今天在用conda配置python环境是提示更新conda的版本，更新命令如下 conda update -n base conda 就被告知以下错误：PermissionError(13,'Permission...分析：当我用root用户去执行时，由于没有将anaconda3加入到root 用户下的环境变量，所以提示conda 命令不存在 ?...查看以下anaconda 的具体信息，可以发现anaconda 的用户主和用户组都是root 用户，因此普通用户不允许去更改升级 ls -l ~ ?...然后运行更新命令，看能否更新 conda update -n base conda 结果如下，更新成功 ? 查看conda 的版本 conda --version ?...选择这种方法的原因是我已经将conda 加入到非root用户（lizeguo)下，所以就只用更改文件的用户和用户组，也可以去将anaconda 加入到root用户的环境变量下，以root用户去更新conda
search 关键字 3、安装软件包 pip install 软件包名字 pip install 软件包名字==版本号 4、卸载软件包 pip uninstall 软件包名字 5、批量安装软件包 先把需要安装的软件写入一个...txt中，一行写一个软件包，再进行安装 pip install -r requirements.txt 6、conda的使用 Anaconda的conda命令与pip相近，conda的软件包都是经过Anaconda...测试的，更适合Windows平台且兼容性更好，更省事
Anaconda使用conda命令来进行包管理和虚拟环境管理. anaconda和conda区别: conda是一个工具，主要是进行包管理和虚拟环境管理. anaconda是一个包含了众多的package...二 conda的使用 1.使用conda安装包 比如安装django包 conda install django 出现报错信息 Collecting package metadata: failed...解决方案: 同时使用国内镜像进行安装相应的包 速度方面也会得到提升 找到用户目录下的.condarc文件,我这里是C:\Users\Kevin 将文本内容替换成以下内容 channels: - http...创建虚拟环境 # 使用conda在python3.6下创建一个名称为testEve的虚拟环境 conda create -n testEve python=3.6 # 进入testEve虚拟环境中 activate...# 删除虚拟环境 将创建的名为testEve,版本3.6的虚拟环境删除 conda remove -n testEve python36 --all # 查看目前剩余的conda虚拟环境 确认是否已经删除
本文由腾讯云+社区自动同步，原文地址 http://blogtest.stackoverflow.club/tls-timeout-docker/ 修改/etc/docker/daemon.json 添加的内容如下...123 { "registry-mirrors": "https://registry.docker-cn.com"} 重启docker 1 service docker restart 修改保存后重启...Docker 以使配置生效。
官网: https://www.anaconda.com/ conda的安装 下载安装包 -- bash 安装 -- 接受协议 -- 选择默认安装路径（回车） -- 重新激活环境 -- 调用帮助文档 #...source ~/.bashrc ## 查看 conda 的帮助文档 conda --help 配置镜像 我们使用 conda 安装软件时，conda 会去 channel 中搜索软件，如果使用的服务器是在国内...## 配置镜像 # 下面四行配置北京外国语大学的conda的channel地址（首选） conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/...=3的软件作为依赖 # 查看当前conda环境 conda info -e conda env list # 每次运行前，激活创建的小环境rna conda activate rna # 退出小环境...conda deactivate 在小环境中安装生信软件 注：软件都要安装在小环境中，不要安装在 base # 激活环境 conda activate rna # 安装 fastqc 软件 conda
设置Sh00t的最简单方法是使用Conda环境。但是，如果你安装了Python 3和pip，Anaconda是可选的 - 你可以跳到下面的第4步。...2.创建一个新的Python 3环境：conda create -n sh00t python=3.6 3.激活sh00t环境：conda activate sh00t。...如果你看到类似CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use ‘conda activate’的错误消息...按照显示的说明和错误消息进行操作。你可能需要重新加载bash配置文件或重启终端。尝试再次激活sh00t：conda activate sh00t。...在执行评估时，我们通常会提供特定于应用程序中某些场景的自定义测试用例。可以在任何时间点轻松创建一个新的Flag。 每当确认一个Flag为有效bug时，就会创建一个Sh0t。
什么是conda？ conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。...通过conda安装软件 1.省时省力省bug 2.方便管理和更新 3.安装时不用配置环境变量 01 安装anaconda/miniconda 首先进入anaconda的网址 https://www.anaconda.com...，软件会询问安装路径，如果是个人使用，默认安装路径就可；如果你是管理员，最好自己创建一个公共的文件夹。...02 添加环境变量 如果在安装conda的最后一步时，你选择了yes，那么它会自动给你环境变量，直接source一下即可使用。.../pkgs/main/ conda config --set show_channel_urls yes 04 conda使用 1.搜索软件 conda search r 2.安装软件 conda
