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f2py:连接 FORTRAN Python 桥梁

f2py 是用来连接 fortran python python 包,可以将 fortran 源程序转换为 python 可用程序(windows下转换为*.pyd格式文件,linux下转换为...f2py 是 numpy 一部分,当你安装了 numpy 时就已经包含 f2py 了,其可以被用来构建 Python C/API 扩展模块,从而更容易调用 FORTRAN77/90/95 子程序,FORTRAN77...将 fortran 程序转换为 python 可用程序是非常必要,尤其是进行复杂数值计算处理大量数据时,调用 fortran 程序比使用 python 要高效多。...由于 f2py 使用需要用到 c/c++ 编译器,fortran 编译器,因此,使用之前要安装相应编译器。...红色框 表示当前系统安装 fortran 编译器,浅蓝色框 表示 f2py 支持 fortran 编译器,又分为当前系统可用不可用部分,黄色圆 以下表示当前系统不可用 fortran 编译器

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使用line_profiler对python代码性能进行评估优化

开源库line_profiler就做了一个这样工作,开源地址:github.com/rkern/line_profiler。下面让我们一起看下该工具安装使用详情。...简单介绍一下每一列含义:代码代码文件对应行号、被调用次数、该行总共执行时间、单次执行所消耗时间、执行时间该函数下占比,最后一列是具体代码内容。...创建一个简单fortran文件fmath.f90,功能为返回正弦函数值: subroutine fsin(theta,result) implicit none real...,但是由于将random模块计算模块放在一起,在给出时间数值上有些差异。...另外,测试过程我们还可以发现,不同形式正弦三角函数实现,性能是存在差异,只是日常使用频率较低情况下是不感知

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NumPy 1.26 中文官方指南(四)

有两种类型适当连续 NumPy 数组: Fortran 连续数组指的是以列方式存储数据,即存储在内存数据索引从最低维开始; C 连续,或简单连续数组,指的是以行方式存储数据,即存储在内存数据索引从最高维开始...NumPy 例程具有内置 ufunc,但用户也可以编写自己。 向量化 NumPy 把数组处理交给了 C 语言,在那里循环计算比 Python 快得多。...视图 不触及底层数据,NumPy 可使一个数组看起来改变其数据类型形状。 以此方式创建数组是一个视图,而且 NumPy 经常利用使用视图而不是创建新数组来获得性能优势。... fft 模块 numpy.ctypeslib 对 ctypes 支持进一步改进 numpy.errstate 现在也是一个函数装饰器 numpy.exp numpy.log...maximum minimum 不再发出警告 Umath multiarray C 扩展模块合并为一个单独模块 getfield 有效性检查已扩展 NumPy 函数现在支持使用

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NumPy 基础知识 :6~10

但是,列表源可能最多包含一个f2py签名文件,然后扩展模块名称必须与签名文件使用匹配。 f2py签名文件必须恰好包含一个 Python 模块块,否则安装程序将无法构建。...您可以决定不在sources参数添加签名文件。 在这种情况下,f2py将扫描 Fortran文件以获取常规签名,以构造 Fortran 代码包装器。...当您对模块所有组件/功能都满意并且没有错误后,用户可以将这些函数/过程存储扩展名为.pyx文件。 这是 Cython 使用扩展名。 将此代码与您应用集成下一步是安装文件添加信息。...在这里,出于说明目的,我们将代码存储名为fib.pyx文件,并创建一个构建该模块安装文件: from distutils.core import setup, Extension from...创建一个模块以保存 Cython 代码(.pyx)。 将这些区域中所有变量循环索引转换为它们 C 对应物。 使用以前测试设置进行测试。 将扩展添加到安装文件

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无缝衔接Fortran大气模式Keras深度学习模型!

