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图解大数据 | 综合案例-使用spark分析肺炎疫情数据

,影响着大家生活,本案例结合大数据分析技术,使用pyspark对2020年美国肺炎疫情进行数据分析,并结合可视化方法进行结果呈现。...1)数据集下载 本案例使用数据集来自Kaggle平台美国肺炎疫情数据集,数据名称us-counties.csv,为csv文件,它包含了美国发现首例肺炎确诊病例至2020-05-19相关数据.../bin/hdfs dfs -put /home/hadoop/us-counties.txt /user/hadoop 3.使用Spark对数据进行分析 这里采用Python作为编程语言,结合pyspark...本案例中使用数据为结构化数据,因此可以使用spark读取源文件生成DataFrame以方便进行后续分析实现。...本案例主要进行了以下统计分析分析目标和方法如下: 获取数据集与代码 → ShowMeAI官方GitHub https://github.com/ShowMeAI-Hub/awesome-AI-cheatsheets

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抗击肺炎肺炎疫情数据可视化及疫情预测分析

在新型冠状病毒感染肺炎疫情牵动社会人心关键时刻,本文将利用数据分析数据挖掘、机器学习相关方法,围绕疫情态势展示、疫情走势预测进行分析,挖掘复杂异构多源数据之间关联关系,以形象生动方式呈现给大家...这里将使用传统时间序列模型Prophet、深度学习模型Seq2seq和传染病模型SIR进行确诊人数预测。...请注意,这是一个时间序列数据,因此任何一天病例数都是累积数。数据从2020年1月22日开始提供,每天都将进行更新。...所以请在使用前清洗) Confirmed - 确诊人数 Deaths - 死亡人数 Recovered - 治愈人数 本文主要使用2019ncovdata.csv数据 数据分析 1.基本导入 import...( 当然这不一定会有用,因为日期中时间不是确认病例登记真实时间,所以会存在各种干扰因素)。

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抗击肺炎,如何进行实时动态时序图谱建模与分析

我们使用AbutionGraph依据真实场景建模,由于详细数据不公开,本文中均使用模拟数据进行分析。 ? ?...肺炎数据建模 了解了图形多种存储形式后,接下来我们使用模拟数据依次建模,并详细介绍每个实体与关系数据映射关系。 ?...“基本信息” 维度 亚健康(得过疾病)2个维度:“基本信息”、“曾患病信息” 维度 患病人(患肺炎)3个维度:“基本信息”、“曾患病信息” 、“患肺炎” 维度 (各维度属性信息前章节已给出)...查询: //<<--按患者传染路径逐步遍历,直到终点实体无“患肺炎”维度 use ["患肺炎"] for ( toEdge [“传染”] ) until ( toEdge [] Dimension...=“患肺炎”) ; 结果: ? ?

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7万例肺炎数据分析结果

点击“机器学习算法与Python实战”,“置顶”公众号 重磅干货,第一时间送达 2月17日,中国疾病预防控制中心发布迄今最大规模肺炎流行病学特征分析。...原始数据来自截至2020年2月11日中国内地报告超过7万病例。相关论文发表于《中华流行病学杂志》。 ? 研究发现: ▸ 大多数肺炎患者表现为轻症,轻/中症病例达到80.9%。...60岁及以上死亡病例占比达81%,有合并症患者死亡率高出很多。 ▸ 肺炎总体呈现暴发流行模式。2019年12月发病病例,可能为小范围暴露传播模式;2020年1月可能是扩散传播模式。...湖北以外首例确诊病例是1月19日确认广东省首例输入性肺炎确诊病例。...在为肺炎患者提供诊治服务422家医疗机构中,共有3019名医务人员感染了新型冠状病毒(1716名确诊病例),其中5人死亡,粗病死率为0.3%。可能存在非职业暴露造成感染。

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使用Python检测肺炎疫情拐点,抗疫成果明显

本文对应代码、数据及文献资料已上传至我Github仓库https://github.com/CNFeffery/DataScienceStudyNotes 对代码不感兴趣朋友可以直接跳至2.2 探索肺炎疫情数据查看疫情拐点分析结果...图1 本文就将针对Python中用于拐点检测第三方包kneed进行介绍,并以新型冠状肺炎数据为例,找出各指标数学意义上拐点。...3所示,其中注意,在使用kneed检测拐点时,落在最左或最右拐点是无效拐点: 图3 2.2 探索肺炎疫情数据 接下来我们尝试将上文介绍kneed应用到肺炎数据上,来探究各个指标数学意义上拐点是否已经出现...你可以在本文开头提到Github仓库对应本文路径下找到下文使用数据,更新时间为2020-02-18 22:55:07,下面开始我们分析。...,死亡率绝对增长量十分微弱: 图15 通过上面的分析,可以看出在这场针对肺炎特殊战役中,到目前为止,除武汉外其他地区已取得阶段性进步,但仍然需要付出更大努力来巩固来之不易改变。

