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使用TBtools叶绿体蛋白编码基因进行GO注释

第一步:根据叶绿体基因组的genbank注释文件获得蛋白编码基因序列 提取序列的python脚本 import sys from Bio import SeqIO input_file = sys.argv...python extract_CDS_from_gb.py input.gb output.fasta 第二步:使用diamond将叶绿体的蛋白编码基因与swissprot数据库比对,获得TBtools...做GO注释需要的.xml格式文件 参考文献:DIAMOND: 超快的蛋白序列比对软件 下载swissprot数据 wget ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot...这样GO注释就做好了,TBtools也会对应有可视化工具,这里我选择使用R语言的ggplot2进行展示 library(ggplot2) df<-read.csv("Bhagwa_cp_protein_coding.csv...image.png 结果进行可视化遇到的问题 数据框如何根据指定列分组排序,比如我的数据 X Y 1 A 1 2 A 2 3 B 3 4 B 4 5 C 5 6 C 6 我想ABC分别从大到小排序

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独立使用ESLint+Prettier代码进行格式校验

前言 写Vue项目时,使用CLI搭建项目,勾选上ESLint+Prettier就会自动帮我们配置好,最近写的代码脱离了webpack,想规范自己的代码格式,搜了很多文章,大都是基于webpack的。...经过我一番折腾后,终于搞出了不需要webpack就能让编辑器结合ESLint代码进行格式校验,接下来就跟大家分享下我的实现过程,欢迎各位感兴趣的开发者阅读本文。..."bracketSpacing": true // 大括号之间的空格 } 配置编辑器 配置ESLint 打开webstorm的设置面板,按照图中所示进行设置 在eslint配置文件处右击,按照图中所示进行操作...配置prettier 打开webstorm的设置面板,按照图中所示进行设置 更多配置 本文只介绍ESLint和prettier的入门使用,更多配置请移步: ESLint文档: ESLint Prettier...测试下自动格式化代码,如图所示写完代码后按Ctrl+S即可自动格式

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使用 CryptoJS 编写 JS 脚本密码变量进行预处理

在 Pre-request Script Tab 下,使用 CryptoJS 编写 JS 脚本密码变量进行预处理 # Pre-request Script var password = "hu123456..."; //md5加密 //使用JS模块CryptoJS中的md5去加密数据 var password_encry = CryptoJS.MD5("hu123456").toString(); console.log...password_encry", password_encry); 预处理设置变量有 2 种方式:全局变量、局部变量 需要注意的是,如果设置到局部环境,我们需要先新建一个环境,并创建一个变量才能在 JS 脚本中引用...image.png 最后,在请求体中替换成上面设置的变量即可 image.png 最后 Postman 可以借助 CryptoJS 完成大部分数据的加密,但是它并不支持 RSA 算法 这里可以使用另外一个算法库...「 forgeJS 」来进行 RSA 的加解密

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使用Numpy特征中的异常值进行替换及条件替换方式

原始数据为Excel文件,由传感器获得,通过Pyhton xlrd模块读入,读入后为数组形式,由于其存在部分异常值和缺失值,所以便利用Numpy其中的异常值进行替换或条件替换。 1....按列进行条件替换 当利用’3σ准则’或者箱型图进行异常值判断时,通常需要对 upper 或 < lower的值进行处理,这时就需要按列进行条件替换了。...data[:, 1][data[:, 1] < 5] = 5 # 第2列小于 5 的替换为5 print(data) # [[100. 5. 2. 3. 4.] # [ 10. 15. 20....2: x[i] = x_mean # print(i) return x df = df.apply(lambda x:panduan(x),axis=1) 以上这篇使用...Numpy特征中的异常值进行替换及条件替换方式就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考。

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在PhpStorm中使用PSR2编码规范phpcbf脚本自动修正代码格式

