使用多个str_detect模式对选定列执行Filter_at操作_Python -如何对多个列执行相同的操作-使用前一行计算行 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行

= "Rodentia") 2 多个变量筛选 %in%实现多个变量选择 msleep %>% select(order, name, sleep_total) %>% filter(order...多个条件可以用AND, OR ，NOT 组合。...主要筛选函数： filter_all() 所有列参与筛选，根据筛选条件筛选 filter_if() 逻辑判断确定哪些列参与筛选，根据筛选条件筛选 filter_at() vars()函数定义哪些列参与筛选...，根据筛选条件筛选首先指定哪些列，然后确定筛选器的条件，多数情况下，需要.操作符引向待筛选的值。.... 3 filter_at()筛选条件列优点：自定义待筛选的列，无需指定待筛选的列的类型 #筛选sleep_total, sleep_rem两个变量，所有值均大于5的行 msleep %>%

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TidyFriday 每天 5 分钟，轻轻松松上手 R 语言（四）

例如，要选择总睡眠时间在16至18小时之间的所有动物，我可以使用filter(sleep_total >= 16, sleep_total <= 18) ，但是使用 between ()看起来会更简洁一些...Didelphimorphia North American Opossum 18.0 ## # ... with 27 more rows 基于正则的过滤只有在完全匹配时，我们才能用字符串对变量进行筛选...通过使用 filter (str_detect (name，pattern=“ mouse”)) ，我们会跳过含有 Mouse 的行。...Deer mouse 11.5 ## 5 African striped mouse 8.70 基于多条件的过滤有时我们需要对多个条件进行筛选...dplyr 包还有几个功能强大的包，来支持我们跨列筛选「filter_all」现在有个需求，只要列值包含字母组合 Ca 我们就把这个观测值筛选出来，我们可以用any_vars() 结合str_detect

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数据处理第3部分：选择行的基本和高级的方法

如果要选择多个动物，可以使用％in％运算符。以下代码将仅选择具有属于Didelphimorphia和Diprotodontia顺序的动物的行。...如果是这样，那么将对这些列执行过滤器指令。 *filter_at（）要求你在vars（）参数中指定要进行过滤的列。在这些情况下，有一般语法：首先指定哪些列，然后提及过滤器的条件。...下面的代码基本上要求保留任何变量中包含模式“Ca”的行。...描述列都是字符列，而测量数据是数字。所以使用filter_if（）我可以指定我只想过滤字符变量。在这种情况下，我只得到7行。...Filter at 其中一个更强大的函数是filter_at（）：它不会过滤所有列，也不需要你指定列的类型，你可以通过`vars（）选择要发生更改的列。论据。

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阿榜的生信笔记7—R语言的综合运用1

arrange(test, desc(Sepal.Length)) ：按照"Sepal.Length"这个变量的值对"test"数组进行从大到小排序。...* Sepal.Width)：这段代码使用了mutate函数，将test数据集中新增一个名为new的列，该列的值为Sepal.Length×Sepal.Width。...即最后一列）之外的所有列，然后将结果转换成矩阵（as.matrix），接着再选出前50行（head函数），最后使用pheatmap包中的pheatmap函数绘制热图。...①、多次赋值，产生多个中间的变量 ②、嵌套，代码不易读 ③、管道符号传递，简洁明了三、条件语句和循环语句 1、if条件语句：满足（）里面的条件，执行；不满足（）里面的条件，不执行 ②、长脚本管理的两种方法...('-') } ifelse(i>0,"+",ifelse(i<0,"-","0")) ⑥、for循环 for循环可以机械重复操作符合同一条件的数据，下面列举了三个例子： ## 二、for循环 for

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生信技能树学习笔记 Day 3

函数stringr功能str_length() #测定字符串长度str_split() #拆分字符串str_sub() #按照位置提取字符 str_detect() #检测是否包含某个字符str_replace...筛选filter() #筛选行select() #筛选列逻辑算法① 管道符号快捷键shift + control + M ② 条件代码if(条件，一个逻辑值){条件正确执行操作}else{条件错误进行的操作...}if(条件，一个逻辑值){条件正确执行操作}else if(条件){第二个条件正确进行的操作}用上述方法就可以同时实现多个条件ifelse条件函数ifelse(条件, 条件成立输出, 条件不成立输出)...t1 = str_detect(samples, "tumor") # 检测样本名中是否有tumorifelse(t1, "tumor', "normal") #如果样本名中包含tumor则输出tumor...()代码，进行多个条件判断③ for循环 for (i in x){执行操作}两种循环方式（1）元素循环for(i in x){s= s+i}（2）下标循环for (i in 1:length(x)

