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使用miRNAtap数据提取miRNA的预测靶基因结果

前面我们分享了:microRNAs靶基因数据库哪家强,提到了综合了12个网页工具的miRWalk,以及整合了7个工具的miRSystem,但是最后我们仍然是推荐R包multiMiR作为提取miRNA的预测靶基因结果的解决方案...今天我们比较一下另外的一个miRNAtap包,与multiMiR的结果的一致性,以及两个数据库的差异!...hsa', method = 'min', min_src = 2) head(predictions_min) 两个总结5个数据结果的方法差异在于靶基因的排名...再看看它与miRSystem网页工具结果的差异 进入 http://mirsystem.cgm.ntu.edu.tw/ ,粘贴我们的 值得注意的是,该工具顺便对靶基因进行了生物学功能数据库的注释 ?...(因为不是这个领域,所以我并不清楚,不同数据结果的30%左右的一致性是好还是坏) 既然是预测,就不可能多个工具完全一致,所以目前主流的做法是,选择5个以上数据库支持的靶基因作为该miRNA的最后列表。

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MyBatis基础2(XML

创建XML文件,并完成resultMap配置 创建对应的XML语句 在MyBatis中使用XML首先需要在 application.properties 文件中添加配置。...* from user where user_name=#{userName} limit 1 这里使用了 resultMap 属性,它的值一般为XML文件下 resultMap...[CDATA[ >= ]]> #{time} 循环语句 XML存在循环语句 <insert id="batchAdd" parameterType...集合的索引值名称指定 separator 遍历每条记录并添加分隔符 open 表示节点开始时的分隔符即所有数据前面的符号 close 表示节点结束时的分隔符即所有数据之后的符号 上面代码结果为: INSERT...=false spring.jackson.default-property-inclusion=non_null 两个配置的作用是: 允许序列化未知字段,可以兼容Java模型和JSON数据不一致的情况

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MyBatis框架之第二篇

pojo属性名不一致的返回值映射 2、动态sql(重点) 3、关联查询结果(重点) a)一对一关联结果 b)一对多关联结果 4、Mybatis整合spring 5、逆向工程...,以方便后面使用。...】 (需要掌握) 项目 解释 在参数映射中,用于循环遍历集合类型的参数。...collection 表示要循环遍历的集合对象名称 item 每次遍历时使用的临时变量名称,在循环内部用占位符来引用 separator 每次循环之间的分隔符号 open 循环开始之前的SQL...6.关联查询结果(重点) 6.1.商品订单数据模型 注意:这里面两个表的关联都是由SQL控制的,跟MyBatis一点关系都没有,现在我们面临的问题就是怎样把具有关联关系的结果集通过结果集映射返回给

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Jmeter系列(37)- 详解 ForEach控制器

/JDBC结果变量一起使用,用于可以遍历读取相关的返回值 该控制器下的 Samplers 和控制器都会被执行一次或多次,每次读取不同的变量值 ForEach 控制器和正则提取器是个好搭档,因为正则提取出来的变量值会用分隔...一共有四个 ForEach ? 前缀为 name 的有四个变量,所以循环四次 运行结果 ? 如果输出变量名称为空,需要怎么取循环的值? ?...JDBC 一共返回 100 条数据,这里我们是通过 Variable names 去接住所有数据,对应有 100 个变量(mobile_1 到 mobile_100) ForEach ?...这里通过 Result Variable name 去接住所有数据,只有一个变量,是无法循环的 所以我们需要通过正则提取器将需要的 mobile 字段的值提取出来 正则提取器 ?...我们要的其实是箭头的那些,但是正则会提取不必要的字段值(如:mobile_new_11_g0),所以注意 ForEach 的输入变量前缀要写正确 ForEach 循环 100 次,输入变量 mobile_new

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带了一个 3 年的开发,不会循环删除 List 中的元素,心态崩了。。

2、普通 for 循环提取变量删除(抛异常) 把上面的示例中的 size 提出变量: /** * 普通 for 循环删除(size提出变量) * @author: 栈长 * @from:...: [张三, 周一, 刘四] 结果输出正常,这是因为迭代器中的 remove 方法将期待修改的数量(expectedModCount)值进行了同步: 所以,这种删除方法是安全的,推荐使用。...: 又是那个并发修改异常,这个示例虽然使用了 Iterator 循环,但删除的时候却使用了 list.remove 方法,同样是有问题的,注意了,千万别用错了。...: forEach 源码: forEach 方法的背后其实就是增强的 for 循环,底层即迭代器,所以使用 list.remove 同样抛出 ConcurrentModificationException...总结 本文总结了 8 种循环删除 List 元素的方法: 普通 for 循环删除(不可靠) 普通 for 循环提取变量删除(抛异常) 普通 for 循环倒序删除(可靠) 增强 for 循环删除(抛异常)