团队开发约定使用PSR-2的编码风格规范,但是并不是所有人都严格按照PSR-2来提交代码的 最大的原因就是口头的约束力极为有限,而团队中大家使用的编辑器不统一,有使用PhpStorm,也有使用VS Code...的等等,而各种编辑器都有自己的格式化规则,因此代码风格统一是个问题 之前的文章使用phpcbf脚本自动修正代码格式,很少有开发者只使用终端开发代码,通常都会用到编辑器,这篇文章介绍一下在PhpStorm...中集成phpcbf、phpcs 让编辑器使用PSR-2标准 1、打开PhpStorm的设置页(File->Setting或者Ctrl+Alt+s),到Code Style页PHP中选择风格为 PSR1/...PSR2 下面还有一处,也要选中 现在使用PhpStorm的格式化,将会自动格式化成psr-2的风格 经过上面的操作,PhpStorm代码格式化的规则基本与phpcs的规则基本一致了,但也有一小部分不一致...原创文章采用CC BY-NC-SA 4.0协议进行许可,转载请注明:转载自:在PhpStorm中使用PSR2编码规范phpcbf脚本自动修正代码格式

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使用JAVA如何图片进行格式检查以及安全检查处理

不过这种判断方式也不是完全没有用,我们可以把它放在判断图片的最外层,如果一个文件连扩展名都不是我们所要求的图片扩展名,那就根本不用后面的内容格式检查了,从一定程度上说,减少服务器的压力还是有一定的帮助...2)、根据文件的前面几个字节,即常说的魔术数字进行判断,不同文件类型的开头几个字节,可以查看我的另外一篇专站介绍:表示不同文件类型的魔术数字。...这就是在一张正常的图片末尾增加的一些iframe代码,我曾经尝试过单独打开这张图片,也将这张图片放于网页上打开,虽然这样都不会被执行,但并不代表插入其它的代码也并不会执行,杀毒软件(如AVAST)这种修改是会报为病毒的...呵,我们这个时候可以对这个图片进地重写,给它增加水印或者进行resize操作,这样新生成的图片就不会再包含这样的恶意代码了,以下是一个增加水印的JAVA实现: [java] view plain

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在PhpStorm中使用PSR2编码规范phpcbf脚本自动修正代码格式

PSR 规范是个好东西 团队开发约定使用 PSR-2 的编码风格规范,但是并不是所有人都严格按照 PSR-2 来提交代码的 最大的原因就是口头的约束力极为有限,而团队中大家使用的编辑器不统一,有使用 [...Php](https://www.oschina.net/p/php)Storm,也有使用 VS Code 的等等,而各种编辑器都有自己的格式化规则,因此代码风格统一是个问题 之前的文章使用 phpcbf...脚本自动修正代码格式,很少有开发者只使用终端开发代码,通常都会用到编辑器,这篇文章介绍一下在 PhpStorm 中集成 [php](https://www.oschina.net/p/php)cbf、...PSR2 下面还有一处,也要选中 现在使用 [Php](https://www.oschina.net/p/php)Storm 的格式化,将会自动格式化成 psr-2 的风格 经过上面的操作,[Php...](https://www.oschina.net/p/php)Storm 代码格式化的规则基本与 [php](https://www.oschina.net/p/php)cs 的规则基本一致了,但也有一小部分不一致

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「Android音视频编码那点破事」第六章,使用MediaMuxer音视频进行混合封装

封面出自:板栗懒得很 本章仅对部分代码进行讲解,以帮助读者更好的理解章节内容。 本系列文章涉及的项目HardwareVideoCodec已经开源到Github,支持软编和编。...使用它你可以很容易的实现任何分辨率的视频编码,无需关心摄像头预览大小。一切都如此简单。目前已迭代多个稳定版本,欢迎查阅学习和使用,如有BUG或建议,欢迎Issue。   ...*/ start() /** * 用于向Muxer写入编码后的音视频数据。...我们先来构造一个Muxer,需要两个参数,第一个是音视频文件的保存路径,第二个是音视频封装文件的格式,可以选择mp4或3gp,我们使用mp4就好。...release() } 本章知识点: 使用MediaMuxer音视频进行混合封装。 本章相关源码·HardwareVideoCodec项目: MuxerImpl