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R语言的综合应用-1

(x2,"h") #对x2的每个元素进行检测，含有h的返回结果为TRUE,不含有的返回为FALSE。...* Sepal.Width)注意，这样操作结束后，test还是原来的列数，因为没有给新的赋值。....#1if(){}if(){}else{}if(一个逻辑值，不可以是多个逻辑值组成的向量){CODE1}else{CODE2}当（逻辑值是TRUE时），{运行CODE1}当（逻辑值是FALSE时），{运行...,"tumor")#4 多个条件i = 0if (i>0){ print('+')} else if (i==0) { print('0')} else if (i0,"+",ifelse(i<0,"-","0"))for循环：对x向量里的每个元素i进行同一操作for(i in x){CODE}例如x <- c(5,6,0,3)s=0for

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R语言行筛选的方法--filter

上篇是数据框中列的筛选（R语言列筛选的方法--select），本次讲解行的筛选，主要是介绍filter函数。 1....数据这里，使用asreml分析中的BLUP值为例，相关的模型为： m1 = asreml(Phen ~ G , random = ~ vm(Progeny,ainv) + vm(Dam,ainv) +...生成ID列和类型首先，把rowname提取，作为新的一列 blup1 = blup %>% as.data.frame() %>% mutate(ID = rownames(.)) head(blup1...如果想对ID中，包含ainv的行，进行筛选，可以这样操作： re3 = blup2 %>% filter(str_detect(ID,"ainv")) %>% arrange(-effect) head...固定字符特征进行行筛选 str_detect没有fixed = T的选项，如果想固定字符匹配，可以用fixed()函数： re3 = blup2 %>% filter(str_detect(ID,fixed

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R练习50题 - 第一期

写在前面从这期开始，大猫课堂将会推出一个新的系列：R练习50题，目的是使用50道练习题让大家掌握常用的数据操作，例如寻找每组最大的N个观测等。...在data.table的语法中，先进行列选择操作，再对列进行处理。所以上述语句会先执行str_detect，再执行unique。练习2：每天上涨和下跌的股票各有多少?...这是因为data.table的第一个语句用来对列进行选择，由于我们这里需要对所有列进行统计，所以不需要进行任何操作。 keyby用来进行分组，是整个代码的核心。先来看keyby = ....它是data.table内置函数之一，和unique几乎执行相同的操作，唯一不同的是，unique返回的是不重复的item（是一个向量），而uniqueN返回的是不重复的数量（是一个数字）。...整个代码的执行顺序是：先选择行（逗号空白行），再分组（keyby语句），最后进行组间统计（num语句）。我们的答案中，行、列以及分组三条语句各占一行，实际上这仅仅是为了让代码更直观。

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

新增一列是两列数值的乘积 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 图片图片 select和filter 筛选出来的结果是数据框 3.连续操作，优秀的管道符号...");k2 ifelse(k2,"normal","tumor") 图片多个条件的if判断 #### (3)多个条件 i = 0 if (i>0){ print('+') } else if (i...，可以将每次循环的结果都保存到列表中 ## cbind 按列拼接 a = rnorm(10) b = 1:10 cbind(a,b) ##do.call() 函数是对列表 list操作的函数，批量操作...", ##新的列的名字 values_to = "count") ## 把原来列中的数值一一对应形成一个新的数值列'count' 图片 library(ggplot2...图片图片 ### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素（向量）实施相同的操作 test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30

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R语言-专题

x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表，但是列表不能进行计算，对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split...:图片ifelse()+str_detect(),王炸#ifelse()+str_detect(),王炸samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1",..."normal2","normal3")k1 = str_detect(samples,"tumor");k1ifelse(k1,"tumor","normal")k2 = str_detect(samples...,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor") #警惕写的代码结果顺序和实际相反3.多个条件#### (3)多个条件i = 0if (i>0){ print('+'.../向量中的每个元素（向量）实施相同的操作test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test#返回值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