容器可以解决很多问题，并且具有诸多优势，当你投身其中时便会发现其奥妙所在。 第一：容器是不可变的 - 操作系统，库版本，配置，文件夹和应用程序都包装在容器内。...这样将更容易重新创建，管理和分发您的图像。 5)不要从正在运行的容器中创建镜像 – 换句话说，不要使用“docker commit”创建镜像。 这种创建图像的方法不可重现，应该完全避免。...基于容器分层文件系统的性质，标签实际上是被鼓励使用的，你应该不会希望看到当你几个月后创建镜像时的不兼容，或从创建缓存的检索中检索到了一个错误的“最新”版本。...当您不能跟踪正在运行的版本时，在生产环境部署容器时应该避免“最新”标签的出现。...9)不要以root用户身份运行进程 - “默认情况下，docker容器会以root身份运行。随着Docker的成熟，更安全的默认选项可能会变得可用。
Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理，并且已经包含了Python和相关的配套工具。...设置国内镜像源 由于 conda默认是官网的镜像源，某些大包下载速度感人，再加上不确定的墙，雪上加霜，依赖很多的包下载不仅速度差，往往还会导致下载失败 conda config --add channels...https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ 这个地址是清华大学的地址源，如果需要最新的包还是推荐官网下载 使用 |创建环境 创建指定版本的...安装py3.5 |激活环境（指定系统默认版本py） linux mac ：source activate py35 （py35是刚起的名，不是填python的版本） windows： activate...image.png 安装 py包 安装 virtualenv conda install virtualenv 查看 已经安装的包列表 conda list 查看 指定环境下的py包 conda
=3.8.8 #创建python3.8.8环境activate py_env #激活环境deactivate py_env #退出环境 2.5 PySpark安装 三个节点也是都需要安装pySpark的...create -n pyspark_env python=3.8 #创建虚拟环境后，它应该在 Conda 环境列表下可见，可以使用以下命令查看conda env list #现在使用以下命令激活新创建的环境...：source activate pyspark_env或者conda activate pyspark_env 如果报错: CommandNotFoundError: Your shell has...not been properly configured to use ‘conda deactivate’.切换使用 source activate #您可以在新创建的环境中通过使用PyPI安装PySpark...--all 激活虚拟环境conda activate myenvsource activate base 退出虚拟环境conda deactivate myenv 2.6 初体验-PySpark shell
新版的 conda 默认会使用conda activate transcriptome来激活环境。...初次使用时会弹出一个提示，需要运行conda init： conda activate qiime2-2020.6 CommandNotFoundError: Your shell has not been...而且如果是根用户安装时，不建议把conda环境默认加到环境变量中，会引起不必要的系统冲突。可以给个用户自己使用是自己配置对应的环境变量。...激活环境后，会看到命令行提示前多了一个环境名字，比如下面激活qiime2-2020.6环境后的展示。...Use 'conda deactivate'. ct@ehbio:~# which python /usr/bin/python 1.4.2 在环境 phylo 中安装 ete3 起因是使用官方的推荐命令安装时出了问题
“目标记忆再激活（TMR）”这种方法可以促进记忆巩固并诱导海马活动，这表明涉及重新激活新的记忆或其中一部分。虽然气味和声音都是有效刺激，但气味的好处是很少唤醒睡眠受试者。...基于上述理论，本文在睡眠时通过对单个鼻孔进行气味刺激来局部激活单个半球的记忆（图1）。这种方法可以评估局部刺激对相应半球的行为记忆和电生理影响，而与另一半球相关的记忆和活动作为对照组（图1A）。...因此，SW功率受嗅觉刺激影响，而纺锤体功率仅在涉及记忆再激活时升高。...本文研究与局部记忆重激活一致，并对其使用单独的解剖路径来阐明局部处理：单侧气味刺激能控制得到提示的区域，并将它们与未得到提示的处理平行记忆的同源区域进行比较，从而更详尽地分离和研究睡眠中的记忆重激活过程...使用Spearman相关来测试SW功率和记忆改善间的相关性，使用单尾Fisher r-to-Z变换检验相关性间的差异。使用聚类校正的跨时频bins的非参数置换检验探究半球间的振荡功率差异。
、依赖和环境管理器Anaconda Navigator为什么要使用Conda？...常用conda install （主命令+子命令）1.3 配置频道要配置好conda的频道才能用conda安装该频道的软件1.找到需要添加的频道2.复制链接地址3.添加conda频道的命令：conda...list/conda info --env列出已经存在的小环境1.4.3 小环境的修改与删除1.4.4 使用conda安装软件1.4.4.1 需要安装哪些软件？...1.4.4.2 哪些软件可以使用conda来安装？在安装之前确保小环境被激活conda可以一次安装多个软件，但是容易遇到报错1.4.4.3 如何指定安装的软件的版本？...添加-y参数可以跳过确认执行的步骤了解内容：用mamba让软件安装更加顺滑安装mamba：conda install mambamamba的使用：除启动环境外，所有conda的命令都可以用mamba来代替
