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f2py:连接 FORTRAN 和 Python 的桥梁

f2py 是用来连接 fortran 和 python 的 python 包,可以将 fortran 源程序转换为 python 可用的程序(windows下转换为*.pyd格式文件,linux下转换为...f2py 是 numpy 的一部分,当你安装了 numpy 时就已经包含 f2py 了,其可以被用来构建 Python C/API 扩展模块,从而更容易调用 FORTRAN77/90/95 子程序,FORTRAN77...将 fortran 程序转换为 python 可用的程序是非常必要的,尤其是在进行复杂数值计算和处理大量数据时,调用 fortran 程序比使用 python 要高效的多。...由于 f2py 的使用需要用到 c/c++ 编译器,fortran 编译器,因此,在使用之前要安装相应的编译器。...红色框 表示当前系统中安装的 fortran 编译器,浅蓝色框 表示 f2py 支持的 fortran 编译器,又分为当前系统可用和不可用的部分,黄色圆 以下表示当前系统不可用的 fortran 编译器

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    NumPy 1.26 中文文档(五十五)

    (gh-22316) 改进 F2PY 改进 生成的扩展模块不再使用已弃用的 NumPy-C API。 改进了f2py生成的异常消息。 大量错误和flake8警告修复。...(gh-22316) 改进 F2PY 改进 生成的扩展模块不再使用已弃用的 NumPy-C API 改进了由f2py生成的异常消息 大量错误和flake8警告修复 在签名文件的 C...(gh-22357) F2PY 改进 生成的扩展模块不再使用已弃用的 NumPy-C API 改进了f2py生成的异常消息 大量的错误和flake8警告修复 在签名文件的 C 表达式中可以使用的各种...: 修复:在共享头文件中公开堆排序算法 #22215: 修复:支持使用 libunwind 进行回溯 #22216: 维护:修复 f2py 中不正确的指针类型使用 #22220: 修复...构建 #22214: BUG: 在共享头文件中公开堆排序算法 #22215: BUG: 支持使用 libunwind 进行回溯 #22216: MAINT: 修复 f2py 中不正确的指针类型使用

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    NumPy 1.26 中文文档(五十四)

    和 Fortran 中的相同名称,而不是在 Python 和 Fortran 中。...(gh-24555) 改进 f2py 对 iso_c_binding 的支持 以前,用户必须定义自己的自定义 f2cmap 文件才能使用 Fortran2003 的 iso_c_binding 内在模块定义的类型映射...(gh-24555) 改进 f2py的iso_c_binding支持 以前,用户必须定义自己的自定义f2cmap文件,以使用 Fortran2003 iso_c_binding内在模块定义的类型映射。...(gh-24555) f2py的iso_c_binding支持 以前,用户必须定义自己的自定义f2cmap文件,以使用 Fortran2003 iso_c_binding内在模块定义的类型映射。...相反,可以通过pip/build的配置设置界面传递给构建的命令行标志。这些标志都列在存储库根目录中的meson_options.txt文件中。

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    使用line_profiler对python代码性能进行评估优化

    开源库line_profiler就做了一个这样的工作,开源地址:github.com/rkern/line_profiler。下面让我们一起看下该工具的安装和使用详情。...简单介绍一下每一列的含义:代码在代码文件中对应的行号、被调用的次数、该行的总共执行时间、单次执行所消耗的时间、执行时间在该函数下的占比,最后一列是具体的代码内容。...创建一个简单的fortran文件fmath.f90,功能为返回正弦函数的值: subroutine fsin(theta,result) implicit none real...,但是由于将random模块和计算模块放在一起,在给出的时间数值上有些差异。...另外,在测试的过程中我们还可以发现,不同形式的正弦三角函数实现,性能是存在差异的,只是在日常使用频率较低的情况下是不感知的。