同样,可以将Fortran构建神经网络模型迁移到Python中进行分析、扩展优化,比如使用Python相关工具进行超参数搜索。...FKB/P 一旦Keras模型训练完成之后,可以将网络架构、权重、偏差、优化器、学习率、梯度等信息存储到HDF5文件。FKB/P可以从HDF5文件解析网络架构、权重、偏差、激活函数等信息。...然后,这些信息转换为与FKB/F匹配Fortran神经网络配置,从而允许用户可以Fortran构建相同网络,很容易Fortran环境中加载使用。...自定义层 为了Fortran应用神经网络,FKB扩展了神经Fortran库。同时引入了可扩展模块,为了实现一个层,可以简单扩展类型并且指定前向后向函数。...FKB库使用户可以直接在Fortran访问Keras API许多功能,包括创建自定义图层丢失函数以满足他们需求能力,而且具有非常好易用性,通过全球大气多尺度物理模型应用也证明了这一点。

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Matlab C混合编程

用C++(或者C)语言操作MATLAB,有三种途径: MEX文件 MATLAB可调用C或Fortran语言程序称为MEX文件。MATLAB可以直接把MEX文件视为它内建函数进行调用。...MEX文件是动态链接例程,MATLAB解释器可以自动载入并执行它。...为了简化MATLAB环境之外对MAT文件使用,MATLAB给出了一个操作例程库,通过它,我们可以使用C/C++或者Fortran程序读写MAT文件。...MATLAB引擎程序指的是那些通过管道(UNIX系统)或者ActiveX(Windows系统)与独立MATLAB进程进行通信C/C++或者Fortran程序。...它是稀疏矩阵不为零元素个数。 ir指向一个长度为nzmax整型数阵列,阵列包含是prpi对应元素行号。 jc指向一个长度为N+1整型数阵列(N为矩阵列数),其中包含是列号信息。

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Python多进程并行编程实践-mpi4py使用

它并不是一门语言,而是一个库,我们可以用Fortran、C、C++结合MPI提供接口来将串行程序进行并行化处理,也可以认为Fortran+MPI或者C+MPI是一种再原来串行语言基础上扩展出来并行语言...Python我们可以使用很多方式进行多进程编程,例如os.fork()来创建进程或者通过multiprocessing模块来更方便创建进程进程池等。...MPI与mpi4py mpi4py是一个构建在MPI之上Python库,主要使用Cython编写。mpi4py使得Python数据结构可以方便多进程传递。...同时它还提供了SWIGF2PY接口能够让我们将自己Fortran或者C/C++程序封装成Python后仍然能够使用mpi4py对象接口来进行并行处理。...总结 本文简单介绍了mpi4py接口python中进行多进程编程方法,MPI接口非常庞大,相应mpi4py也非常庞大,mpi4py还有实现了相应SWIGF2PY封装文件类型映射,能够帮助我们将

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CMake 秘籍(四)

相应占位符;我们将 Fortran C 源文件编译成一个可执行文件: 我们创建一个混合 Fortran-C 项目,如下所示: cmake_minimum_required(VERSION 3.10...我们示例,我们使用configure_file来修改我们模板文件内容,并将其复制到一个可以编译到我们可执行文件位置。...Git 信息保存到version.hpp头文件将需要以下操作: 我们将把之前配方中CMakeLists.txt大部分代码移动到一个单独文件并将其命名为git-hash.cmake: # in...工作原理 我们在这里使用模式是: 定义一个函数或宏并将其放入模块 包含模块 调用函数或宏 从输出,我们可以看到代码检查列表每个标志,一旦检查成功,它就会打印出成功编译标志。...,包含了一个自定义模块(与前一个示例相同模块),并打印了所有包含模块列表。

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15个节省时间Jupyter技巧

%matplotlib inline:notebook显示图形。 %load_ext:加载扩展,例如IPython扩展。 %pwd:打印当前工作目录。 %ls:显示当前目录所有文件。...ls 你也可以通过命令后面添加参数来传递参数。例如,要列出特定目录下文件,可以使用-l选项以长格式显示文件并将目录路径指定为参数: !...7、为程序完成设置闹钟⏰ 当你模型完成训练或任何任务时,得到一个通知总是很有帮助windows 10,我们可以使用win10toast模块设置它。...%store var1:存储变量var1 %store -r var1:检索存储变量var1,并将其赋值给当前笔记本同名变量 %store -d var1:删除已存储变量var1 %store...compute_fortran([1, 2, 3], [4, 5, 6]) 13、扩展pandas输出列数行数 默认情况下,pandadataframe只能显示有限数量列。

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因为对PerlPython不满?圣诞节无聊?编程语言出现都这么随意吗?

