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Fortran中的陷阱——可分数组的size

早期的Fortran程序多使用静态数组。在编译,静态数组被分配固定的存储空间,且在程序运行过程中静态数组的大小是不会改变的。为了能够存储足够多的数据,静态数组的大小需要足够大,这会造成内存的浪费。...如果静态数组的大小不够大,程序的运行也可能会出现错误。 在Fortran90标准之后,我们可以很方便地使用可分数组。...使用allocatable属性定义可分数组,allocate和deallocate语句动态地为数组分配和释放内存。使用size语句可以查询可分数组的大小(元素总数)。...若一个可分数组的内存已经被释放了,数组内元素的总数是0。然而,笔者最近发现,仍然用size语句查询其大小,得到的结果却是上一次其被分配的大小。...这个例子说明当使用可分数组,查询可分数组的大小前需要先查询其是否被分配了内存,即用allocated()查询,否则得到的数组的大小可能是这个数组上一次被分配的大小。

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基于netcdf库的nc文件读写

错误处理函数 无论是C,F77还是F90的API,如果函数成功执行,都会返回0,否则返回对应错误的代码,然后可使用nc_strerror/nf_strerror等函数错误代码转换为字符串信息。...关闭文件对象 当上述步骤已经完成,不需要再添加任何信息,需要使用如下函数关闭打开的文件对象: •nc_close•nf_close•nf90_close ⚠️:在创建新文件,如果定义的维度有记录维度...,那么要确保记录维度位于最左侧(⚠️:这里所说的最左侧是nc文件中变量的最左侧,但是在程序中定义变量的时候,使用nc_def_var等定义变量,记录维度应该位于最右侧),否则会出现 NetCDF: NC_UNLIMITED...定义变量的维度顺序与添加数据变量的维度信息大小要一致,否则可能会出现NetCDF: Start+count exceeds dimension bound的错误。...字符和数字转换 字符和数字间的转换,可以使用write语句,变量看作内部文件

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f2py:连接 FORTRAN 和 Python 的桥梁

f2py 是用来连接 fortran 和 python 的 python 包,可以 fortran 源程序转换为 python 可用的程序(windows下转换为*.pyd格式文件,linux下转换为...f2py 是 numpy 的一部分,当你安装了 numpy 就已经包含 f2py 了,其可以被用来构建 Python C/API 扩展模块,从而更容易调用 FORTRAN77/90/95 子程序,FORTRAN77... fortran 程序转换为 python 可用的程序是非常必要的,尤其是在进行复杂数值计算和处理大量数据,调用 fortran 程序比使用 python 要高效的多。...而且上述使用的数据样本很少,当数据量变大,两者之间的差异更加明显。 ?...当然在编写可转换的 fortran 程序时很容易出错,下一次讲一下常见错误,以及如何看错误并解决之。

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开讲啦:Chap 10 对文件的输入输出

:数据文件; c:C语言源程序文件; cpp:C++源程序文件; for:FORTRAN语言源程序文件; pas:Pascal语言源程序文件; obj:目标文件; exe:可执行文件; ppt:电子幻灯片...10.1.4 文件缓冲区 所谓缓冲文件系统是指系统自动地在内存区为程序中每一个正在使用文件开辟一个文件缓冲区,从内存向磁盘输出数据必须先送到内存中的缓冲区,装满缓冲区后才一起送到磁盘去,如果从磁盘向计算机读入数据...(char *str,FILE *fp),其作用是str所指向的字符串输出到fp所指向的文件中,该函数第一个参数可以是字符串常量、字符数组名或字符型指针,字符串末尾的\0不输出,若输出成功,函数值为0...,失败,函数值为EOF; 例10.4 从键盘读入若干个字符串,对它们按字母大小的顺序排序,然后排好序的字符串送入磁盘文件中保存。...clearerr函数 clearerr的作用是使文件错误标志和文件结束标志置为0,假设在调用一个输入输出函数出现错误,ferror函数值为一个非零值,应该立即调用clearerr(fp),使ferror

