的时候，是从人员结构数据来的，并且是基于可以量化的数据，在人员结构中，我们比较关注的是 年龄...，工龄，薪资等这些维度，所以我们在分析的时候以这几个维度来。

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    近9分的生信杂志发了一篇Venn图工具大比拼

    文氏图是被广泛用于图形化描绘多个数据集之间的并集，交集和区别的工具，目前已经开发了大量的程序来生成文氏图，以用于各个研究领域。但是，当前尚未研究对这些工具进行全面的比较和综述。...在本文中，我们收集了文氏图生成器（即，仅用文氏图用于可视化几个数据集之间的关系）和维恩图应用程序工具（即，分析生物数据之间的关系并在文氏图中进行可视化）并比较它们的功能如下：生成高质量图表的能力；每个程序能处理的最大数据集...我们还根据图形布局来评估文氏图生成器的图片美化参数，并简要概述了最流行的文氏图应用工具的功能特性。最后，我们讨论了文氏图应用程序工具所面临的挑战，并对文氏图在生物信息学中的应用提供了新视角。...我们的目标是协助用户选择合适的工具来分析和可视化他们自定义的数据集。 王教授团队是OrthoVenn系列软件的开发团队，于2019年推出OrthoVenn2，对venn图和软件开发有很多经验。...推荐EVenn，全新改版，上传一个文件，支持全部图形绘制 http://www.ehbio.com/test/venn/#/

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    UpSetR 关联的 venneuler 包安装笔记

    背景 R 语言中的 venneuler 是一个用于计算并显示韦恩图和欧拉图的包，这个包在 CRAN 上的最后一个版本是 1.1.0，发布于 2011-08-10，它是一个基于 rJava 依赖的 R 包...(m > 0) plot(v) # with weights v venneuler(m) plot(v) 在 venneuler 包，作者引入了一个的用于描述集合交集的向量，这一点后来也被UpSetR...早在 18 年 6 月的时候，我公众号上写过一篇关于UpSetR的学习笔记《UpSetR：多数据集绘图可视化处理利器》，提到过一下venneuler，当时也没怎么留意，直到前不久有个读者在使用UpSetR...，在使用library(venneuler)后上面提到的问题也仍然会出现。...conda环境中openjdk，r-rjava，r-venneuler都可以安装成功，但就是用不了，这是我在 conda 中遇到的问题，暂时没找到解决方法。

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    填坑填坑，万字+28张图会一会传说中的Raft协议

    JRaft框架来讲解 本文我大致分为了下面三个方面的内容： 第一个方面就是讲解在Raft协议中，一个请求在整个集群中的处理过程 第二个方面就是讲解Leader选举相关的内容 第三个方面就是讲一讲JRaft...什么意思呢，画张图你就明白了 如上图，整个集群有5个节点，一个Leader，四个Follower 按照图上复制进度我们可以看出，已经被超过半数节点成功复制的LogEntry就是index=4的那个LogEntry...到这，一个请求就算真正完成了 按照传统，这里画一张图来总结整个请求的一生 3、快照（Snapshot） 前面在说LogEntry留了这么一个问题 Raft协议会重写LogEntry日志文件来减小日志的大小么...节点时，此时就会进入下一个周期选举 周期会保存在每个节点的内存中，在一个已经选举稳定运行的集群中，每个节点的周期是一样的 前面在介绍LogEntry的时候，我说过暂时可以认为index全局唯一的 之所以这么说...当Follower可以发起选举的时候，并不会直接选举，而是先进行一波预选举 在原始的Raft协议中是没有预选举机制，预选举是JRaft框架做的优化 所谓预选举就是在正式选举之前去判断一下自己是不是有潜质

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    可以旋转的3D韦恩图你见过吗？

    导语 GUIDE ╲ 韦恩图是一种在科研文章中非常常见的图示法，比如在转录组数据中，常常会涉及到几千甚至上万的基因数量，有时为了研究需要，会分别获得两组或多组数据中具有某种特定功能或特点的基因集。...通过绘制韦恩图，可以直观的显示出这些特定功能的基因集中，哪些是组间共有的基因，哪些是每组独有的基因[PMID: 32388965]。...我们总结过几款简单易操作的在线韦恩图绘图工具[0代码绘制文氏图]，有很多小伙伴来私信讨论，今天我们再来分享几个R包。...韦恩图在文献中的应用 [PMID:32616488]Figure 1：失业和就业人群中CVD、PD、IC和RD的多病性。 [PMID: 32603365]Fig 2....= TRUE时使小球边缘光滑，多个集合旋转图形时显示窗口不稳定 ) 3D球形韦恩图，在R中的操作界面中是可以拖拉旋转的，但小编找了几个函数都没能保存，如果你有好的方法，欢迎大家在后台留言~ （2）