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高效的Shell编程建议及入坑

比如: if [[ $# < 2 ]];then echo "#这时只有一个参数及运行的shell脚本文件 = $0" exit fi 7)编码要统一 尽量使用UTF-8编码能够支持中文等一些奇奇怪怪的字符...9)请勿再脚本编码敏感信息 描述:不要把密码编码脚本里,不要把密码编码脚本里,不要把密码编码脚本里。..." #条件不满足 } 14) 变量预定义 描述: 注意在shell脚本中的 : 可作为预定义变量使得不将变量中的字符串作为命令执行; 命令使用1: # 差异查看 : ${VAR1:="Linux"}...原因:test.sh是我在windows下编辑然后上传到linux系统里执行的,.sh文件的格式为dos格式,而linux只能执行格式为unix格式脚本。...^M 是dos的格式 \rn 是微软 \n 是linux \r 是苹果 举出三种解决方法:为了防止中文乱码:建议编码设置UTF-8无BOM格式

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NerbianRAT样本分析报告

最后一个函数是创建计划任务实现持久化运行,首先通过CMD调用格式化好的命令创建计划任务。 我们可以打开计划任务查看,可以看到触发条件是每隔1小时运行一次。...加密后的Buff为0x100 然后拼接了0x14C大小的缓冲区 接下来使用了AesCBC模式加密,使用补全码0x4填充了4字节到0x150大小 使用编码的32字节Aes密钥进行加密 使用编码的...使用AesCBC模式加密后 接着生成了70个字节的随机数 使用Base64AesCBC模式加密后的数据进行编码 将随机生成的70个字节数据填充到头部,将AesCBC模式加密使用的32字节大小随机生成密钥存放在...将MD5转为十六进制 之后将0x40字节大小的全局变量和bios信息MD5值和字符串windows进行格式化,随后直接使用Base64这些数据进行编码。...Base64编码,其他的4个字段的数据都可以使用这个脚本解密,auth_post和data_post使用了3层加密,第一层的数据使用了RSA-2048进行加密,第二层req使用编码的AesCBC密钥加密

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框架安全之Shiro渗透复现

由于使用了AES加密,成功利用该漏洞需要获取AES的加密密钥,在Shiro1.2.4版本之前AES的加密密钥为编码,其默认密钥的Base64编码后的值为kPH+bIxk5D2deZiIxcaaaA==...0x04 自动化工具及上线CS 这里介绍一款反序列化远程命令执行利用脚本shiro-1.2.4-rce,传送门 利用条件:shiro <= 1.2.4 使用延时判断key和gadget,即使目标不出网也可以检测是否存在漏洞...从而实现URL的访问控制,URL路径表达式通常为ANT格式。即访问/index时无需登陆,而访问/user/test时需要登陆认证。...3)Kali通过代理使用脚本进行Attack 配置proxychains.conf vi /etc/proxychains4.conf ?...遗憾的是这里还是有点小bug,没能复现成功,但基本思路就是这样 六、总结 Shiro框架使用了AES对称加密技术,故其加密密钥与解密密钥一致,并且密钥是编码在代码中的,容易获取。

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通用规则平台的设计与应用

但是不同于 SaaS 服务,直播带货属于平台级的业务,平台有义务平台商家的商品进行审核,剔除部分因为资质或者商品类目不满足平台要求等等原因而不允许售卖的商品。然而,不同的直播卖货渠道审核规则多样化。...历史流程通过查询接口获取校验字段,编码规则商品类目、标题等一系列商品属性进行校验,对于不符合规则的商品返回相关的提示文案。...除此之外,文案的解析也使用脚本执行引擎,来支持动态的文案参数解析和逻辑解析。 3.2.3 规则灰度发布流程 配置化导致了变更的便捷。但是便捷的流程如果没有可靠的保障,频繁变更之下就很容易出错。...在灰度配置中校验规则格式正确性,在灰度运行时校验规则逻辑正确性。...四、总结 配置化的规则替代了编码的校验逻辑,减少了修改规则发布代码维护的成本,使原本的规则变更周期从一周的修改测试发布变成了实时更改。同时规则的灰度发布也使验证变得简单。

