首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

构建可重复的单细胞数据分析流程

分析可重复也是对数据科学家的基本要求之一,你不能给出资方一个不可重复的结果。...在这方面R语言和Python都有相应的工程技术来保证数据科学的可重复性,今天我们主要讲一讲R语言生态的单细胞数据分析可重复性流程构建方法。...为了保证数据科学项目的可持续和可重复,一个RProjects是值得拥有的。...Readme 为项目建立rawdata以及过程数据文件夹 建议使用相对路径 为经常用到的脚本写模板 在Linux下,写好一个Rmd之后,如想批量可视化某个基因集,可以用下面的代码来执行。...以上,其实用到的核心技术并不多,主要是R语言生态的: ? 怎么样?对构建可重复的单细胞数据分析流程有信心了吗?

1.2K20
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    C#如何创建一个可快速重复使用的项目模板

    今天我们聊聊:如何基于官方的cli donet new 命令创建自己的项目模板。...,并在vs新建项目时可供选择创建项目,或者使用cli命令直接创建; 当然,还有公开模板: https://dotnetnew.azurewebsites.net/ 创建自己的模板 1、先准备好一个项目...这里准备的项目就是平时普通的项目,后面会以这个项目为蓝本创建模板;因为我最近使用Azure Function类型项目比较多,我就以Function项目为例,其他类型项目同理的; 项目结构图: 项目文件结构...-Source参数,如果你有搭建好自己的nuget服务端的话改成你自己的; 如何使用一个模板 模板有了,怎么用这个就简单了; vs使用 在创建项目时直接选择自定义模板 不过这样的话,自定义参数都是用默认值...,所以我还是更推荐用命令行方式; 命令行使用(推荐) 大家做demo的时候都应该执行过这样的命令,其实这就是使用了官方shotname为console的模板 dotnet new console -n

    8410

    MySQL数据库的默认隔离级别为什么是可重复读

    一般的DBMS系统,默认都会使用读提交(Read-Comitted,RC)作为默认隔离级别,如Oracle、SQLServer等,而MySQL却使用可重复读(Read-Repeatable,RR)。...要知道,越高的隔离级别,能解决的数据一致性问题越多,理论上性能损耗更大,可并发性越低。...隔离级别依次为>:串行化 > RR > RC >读未提交 在SQL标准中,前三种隔离级别分别解决了幻象读、不可重复读和脏读的问题。那么,为什么MySQL使用可重复读作为默认隔离级别呢?...statement:记录的是修改SQL语句 row:记录的是每行实际数据的变更 mixed:statement和row模式的混合 那Mysql在5.0这个版本以前,binlog只支持STATEMENT这种格式...因此由于历史原因,mysql将默认的隔离级别设为可重复读(Repeatable Read),保证主从复制不出问题。

    2.1K10

    (五)给对象添加类型和使用 type 关键字定义可复用的对象类型

    #给对象添加类型 let product: { title: string price: number insTock: boolean } = { title: '纯棉...T 恤', price: 99.8, inStock: true } # 使用 type 关键字定义可复用的对象类型 在上一章节中我们定义的类型是直接写死在变量后面的,这样的话有新的对象需要用到要在复制一份...number insTock: boolean } = { title: '纯棉 T 恤', price: 99.8, inStock: true } // 新,这两个是重复的...,TypeScript 可以允许我们将上面这种可复用的类型定义到一个 type 里面,使用的时候直接在属性后面使用就可以了(推荐首字母大写和其他变量名区分开) type Product = {...title: string price: number insTock: boolean } // 使用 let product: Product = { title: '纯棉