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    图算法、图数据库在风控场景的应用

    导读：本文将分享图算法在风控中的应用。 今天的介绍会围绕下面四点展开： 图算法和风控简介 图算法在风控的演化 相应平台的心得 展望未来 分享嘉宾｜汪浩然，互联网行业资深风控和图计算专家。...此时标签传播算法和半监督技术就开始在风控中使用。图神经网络的半监督学习，其学习能力和鲁棒性高于传统图算法。...常用离线图算法框架——GraphX 图片 早期尝试去做图的时候，主要是做图的最短路径，单机版很简单。在大厂数据量很大，会使用分布式的图学习。...在风控的特定场景下，还要对图的特定 Pattern 去进行挖掘。...两者难度是不一样的，在算法的复杂度特征上是会不一样的。 Q2：在风控场景中有遇到图模型的可解释性问题吗？怎么解决？ A2：这个其实是很有意思的问题。图模型的解释性，其实说句实话比其他模型要容易的。

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    GraphX 在图数据库 Nebula Graph 的图计算实践

    不同来源的异构数据间存在着千丝万缕的关联，这种数据之间隐藏的关联关系和网络结构特性对于数据分析至关重要，图计算就是以图作为数据模型来表达问题并予以解决的过程。...但传统关系型数据库在分析大规模数据关联特性时存在性能缺陷、表达有限等问题，因此有着更强大表达能力的图数据受到业界极大重视，图计算就是以图作为数据模型来表达问题并予以解决的过程。...图可以融合多源多类型的数据，除了可以展示数据静态基础特性之外，还可通过图计算展示隐藏在数据之间的图结构特性和点对关联关系，成为社交网络、推荐系统、知识图谱、金融风控、网络安全、文本检索等领域重要的分析手段...，即一个社区作为图的一个新的节点。...注：社区内的权重为所有内部结点之间边权重的两倍，因为 Kin 的概念是社区内所有节点与节点 i 的连边和，在计算某一社区的 Kin 时，实际上每条边都被其两端的顶点计算了一次，一共被计算了两次。

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    我汇总了韦恩图(Venn Diagram)所有绘制方法，推荐收藏~~

    今天这篇推文小编就汇总一下有关Venn Diagram(韦恩图) 的绘制方法，主要内容包括： Venn Diagram(韦恩图)的简介 Venn Diagram(韦恩图)的R绘制方法 Venn Diagram...(韦恩图)的Python绘制方法 Venn Diagram(韦恩图)的简介 Venn Diagram(韦恩图)，或叫Venn图、文氏图、温氏图，是在所谓的集合论（或者类的理论）数学分支中表示集合或者类的一种草图...Venn Diagram(韦恩图)的R绘制方法 R-ggvenn包绘制 使用R绘制Venn Diagram图，首先想到的肯定是ggplot2,而ggvenn包作为ggplot2的拓展包且有geom_*(...Diagram(韦恩图)的Python绘制方法 要想使用Python绘制韦恩图(这里主要介绍基于matplotlib的绘制方法，交互式后期统一介绍)，这里介绍一个非常便捷的方法-matplotlib-venn...Venn Diagram(韦恩图)的用途，希望大家可以有所收获哈~~ 再小的技能，也应该被认真对待。

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    绘图技巧 | 我总结了韦恩图(Venn Diagram)绘制方法(R+Python)

    今天这篇推文小编就汇总一下有关Venn Diagram(韦恩图) 的绘制方法，主要内容包括： Venn Diagram(韦恩图)的简介 Venn Diagram(韦恩图)的R绘制方法 Venn Diagram...(韦恩图)的Python绘制方法 Venn Diagram(韦恩图)的简介 Venn Diagram(韦恩图)，或叫Venn图、文氏图、温氏图，是在所谓的集合论（或者类的理论）数学分支中表示集合或者类的一种草图...Venn Diagram(韦恩图)的R绘制方法 R-ggvenn包绘制 使用R绘制Venn Diagram图，首先想到的肯定是ggplot2,而ggvenn包作为ggplot2的拓展包且有geom_*(...Diagram(韦恩图)的Python绘制方法 要想使用Python绘制韦恩图(这里主要介绍基于matplotlib的绘制方法，交互式后期统一介绍)，这里介绍一个非常便捷的方法-matplotlib-venn...Venn Diagram(韦恩图)的用途，希望大家可以有所收获哈~~

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    局部整体（二）利用python绘制维恩图

    局部整体（二）利用python绘制维恩图 维恩图（ Venn Diagram）简介 维恩图显示集与集之间所有可能存在的逻辑关系，每个集通常以一个圆圈表示，每个集都是一组具有共同之处的物件或数据。...2组 venn2(subsets = (10, 5, 2), set_labels = ('Group A', 'Group B')) plt.show() 定制多样化的维恩图 自定义维恩图一般是结合使用场景对相关参数进行修改...【Set "A"】 c = venn3_circles(subsets=(1, 1, 1, 1, 1, 1, 1), linestyle='dashed') c[0].set_lw(1.0) # 修改第一个圆图的线宽...2、下方的点图表示出现的所有交集情况 3、上方的条形图对应交集内的元素数量 更多方法可参考UpSetPlot documentation[2] 总结 以上通过matplotlib_venn快速绘制维恩图...，并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的维恩图来适应相关使用场景。