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从 jsonpath 和 xpath 到 SPL

早期,没有专业的json/XML的后处理技术,JAVA开发者通常要采取写代码或入库再算的方式。编码计算能力差,代码量大,开发效率很低。...比起以前编码的方式,XPath/JsonPath代码简短得多,具有突破性的计算能力。         ...比如,用arronlong HTTP函数库从WebService取XML字符串,使用Dom4J函数库将XML字符串解析为Document类型,使用Dom4J内置的XPath语法进行条件查询: String...从这些例子可以看出来,JsonPath/XPath的语法直观易懂,可以用较短的代码实现条件查询和聚合计算,可以方便地访问多层结构,比编码方便多了。...,可使用选项@m: Orders.select@m(Amount>1000) 排序过的数据,用二分法进行快速过滤,可用@b: Orders.select@b(Amount>1000) 函数选项还可以组合搭配

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关于自动化测试脚本设计那些事

优缺点: 是一种非结构化的编程方式 测试用例由脚本定义 非常低的开发成本 测试人员所需要的编程方面的技巧几乎可以忽略 不需要计划、设计 测试数据在脚本中是编码脚本会很脆弱,因此维护成本会很高 没有公用的脚本...在脚本中,典型的结构控制是使用“if-else”, “switch”,“for”,“while”等条件状态语句来帮助实现判定、实现某些循环任务、调用其它覆盖普遍功能的函数。...优缺点: 是结构化的脚本编写方法 测试用例在脚本中定义 编程的成本要比线性脚本编写方法略为高一点 需要测试员的调整编码技巧 需要某种程度上的计划、设计 测试数据也是在脚本中被编码 因为相对稳定一点,所以需要相对少的脚本维护...意味着把被测应用程序的公共的、普遍的功能的测试脚本独立出来,其它脚本进行调用。这使得某些脚本按照普遍功能划分来标准化、组件化。这种脚本甚至也可以使用在被测系统之外的其它软件应用系统。...优缺点: 脚本是结构化的 测试用例在脚本中定义 开发成本相对于结构化脚本编写方法来说要降低一些,因为减少了很多复制的劳动 需要测试员的调整代码的编程技巧 由于脚本需要模块化,所以需要更多的计划和设计 测试数据也是编码

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干货 | 高效联动,携程机票IVR可视化的探索和实践

话术配置 话术模板存放在配置中心,然后编码解析动态话术 提供可视化的话术配置页面,并且实现通用解析话术逻辑 开关 需要在代码中定义开关 通过语言线配置解耦、灰度版本控制支持开关功能,无需编码 三、...脚本引擎 在脚本引擎中,可以编辑`JavaScript`脚本实现服务调用,并且可以对接口返回的结果进行处理。 话术模板 可以插入动态话术、支持循环播报、支持时间格式化。...(3)规则引擎 规则引擎用于IVR流程中条件分支规则判断,我们基于react-awesome-query-builder开源组件,并该组件进行扩展,支持输出javascript脚本,满足业务需要。...(4)脚本编辑及调试 脚本编辑使用Monaco Editor编辑器,支持智能提示,并且我们智能提示进行扩展,使编辑器支持自定义的方法和对象,更加人性化,操作更方便。...在运行沙箱中的代码时,使用try/catch进行包裹,避免脚本出现问题导致全局崩溃。

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使用 Shell-Operator,让 Pod 继承节点标签

Shell Operator 的基本开发流程是: 编写配置文件,确定触发条件。 开发操作脚本,打包容器镜像。 确定操作权限,设置 RBAC。 运行和测试。...官方的例子中,入口脚本如果带有参数 --config,就会返回一段 YAML 格式的配置文件,这部分是编码到代码之中的,例如: #!...使用 jqFilter 关注 .spec.nodeName 字段的变化,仅变化时触发 给对象 Pod 提供两个标签 node-dc 用于标注该对象是否已经完成标签复制,完成的不触发。...node-label 用于标注该对象是否需要进行标签复制,没有该标签的不进行触发。 用这个配置文件生成 ConfigMap,预备给 Pod 进行加载。...这个功能需要读取 Node 信息,并为 Pod 打标签,Pod 中的 Kubectl 会用 ServiceAccount 凭据集群进行操作。所以需要进行 RBAC 配置。

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