    67540

    识别最优的数据驱动特征选择方法以提高分类任务的可重复性

    识别最具有可重复性的连接组特征 一旦识别出最可靠的FS方法,算法就使用前K个选择的特征训练支持向量机分类器,以发现最具鉴别性的特征。...当观察这个数据集中最具有可重复性的特征时,形态学连接[顶叶皮层(29)↔脑岛皮层(35)]总是被发现;[尾前扣带皮层(2)↔胼胝体(4)]和[颞上回后坡(1)↔内嗅皮层(6)]作为相关特性出现。...使用多种交叉验证策略评估FS-Select方法 FS- select从给定的FS池中识别出最佳的FS方法,并能够找出在感兴趣的生物医学数据集中分离两个类的最具有可重复性和最具鉴别性的特性。...需要对不同数据集上的FS- select进行评估,以可靠地评估使用的FS方法的潜力; 2. 在研究最具有可重复性的连接特征时,只选择了前10个特征。...本文并不关注所使用的FS方法的时间复杂度,而是关注每个FS方法在选择最具有可重复性特征时的可重复效力。 未来工作与改进 有几个未来的方向可以探索,以进一步提高这项开创性工作。

    1.1K30

    J Cheminform|使用具有自适应训练数据的GANs搜索新分子

    一、研究背景 从材料设计到药物发现,许多具有重要实际应用意义的科学研究都可以看作是对所有可能的化合物的空间的搜索。由于搜索空间的高维性质,对可能的候选进行枚举是不可行的。...二、模型与方法 2.1 数据集 模型使用的原始训练数据取自QM9,这是GDB-17化学数据库的一个子集。作者从deepchem上下载数据,然后使用rdkit处理。...从图中可以观察到与不重组情况相同的层次结构。然而,重组确实增加了产生的新分子的绝对数量。新分子的增加也带来了更多的Top Performers。图3展示了6个Top Performers的例子。 ?...因此,作者将训练过程扩展到具有至多20个原子的分子,并从ZINC环数据集中添加了10k分子。...使用至多20个原子的数据集训练的实验结果 四、总结 生成式机器学习模型,包括GAN,是探索所需新分子的化学空间的有力工具。在这里,作者提出了一个策略,使用增量更新的数据以促进搜索超越原来的训练集。

    74430

    如何正确的使用一条SQL删除重复数据

    数据库中表存在重复数据,需要清理重复数据,清理后保留其中一条的情况是比较常见的需求,如何通过1条SQL准确的删除数据呢? 1....例如c1,c2 这2个字段组合作为唯一条件,则查询重复数据的SQL如下 SELECT c1, c2, COUNT(*) FROM test GROUP BY c1, c2 HAVING...如何删除重复数据 2.1 方案一 很多研发同学习惯的思路如下: 先查出重复的记录(使用in) 再查出在重复记录但id不在每组id最大值的记录 直接将select 改为delete进行删除 查询SQL...推荐写法 基于以上情况,使用单条SQL删除的方式如下: 查询SQL: SELECT a.* FROM test a , (SELECT c1,c2,MAX(id)id FROM test...共 7 行受到影响 删除后数据如下: 无重复数据了。

    1.8K20

    详解使用对象存储服务备份NAS中的数据

    文章目录[隐藏] 0.前言 1.什么是对象存储 2.购买资源包 3.创建访问密钥 4.新建存储桶 5.设置群晖使用对象存储 6.计费模式说明 0.前言 对数据备份有所了解的朋友应该都听说过“两地三中心”...包括群晖在内的各家 NAS 均有提供网盘同步的功能,使用起来也相当方便。不过有利就有弊,网盘以免费或及其低廉的价格提供庞大存储容量的同时,也存在数据安全和速度方面的问题。...与网盘服务的不同之处在于,数据的安全和稳定性是对象存储服务的基本特性。以腾讯云的文档为例,其对象存储的数据持久性高达 99.9999999999% ,服务可用性高达 99.995% 。...下面便以腾讯云对象存储(COS)和群晖 DSM 6.2 为例,详细介绍如何使用对象存储服务备份 NAS 中的数据。...虽然看起来对象存储的使用成本较高,但实际作为第二备份来说取回的概率是相当低的。如果确实需要时也可以额外购买对应费用的资源包进行抵扣。