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    在Android中高效的加载大图

    大家都知道，Android系统的内存有限。我们必须牢记这一点。 stackoverflow上有很多关于大图加载的问题，当你的应用程序遇到OOM的时候，你可以选择直接复制粘贴其中的答案来解决这个问题。...因此，你完全可以略过本篇文章，但我想介绍一些加载大图的基础知识及其实际工作的原理。 我只想解释图片解码背后的逻辑。我建议你使用Picasso或Glide来加载图片。没有必要重新发明轮子。...原因如下： 存储在磁盘上的图片是被压缩过的（以JPG，PNG或类似的格式存储）。 一旦将图片加载到内存中，它就不再被压缩，并占用尽可能多的图片的所有像素所需的内存空间。...在android官方文档中，计算结果是2的幂次方。...注意：在改变compress方法中的质量参数的时候，压缩格式应该是.JPEG。设置为PNG格式的时候，修改是无效的。 下面是一张对比效果图： ?

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    Transformer在图的应用——睡前小论文

    本文主要是将transform应用于图数据挖掘领域，并通过实验证明transform在图领域的应用优于传统的GNN。...在代码属性图中则表示方法的调用和被调用关系，映射到代码就是这个方法的代码段信息和这个方法出现在哪些方法里面。...数学表达： 提出了空间编码(Spatial Encoding)来将节点在整空间中的关系信息编码进模型，让模型学习到节点和整个空间的关系。在代码属性图则表示这个方法和整体代码的关系。...提出了边编码(Edge Encoding)来将边和整个空间相关的信息也编码进模型，让模型学习到边和整个空间之间的关系。在代码属性图中，则表示两个节点之间的调用链。...（train MAE训练平均绝对误差，validate MAE 验证平均绝对误差） 下图是在不同数据集下，图预测相关的性能（AP表示平均精准度，AUC表示ROC曲线下坐标轴围成的面积，AUC越接近1.0

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    Mathematica 在图与网络中的应用

    1 导读 版本 11 在其图与网络领域既有的强大功能基础上作了大量扩展与改进. 其中包括新增的图构建器、新的审编数据的图属性以及新的针对特定领域的网络....工作性能改进可在全方位功能中使用. 2 1 案例 下面小编用Mathematica来向大家展示其在图和网络中的应用. 示例1:绘图主题集 版本 11 增加了一个内容广泛的有关图的绘图主题集....示例2:更高保真度绘图 图和网络的更高保真度绘制. ‍ 示例3:找出图的连通分量 根据荷叶密度模拟青蛙跳网络....荷花池中的青蛙要从25片荷叶中的一片跳到另一片上面,它一跳能够跳1.5英尺. 随机取样一个荷花池. 找出青蛙可以在之间跳跃的最大的荷叶集 找出青蛙要访问所有的荷叶而需要游水的次数....选用一个不同的 GraphLayout. 示例5:文字的语法结构 用新的 TextStructure 函数制作并可视化一个句子或结构中的语法依赖关系. ‍‍ 短语结构

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    绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图

    本版块会持续分享一些常用的结果展示的图形。 在得到数据之后，我们经常会用到维恩图来展示各个数据集之间的重叠关系。本文简单的介绍R语言中的VennDiagram包绘制数据集的维恩图。...三 知道各个数据集的个数以及重叠（交叉）的个数 2.1 两个已知数据集的韦恩图 # 圆的大小不会根据数据量多少改变 venn.plot venn(80, 30, 10,...) #调整参数进行图形优化 venn.plot venn( area1 = 80, #区域1的数 area2 = 30, #区域2的数 cross.area...2.2 三个已知数据集的韦恩图 venn.plot venn(area1 = 80,area2 = 70,area3 = 50,n12 = 38,n23 = 18,n13...VennDiagram函数包最大能绘制5个数据集合的韦恩图，可以看到已经有点乱了，当更多集合的时候，可以使用之前分享的R|UpSet-集合可视化进行绘制。 韦恩图，走你。

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    图算法在风控场景的应用

    导读：本文将分享图算法在风控中的应用。...此时标签传播算法和半监督技术就开始在风控中使用。图神经网络的半监督学习，其学习能力和鲁棒性高于传统图算法。...常用离线图算法框架——GraphX早期尝试去做图的时候，主要是做图的最短路径，单机版很简单。在大厂数据量很大，会使用分布式的图学习。...在风控的特定场景下，还要对图的特定 Pattern 去进行挖掘。...两者难度是不一样的，在算法的复杂度特征上是会不一样的。Q2：在风控场景中有遇到图模型的可解释性问题吗？怎么解决？A2：这个其实是很有意思的问题。图模型的解释性，其实说句实话比其他模型要容易的。为什么？

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