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Mybatis学习笔记之二(动态mapper开发和spring-mybatis整合)

如果sql查询字段名和pojo的属性名不一致,可以通过resultMap将字段名和属性名作一个对应关系 ,resultMap实质上还需要将查询结果映射到pojo对象中。...(类属性与数据库字段不一致) */ public List findAll(); } 【测试方法】 /* *查询所有数据(属性名称与数据库字段名称不一致...resultMap   由于上边的mapper.xml中sql查询列(user_id)和Order类属性(userId)不一致,所以查询结果不能映射到pojo中。...需求:根据性别和名字查询用户 2.1 使用If标签和WHERE标签 【Mapper.xml文件】 <!...此方法较为简单,企业中使用普遍。 方法二:使用resultMap   使用resultMap,定义专门的resultMap用于映射一对一查询结果

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带了一个 3 年的开发,不会循环删除 List 中的元素,心态崩了。。

2、普通 for 循环提取变量删除(抛异常) 把上面的示例中的 size 提出变量: /** * 普通 for 循环删除(size提出变量) * @author: 栈长 * @from: 公众号Java...: [张三, 周一, 刘四] 结果输出正常,这是因为迭代器中的 remove 方法将期待修改的数量(expectedModCount)值进行了同步: 所以,这种删除方法是安全的,推荐使用。...: 又是那个并发修改异常,这个示例虽然使用了 Iterator 循环,但删除的时候却使用了 list.remove 方法,同样是有问题的,注意了,千万别用错了。...: forEach 源码: forEach 方法的背后其实就是增强的 for 循环,底层即迭代器,所以使用 list.remove 同样抛出 ConcurrentModificationException...总结 本文总结了 8 种循环删除 List 元素的方法: 普通 for 循环删除(不可靠) 普通 for 循环提取变量删除(抛异常) 普通 for 循环倒序删除(可靠) 增强 for 循环删除(抛异常)

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JavaWeb(五)之JSTL标签库

例如,用于输出一个变量内容的标签、用于条件判断的标签、用于迭代循环的标签。     2)国际化/格式化标签库中包含实现WEB应用程序的国际化的标签。...4)XML标签库中包含对XML文档中的数据进行操作的标签。例如,解析XML文档、输出XML文档中的内容,以及迭代处理XML文档中的元素。        ...例如,提取字符串中的子字符串、获取字符串的长度和处理字符串中的空格等。...(增强的for循环)   格式:       var:用于存放遍历的每一项内容,存放在page作用域,只能在循环体中使用(也就是设置遍历出对象的名称...结果: ?     2)items为list集合 ?       结果: ?     3)items为map集合 ?       结果: ?     4)普通for循环 ?

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mybatis的学习

SqlSession 4.12 dao接口 图片 4.13 dao接口实现类 图片 4.1.4 测试代码 图片 4.2.5 总结问题 dao接口实现类方法中存在大量模板方法,设想能否将这些代码提取出来...typeHandlers(类型处理器) objectFactory(对象工厂) plugins(插件) environments(环境集合属性对象) transactionManager(事务管理) dataSource(数据源...8.2 resultMap 8.2.1 resultMap使用方法 如果查询出来的列名和pojo的属性名不一致,通过定义一个resultMap对列名和pojo属性名之间作一个映射关系。..._ FROM USER WHERE id=#{value} User类中属性名和上边查询列名不一致。...foreach 向sql传递数组或List,mybatis使用foreach解析 9.4.1 需求 在用户查询列表和查询总数的statement中增加多个id输入查询。

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【JavaEE进阶】MyBatis表查询

2.5 实体类中的属性和数据库表中的字段名不一致出现的问题的三种解决方式 MyBatis是通过实体类的属性名称和数据库中的字段名进行映射的,如果实体类中的属性名和数据库表中的字段名不同,在进行查询的时候.... 标签 在MyBatis中,标签用于循环遍历集合或数组,并将其中的元素逐个应用到SQL语句中的特定位置,以便生成动态SQL。...标签通常与动态SQL一起使用,可以在in子句中动态生成多个值或者在批量插入/更新操作中循环处理多个数据。...需要注意的是,标签也可以用于批量插入或更新操作中,通过循环处理多个数据。此时,可以将循环体中的SQL片段放置在合适的位置来重复执行插入或更新。...通过使用标签,可以实现对集合或数组的循环遍历,动态生成包含多个值的SQL语句,并在动态SQL中灵活地处理多个数据

