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Tidyverse|数据分分合合,一分多,多合一

一 载入数据 R使用TCGA下载数据,仅使用以下几行几列, 作为示例 library(tidyverse) data <- read.csv("separate.csv",header = TRUE...二 久可分-一拆多 使用separate函数, “指定”分隔符出现位置一分成多 2.1 默认,不指定分隔符 data %>% separate(ID, into = c("Gene",...2.4,按照第几个字符拆 根据第几个字符拆分,适合数据规整,,, 可以用来TCGA中sampleID转为常见16位,需要先转置 data2 %>% select(Gene1,contains...可参考:盘一盘Tidyverse| 筛行选之select,玩转列操作 Tips: 1)数据分列可以先默认试一下,如2.1所示 2)使用R帮助,一定!...三 分久必合-多合一 使用unite函数, 可将多按照“指定”分隔符并为 data %>% unite(ID_new, ID:ID2, sep = "_") %>% head() ?

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Hive SQL 常用零碎知识

去换行符去除某里面的换行符转义符等等regexp_replace(col_name, '\n|\t|\r', '') AS new_col_name2....cherry')输出:'apple,banana,cherry'CONCAT:提供字符串按顺序连接起来,但不包括任何分隔符。...为了在Presto或Spark SQL中实现类似的局部排序需求,请使用窗口函数(如使用OVER和PARTITION BY子句)。...UNION和UNION ALLUNION:UNION操作符两个或多个查询结果集合并为一个结果集,并去除其中重复行。UNION操作符会对结果进行去重,即如果两个结果集存在相同行,则只保留一份。...UNION ALL:UNION ALL操作符也两个或多个查询结果集合并为一个结果集,但不进行去重。UNION ALL会保留所有结果中重复行,并将其全部加入到最终结果集中。

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Pyspark处理数据中带有分隔符数据

本篇文章目标是处理在数据集中存在分隔符分隔符特殊场景。对于Pyspark开发人员来说,处理这种类型数据集有时是一件令人头疼事情,但无论如何都必须处理它。...使用sparkRead .csv()方法读取数据集: #create spark session import pyspark from pyspark.sql import SparkSession...从文件中读取数据并将数据放入内存后我们发现,最后一数据在哪里,年龄必须有一个整数数据类型,但是我们看到了一些其他东西。这不是我们所期望。一团糟,完全不匹配,不是吗?...再次读取数据,但这次使用Read .text()方法: df=spark.read.text(r’/Python_Pyspark_Corp_Training/delimit_data.txt’) df.show...我们已经成功地“|”分隔(“name”)数据分成两。现在,数据更加干净,可以轻松地使用

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Linux好用管道命令

这些字节位置忽略多字节字符边界,除非也指定了 -n 标志。 -c :以字符为单位取出固定字符区间。 -d :自定义分隔符,默认为制表符,与-f一起使用。...-f :根据-d分隔符一段信息分成数段,使用-f表示取出第几段意思。 -n :取消分割多字节字符。仅和 -b 标志一起使用。...-d delim 分隔符,默认xargs分隔符是回车,argument分隔符是空格,这里修改是xargs分隔符。 -x exit意思,主要是配合-s使用。。...但有以下限制,不识别:/x、函数关键字、func、换码序列以及当fs是一个空格时,行作为一个域分隔符;操作符**和**=不能代替^和^=;fflush无效。...-r:sed操作使用是扩展型正则表达式语法(默认是基础正则表达式语法) 操作说明 a :新增, a 后面可以接字串,而这些字串会在一行出现(目前下一行)~ c :取代, c 后面可以接字串

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shell文本处理工具sed、cut、awk

d :删除,因为是删除啊,所以 d 后面通常不接任何东东; i :插入, i 后面可以接字串,而这些字串会在一行出现(目前上一行); p :打印,亦即将某个选择数据印出。...| sed '/hello/d' 1 xujinding 2 wuyicheng 3 caiyufei 4 wahaha 数据查找与替换 sed ‘s/要被取代字串/字串/g’ g...语法 cut [选项参数] filename 说明:默认分隔符是制表符 参数说明 -f: 号,提取第几列 -d: 分隔符,按照指定分隔符分割 -c: 指定具体字符 测试文件 [admin...,把文件逐行读入,以空格为默认分隔符每行切片,切开部分再进行分析处理。..." "|awk 'BEGIN{ay[1,10]=5;ay[10,2]=12;}END{for (k in ay) {print k,ay[k];}}' 输出结果: 110 5 102 12 多个分隔符