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Java IO

节点流:直接与数据源相连,读入或读出。 直接使用节点流,读写不方便,为了更快的读写文件,才有了处理流。 处理流:与节点流一块使用,在节点流的基础上,再套接一层,套接在节点流上的就是处理流。...(字符输出流):表示文本文件(Windows 自带的记事本软件打开能看懂内容的文件) Java的常用输入、输出流 java.io包中的stream类根据它们操作对象的类型是字符还是字节可分为两大类:...* 1.打开文件(创建字节输入流对象) * 2.读取数据 * 2.1建立一个byte数组 * 2.2文件中的内容读取到byte...转换成字节数组的操作 API: public byte[] getBytes()使用平台的默认字符集将此 String 编码为 byte 序列,并将结果存储到一个新的 byte 数组中。...* 当我们向外输出,用 UTF-8 读进行了编码,而我们的操作系统显示 txt 文档是用 GBK * 解码的,由于编码和解码码表不一致,所以就会出现乱码。

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如何在Fortran中调用Python

气候模式通常是使用Fortran实现的。那么我们应该基于Python的机器学习迁移到Fortran模型中吗?...下面通过Hello World示例演示如何通过Fortran调用Python。Fortran代码保存在test.f90文件,如下: !...但使用CFFI,我们不需要写任何C代码,CFFI会生成C类型的打包接口。下一行则定义了一个C函数hello_world接口,这可以在C语言中实现,但是这里我们使用Python和CFFI。...get和set函数的功能主要就是Fortran数组传递给STATA或者从STATE中取出Fortran数组。...通过调用给定的名称来获取数据,并且将计算结果也存储到相同的字段中,然后,Fortran代码通过索引字典中正确的关键词来获取结果。Cython中使用了类似的架构,但CFFI更为方便。

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Python:numpy总结(4)

print b # 读入的数据是错误的print a.dtype # 查看a的dtypeb = fromfile("a.bin", dtype=int32) # 按照int32类型读入数据print b...tofile可以方便地数组中数据以二进制的格式写进文件。...读入的时候设置正确的dtype和shape才能保证数据一致。 并且tofile函数不管数组的排列顺序是C语言格式的还是Fortran语言格式的,统一使用C语言格式输出。...) 以NumPy专用的二进制类型保存数据,这两个函数会自动处理元素类型和shape等信息, 使用它们读写数组就方便多了,但是numpy.save输出的文件很难和其它语言编写的程序读入。...savez函数的第一个参数是文件名,其后的参数都是需要保存的数组,也可以使用关键字参数为数组起一个名字,非关键字参数传递的数组会自动起名为arr_0, arr_1, …。

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C++fread小解

中,如同以对每个对象调用 size 次 std::fgetc ,并按顺序存储结果到转译为 unsigned char 数组的 buffer 中的相继位置。...流的文件位置指示器前进读取的字符数。   若出现错误,则 stream 的结果值不确定。若只读入部分的元素,则元素值不确定。   ...参数    1 buffer  -   指向要读取的数组中首个对象的指针 2 size    -   每个对象的字节大小 3 count   -   要读取的对象数 4 stream  -   读取来源的输入文件流...   返回值 成功读取的对象数,若出现错误文件尾条件,则可能小于 count 。   ...示例:   假设程序当前目录下,已将有一个test.txt文件,内容为:    1 2   样例代码:     1 #include  2 #include  3

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awk详解 数组

2、awk从输入文件中读取一行,称为一条输入记录。如果输入文件省略,将从标准输入读取 3、awk读入的记录分割成字段,第1个字段放入变量$1中,第2个字段放入$2,以此类推。$0表示整条记录。...,在awk中不包含可以使用! 表示。 $NF       表示这个文件的最后一列 -F   分隔符指定为: [root@znix ~]# awk -F: '$NF!...2.2.1 使用awk的END模式 前面的i++先进行计算,再输出结果。...@znix ~]# awk '{i=i+$0}END{print i}' num.txt 5050 第3章 awk数组 3.1 数组是用来做什么的?...统计日志文件中 图片.jpg 出现了多少次 统计日志文件中 图片.png 出现了多少次 统计更累的信息 3.2 数组详解---"老男孩酒店" 假设我们的酒店叫老男孩教育酒店 老男孩教育酒店hotel

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Java8读文件方法代码学习

开发者还可以使用Files.readAllBytes(Path)方法把整个文件读入内存,此方法返回一个字节数组,还可以把结果传递给String的构造器,以便创建字符串输出。   ...此方法确保了当读入文件的所有字节内容文件属性是关闭的,否则就会出现IO异常或其它的未检查异常。这意味着在读文件到最后的块内容后,无需关闭文件。...如果你想一行一行的读入文件作为字符串,那么你可以使用Files.lines()方法,它会从读入文件中返回字符串流,并使用UTF-8编码把字节转换成字符。...,故文件的编码如果不是UTF-8,那么中文内容会出现乱字符 System.out.println(new String(Files.readAllBytes(Paths.get("D:\\jd.txt...2)要输出日志,记录为什么无法读取文件或者在阅读文件遇到的任何错误。   3)在把字节转换成字符,应该指定字符编码。   4)要处理文件不存在的情况。