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肺炎可视化和预测分析(附代码)

肺炎现在情况怎么样了?推荐一份Jupyter notebook代码进行分析,把数据可视化,并对感染人数进行了预测。...scriptVersionId=32149572 (下载train.csv、test.csv、usa_states2.csv) 到inputconvid19目录即可,数据更新到2020-4-14。...原始数据是这里下载修改: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 完整代码放在github下载: https://github.com/fengdu78/...死亡率最高国家 省份情况 出现肺炎主要国家各省(州)清单 放大美国:现在美国正在发生什么?...确诊数预测,美国将会达到70万以上确诊 总结 ‍ 本文推荐一份Jupyter notebook代码进行分析,把数据可视化,并对感染人数进行了预测。

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大作业——肺炎疫情数据采集和可视化分析系统

json格式,用java程序,先转化为用tab键分割文本数据,然后导入hive中; 其次是在hive中对导进来数据进行处理过滤,再建几个表,把处理结果存到新建表里,然后把hive处理结果数据表导入...; 最后用echarts对封装数据进行数据可视化,可以做成条形图,折线图,饼图,气泡图,地图等可视化图标。...效果如下: 首页 国内疫情趋势可视化 全国省份疫情数据详情 国内疫情分布地图 各省份所有地区数据详情 各省分疫情分布地图 总结——源码下载    这次做可视化分析系统总的来说达到了自己期待效果...用到技术主要有大数据那一块:shell脚本,hive,sqoop,MySQL;SSM框架整合;前端基本没有写什么样式,简单使用了bootstrap;和数据可视化工具:echarts。    ...刚开始想要自己写爬虫程序来获取数据,但是时间比较紧,对爬虫也不熟悉,所以使用了现成接口来采集数据,虽然数据采集过程有点像模拟数据,但是整个流程还是比较完善,缺只是爬虫获取数据过程。

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肺炎数据里学到四个数据分析和机器学习知识

第2课:一定要多多探究离群值 数据集里几乎总是会存在离群值(也叫逸出值,是指数据中有一个或几个数值超出了其余数值范围),但你绝不会希望你数据分析里一直出现离群值,这是因为离群值可能只是简单疏忽或异常事件发生结果...所以,探究离群值是一件很重要事, 这样就可以确定在数据分析中是否应当包括它们,还是将它们排除出去。...第3课:对地理数据进行归一化 大家特别容易忘记一个基本技巧是,用人口或其他具有代表性因素对数据进行归一化后,按地理区域收集数据总是更有意义。...伦敦各个区COVID病例数分布图,颜色更深=病例更多 然而问题在于,不同行政区有不同的人口数量。当我们在地图上仅仅使用病例数进行着色时,最终不可避免地还是要重新绘制人口图。...IHME预测英国COVID死亡人数() 即使有了置信度区间,该模型仍然预测出了比其他团队类似模型预测更高数字。

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【推荐】肺炎最新数据集和简单可视化和预测分析(附代码)

肺炎现在情况怎么样了?推荐Github标星21.7K+肺炎公开数据集,并且用代码进行简单地可视化及预测。...推荐肺炎公开数据集: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 数据可视化: https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard...这个数据集可以做以下分析: 全球趋势 国家(地区)增长 省份情况 美国 欧洲 亚洲 什么时候会收敛?进行预测 简单演示 ? 世界病例增长 ? 美国病例增长 ? 主要国家比较 ? ?...https://fdoh.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/8d0de33f260d444c852a615dc7837c86 总结 本文推荐肺炎公开数据集...,并把数据可视化,并对感染人数进行了预测。

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flask + pyecharts 搭建肺炎疫情数据可视化交互分析平台:包含疫情数据获取、态势感知、预测分析、舆情监测等任务

该项目是浙江大学地理空间数据库课程作业8:空间分析中,使用 flask + pyecharts 搭建简单肺炎疫情数据可视化交互分析平台,包含疫情数据获取、态势感知、预测分析、舆情监测等任务 包含完整代码和实现...作业内容: 新型冠状病毒肺炎(COVID-19,简称“肺炎”)疫情肆虐全球多个国家,2020年3月11日,世界卫生组织 (WHO) 正式宣布将肺炎列为全球性大流行病。...作业要求以疫情或其它重大公共卫生事件相关时空数据为基础,利用数据清洗与管理、统计分析数据挖掘、数据可视化等相关技术和方法,探索并发现疫情大数据背后隐藏模式和规律。...nCoV_900k_train.unlabled.csv 数据集依据与“肺炎”相关230个主题关键词进行数据采集,抓取了2020年1月1日—2020年2月20日期间共计100万条微博数据...notebook 分析使用notebook scripts python脚本(爬虫、可视化、数据处理等等) spider-yqkx.py 人民网爬虫 spider-社会组织.py 中国社会组织公共服务平台爬虫