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数据处理 | R-tidyr包

#载入所需R包 library(dplyr) library(tidyr) #测试数据集 widedata <- data.frame(person=c('A','B','C'),grade=c(5,6,4...:需要被转换宽形表 key:数据框中所有赋给一个变量key value:数据框中所有值赋给一个变量value ......三 多并为 unite(data, col, … , sep = " ") data::表示数据框, col:表示合并后列名称, … :表示需要合并若干变量, sep: = " "用于指定分隔符.... separate(data, col, into, sep = " ") data:为数据框 col:需要被拆分 into:要拆分为(多个), 通常用c()形式进行命名 sep : = "..." 用于指定分隔符 remove:是否删除被分割 用separate函数将上面的wideunite数据框还原: widesep <- separate(wideunite, information

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Spark【面试】

使用是mr程序来执行任务,使用jdbc和关系型数据库进行交互。 import原理:通过指定分隔符进行数据切分,分片传入各个map中,在map任务中在每行数据进行写入处理没有reduce。...export原理:根据要操作表名生成一个java类,并读取其元数据信息和分隔符对非结构化数据进行匹配,多个map作业同时执行写入关系型数据库 11、Hbase行健概念,物理模型,表设计原则?...行健:是hbase表自带,每个行健对应一条数据族:是创建表时指定,为集合,每个族作为一个文件单独存储,存储数据都是字节数组,其中数据可以有很多,通过时间戳来区分。...设计原则:尽可能少(按照族进行存储,按照region进行读取,不必要io操作),经常和不经常使用两类数据放入不同族中,族名字尽可能短。...随机初始化中心点范围,计算各个类别的平均值得到中心点。 重新计算各个点到中心值距离划分,再次计算平均值得到中心点,直至各个类别数据平均值无变化。 30、canopy算法原理?

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PySpark UD(A)F 高效使用

GROUPED_MAP UDF是最灵活,因为它获得一个Pandas数据,并允许返回修改。 4.基本想法 解决方案非常简单。...这意味着在UDF中将这些转换为JSON,返回Pandas数据,并最终将Spark数据相应列从JSON转换为复杂类型 [2enpwvagkq.png] 5.实现 实现分为三种不同功能: 1)...Spark数据转换为一个数据,其中所有具有复杂类型都被JSON字符串替换。...除了转换后数据外,它还返回一个带有列名及其转换后原始数据类型字典。 complex_dtypes_from_json使用该信息这些精确地转换回它们原始类型。...作为最后一步,使用 complex_dtypes_from_json 转换后 Spark 数据 JSON 字符串转换回复杂数据类型。

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Shell进阶必会几个工具,你都掌握了吗?(附真实企业面试题)

1.1 基本用法 cut[选项参数] filename 说明: 默认分隔符是制表符 1.2 选项参数说明 选项参数 功能 -f 号,提前第几列 -d 分隔符,按照指定分隔符分割 1.3 案例实操...le le 3、awk 一个强大文本分析工具,把文件逐行读入,以空格为默认分隔符每行切片,切开部分再进行分析处理。...action:在找到匹配内容时所执行一系列命令 3.2 选项参数说明 选项参数 功能 -F 指定输入文件折分隔符 -v 赋值一个用户定义变量 3.3 案例实操 (0) 数据准备 [root@...4.1 基本语法 sort(选项)(参数) 选项 说明 -n 依照数值大小排序 -r 以相反顺序来排序 -t 设置排序时所用分隔字符 -k 指定需要排序 参数:指定待排序文件列表 4.2...这些工具不论是在Linux开发,还是在大数据运维环境下,使用频率都很高,热爱学习小伙伴们记得勤加练习哟~ 如果以上过程中出现了任何纰漏错误,烦请大佬们指正?

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深入理解XGBoost:分布式实现

任何原始RDD中元素在RDD中有且只有一个元素与之对应。 flatMap:与map类似,原始RDD中元素通过函数生成元素,并将生成RDD每个集合中元素合并为一个集合。...groupBy:RDD中元素通过函数生成相应key,然后通过key对元素进行分组。 reduceByKey:数据中每个key对应多个value进行用户自定义规约操作。...DataFrame API可以在Scala、Java、Python和R使用。下面只介绍几个常用API(更多API可以参考相关资料[插图])。...它可以原始特征和一系列通过其他转换器得到特征合并为单一特征向量,以训练如逻辑回归和决策树等机器学习算法。...VectorSlicer:从特征向量中输出一个特征向量,该特征向量为原特征向量子集,在向量中提取特征时很有用。 RFormula:选择由R模型公式指定

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Day4:R语言课程(向量和因子取子集)

1.数据读入R 无论要执行R具体分析是什么,通常都需要导入数据用于分析。...我们使用R函数取决于我们引入数据文件类型(例如文本,Stata,SPSS,SAS,Excel等)以及该文件中数据如何分开或分隔。下表列出了可用于从常见文件格式导入数据函数。...但是,如果数据在文本文件中由不同分隔符分隔,我们可以使用泛型read.table函数并将分隔符指定为函数中参数。 基因组数据通常有一个metadata文件,其中包含有关数据集中每个样本信息。...所有数据结构 - 内容显示: `str()`:紧凑数据内容显示(环境) `class()`:向量数据类型(例如字符,数字等)以及数据,矩阵和列表数据结构。...(1)向量 选择使用索引 从向量中提取一个或多个值,可以使用方括号[ ]语法提供一个或多个索引。索引表示一个向量中元素数目(桶中隔室编号)。R索引从1开始。