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    NumPy 基础知识 :6~10

    但是,列表源可能最多包含一个f2py签名文件,然后扩展模块的名称必须与签名文件中使用的匹配。 f2py签名文件必须恰好包含一个 Python 模块块,否则安装程序将无法构建。...您可以决定不在sources参数中添加签名文件。 在这种情况下,f2py将扫描 Fortran 源文件以获取常规签名,以构造 Fortran 代码的包装器。...当您对模块的所有组件/功能都满意并且没有错误后,用户可以将这些函数/过程存储在扩展名为.pyx的文件中。 这是 Cython 使用的扩展名。 将此代码与您的应用集成的下一步是在安装文件中添加信息。...在这里,出于说明目的,我们将代码存储在名为fib.pyx的文件中,并创建了一个构建该模块的安装文件: from distutils.core import setup, Extension from...创建一个新模块以保存 Cython 代码(.pyx)。 将这些区域中的所有变量和循环索引转换为它们的 C 对应物。 使用以前的测试设置进行测试。 将扩展添加到安装文件中。

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    NumPy 1.26 中文官方指南(四)

    有两种类型的适当连续的 NumPy 数组: Fortran 连续数组指的是以列方式存储的数据,即存储在内存中的数据索引从最低维开始; C 连续,或简单连续的数组,指的是以行方式存储的数据,即存储在内存中的数据索引从最高维开始...NumPy 例程具有内置的 ufunc,但用户也可以编写自己的。 向量化 NumPy 把数组处理交给了 C 语言,在那里循环和计算比在 Python 中快得多。...视图 不触及底层数据,NumPy 可使一个数组看起来改变其数据类型和形状。 以此方式创建的数组是一个视图,而且 NumPy 经常利用使用视图而不是创建新数组来获得性能优势。...的 fft 模块 在 numpy.ctypeslib 中对 ctypes 支持的进一步改进 numpy.errstate 现在也是一个函数装饰器 numpy.exp 和 numpy.log...maximum 和 minimum 不再发出警告 Umath 和 multiarray C 扩展模块合并为一个单独模块 getfield 的有效性检查已扩展 NumPy 函数现在支持使用

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    DEEPSEEK如何回答什么编程语言最适合大气科学

    接下来,我需要考虑不同编程语言在科学计算中的优缺点。常见的语言有Python、Fortran、R、MATLAB、Julia、C/C++、NCL、IDL等。...Python的社区支持和学习资源也很丰富,这对于科研人员来说很重要。 不过Fortran在数值模式开发中仍然占有一席之地,像WRF这样的模式用Fortran编写,因为它执行效率高,尤其在超级计算机上。...Julia作为新兴语言,结合了Python的易用性和C的速度,可能是一个有潜力的选择,但生态系统还在发展中,社区可能不如Python成熟。...遗留用途:部分旧脚本或课程仍在使用。 6. C/C++:底层优化 用途:高性能计算核心模块(如MPI并行)、加速Python代码(通过C扩展)。...实际工作中,多语言混合使用(如Fortran做核心计算 + Python处理数据)是常见策略。选择时需权衡任务需求、团队习惯和硬件环境。>

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    无缝衔接Fortran大气模式和Keras深度学习模型!

    同样的,可以将Fortran构建的神经网络模型迁移到Python中进行分析、扩展和优化,比如使用Python相关工具进行超参数搜索。...FKB/P 一旦Keras模型训练完成之后,可以将网络架构、权重、偏差、优化器、学习率、梯度等信息存储到HDF5文件中。FKB/P可以从HDF5文件中解析网络架构、权重、偏差、激活函数等信息。...然后,这些信息转换为与FKB/F中匹配的Fortran神经网络配置,从而允许用户可以在Fortran中构建相同的网络,很容易在Fortran环境中加载和使用。...自定义层 为了在Fortran中应用神经网络,FKB扩展了神经Fortran库。同时引入了可扩展的层模块,为了实现一个层,可以简单的扩展层的类型并且指定前向和后向函数。...FKB库使用户可以直接在Fortran中访问Keras API的许多功能,包括创建自定义图层和丢失函数以满足他们的需求的能力,而且具有非常好的易用性,通过在全球大气的多尺度物理模型应用中也证明了这一点。