    4.5K20

    DENVIS:使用具有原子和表面蛋白口袋特征的图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选

    传统的分子对接算法使用基于物理的模拟,通过估计查询蛋白配体对的结合方向和相应的结合亲和度评分来解决这一挑战。近年来,经典和现代机器学习架构显示出超越传统对接算法的潜力。...在氨基酸序列级别处理目标信息的算法家族以在更高表示级别处理蛋白质数据为代价,避免了这一情况。本文介绍了深度神经虚拟筛选(DENVIS),一种使用图神经网络(GNNs)进行虚拟筛选的端到端管道。...通过在两个基准数据库上进行实验,本文证明了本文的方法与几种基于分子对接的、基于机器学习的以及基于分子对接的与机器学习结合的算法相比具有竞争力。...由于避免了中间的分子对接步骤,DENVIS的筛选时间比基于分子对接的和混合模型都要快几个数量级(即更高的吞吐量)。与筛选时间相当的基于氨基酸序列的机器学习模型相比,DENVIS的性能显著提高。...我们方法的一些关键元素包括使用原子和表面特征组合的蛋白质口袋建模,模型集成的使用,以及在模型训练期间通过人工负采样的数据增强。

    40010

    大学生常用python变量和简单的数据类型、可迭代对象、for循环的3用法

    文章目录 变量和简单的数据类型 下划线开头的对象 删除内存中的对象 列表与元组 debug 三酷猫钓鱼记录 实际POS机小条打印 使用循环找乌龟 可迭代对象 理解一 理解二 2️⃣什么是迭代器 ✔️...特别鸣谢:木芯工作室 、Ivan from Russia ---- 变量和简单的数据类型 下划线开头的对象 单下划线_ 变量 在Python中,变量可以包含数字、字母、下划线等,所以单独一个下划线...数字列表,字符串,列表,元组,字典… 理解一 Iterable对象,就是可迭代对象,即可以用for...in...进行遍历的对象,就叫可迭代对象。...当有多个可迭代对象时,最短的可迭代对象耗尽则整个迭代就将结束 实例: 由于该函数返回的是迭代器,所有我们可以用list()函数将结果转换为列表。...返回: 该函数在多个iterable上并行迭代,从每个可迭代对象上返回一个数据项组成元组。 也就是说, zip() 返回元组的迭代器,其中第 i 个元组包含的是每个参数迭代器的第 i 个元素。

    90120

    JCIM|DENVIS:使用具有原子和表面蛋白口袋特征的图神经网络进行可扩展和高通量的虚拟筛选

    作者提出了DENVIS(DEep Neural VIrtual Screening),一种使用具有原子和表面蛋白袋特征的图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选的新型算法。...DENVIS使用原子和表面特征的组合进行蛋白质口袋建模,实现了具有竞争力的先进的虚拟筛选性能。 概要 虚拟筛选的计算方法可以通过识别特定目标的潜在hit,显著加快早期药物发现。...在两个基准数据库上进行的实验,表明这种方法在几种基于对接、基于机器学习和基于混合对接/机器学习的算法中具有竞争力。...该方法的一些关键要素包括使用原子和表面特征组合的蛋白质口袋建模,模型集成的使用,以及在模型训练期间通过人工负采样进行数据增强。...原子级模型由图同构网络(GIN)[2]组成,这是一种通用但功能强大的GNN实现,已用于生物和化学应用。表面级方法使用混合模型网络(MoNet)[3],一种特殊的GNN,具有考虑输入流形几何的卷积运算。

