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awk命指定分隔符输出字符串使用bgzip遇到一个报错

awk指定字符分割字符串指定分隔符输出字符串 遇到问题 使用blasr软件将三代测序数据比对到参考序列 blasr longreads.fastq reference.fasta --nproc 16...如果利用这个ID再来提取比对上reads时就得不到结果 可以利用awk命令把结尾部分去掉 参考链接 https://blog.csdn.net/liangbilin/article/details/...108593296 cat blasr.out | awk '{print $1}' | awk -F '/' -v OFS="/" '{print $1,$2,$3}' > blasr.out1 -F 指定输入文件分隔符...-v OFS 指定输出文件分隔符 bgzip遇到报错及解决办法 这个服务器上没有bgzip这个命令,我使用conda进行安装 conda install tabix 这个安装是 0.2.6版本...conda install tabix=0.2.5 再次解压遇到报错 Error: invalid block header 以上报错不知道什么原因,搜索一番后看到有人说安装好 htslib后就可以直接使用

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字符串拆分为若干长度 k

题目 字符串 s 可以按下述步骤划分为若干长度 k 组: 第一组由字符串前 k 个字符组成,第二组由接下来 k 个字符串组成,依此类推。每个字符都能够成为 某一个 组一部分。...对于最后一组,如果字符串剩下字符 不足 k 个,需使用字符 fill 来补全这一组字符。...给你一个字符串 s ,以及每组长度 k 和一个用于填充字符 fill ,按上述步骤处理之后,返回一个字符串数组,该数组表示 s 分组后 每个组组成情况 。...由于所有组都可以由字符串字符完全填充,所以不需要使用填充字符。 因此,形成 3 组,分别是 "abc"、"def" 和 "ghi" 。...对于最后一组,字符串中仅剩下字符 'j' 可以用。为了补全这一组,使用填充字符 'x' 两次。 因此,形成 4 组,分别是 "abc"、"def"、"ghi" 和 "jxx" 。

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面试题-python3 连续输入字符串,请按长度8拆分每个字符串后输出到新字符串数组

题目 连续输入字符串,请按长度8拆分每个字符串后输出到新字符串数组; 长度不是8整数倍字符串请在后面补数字0,空字符串不处理。...输入描述: 连续输入字符串(输入2次,每个字符串长度小于100) 举例: 输入:abc 123456789 输出: abc00000 12345678 90000000 实现代码 这题首先考察字符串个数...,分为小于8,等于8,大于8情况,其中大于8字符按每8个字符切割,最后余数不足8个继续补齐。...输入要求:输入2次,每个字符串长度小于100。...当大于100时候,可以让用户重新输入,直到小于100 # 作者-上海悠悠 QQ交流群:717225969 # blog地址 https://www.cnblogs.com/yoyoketang/ b

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使用Python拆分一个字符串多个子串多功能函数代码设计

Python把字符串拆成多个子串方法要想将Python字符串拆成多个子串,可以使用字符串对象split()方法。...不过,使用才方法时,需要注意是参数传递,确切来说,需要观察原字符串特点,比如目标子串之间是否有一样分隔符,因此,又可以将该方法使用分成两种情况。...现罗列在下方:子串之间存在一样分隔符,比如“A、B、C”字符串三个子串“A”、“B”和“C”之间都使用“、”间隔开来,那么就可以将“、”字符作为参数传递给split()方法,一次性将Python字符串拆分成多个目标子串...;子串之间不存在一样分隔符,比如“C、D,E”,那就需要多次使用split()方法来拆分字符串以得到目标子串;Python把字符串拆成多个子串函数设计我们应该设计一个函数既可以在具有相同分隔符情况下一次性拆分字符串...,也可以在不存在一样分隔符情况下拆分字符串,因此,我们就需要传递一个参数作为信息告诉函数程序是否具有相同分隔符,然后根据不同情况执行不同程序。

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VBA实用小程序55: 计算一个或多个分隔符字符串分隔成文本块数