前几天构筑开发环境，使用了一些docker命令，随手记下来。...经常使用的命令（bash>开头的操作为容器中，其他的均是在宿主机器上）# 下载rhel8的镜像文件docker pull roboxes/rhel8 #获取镜像docker images...ps #正在运行的容器列表docker stop containerID #停止容器docker exec -it 77xxx /bin/bash #进入正在运行的容器bash>yum install.../7/x86_64/stable/gpgcheck=0windows图片开始使用搜索镜像仓库。...比如要构建oracle19c的docker镜像。
When you issue a docker build command, the current working directory is called the build context....actually lives, all recursive contents of files and directories in the current directory are sent to the Docker...发出docker build命令时，当前工作目录称为build context。默认情况下，Dockerfile假定位于此处，但可以使用文件标志（-f）指定其他位置。...不管Dockerfile实际位于何处，当前目录中文件和目录的所有递归内容都将作为构建上下文发送到Docker守护进程。
坑一：Docker run 之后没反应 什么都没有 日志都没有 检查Gunicorn配置文件，原来使用了daemon = True参数，这个参数是将Guncorn放到后台运行，所以消失了并且没有任何输出...解决方案：屏蔽daemon参数 坑二：Gunicorn没有Flask的日志输出 启动后只有Gunicorn的日志，而没有Flask的日志 解决方案：在Flask里面添加 if __name__!...geventwebsocket.gunicorn.workers.GeventWebSocketWorker 时没有Flask的访问日志 解决方案：不知道怎么解决，将worker_class换为gevent...可以输出访问日志，但是并没有解决根本问题 坑四：Gunicorn的启动参数不生效 原因：Gunicorn的默认配置文件名称是gunicorn.conf.py，如果这里面写了内容，直接用参数运行是怎么都不会生效的...删除默认配置文件gunicorn.conf.py，或者使用gunicorn.conf.py去配置
新版的conda默认会使用conda activate transcriptome激活环境。...初次使用时会弹出一个提示，需要运行conda init： conda activate qiime2-2020.6 CommandNotFoundError: Your shell has not been...而且如果是根用户安装时，不建议把conda环境默认加到环境变量中，会引起不必要的系统冲突。可以给个用户自己使用是自己配置对应的环境变量。...激活环境后，会看到命令行提示前多了一个环境名字，比如下面激活qiime2-2020.6环境后的展示。...Use 'conda deactivate'. ct@ehbio:~# which python /usr/bin/python 在环境phylo中安装ete3 起因是使用官方的推荐命令安装时出了问题，
许多Python项目中都包含了requirements.txt文件，该文件记录了当前程序的所有依赖包及其精确版本号。...pip命令来生成及安装requirement.txt文件以外，也可以使用conda命令来安装。...conda install --yes --file requirements.txt 但是这里存在一个问题，如果requirements.txt中的包不可用，则会抛出“无包错误”。...使用下面这个命令可以解决这个问题 while read requirement; do conda install --yes requirement; done < requirements.txt...如果想要在conda命令无效时使用pip命令来代替，那么使用如下命令： while read requirement; do conda install --yes requirement |
需要使用docker将golang的httpserver容器化。在这个过程中遇到了一个弱智问题，特此记录。...于是，打算采用命令进入docker容器内部查看： [root@hecs-205828 ~]# docker ps -a CONTAINER ID IMAGE COMMAND...服务内部运行是正常的。...忽然想到，容器内部的nestat监听端口是127.0.0.1，于是瞬间明白了。 在容器内部的监听端口为127.0.0.1的话，那么只能接受容器内部来自127.0.0.1的本地回环访问。...来自容器外外部的访问请求将被拒绝。 因此，这个问题的修复原因实际上很简单，只需要将main.go的中监听ip改为0.0.0.0即可。
写在前面 Docker 是一个开源的应用容器引擎，让开发者可以打包他们的应用以及依赖包到一个可移植的镜像中，然后发布到任何流行的 Linux或Windows 机器上，也可以实现虚拟化。...容器是完全使用沙箱机制，相互之间不会有任何接口 安装 目前，大多数linux系统已经包含docker的软件源，所以只需要一句命令安装完事，这里以centos为例 yum install docker-ce.../bin/bash：放在镜像名后的是命令，这里我们希望有个交互式 Shell，因此用的是 /bin/bash 然后键入了exit是退出容器内shell 如何查看运行了哪些docker 键入docker...ps 即可查看正在运行的docker 如何再次进入ubuntu的终端 我们键入docker attach 容器ID 容器的ID我们用docker ps即可看见 exit又可以切回宿主机 如何删除镜像 我们使用...(移除对应服务) sudo docker ps (查看正在运行的服务) sudo docker image ls (查看已经下载的镜像) sudo docker image rm ...
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