以上操作根据此前学过的知识新增列的话这么写：图片 4.简单了解：select() 、filter()筛选列、行 5.补充知识：管道符%>% -（1）当遇到连续的步骤时：多次赋值，会产生多个中间的变量；...； -（2）当逻辑值为TRUE时执行大括号内的代码，如果为FALSE就不执行； -（3）如果要执行的代码只有一行可以不加大于号； -（4）实例：安装R包的满分操作——根据一个包是否已安装来决定要不要安装这个包...) 4. ifelse()+str_detect()【王炸】 str_detect()可以检测样本中是不是含有某个字符，然后返回逻辑值，ifelse()对逻辑值T/F进行替换 samples = c("...,"tumor","normal") k2 = str_detect(samples,"normal");k2 ifelse(k2,"normal","tumor") 5. else if() 对多个条件进行判断...如何挑出30个数里最大的五个 -（1）排序 -（2）取最后五个图片 3.向量/列表的隐式循环-lapply() 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图

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R语言基础提升与总结

* Sepal.Width)⭐只是在控制台上对数据框test进行了一些操作，实际上的test还是只有5列！...3.1 if条件语句如果……就……if(一个逻辑值，不可以是逻辑值组成的向量){ }TRUE 执行FALSE 不执行如果……就……否则……if(一个逻辑值，不可以是逻辑值组成的向量){ }else{...do.call完成批量操作4 表达矩阵画箱线图4.1 表达矩阵的概念基因表达的数据通常使用表达矩阵来表示其中矩阵的行代表某个基因在不同样本（不同处理，或时间点等）中的表达水平列表示某个样本中各个基因的表达水平...mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) #数据框新增一列#变形的函数完成宽数据变长数据的操作pdat = dat%>% **pivot_longer...：具体函数对X的每一行/每一列进行FUN这个函数test<- iris[1:6,1:4]apply(test, 2, mean)apply(test, 1, sum)5.2 列表的隐式循环——lapply

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R07-R语言的综合应用

#数据框新增一列，名称是new，结果是Sepal.Length * Sepal.Width两列的乘积连续的步骤1.多次赋值，产生多个中间的变量x1 = select(iris,-5)x2 = as.matrix...ifelse(i>0,"+",ifelse(i0输出“+”，否则执行判断是否<0，T则输出“-”，F则输出0（套娃模式）二、for循环for(i in x){CODE}...# 对x里的每个元素i进行同一操作for( i in 1:4){print(i)} #对1:4中的每个元素进行循环输出批量画图par(mfrow = c(2,2))for(i in 1:4)...FUN是函数#对X的每一行/列进行FUN函数test<- iris[1:6,1:4]apply(test, 2, mean)apply(test, 1, sum)向量/列表的隐式循环---lapplylapply...(list, FUN, …) #对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm) #对1:4中的每个元素进行rnorm操作5.数据框的连接inner_join #取交集连接full_join

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十二、R语言的综合应用

1.4.字符检测 str_detect(x2,"h") ### 看x2这个长度为8的向量中的每个元素是否含有h这个关键词，生成的与x2长度相等且一一对应的逻辑值向量 str_starts(x2,"...###没有赋值，所以修改后的test还是5列图片 2.4 连续的步骤 select() 筛选列 filter() 筛选行 2.4.1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...require(tidyr)) install.packages('tidyr') #### (2)有else if返回的逻辑值是true时，执行if的函数结果，返回的逻辑值是false时，执行的是...FUN是函数 test<- iris[1:6,1:4] apply(test, 2, mean) ### 对test的这个矩阵的每一列求平均值 apply(test, 1, sum) ###.../向量中的每个元素（向量）实施相同的操作 test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #返回值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var