学习Excel技术,关注微信公众号: excelperfect 下面的自定义函数:CountBlock函数,可以根据提供一个或多个分隔符进行查找,得到这些分隔符字符串分隔成文本块数。...CountBlock函数代码: ' ---------------------------------------- '参数strText:给出文本字符串 '参数strDelimiter:文本字符串分隔符...函数统计出strText中strChar(即:)数量,加1,得到文本字符串中被分隔符分成文本块数,示例中得到4。...其中iCountString函数来源于《VBA实用小程序54:计算字符串指定字符串出现次数》。 上述测试代码及结果如图1所示。 ?...图2 CountBlock函数很巧妙,它没有像通常那样遍历,而是将文本字符串中不同分隔符统一转换成分隔符参数中第1个分隔符,然后通过计算这个分隔符数量来得出分隔块数。

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Jmeter(二十三) - 从入门到精通 - JMeter函数 - 上篇(详解教程)

脚本 1.9 字符串操作函数 __split 根据分隔符拆分字符串多个变量 2.0.2 __changeCase 转换大小写 4.0 __regexFunction 使用正则表达式解析之前响应结果...:变量名,重用函数计算值引用名 请记得文本字符串添加必要引号。...2.2字符串操作函数 2.2.1__split 根据分隔符拆分字符串多个变量。 当两个分隔符中间没有字符时,返回 ?。...函数__split会通过分隔符拆分传递给它字符串,并返回原始字符串。如果分隔符紧挨在一起,那么函数就会以变量值形式返回"?"。...2、关键参数说明: 待拆分字符串 一个待拆分字符串,例如“a|b|c” 是 变量名 重用函数计算值引用名 否 分隔符 分隔符,例如“|”。

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2021-08-18:扰乱字符串使用下面描述算法可以扰乱字符串 s 得到字符串 t :1.如果字符串长度 1 ,算法停止

2021-08-18:扰乱字符串使用下面描述算法可以扰乱字符串 s 得到字符串 t :1.如果字符串长度 1 ,算法停止。...2.如果字符串长度 > 1 ,执行下述步骤:在一个随机下标处将字符串分割成两个非空字符串。即,如果已知字符串 s ,则可以将其分成两个子字符串 x 和 y ,且满足 s = x + y 。...随机 决定是要「交换两个子字符串」还是要「保持这两个子字符串顺序不变」。即,在执行这一步骤之后,s 可能是 s = x + y 或者 s = y + x 。...在 x 和 y 这两个子字符串上继续从步骤 1 开始递归执行此算法。给你两个 长度相等 字符串 s1 和 s2,判断 s2 是否是 s1 扰乱字符串。...递归分割字符串 s 和字符串 t 。分割时,s左长度=s右长度,t左长度=t右长度。 代码用golang编写。

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示例详解VBASplit函数

标签:VBA,Split函数 使用VBA时,有可能需要根据分隔符字符串拆分为不同部分。此时,就可以使用VBASplit函数。...Split函数是ExcelVBA中内置字符串函数,可用于根据分隔符拆分文本字符串。...如果是一个长度字符串(“”),SPLIT函数将返回一个空数组。 2.参数Deimiter,可选,指定用于拆分“Expression”参数分隔符。如果不指定此参数,则空格字符被视为默认分隔符。...图1 在本示例中,只指定了第一个参数,即要拆分文本。由于未指定分隔符,因此将空格字符作为默认分隔符。 注意:VBA Split函数返回索引基于0开始数组。...图4 示例4:拆分句子指定数量 通过Split函数,可以指定希望获得拆分次数。例如,如果没有指定任何内容,分隔符每个实例都将用于拆分字符串

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UWP WinRT 使用系统自带分词库对字符串文本进行分词

本文将和大家介绍在 UWP 应用,或其他能接入 WinRT 应用里,使用系统自带分词库,对中文、英文等等自然语言字符串文本进行分词 开始之前需要说明是,现在不仅仅 UWP 应用,其他 UI...可以传入 可以传入语言文化字符串请参阅 BCP-47 标准文档 创建过程中,由于不同用户设备可能安装有不同分词库,可能传入语言文化对应分词库是在当前设备上找不到。...} 如果传入语言文化在本机没有找到,那么 ResolvedLanguage 将会是 “und” 字符串值。...这个时候将采用通用语言文化无关规则进行分词 值得一提是这里传入语言文化是采用本机语言文化库进行分词,传入中文语言文化不代表只能对中文字符串进行分词,而是采用中文语音文化规则对文本字符串分词,可以支持中文英文和数字等等...创建了 WordsSegmenter 对象,即可通过 GetTokens 方法进行分词,分词时可以看到分出每个单词和对应词在字符串里面的偏移量 以上就是 WinRT 使用系统自带语言文化分词库对文本进行分词方法