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    Matlab C混合编程

    用C++(或者C)语言操作MATLAB,有三种途径: MEX文件 在MATLAB中可调用的C或Fortran语言程序称为MEX文件。MATLAB可以直接把MEX文件视为它的内建函数进行调用。...MEX文件是动态链接的子例程,MATLAB解释器可以自动载入并执行它。...为了简化在MATLAB环境之外对MAT文件的使用,MATLAB给出了一个操作例程库,通过它,我们可以使用C/C++或者Fortran程序读写MAT文件。...MATLAB引擎程序指的是那些通过管道(在UNIX系统中)或者ActiveX(在Windows系统中)与独立MATLAB进程进行通信的C/C++或者Fortran程序。...它是稀疏矩阵中不为零的元素的个数。 ir指向一个长度为nzmax的整型数阵列,阵列包含的是pr和pi中对应元素的行号。 jc指向一个长度为N+1的整型数阵列(N为矩阵的列数),其中包含的是列号信息。

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    厉害了!Ziglang首次落地高性能计算场景

    Zig 与 OpenMP 的集成不仅在扩展性上可与 Fortran 和 C 的 NPB 参考实现相媲美,同时在某些场景下,Zig 的性能相较Fortran来说,提升幅度多大1.25倍。...在获取每个标识符的 AST 节点索引后,这些索引被连续存储在extra_data数组中,子句结构的开始和结束索引则存储在子句中。...有些子句可以用少于 32 位表示,并将它们组合到一个压缩结构中。例如,default子句使用 2 位的枚举表示,而nowait子句用一个布尔值表示,占用压缩结构中的 1 位。...分解函数为每个 reduction 变量创建一个单独的变量,并使用 reduction 变量中持有的初始值进行初始化。初始化必须符合 OpenMP 标准[5]。...由于目前尚无现成的 Zig 高性能计算 (HPC) 基准测试,本文决定使用其他成熟 HPC 语言(如 Fortran 和 C)创建的基准测试,并将其转换为 Zig。

    47710

    NumPy 1.26 中文文档(四十五)

    非 Fortran 文件使用单独的语法来定义应使用类似于 Fortran 特定重复的命名重复规则的模板块的变量扩展。...### Fortran 文件 此模板转换器将根据‘’中的规则,复制文件中所有的函数和子例程块,并以包含‘’的名称来重复。‘’中用逗号分隔的单词的数量决定了块被重复的次数。...非 Fortran 文件使用单独的语法来定义应使用类似于 Fortran 特定重复规则的变量扩展的模板块。...Fortran 文件 此模板转换器将根据‘’中的规则,复制文件中所有函数和子例程块的名称中包含‘’的块。‘’中以逗号分隔的单词数确定块重复的次数。...非 Fortran 文件使用单独的语法来定义应使用类似于 Fortran 特定重复的命名重复规则的模板块。

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    NumPy 1.26 中文文档(四十六)

    杂项 导入 API 为了从另一个扩展模块中使用 C-API,必须调用import_array函数。如果扩展模块是一个单独的.c 文件,那么只需要做这些。...假设我有两个文件 coolmodule.c 和 coolhelper.c 需要编译并链接成一个单独的扩展模块。...返回的迭代器不能使用PyArray_ITER_GOTO1D。此迭代器可用于编写类似于 ufuncs 的内容,其中在最大轴上的循环由一个单独的子例程完成。...它导入存储函数指针表的模块,并将正确的变量指向它。 PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL NO_IMPORT_ARRAY 使用这些#定义,您可以在单个扩展模块的多个文件中使用 C-API。...导入 API 要从另一个扩展模块中使用 C-API,必须调用 import_array 函数。如果扩展模块是包含在一个单独的 .c 文件中的自包含模块,则只需要做这些。

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    NumPy 1.26 中文文档(五十三)