    70220

    南工大团队研制的可重复使用纸墨组合,刷新现有印刷模式的同时降低了成本 | 黑科技

    采用清水就可以重复书写,这不仅保护了环境,还降低了成本。 近日,《自然·通讯》杂志上公布了一项研究成果:南京工业大学黄维及其研究团队研制的一套可重复打印、持久保持且可消除的纸张和墨水。...然而,由于缺乏有效的方法,目前很难在可擦写纸上实现多色和喷墨打印,并维持图像的持续时间,所以其实际应用一直受到限制。而黄维所带领的团队研制出的这套纸墨组合不仅具有环保效益,而且具有成本效益。...谈及纸张的制作原理,黄维表示,他们采用了具有可逆性的动态金属,利用它们之间的相互作用机制来实现可擦写,因此也打破了现有的技术限制。...最后,按需要生成的彩色图像可以保留6个月以上,期间想要擦除它,我们只需要使用四丁基氟化铵(TBAF)破坏“图像”中已经形成的化学键即可。...整个过程简单方便,但研究人员不满足于此,他们希望找到一种更加经济的印刷方法 通过研究,他们发现通过将水响应型发光锌络合物引入成像层中,可以制造出另一种以水为墨水的可重复使用纸张。

    42560

    【Node】sequelize 使用对象的方式操作数据库

    本文分享 sequelize 的项目实践经验,如果你还不了解 sequelize,可以先看文档 https://www.sequelize.com.cn/ sequelize 是一个可以使用对象的方式操作数据库的...其实我觉得就是用 mongo 的方式操作 mysql 等关系型数据库 用ORM的好处就是你不用操作表,不用写sql语句,在程序中用面向对象的思路,直接操作对象即可。...() 等等 下面记录一些 定义model 时 多会用到的配置 1、自动生成model 复杂的数据表如果要一个个人工去定义,那可太麻烦了,可有使用 https://github.com/sequelize...: true, // 查出 name 不重复的数量 col: 'name', }); 注意这里是查出数量,不是数据,比如下面以name 为重复字段的,虽然有 6条数据,但是 counts 是 2...可以避免创建重复的数据,直接插入数据 如果数据不存在,就插入,如果存在,就更新 怎么判定这个数据是否存在?

    8.6K20

    我们有了可重复使用的火箭,但为什么还没有会飞的汽车?「Rodney Brooks」法则为你解惑

    AI 科技评论按:制造电动汽车和可重复使用的火箭可能很容易,而相比之下,建造核聚变反应堆、可以飞行的汽车、自动驾驶汽车或超回路列车系统就十分困难了。...同样地,可重复使用的火箭听起来可能是颇具革命性的,但是这个领域仍然有大量的现有技术。所有的液体燃料火箭都起源于 Wernher von Braun为希特勒制造的 V-2 火箭。...如今,SpaceX 公司生产的可重复使用的猎鹰火箭,在返回发射场或回收驳船软着陆时,利用网格鳍来控制第一阶段。...我绝不是说开发电动汽车或可重复使用的火箭不勇于创新、不努力,也不具有令人印象深刻的创造性工作。...66 年前,随着「Ivy Mike」氢弹的爆炸,人类首次实现了短暂的核聚变反应。过去,未来主义者满怀信心地预测人们在可预期的将来可以使用核聚变内发电,但这一点到现在还没有实现。

    54720

    可一键显示论文使用的数据集

    这使得跟踪整个机器学习社区中的数据集使用情况并使用相同的数据集快速查找其他论文变得更加容易。...的这个页面还显示了当前所有用到ImageNet数据集的5619篇论文(可真多啊,ImageNet 牛 !)...能够索引的数据集规模达到了3000+,而且提供按任务和模式查找的功能,能够比较数据集的使用情况,浏览基准.........3 数据的重要性 数据是构建人工智能系统必需的关键基础设施。数据在很大程度上决定了AI系统的性能、公平性、稳健性、安全性和可扩展性。...谷歌的一项研究发现,对数据工作的低估是具有普遍性的更多内容请查看:“谷歌AI研究院:被低估的数据,被高估的模型”一文。

    1.2K40
    领券