不支持:数据类型声明、单独编译子程序 Fortran II 发布于 1958 年,主要对 Fortran I 编译器做了优化,并支持了单独编译子程序。...随着 Fortran 诞生,其他一些语言也开发,这些语言语法格式各不相同,而且 Fortran 一样,都与运行它们具体计算机关联(比如标示符长度、代码行数限制等)。...Scheme 第一个引入词法作用域,延续体,闭包等概念。并将数据函数等同对待。 Scheme 简约优美使它博得了计算机语言皇后桂冠,并与另一个以优雅著称 Pascal 一起成为教学语言。... Self 对象创建对象方式是自我拷贝,所以叫做原型。 Self 是原型面向对象语言鼻祖,就像 SIMUAL 67 是类面向对象语鼻祖。 A.20....PHP JavaScript 语发相似,都是嵌入 HTML ,只不过一个服务器端,一个浏览器端。 A.28.

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python开篇——初识python

Python也可用于可定制化软件扩展程序语言。Python拥有动态类型系统垃圾回收功能,能够自动管理内存使用,并且其本身拥有一个巨大而广泛标准库,提供了适用于各个主要系统平台源码或机器码。...,它是python一个模块,集成了经典机器学习算法,这些算法是python科学包紧密联系在一起;   MDP-Toolkit这是一个Python数据处理框架,可以很容易进行扩展。...此外,Python模块还可以通过Telnet、SSHAPI与网络设备进行更高级别的交互。本章将深入探讨如何在Python中使用Telnet与SSH模块远程设备上建立连接执行命令。...python基于类语言特性让它比起fortran等更加容易规模化开发。 python老牌科学计算语言fortran相比,有着众多优势,如果能用f2py接合两者,那是极好。...第四、是更高级Virtual Machine(虚拟机) Python执行时,首先将py文件源代码编译成Pythonbyte code(字节码),然后再由Python Virtual Machine

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与机器学习算法相关数据结构

需要无限扩展数组情况下,可以使用扩展数组,如C++标准模板库(STL)向量类。Matlab常规数组具有类似的可扩展性,可扩展数组是整个Python语言基础。...链表 链表由几个单独分配节点组成。每个节点都包含一个数据值以及指向列表中下一个节点指针。插入固定时间非常有效,但访问值很慢并且通常需要扫描大部分列表。 链接列表很容易拼接在一起以及分开。...左节点中值始终小于父节点中值,而父节点中值又小于右节点中值。因此,二叉树数据被自动排序。插入访问O(log n)平均有效。与链表一样,它们很容易转换为数组,这是树排序基础。...更复杂数据结构也可以由基本结构组成。考虑一个稀疏矩阵类。稀疏矩阵,大多数元素为零,并且仅存储非零元素。我们可以将每个元素位置存储为三元组,并在可扩展数组包含它们列表。...问题 如果你想自己练习并实现ML算法数据结构,请尝试解决以下一些问题: 1. 将矩阵向量乘法代码片段封装到一个名为MatrixTimeVectoral例程,为例程设计调用语法。 2.

