首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

R语言数据挖掘实战系列(3)

在数据挖掘过程中,不一致数据的产生主要发生在数据集成的过程中,可能是由被挖掘数据来自于不同的数据源、对于重复存放的数据未能进行一致性更新造成的。...平均水平的指标是对个体集中趋势的度量,使用最广泛的是均值和中位数;反应变异程度的指标则是对个体离开平均水平的度量,使用较广泛的是标准差(方差)、四分位数间距。         ...1.直接绘制散点图         判断两个变量是否具有线性相关关系最直观的方法是直接绘制散点图。         ...不服从正态分布的变量,分类或等级变量之间的关联性可采用Spearman秩相关系数来描述。         ...作图函数名 作图函数功能 barplot() 绘制简单条形图 pie() 绘制饼形图 hist() 绘制二维条形直方图,可显示数据的分配情形 boxplot() 绘制样本数据的箱型图 plot() 绘制线性二维图

1.1K30

美女教授带你从统计学视角看转录组分析

样本分析层面:样本相似性度量 作者首先从样本分析层面上讨论了如何利用RNA-seq数据对来自同种或者不同物种的多种细胞类型的样本进行比较,从而研究基因表达机制在物种进化过程中的分化和保守现象。...测序数据可视化 (一) IGV基因组浏览器可视化高通量测序数据 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 1 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 2 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍...,进一步讲解16种常用分析图的原理和使用范围,让你不仅读懂图,更知道如何应用于自己的研究,并亲自轻松完成绘图。...针对大家使用R语言绘图学习时间成本较高的问题,易生信团队针对常用16种图开发了免费绘图网站,一键出图,更可鼠标点选参数修改图形的个性样式。 ?...WGCNA基因共表达分析 WGCNA基因、表型关联分析 Cytoscape 共表达网络绘制 转录组常见图形在线绘制 KEGG/Reactome通路图绘制,表达映射 基因互作的文献挖掘和数据库挖掘展示

2.8K31
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    Python数据分析-数据探索下

    主题 数据探索 接着上一节的内容~ 二、数据特征分析 5. 相关性分析 (1)直接描述散点图 从散点图可以比较直观地看书两个变量的相关性。...(一般分为完全正线性相关、完全负线性相关、非线性相关、正线性相关、负线性相关、不相关) (2)绘制散点图矩阵 可对多个变量同时进行相关关系的考察 (3)计算相关系数 这里的相关系数有很多,如Pearson...统计作图函数 (1)plot(),绘制线性二维图,matplotlib/pandas 使用格式:plt.plot(x,y,S) 字符串S指定绘制图形的类型、样式和颜色,常用的有:‘b’为蓝色、‘r’为红色...、‘g’为绿色、‘o’为圆圈、‘+’为加号标记、‘-’为实线、‘--’为虚线 (2)pie(),绘制饼形图,matplotlib/pandas (3)hist(),绘制二维条形直方图,matplotlib.../pandas (4)boxplot(),绘制样本数据的箱形图,pandas (5)plot(logy=true),绘制y轴的对数图形,pandas (6)plot(yerr=error),绘制误差条形图

    1.3K90

    《python数据分析与挖掘实战》笔记第3章

    对于定量数据,欲了解其分布形式是对称的还是非对称的,发现某些特大或特小的可疑值,可通过绘制频率分布表、绘制频率分布直方 图、绘制茎叶图进行直观地分析;对于定性分类数据,可用饼图和条形图直观地显示分布情况...为了消除少数极端值的影响, 可以使用截断均值或者中位数来度量数据的集中趋势。截断均值是去掉高、低极端值之后的平均数。 (2)中位数 中位数是将一组观察值按从小到大的顺序排列,位于中间的那个数。...直接绘制散点图 判断两个变量是否具有线性相关关系的最直观的方法是直接绘制散点图,如图3-11所示。 ? 2....计算相关系数 为了更加准确地描述变量之间的线性相关程度,可以通过计算相关系数来进行相关分析。在二元变量的相关分析过程中比较常用的有Pearson相关系数、Spearman秩相关系数和判定系数。...(2) pie 功能:绘制饼型图。 使用格式:plt.pie(size) 使用Matplotlib绘制饼图,其中size是一个列表,记录各个扇形的比例。

    2.2K20

    你愿意花十分钟系统了解数据分析方法吗?