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读取Excel数据

,将其处理为nan] txt: cell类型的数组,如果第一行有文本信息,将其存储在这个当中 raw: cell类型的数组,sheet1中所有未处理的原始数据 2.2....[num,txt,raw] = xlsread(filename,sheet,range) sheet: 用来指定读入Excel文件的第几个sheet,sheet取值为大于等于1的整数 range...例如:'D3:Y4'代表以D3和Y4为对角定点的矩形域; 注意: 当Excel中有合并单元格,任何一个合并前的单元格的名字(比如D3)都会指代整个合并后的单元格,而将整个单元格读入。...为了避免不必要的错误,尽量读入表格中合并单元格。 2.3....%% 获取xls数据 clear all clc %% Wx15 filename = 'VT0_To_90_Wx15_AOA4_12_Betax_LRVTWB.xls'; % 该文件就在同一目录下

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【数据分析丨主题周】用Python脚本模仿Hadoop处理大数据

首先对大的日志文件进行分割,根据处理计算机的配置,设置一个分割大小的标准,大的日志文件分割为n份。 分割出来的较小日志文件分别提交给Map函数进行处理,这时的Map函数可分布在多台计算机中。...接着打开大的日志文件,逐行读入数据,再将其添加到缓存列表中,当达到分割文件保存数据的数量缓存列表中的数据写入文件。...前面介绍过,日志文件中每一条数据可分为7个部分,用空格来隔开。注意,这里最好不用split函数对一条日志进行切分,因为日志某些字段内部可能也会出现空格。...Reduce函数的处理流程也很简单,就是读入后缀为“_map.txt”的文件,进行数据的归并处理,最后输出一个结果文件。具体的脚本如下。...接着使用os.walk函数循环指定目录中的文件,找到后缀为“_map.txt”的文件进行处理。具体处理过程是,逐个Map函数的输出文件(后缀为“_map.txt”)读入,并将数据装入字典。

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学习Numpy,看这篇文章就够啦

数组维数分类可分为:一维数组、二维数组、多维数组(N维数组)。 ? Numpy是最著名的 Python库之一,常用于高性能计算。Numpy提供了两种基本对象:ndarray和ufunc。...当然这里就有一个问题出现了,Python已有列表类型,为什么需要一个数组对象(类型)?...在这节的学习中,发现一个有趣的问题:在使用np.empty函数,本想用arr = np.empty((4,7))创建一个空的多维数组,但是返回的结果是这样: ?...#利用np.ix函数两个一维的整数ndarray转化为方形区域的索引器 print('使用ix成片索引arr结果为:\n', arr[np.ix_([5, 1, 4, 2], [3, 0, 1, 2]...count:读入元素个数,‐1表示读入整个文件 sep:数据分割字符串,如果是空串,写入文件为二进制 需要注意的是,该方法需要读取知道存入文件数组的维度和元素类型,a.tofile()和np.fromfile

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NumPy 文件存取 tofile,fromfile, load,save

一,tofile()和fromfile() tofile()数组中的数据以二进制格式写进文件 tofile()输出的数据不保存数组形状和元素类型等信息 fromfile()函数读回数据需要用户指定元素类型...从上面的例子可以看出,在读入数据:需要正确设置dtype参数,并修改数组的shape属性才能得到和原始数据一致的结果。...无论数据的排列顺序是C语言格式还是Fortran语言格式,tofile()都统一使用C语言格式输出。此外如果指定了sep参数,则fromfile()和tofile()将以文本格式对数组进行输入输出。...二.save()和load() NumPy专用的二进制格式保存数据,它们会自动处理元素类型和形状等信息 如果想将多个数组保存到一个文件中,可以使用savez() savez()的第一个参数是文件名,其后的参数都是需要保存的数组...,也可以使用关键字参数为数组起名 非关键字参数传递的数组会自动起名为arr_0、arr_1、… savez()输出的是一个扩展名为npz的压缩文件,其中每个文件都是一个save()保存的npy文件文件名和数组名相同

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全方位对比:Python、Julia、MATLAB、IDL 和 Java (2019 版)