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Perl正则表达式:文本处理

其中s///可以理解正则表达式模式,也可以理解操作符,其要修改数据必须储存在变量,使用绑定操作符指定替换操作(不指定使用默认变量$_),中如下所示: $_ = "He's out bowling...⑵拆分模式 split是拆分模式正则表达式,会根据模式匹配结果拆分字符串,其第一个参数正则表达式,第二个参数拆分字符串,返回值拆分字符串列表,假如有空子字符串,默认开头和中间会被保留...①join函数 join函数split操作符逆操作,是指通过特定分隔符将不同子字符串连接起来,因为是指定的确定分隔符,所以不需要使用正则表达式进行模糊匹配,因此不是join函数模式操作符。...自动循环+自动输出,相当于 while() { 脚本; print; }; -a:可与-n或者-p一起使用,负责打开自动拆分模式,用于对字符串指定分隔符进行隐式拆分,默认为以空白符拆分拆分字符串列表保存到...@F中,相当于@F=split '字符串',分隔符可以使用-F参数指定; -F:其后直接加分隔符或者模式,放在-a参数之前,模式是位于斜杠、单引号或双引号之间正则表达式。

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Linux 基础下

awk awk //基于列文本报告工具 语法:awk [选项] '匹配模式 {执行动作}' -F '' //指定分隔符,可以使用正则表达式[]指定多个分隔符...:"$1}' /etc/passwd //使用:分隔符分割/etc/passwd文件中内容,按照想要格式打印出来 awk -F ':' '{...print "第一列:"$1,"第二列:"$2,"第三列:"$3}' /etc/passwd //使用:分隔符分割/etc/passwd文件中内容,按照想要格式打印出来...:或多个/或多个:/分隔符分割/etc/passwd文件中内容,打印出第1列和第6列 文本过滤和流编辑器sed sed //基于行过滤和转换文本流编辑器 语法...//删除第一个关键字到第二个关键字中间所有的行 文本过滤grep grep //搜索文本内容,并将匹配内容所在一整行都显示出来 //支持使用正则表达式来过滤文本

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Python 超高频常见字符操作【建议收藏】

字符串格式化 字符串格式化是一种将变量或数据插入到字符串方法,以创建具有特定格式文本。在 Python 中,字符串格式化可以通过多种方式实现。 1....} 13 右对齐 (默认, 宽度 10) 13 {:<10d} 13 左对齐 (宽度 10) 13 {:^10d} 13 中间对齐 (宽度 10) 11 ‘{:b}’.format(11)‘{:d...下面是其中几种常用方法: 1.replace() 方法: 该方法用于替换字符串指定字符串字符串。 text = "Hello, World!"...以下是几种常见方法: 1.split() 方法: 该方法根据指定 分隔符字符串拆分成子字符串,并返回一个列表。 text = "Hello, World!"...words = text.rsplit(",", 1) # 从右侧使用逗号作为分隔符拆分一次 print(words) # 输出:['Hello', ' World!']

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【js】字符串反转可实现几种方式「建议收藏」

大家好,我是架构君,一个会写代码吟诗架构师。今天说一说【js】字符串反转可实现几种方式「建议收藏」,希望能够帮助大家进步!!!...方式1: 这种方式比较简单,推荐使用 字符串转数组,反转数组,数组转字符串。...split(""):根据空字符串拆分数组 reverse():数组反转元素位置 join(""):数组转回字符串,且不带分隔符 实现效果如图: 方式2: 这种方式相对麻烦,但也可以。...定义新字符串,遍历str,charAt()是取字符串一个字符,先去最后一个字符,再取倒数第二个...以此类推。 都放到新字符串前面。...这样就是倒序了 方式3: 这种方式有点类似第一种方式底层实现版,一般不推荐使用。 把中间数组元素替换位置换成了可以理解。但是太繁琐。有了可使用函数就可以不用这样了。