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Python数据分析实战之数据获取三大招

如果不指定参数,则会尝试使用逗号分隔。分隔符长于一个字符并且不是‘\s+’,将使用python语法分析器。并且忽略数据逗号。...header参数可以是一个list例如:[0,1,3],这个list表示文件中这些行作为标题(意味着每一多个标题),介于中间行将被忽略掉(例如本例中2;本例中数据1,2,4行将被作为多级标题出现.../test.csv', parse_dates=[3]) 特定日期解析为日期格式; 2, 先使用默认值file = pd.read_csv('./test.csv'),再对特定进行格式转换。...delimiter : str, optional 字符串, 选填, 默认空格, 用来分隔多个分隔符, 如逗号、TAB符。...空("")分隔符表示该文件应该作为二进制文件处理。分隔符空格(" ")匹配零个或多个空格字符。仅由空格组成分隔符必须至少匹配一个空白。

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Spark SQL 外部数据

一、简介 1.1 多数据源支持 Spark 支持以下六个核心数据源,同时 Spark 社区还提供了多达上百种数据读取方式,能够满足绝大部分使用场景。...但是 Spark 程序默认是没有提供数据库驱动,所以在使用前需要将对应数据库驱动上传到安装目录下 jars 目录中。...("/tmp/spark/txt/dept") 八、数据读写高级特性 8.1 并行读 多个 Executors 不能同时读取同一个文件,但它们可以同时读取不同文件。...8.3 分桶写入 分桶写入就是数据按照指定和桶数进行散,目前分桶写入只支持保存为表,实际上这就是 Hive 分桶表。...Bothseq任意字符,(逗号)分隔符Bothheadertrue, falsefalse文件中第一行是否为名称。

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Python数据分析实战之数据获取三大招

header参数可以是一个list例如:[0,1,3],这个list表示文件中这些行作为标题(意味着每一多个标题),介于中间行将被忽略掉(例如本例中2;本例中数据1,2,4行将被作为多级标题出现.../test.csv', parse_dates=[3]) 特定日期解析为日期格式; 2, 先使用默认值file = pd.read_csv('./test.csv'),再对特定进行格式转换。...delimiter : str, optional 字符串, 选填, 默认空格, 用来分隔多个分隔符, 如逗号、TAB符。...converters : dict, optional 字典, 选填, 默认为空, 用来特定数据转换为字典中对应函数浮点型数据。...空("")分隔符表示该文件应该作为二进制文件处理。分隔符空格(" ")匹配零个或多个空格字符。仅由空格组成分隔符必须至少匹配一个空白。

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Day5:R语言课程(数据框、矩阵、列表取子集)

学习目标 演示如何从现有的数据结构中取子集,合并及创建数据集。 导出数据表和图以供在R环境以外使用。...---- 注意:有更简单方法可以使用逻辑表达式对数据进行子集化,包括filter()和subset()函数。这些函数返回逻辑表达式为TRUE数据行,允许我们在一个步骤中对数据进行子集化。...我们filter()在后面的课程中更详细地探讨该功能。 2.列表 从列表中选择组件需要略有不同表示法,即使理论上列表是向量(包含多个数据结构)。...列表组件命名数据命名使用函数都是names()。 查看list1组件名称: names(list1) 创建列表时,species向量与数据集df和向量number组合在一起。...write.table也是常用导出函数,允许用户指定要使用分隔符。此函数通常用于创建制表符分隔文件。 注意:有时在具有行名称数据框写入文件时,列名称将从行名称开始对齐。

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Spark Streaming入门

本文帮助您使用基于HBaseApache Spark Streaming。Spark Streaming是Spark API核心一个扩展,支持连续数据流处理。...其他Spark示例代码执行以下操作: 读取流媒体代码编写HBase Table数据 计算每日汇总统计信息 汇总统计信息写入HBase表 示例数据集 油泵传感器数据文件放入目录中(文件是以逗号为分隔符...以下是带有一些示例数据csv文件示例: [1fa39r627y.png] 我们使用Scala案例类来定义与传感器数据csv文件相对应传感器模式,并使用parseSensor函数逗号分隔值解析到传感器案例类中...[mt01r4ub58.png] 下面的函数Sensor对象转换为HBase Put对象,该对象用于数据行插入到HBase中。...[vcw2evmjap.png] 以下代码读取HBase表,传感器表,psi数据使用StatCounter计算此数据统计数据,然后统计数据写入传感器统计数据

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