备注:在下面显示的结果中,我们使用了较旧版本的 Julia,因为在 Xeon Haswell 节点上安装最新版本的 Julia(1.1.1) 我们遇到了困难。...循环与向量化 复制多维数组 给定任意 n x n x 3 矩阵 A,我们执行以下操作: 复制代码 A(i, j, 1) = A(i, j, 2) 循环和向量化的使用。...在我们的测试中,使用了四个文件: 复制代码 world192.txt、plrabn12.txt、bible.txt、book1.txt 这些文件取自 Canterbury 语料库。...研究结果 概述: 没有任何一种语言在所有测试中都优于其他语言。 通过仅在必要创建变量以及“清空”不再使用的变量来减少内存占用非常重要。 对于相同的任务,使用内置函数会比内联代码带来更高的性能。...循环和向量化: 与使用循环相比,Python(和 NumPy)、IDL 和 R 在向量化时运行速度更快。 在使用 Numba ,只要使用 NumPy 数组,Python 就可以更快地处理循环。

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Fortran中的陷阱-NAMELIST

当执行表控有名列表的READ语句,程序搜索带有&nl_group_name的输入文件行,它表示有名列表的开始。然后读取有名列表中的所有数值,直到碰到字符"/"终止READ。...列表变量可以不出现在输入文件的有名列表中,此时READ前后这些变量的值保持不变。而且输入文件中列表变量可以出现在&nl_group_name和字符"/"间的任意一行。...使用NAMELIST可以比较方便地在程序之间传递一系列数据,省去了很多文件读写格式上的麻烦。 2....2.3.3 修改源代码与Input文件 namelist.f90中的第4行改写为 namelist /int_list/ i,j 即namelist中多出了一个变量j。...总结 当NAMELIST写在MODULE中,修改NAMELIST的内容,但不重新编译调用了这个MODULE的代码,就会出现错误

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基因组选择分析软件调研

以下是分析软件的调研结果,主要包括以下4个方面内容: 1, 主要软件汇总 2, 基因组软件介绍: 单机版 3, 基因组软件介绍: R语言版 4, 结论及建议 调研结果主要来源于三个方面:文件检索,..., Daniela Lourenco, Yutake Masuda, Ignacio Aguilar 计算机语言:FORTRAN BLUPF90命名:BLUP:最佳线性无偏预测;F90Fortran...BLUPF90模块介绍: RENUM90: 处理数据和代码,生成模板 BLUPF90:计算BLUP值 AIREMLF90使用AI,估算方差组分,计算BLUP值 ?...建议学习软件, 以理论学习为主, 比如H矩阵构建, 方差组分估算等, 数量遗传学扎实了, 再去学习相关软件, 也相对简单。...整体而言, BLUPF90构建H矩阵相对简单, ASREML遇到错误时报错机制比较健全, DMU5和PIBLUP计算BLUP值速度很快。

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Java 持久化操作之 --io流与序列化

1)字节流读写文件 一般用于处理字节数据,但字节流采用ASCII编码的,所以处理字符数据容易出现中文乱码 1. ...表示当前还剩多少个字节未读取     注意:read方法返回 int 类型 返回读入字节数组的长度,如果读取到文件末尾的时候,则返回-1 代码演示按字节读取到控制台:     四步走:1.导入相关类  ...//B.txt"),true); //声明要写入的内容 String name="我是测试字符串"; //字符串转换为字节数组...//B.txt"),true); //声明要写入的内容 String name="我是测试字符串"; //字符串转换为字节数组...: 很明显出现了乱码 2)下面使用FileReader字符流 Read()读取文件,示例如下 package text; /** * 使用字符流读取文本文件 *Title:FileReaderDemo

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【linux命令讲解大全】050.awk内置变量的使用方法和各种运算符详细解析

[P] ENVIRON 环境变量关联数组。 [N] ERRNO 最后一个系统错误的描述。 [G] FIELDWIDTHS 字段宽度列表(用空格键分隔)。 [A] FILENAME 当前输入文件的名。...: awk '{ print $2,$3 }' filename 统计文件中的行数: awk 'END{ print NR }' filename 以上命令只使用了END语句块,在读入每一行的,awk...如果得到一条记录,getline函数返回1,如果到达文件的末尾就返回0,如果出现错误,例如打开文件失败,就返回-1。 getline语法:getline var,变量var包含了特定行的内容。...当其左右有重定向符|或<: getline则作用于定向输入文件,由于该文件是刚打开,并没有被awk读入一行,只是getline读入,那么getline返回的是该文件的第一行,而不是隔行。...输出到一个文件 awk中允许用如下方式结果输出到一个文件: echo | awk '{printf("hello word!

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