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day05-字符串

,如果字符串长度奇数,则返回中间字符;如果长度偶数,则返回中间两个字符(可使用判断语句if else) # 第一题 str = "hello world" print(str[0] + str[-1...str.count(sub) 统计子串在字符串中出现次数 str.replace(old, new) 将字符串指定子串替换为新子串,返回新字符串 str.split(sep) 使用指定分隔符字符串拆分为子字符串列表...hello,world" new_str = "hello,world,python" print(str.split()) # 默认以空格分隔符进行拆分,返回列表 print(my_str.split...'hello', 'world'] ['hello', 'world,python'] # 注意:如果原始字符串不存在分隔符,如果是默认以空格分隔符来划分,则返回包含整个字符串列表。...is 7)将字符串my_str按照空格拆分并输出 8)字符串下标7字符是什么 9) 字符串最后索引字符是什么 10)检查字符串是否以子字符'we' 开头 11) 检查字符串是否以子字符'ly' 结尾

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VBA数组(五)数组函数2

因为此时动态数组在使用Erase语句后已经不存在了。 Split函数 Split函数把一个文本字符串按照指定分隔符分开,返回一个一维Variant变体型数组,该数组最小索引号为0下界。...1、参数expression必需,String型,即要拆分成数组字符串。 2、参数delimiter可选,参数拆分分隔符,如果省略则使用空格做为分隔符。...函数中第三参数limit返回字符串数,通常是不指定。下面通过示例简单介绍下如何使用: 如果将上面示例修改下。在Split函数中加入第三参数limit参数2,即要求拆分成两个字符串。...Join函数 上面介绍Split函数是将字符串分割,然后返回一个一维数组。那么Join函数正相反,Join函数是将一个一维数组里元素使用指定分隔符连接成一个新字符串返回。...2、参数delimiter可选,String字符串型,用来连接数组各元素分隔符。如果没有指定该参数,那么使用空格作为分隔符

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使用awk和正则表达式过滤文件中文本字符串

当我们在 Unix/Linux 中运行某些命令来读取或编辑字符串或文件中文本时,我们很多时候都会查找指定特征字符串。这可能会使用正则表达式。 什么是正则表达式?...正则表达式可以定义表示多个字符序列字符串。关于正则表达式最重要事情之一是它们允许你过滤命令或文件输出、编辑文本或配置文件一部分等等。...[character(s)]它匹配字符中指定任何一个字符,也可以使用连字符(-)表示一系列字符,例如[a-f]、[1-5]等。 ^ 它匹配文件中一行开头。 $ 匹配文件中行尾。...为了过滤文本,必须使用文本过滤工具,例如 awk 你可以想到awk作为自己编程语言。但是对于本教程使用范围awk,我们将把它作为一个简单命令行过滤工具来介绍。...K或k开头字符串T: # awk '/[Kk]T/{print}' /etc/hosts 指定范围内字符 用awk理解字符: [0-9] 表示一个数字 [a-z] 表示匹配单个小写字母 [A-Z]

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使用 Python 拆分文本文件最快方法是什么?

在 Python 中拆分文本文件可以通过多种方式完成,具体取决于文件大小和所需输出格式。在本文中,我们将讨论使用 Python 拆分文本文件最快方法,同时考虑代码性能和可读性。...拆分() 方法 拆分文本文件最直接方法之一是使用 Python 中内置 split() 函数。基于指定分隔符,此函数将字符串拆分为子字符串列表。...接下来,在文件对象上使用 read() 方法将文件全部内容作为单个字符串读入内存。 然后在此字符串上调用 split() 函数,换行符 \n 作为分隔符传递。...然后对内存映射文件调用 read() 方法,该文件像以前一样将文件全部内容读取到单个字符串中。 然后在此字符串上调用 split() 函数,再次使用换行符 \n 作为分隔符传递。...这会将字符串拆分为子字符串列表,其中每个子字符串对应于原始文件中一行。最后,结果存储在变量行中。 结论 总之,使用 Python 拆分文本文件最快方法取决于文件大小。

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