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【JavaEE进阶】MyBatis表查询

2.5 实体类中的属性和数据库表中的字段名不一致出现的问题的三种解决方式 MyBatis是通过实体类的属性名称和数据库中的字段名进行映射的,如果实体类中的属性名和数据库表中的字段名不同,在进行查询的时候.... 标签 在MyBatis中,标签用于循环遍历集合或数组,并将其中的元素逐个应用到SQL语句中的特定位置,以便生成动态SQL。...标签通常与动态SQL一起使用,可以在in子句中动态生成多个值或者在批量插入/更新操作中循环处理多个数据。...需要注意的是,标签也可以用于批量插入或更新操作中,通过循环处理多个数据。此时,可以将循环体中的SQL片段放置在合适的位置来重复执行插入或更新。...通过使用标签,可以实现对集合或数组的循环遍历,动态生成包含多个值的SQL语句,并在动态SQL中灵活地处理多个数据

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MyBatis学习笔记(二) --- MyBatis进阶

1、输入映射和输出映射 Mapper.xml映射文件中定义了操作数据库的sql,每个sql是一个statement,映射文件是mybatis的核心。...如果sql查询字段名和pojo的属性名不一致,可以通过resultMap将字段名和属性名作一个对应关系,resultMap实质上还需要将查询结果映射到pojo对象中。       ...resultMap可以实现将查询结果映射为复杂类型的pojo,比如在查询结果映射对象中包括pojo和list实现一对一查询和一对多查询。 Mapper.xml定义: ?...定义resultMap:由于上边的mapper.xml中sql查询列和Users.java类属性不一致,需要定义resultMap:userListResultMap将sql查询列和Users.java...传入多个id查询用户信息,需要向Sql传递数组或List,MyBatis使用foreach解析,用下边两个sql实现: SELECT * FROM USERS WHERE username LIKE

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说说 MyBatis 二级缓存?关联刷新实现?

当开启二级缓存时,MyBatis会将首次查询结果存入对于Mapper的全局缓存,如果中间不执行该Mapper的数据更新操作,那么后续的相同查询都将会从缓存中获取。...在查询 user 信息时需要关联查询 组织信息,也就是需要 user 表和 organization 表关联,OrganizationMapper 在执行更新时并不会更新 UserMapper 的缓存,结果会导致在使用相同条件...使用 UserMapper 查询 user 信息时,会等到未更新前的 organization 信息,造成数据不一致的情况。...2.1、数据不一致问题验证 [查询SQL] SELECT u.*, o.name org_name FROM user u LEFT JOIN organization o ON u.org_id...实现的接口,所以需要在对应xml中配置,不然查询结果不会被缓存化。

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【深入浅出C#】章节 9: C#高级主题:LINQ查询和表达式

var repeatedValues = Enumerable.Repeat("Hello", 5); // 创建包含5个"Hello"的序列 使用LINQ to XML使用LINQ查询从XML文档中提取数据...最后,通过 foreach 循环遍历查询结果并输出。 4.2 查询操作符的返回类型和结果处理 LINQ查询操作符返回的类型取决于操作符本身以及操作前的数据源类型。...: 对于返回序列的操作符,你可以使用循环(如foreach)来遍历结果,并处理每个元素。...匿名类型的属性名是从查询结果中的属性名推断出来的。然后我们在foreach循环中遍历查询结果并输出。 注意以下关键点: 匿名类型的类型名是由编译器生成的,并且在编译时是不可见的。...避免在循环中执行查询: 将查询移到循环外部,避免在每次迭代中都执行一次查询。 使用索引或哈希表进行查找: 如果需要频繁查找数据,可以考虑使用索引或者哈希表数据结构,以获得更高的查询性能。

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C#3.0新增功能09 LINQ 基础02 LINQ 查询简介

可以使用相同的基本编码模式来查询和转换 XML 文档、SQL 数据库、ADO.NET 数据集、.NET 集合中的数据以及 LINQ 提供程序可用的任何其他格式的数据。...查询的实际执行将推迟到在 foreach 语句中循环访问查询变量之后进行。...foreach 语句也是检索查询结果的地方。...在应用程序中,可以创建一个检索最新数据的查询,并可以按某一时间间隔反复执行该查询以便每次检索不同的结果。 强制立即执行 对一系列源元素执行聚合函数的查询必须首先循环访问这些元素。...由于查询本身必须使用 foreach 以便返回结果,因此这些查询在执行时不使用显式 foreach 语句。 另外还要注意,这些类型的查询返回单个值,而不是 IEnumerable 集合。

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