    一些在 C 扩展模块中定义的函数/对象,如 numpy.ndarray.transpose, numpy.array 等,在_add_newdocs.py中有其单独定义的文档字符串。...子配置文件的唯一名称为 .doxyfile,通常可以在包含有文档化头文件的目录附近找到。如果靠近(2 深度)你想添加的头文件的路径中没有配置文件,则需要创建一个新的配置文件。...一些函数/对象,如 numpy.ndarray.transpose、numpy.array 等,在 C 扩展模块中定义,其文档字符串在_add_newdocs.py中单独定义。...子配置文件具有独特的名称.doxyfile,通常可以在包含文档头文件的目录附近找到。如果要添加的头文件所在路径(2 层深度)没有配置文件,就需要创建一个新的配置文件。...子配置文件的唯一名称是.doxyfile,您通常可以在包含文档头文件的目录附近找到它。如果您想添加的头文件所在的路径中没有配置文件,您需要创建一个新的配置文件。

    13310

    CMake 秘籍(四)

    中相应的占位符;我们将 Fortran 和 C 源文件编译成一个可执行文件: 我们创建一个混合 Fortran-C 项目,如下所示: cmake_minimum_required(VERSION 3.10...在我们的示例中,我们使用configure_file来修改我们的模板文件的内容,并将其复制到一个可以编译到我们的可执行文件的位置。...Git 信息保存到version.hpp头文件将需要以下操作: 我们将把之前配方中CMakeLists.txt的大部分代码移动到一个单独的文件中,并将其命名为git-hash.cmake: # in...工作原理 我们在这里使用的模式是: 定义一个函数或宏并将其放入模块中 包含模块 调用函数或宏 从输出中,我们可以看到代码检查列表中的每个标志,一旦检查成功,它就会打印出成功的编译标志。...,包含了一个自定义模块(与前一个示例相同的模块),并打印了所有包含的模块列表。

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    Python多进程并行编程实践-mpi4py的使用

    它并不是一门语言,而是一个库,我们可以用Fortran、C、C++结合MPI提供的接口来将串行的程序进行并行化处理,也可以认为Fortran+MPI或者C+MPI是一种再原来串行语言的基础上扩展出来的并行语言...Python中我们可以使用很多方式进行多进程编程,例如os.fork()来创建进程或者通过multiprocessing模块来更方便的创建进程和进程池等。...MPI与mpi4py mpi4py是一个构建在MPI之上的Python库,主要使用Cython编写。mpi4py使得Python的数据结构可以方便的在多进程中传递。...同时它还提供了SWIG和F2PY的接口能够让我们将自己的Fortran或者C/C++程序在封装成Python后仍然能够使用mpi4py的对象和接口来进行并行处理。...总结 本文简单介绍了mpi4py的接口在python中进行多进程编程的方法,MPI的接口非常庞大,相应的mpi4py也非常庞大,mpi4py还有实现了相应的SWIG和F2PY的封装文件和类型映射,能够帮助我们将

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    15个节省时间的Jupyter技巧

    %matplotlib inline:在notebook中显示图形。 %load_ext:加载扩展,例如IPython扩展。 %pwd:打印当前工作目录。 %ls:显示当前目录中的所有文件。...ls 你也可以通过在命令后面添加参数来传递参数。例如,要列出特定目录下的文件,可以使用-l选项以长格式显示文件,并将目录路径指定为参数: !...7、为程序完成设置闹钟⏰ 当你的模型完成训练或任何任务时,得到一个通知总是很有帮助的。 在windows 10中,我们可以使用win10toast模块设置它。...%store var1:存储变量var1 %store -r var1:检索存储的变量var1,并将其赋值给当前笔记本中同名的变量 %store -d var1:删除已存储的变量var1 %store...compute_fortran([1, 2, 3], [4, 5, 6]) 13、扩展pandas输出中的列数和行数 默认情况下,panda的dataframe只能显示有限数量的行和列。

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