    对定量数据的分布分析按照如下步骤进行: 1、求极差 2、决定组距与组数 3、决定分点 4、绘制频率分布图 对定性的数据分布分析: 根据变量的分类类型来确定分组,然后使用图形对信息进行显示。...3.计算每段参考总价的区间的频数、频率并绘制直方图。 ? 房屋朝向定性分析 对不同房屋朝向占比可绘制一个饼图。 ?...如 “基本建设投资额中工业、农业、教育投资的比例”、“男女比例” 空间相对数(横向):比如说同样的2017年北京和深圳膜拜单车使用量,空间是比较抽象的更多的是在时间相同的情况下,不同的元素的比较 。...对某一组数据分析其离中趋势结果: 你要比较A、B数据的分散程度,可求得其分位差和其他指标。你可以绘制箱型图对比。 ?...可按照如下步骤来实现贡献度分析: 对不同菜品按盈利额排序 计算累积占比 找到累积占比85%的菜品,并找到其对应的索引位置。 绘制盈利图并标记核心位置。 ?

    64610

    你愿意花十分钟系统了解数据分析方法吗?

    对定量数据的分布分析按照如下步骤进行: 1、求极差 2、决定组距与组数 3、决定分点 4、绘制频率分布图 对定性的数据分布分析: 根据变量的分类类型来确定分组,然后使用图形对信息进行显示。...3.计算每段参考总价的区间的频数、频率并绘制直方图。 ? 房屋朝向定性分析 对不同房屋朝向占比可绘制一个饼图。 ?...如 “基本建设投资额中工业、农业、教育投资的比例”、“男女比例” 空间相对数(横向):比如说同样的2017年北京和深圳膜拜单车使用量,空间是比较抽象的更多的是在时间相同的情况下,不同的元素的比较 。...对某一组数据分析其离中趋势结果: 你要比较A、B数据的分散程度,可求得其分位差和其他指标。你可以绘制箱型图对比。 ?...可按照如下步骤来实现贡献度分析: 对不同菜品按盈利额排序 计算累积占比 找到累积占比85%的菜品,并找到其对应的索引位置。 绘制盈利图并标记核心位置。 ?

    96320

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析|附代码数据

    双变量分布以及更高维度的分布都是可能的。  此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_  Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    60200

    静息态fMRI中的非线性功能网络连接

    说明这种不足的一个例子是Anscombe的四重奏,它显示了四个不同的非随机数据点的图具有相同的相关系数,尽管它们的依赖结构截然不同。...3.2 fMRI数据我们测量了静息功能磁共振数据估计的47个ICN时间TC之间的线性相关性,结果见图2。图2a是314名受试者的平均FNC。...对一个受试者,绘制出配对(23,38)和配对(2,3)的时间轨迹(图3a),并用快速傅里叶变换(FFT)的振幅计算出它们的频谱(图3b)。...图4 (a)上三角:去除线性相关后NMI中的群差(HC-SZ)。p值由FDR调整,阈值(p绘制为-log10(p) x sign(t-statistics)。...我们建立了一种评估不同大脑区域之间显式非线性依赖的方法,首先消除线性依赖。我们首先在模拟数据上证明了我们的方法如预期的那样工作(图1)。

    56150

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析|附代码数据

    双变量分布以及更高维度的分布都是可能的。  此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_  Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    1K40

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析

    此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。 算法 默认情况下,fit 使用最大似然将 copula 拟合到 u。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_ Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    2.7K12

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析|附代码数据

    双变量分布以及更高维度的分布都是可能的。  此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_  Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    67900

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析|附代码数据

    双变量分布以及更高维度的分布都是可能的。  此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_  Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    75720