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生信技能树- R语言-day7

elseif(一个逻辑值，不可以是多个逻辑值组成的向量){code1} else{code2}如果逻辑值是FALSE，就执行else里的codeifelse支持单个的逻辑值，也支持多个逻辑值组成的向量...= str_detect(samples,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor")多个条件两种写法1，if。。。...deg$b <0.05;table(k2)x = ifelse(k1,"down",ifelse(k2,"up","no"))table(x)小李的case when写法循环让x里的每个元素i都进行代码操作...head 取头几个tail 取尾巴的几个还没做思考题：如何跳出一个表达矩阵里方差最大的1000个基因思考题：取出大于1的所有行向量/列表的隐式循环-lapplylapply(list, FUN, …)对列表.../向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm)两个数据框的链接merge可以合并inner_join:交集都存在的取inner_join(test1,test2,by="name")

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R数据科学|第十章内容介绍

使用stringr处理字符串本章通过学习字符串的处理，再结合正则表达式进行正确的模式匹配。..., use single quotes' 如果想要在字符串中包含一个单引号或双引号，可以使用 \ 对其进行“转义”： double_quote <- "\"" # or '"' single_quote...字符类与字符选项很多特殊模式可以匹配多个字符： ....，可以使用str_detect()函数。...str_replace_all()函数可以同时执行多个替换： x <- c("1 house", "2 cars", "3 people") str_replace_all(x, c("1" = "one

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生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

Rdata可以保存多个变量，下次使用只需要一次load可以的到多个数据。-Rdata不仅可以保存数据框，也可以保存其他任何数据结构，包括复杂的对象！...table(x)2.7 for循环对x里的每个元素进行同一操作for(i in x){CODE}#x是向量；i是代称，i自动等于某个循环里的x元素for( i in 1:4){ print(i)}#for...#x是数据框/矩阵名；MARGIN为1表示行，为2表示列，FUN是函数test<- iris[1:6,1:4]apply(test, 2, mean)#对test每一列求平均值apply(test, 1..., sum)#对test每一行求和向量/列表的隐式循环-lapply,批量操作### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm...分组信息：是一个有重复值的离散型的向量，分组向量的元素和表达矩阵的列是一一对应的。

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跟小洁老师学习R语言的第七天

* Sepal.Width)连续的步骤# 1.多次赋值，产生多个变量x1 = filter(iris,Sepal.Width>3)x2 = select(x1, Sepal.Length,Sepal.Width...(),王炸samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1","normal2","normal3")k1 = str_detect(samples,"tumor...");k1ifelse(k1,"tumor","normal")k2 = str_detect(samples,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor")多个条件i...FUN是函数test<- iris[1:6,1:4]apply(test, 2, mean)apply(test, 1, sum)#2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素...（向量）实施相同的操作test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test#返回值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile

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生信马拉松 Day7

50行 pheatmap::pheatmap(x3) #画热图 #使用管道符%>%的代码 iris %>% select(-5) %>% as.matrix() %>% head(50)...if，for 碎碎念：这个东西每次好久不用就想不起格式要重新查，脑子是个好东西，就是漏的厉害 rm(list=ls()) #if的格式 if (){ #if后面的括号里只能是一个逻辑值，不可以是多个逻辑值组成的向量...FUN是函数 test<- iris[1:6,1:4] apply(test, 2, mean) #对列操作，得到有names的向量 #Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length...4.9500000 3.3833333 1.4500000 0.2333333 apply(test, 1, sum) ### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表.../向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #=rnorm(1),rnom(2),rnorm(3),rnom(4)，得到一个分别是1/2/3/4个元素的list 5.join

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R语言基础5（绘图基础）

geom_bar(mapping = aes(x = cut)) ggplot(data = diamonds) + stat_count(mapping = aes(x = cut)) #统计变换使用场景...add = "jitter") ggsave(p,filename = "iris_box_ggpubr.png") #3.eoffice包导出为ppt,全部元素都是可编辑模式...sort()##只排序某一列，其他列不改变；无法改变对应关系。...#x是数据框或者矩阵 #margin为行则是1，margin为列是2; #fun为函数 #apply(test,2,mean) #对test的每一列求平均值 sort(x) #对x从小到大排序 head...#对列表向量中的每个元素实施相同的操作 lappy(1:4,rnorm) 两个数据框的连接 #inner_join：取交集 #full_join：全连接 #left_join：左连接 #right_join

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