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API简介(二)

通过将一种语言特性功能映射到以另一种语言实现接口,语言绑定允许以一种语言进行开发时使用另一种语言编写库或服务。...诸如SWIGF2PY(一种从Fortran到Python接口生成器)之类工具可简化此类接口创建。...Microsoft已显示出对向后兼容API坚定承诺,尤其是在其Windows API(Win32)库,因此较旧应用程序可以较新版本Windows上使用称为“兼容模式”特定于可执行文件设置。...因此,远程API对于维护面向对象程序设计对象抽象很有用。代理对象上本地执行方法调用,使用远程协议远程对象上调用相应方法,并获取要在本地用作返回值结果。...社交媒体领域,Web API使Web社区可以促进在社区应用程序之间共享内容和数据。这样,可以将在一个地方动态创建内容发布并更新到Web上多个位置。

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CMake 秘籍(二)

最后一个进程返回值将被保存到作为参数传递给RESULT_VARIABLE变量,而标准输出标准错误管道内容将被保存到作为参数传递给OUTPUT_VARIABLEERROR_VARIABLE变量...Fortran ,需要使用omp_lib模块并链接到正确库。...本配方将展示如何找到 Eigen 库,并指示它使用 OpenMP 并行化并将部分工作卸载到 BLAS 库。 准备就绪 本例,我们将编译一个程序,该程序分配一个随机方阵从命令行传递维度向量。...我们不是直接链接可执行文件,而是可以将库依赖项收集到一个单独库目标使用 PUBLIC/PRIVATE 关键字,我们可以调整相应标志定义对库目标依赖项可见性。...它是如何工作 查找模块通常遵循特定模式: 检查用户是否为所需包提供了自定义位置。 使用find_家族命令来搜索所需包已知必需组件,即头文件、库、可执行文件等。

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如何在Fortran调用Python

2003内部定义C语言类型互通模块iso_c_binding。...但使用CFFI时,我们不需要写任何C代码,CFFI会生成C类型打包接口。下一行则定义了一个C函数hello_world接口,这可以C语言中实现,但是这里我们使用PythonCFFI。...下面是一个示例,将代码定义一个模块文件,比如my_module.py: # my_module.py # Create the dictionary mapping ctypes to np dtypes...•首先,必须在header.h中进行C头文件声明•然后,执行函数必须要在builder.pymodule字符串,或一个外部模块•最后,Fortran代码必须包含定义子程序interface块(...通过调用给定名称来获取数据,并且将计算结果也存储到相同字段,然后,Fortran代码通过索引字典中正确关键词来获取结果。Cython中使用了类似的架构,但CFFI更为方便。

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Python数据分析库介绍及引入惯例

作为算法库之间传递数据容器。对于数值型数据,NumPy数组存储处理数据时要比内置Python数据结构高效得多。...此外,由低级语言(比如CFortran)编写库可以直接操作NumPy数组数据,无需进行任何数据复制工作。 因此,许多Python数值计算工具使用NumPy数组作为主要数据结构。...SciPy SciPy是一组专门解决科学计算各种标准问题域集合,主要包括下面这些包: scipy.integrate:数值积分例程微分方程求解器。...scipy.linalg:扩展了由numpy.linalg提供线性代数例程矩阵分解功能。 scipy.optimize:函数优化器(最小化器)以及根查找算法。...scipy.sparse:稀疏矩阵稀疏线性系统求解器。 scipy.special:SPECFUN(这是一个实现了许多常用数学函数(如伽玛函数)Fortran库)包装器。

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与机器学习算法有关数据结构

[nfa9atts6c.png] 但是这些数据结构好处是,即使更通用编程语言中,实现向量矩阵公式就在上面图中,假设语言中有任何Fortran DNA,那么实现向量矩阵就很简单。...在那些需要数组无限扩展情况下,可以使用扩展数组,例如C ++标准模板库(STL)vector类。Matlab数组规则具有相似的可扩展性,可扩展数组也是整个Python语言基础。...所以你可以输入最近运动员运动员号码列表,然后按一个单独键,队列登记下一个已经通过号码。 元组 一个集合包含一个非重复元素无序列表。如果添加已经该集合元素,则不会有任何更改。...稀疏矩阵,大部分元素都是零,只有非零元素被存储。我们可以将每个元素位置存储一个三元组,并将它们列表存储一个扩展数组。...问题 如果你想自己练习实现ML算法数据结构,试着解决下面的一些问题: 将矩阵向量乘法代码片段封装到一个名为matrix_times_vector例程。设计例程调用语法。

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