    用COPULA模型进行蒙特卡洛(MONTE CARLO)模拟和拟合股票收益数据分析|附代码数据

    双变量分布以及更高维度的分布都是可能的。  此示例说明如何在变量之间存在复杂关系或单个变量来自不同分布时使用 copula 从多元分布生成数据。...可以使用'Alpha' 名称-值对指定不同的置信区间 。 例子 将_t_  Copula拟合到股票收益数据 加载并绘制模拟股票收益数据。...t Copulas 可以通过从二元 t 分布开始并使用相应的 t CDF 进行转换来构建不同的 copula 族。二元 t 分布使用 Rho(线性相关矩阵)和 nu(自由度)进行参数化。...然而,正如这些图所示,at(1) copula 与高斯 copula 有很大不同,即使它们的成分具有相同的等级相关性。不同之处在于它们的依赖结构。...例如,我们可以使用 Gaussian copula 模拟来自具有 Gamma(2,1)、Beta(2,2) 和 t(5) 边缘的三变量分布的数据,如下所示。

    50530

    Statsmodels线性回归看特征间关系

    P>|t| 统计检验中的P值,这个值越小越能拒绝原假设。 线性回归图像 Statsmodels的plot_regress_exog函数来帮助我们理解我们的模型。 根据一个回归因子绘制回归结果。...线性回归拟合散点图 一般在不使用statsmodels模块时,运用线性回归加散点图的绘制组合图,同样可以以此判断变量是否线性相关性。 以Open为预测自变量,Adj_Close 为因变量,绘制散点图。...由图可发现,两变量呈现较好的线性相关性。...绘制偏回归图 plot_partregress_grid 绘制多元偏回归图,展示包括截距项在内对多个自变量与因变量间的关系。并同时加上线性拟合线展示对收盘价对影响。...因为这里我们使用的数据基本是线性的,在其他场景中,需要根据实际情况确定多项式回归的最高次幂,可以绘制学习曲线,根据模型在训练集及测试集上的得分来确定最终结果。

    3.6K20

    统计计量 | 吸烟的人更长寿?冰淇淋销量越好溺亡人数越多?——相关分析概述

    可视化的优点是:直观,但其缺点是:无法准确度量。比如腰围和脂肪比重,对体重的影响程度到底有多大?或者说,这两个因素中哪个因素对体重的影响会更大?...观察散点图,可知:腰围与体重应该是存在线性相关性的,或者说,腰围对体重是有影响的。不过,这相关程度(或影响程度)有多大,则需要进一步计算相关系数来度量。...将待判断的变量选入因变量列表。 打开绘制界面,选中带检验的正态图,确定。 确定后得到如下的正态性检验结果: 在SPSS中,采用的是K-S检验以及Shapiro-Wilk检验的结果。...数据序列通常来自对同一组样本的多次测量或不同视角的测量。 结论分析 在斯皮尔曼相关性分析中,也能够得到相关系数(r)和检验概率(Sig.),当检验概率小于0.05时,表示两列数据之间存在相关性。...请分析其中的语文、数学、英语、历史、地理成绩之间的相关性: 解题思路 观察图中数据可知,需要分析的数据都是定距数据,而且它们来自同一组样本(同一批学生)的多次多视角测试(不同学科考试),可以使用Pearson

    1.3K40

    Statsmodels线性回归看特征间关系

    而smf.ols还要输入数据data,这个数据必须是pandas.DataFrame格式的,当使用公式和pandas对象时,不需要使用add_constant。...P>|t| 统计检验中的P值,这个值越小越能拒绝原假设。 线性回归图像 Statsmodels的plot_regress_exog函数来帮助我们理解我们的模型。 根据一个回归因子绘制回归结果。...一般在不使用statsmodels模块时,运用线性回归加散点图的绘制组合图,同样可以以此判断变量是否线性相关性。...以Open为预测自变量,Adj_Close 为因变量,绘制散点图。由图可发现,两变量呈现较好的线性相关性。...因为这里我们使用的数据基本是线性的,在其他场景中,需要根据实际情况确定多项式回归的最高次幂,可以绘制学习曲线,根据模型在训练集及测试集上的得分来确定最终结果。

    3.7K20

    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第五章 数据的描述性分析(下)

    :34.6 函数var()应用在多组数据上,得到的计算结果是一个协方差阵,其每个元素是各个向量之间的协方差。使用指令cor(group)也得到相同结果。...,但它还受变量本身度量单位的影响,因此我们还要计算相关系数来度量变量之间的线性相关程度。...Y可以省略:use指定如何处理缺失样本:method给出计算i哪一种相关系数:默认的皮尔逊(Pearson )系数度量线性相关性,如果数据呈现的不是线性关系,而是单调的,则可以用肯德尔(Kendall...函数kde2d()的使用方法: kde2d(x, y, h, n = 25, lims = c(range(x), range(y))) 其中x,y分别为横轴和纵轴的数据;n指定每个方向上的网格点数量,...(3)矩阵散点图 多组数据的图形也可以用散点图来展示,不同在于这里是矩阵散点图。对于一个数据框,R中可以直接使用plot()命令或pairs()绘制矩阵散点图。

    1.3K20

    CSDN——C知道已开通满血版DeepSeek-R1功能-超级强大,快来尝试一下吧

    其中联网查询与思维导图都能单独使用开关来操作。 满血版本DeepSeek思维导图 我们来绘制一下线性代数学习的思维导图吧。...提问问题: 请帮我绘制一下大学的线性代数整个学习过程的思维脑图,要有层次感,以及能刚好的显示出学习的顺序。...向量组的线性相关性:给出向量组线性相关与线性无关的定义,介绍判断向量组线性相关性的方法,如利用定义、矩阵的秩等。...适用数据 对比分析类数据:如对不同产品的性能、价格、质量等方面进行对比,行可以是不同的产品,列是对比的维度,能直观地看出各产品在不同方面的优劣。...继续提问: 使用放射图模式帮我重新绘制线性代数的目录。 返回结果: 当前已经确认,它只会这个分支图。。。 满血版本DeepSeek联网使用 问题: 介绍一下CSDN的红目香薰博主。

    8400

    R语言相关分析和稳健线性回归分析

    皮尔逊相关 皮尔逊相关是最常见的相关形式。假设数据是线性相关的,并且残差呈正态分布。...product-moment correlationt = -2.0225, df = 15, p-value = 0.06134       cor-0.4628844 肯德尔相关 肯德尔秩相关是一种非参数检验,它不假设数据的分布或数据是线性相关的...rank correlation tauz = -1.3234, p-value = 0.1857 tau-0.2388326 斯皮尔曼相关 Spearman等级相关性是一种非参数检验,它不假设数据的分布或数据是线性相关的...它对数据进行排序以确定相关程度,并且适合于顺序测量。 线性回归 线性回归可以使用 lm函数执行。可以使用lmrob函数执行稳健回归。...这些残差的分布应近似正态。 残差与预测值的关系图。残差应无偏且均等。  稳健回归 该线性回归对响应变量中的异常值不敏感。

    1.1K00

    机器学习线性回归:谈谈多重共线性问题及相关算法

    然而,在面对一堆数据集存在多重共线性时,OLS 就变得对样本点的误差极为敏感,最终回归后的权重参数方差变大。...我们可以绘制每个特征与 y 间的关系图,然后肉眼对比每个特征对 y 的影响情况,关系走势图相近的那些特征就是可能存在共线性的。...得出参数: array([-1. , 0.9]) 再降低A =np.array([[0.5,2],[2,4],[4,8]]),得出参数: array([-0.4, 0.6]) 画出以第一个权重参数随着线性相关性的增加的趋势图...分析上面的共线性数据在使用普通最小二乘,L1最小二乘(套索),L2最小二乘(脊回归)下回归样本后,对新来的数据的预测精度。..., 0.30535714]) 可以看到脊回归和套索回归由于正则化项不同,最终导致的权重参数也一样,最令人印象深刻的是,套索回归由于使用了L1正则化,直接将特征1的权重参数置为0,也就是将强线性相关项中的某一个直接抛弃掉

    2K40
    领券