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文献分享|代谢组学分析揭示了肺炎阶段性特征

使用非靶向和靶向代谢组学分析肺炎患者所有阶段血清代谢特征进行了全面的观察。...Results 肺炎患者各期血清非靶向代谢组学研究 对发现队列进行了非靶向代谢组学分析,包括13例健康人作为正常组,18例轻度患者,12例重症患者,20例重症肺炎恢复者。...收集并分析肺炎感染者临床症状和实验室指标。 使用健康对照组(正常)和轻度、重度和恢复组患者血清进行非靶向代谢组学分析。...血清代谢物组合可能是一个潜在预测生物标志物 为了研究这9种代谢物是否可以作为肺炎患者风险分层生物标志物,用发现队列训练了几个经典模型,并用验证队列进行了验证,包括决策树、随机森林、支持向量机和...Discussion 代谢组学数据提供了肺炎患者所有阶段循环代谢物特征综合视图,并确定糖代谢和尿素循环代谢重新编程是肺炎潜在病理机制。

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基于Qt肺炎疫情数据实时监控平台1.1版本

,PC上浏览效果并不好,如下: 手机端: 上一篇文章我们也介绍了,腾讯开放了一个接口,可以根据谣言ID号,去获取谣言详细信息,数据为JSON格式,但是上一个版本程序中并没有使用这个接口,这次我们把他用上...如这条辟谣新闻: 标题: 阴雨天和大雾天会增加病毒感染风险 ID: 8be33c500e00257c97419ac24ab59d8f 我们访问这样一个地址: https://vp.fact.qq.com...id=8be33c500e00257c97419ac24ab59d8f 就会得到这条谣言新闻JSON格式详细信息,如下: 好了,有了接口返回JSON数据,我们就可以直接解析使用了。...5.开源地址 本项目Qt工程所有的代码和安装包下载地址已经开源在Github和Gitee上,现在已经更新到1.1版本,地址如下: 国外GitHub: https://github.com/whik/qt...推荐阅读 [开源]我用Qt做了个疫情数据实时监控平台 Qt平台下使用QJson解析和构建JSON字符串 Qt实现软件自动更新一种简单方法 Qt小项目之串口助手控制LED 详解EMC测试国家标准GB/T

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筛选和分析文献AI神器paperai

就是在这样一项比赛中,这个paperai,获得了8项任务大奖中6项: 创建了与肺炎相关的人口研究汇总表; 创建了与肺炎相关患者描述汇总表; 创建了与肺炎相关模型和未决问题汇总表;...创建了与肺炎相关材料研究汇总表; 创建了针对肺炎诊断汇总表; 创建了与肺炎相关风险因素汇总表。...句嵌入索引分析CORD-19 简单来说就是,该模型就是句嵌入索引和带有文章SQLite数据组合。 首先,每篇文章都被解析成句子,并与文章元数据一起存储在SQLite中。...最后,检索出来句子,会通过过TextRank算法进行分析和运行,以便在最终报告中,以高亮形式框出。 ? 以上图为例,在目标进行检索后,系统会输出文献基本信息,如日期、研究方向、期刊等。...CSV,输出CSV报告。 注释,从文章中提取结果,并在原始PDF文件上进行注释。 目前,该项目已经在Github开源获取,感兴趣小伙伴可以点击下面链接访问获得。

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清华-腾讯联合实验室针对疫情分析1:肺炎疫情拐点何时出现?

文章内容转自:腾讯医典 新型冠状病毒感染肺炎疫情仍在蔓延,国家卫计委每天发布疫情情况,变化疫情数字也牵动着千万人心。 这些变化数字中,有什么内在规律和趋势?又反映出什么疫情发展信号?...腾讯医典邀请“清华-腾讯互联网创新技术联合实验室”专家进行科学解读。希望通过进一步数据处理、分析和可视化展示,让更多的人对疫情有更科学认知。...要回答这个问题,我们要看下全国扩散指数和消亡指数变化,趋势如下: ? 图1  全国疫情扩散指数趋势图(数据截至2月6日) ?...图2 全国疫情消亡指数趋势图(数据截至2月6日) 从全国扩散指数趋势看,新型冠状病毒扩散速度在减慢,情况在好转,说明最近政府采取很多措施在见效,而消亡指数在震荡中上升。...湖北是此次疫情最严重地区,分析湖北疫情扩散指数和消亡指数,可以看下面两张图: ? 图4  湖北疫情扩散指数趋势图(数据截至2月6日) ?

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每日一练:Python爬虫爬取全国肺炎疫情数据实例详解,使用beautifulsoup4库实现

Python 爬虫篇 - 爬取全国肺炎疫情数据实例详解 效果图展示 第一章:疫情信息下载与数据提取 ① 爬取页面数据到本地 ② json 字符串正则表达式分析 ③ 提取数据 json 字符串...第二章:疫情信息数据分析 ① 提取 json 字符串里省份疫情数据并显示 ② 显示查询省份城市疫情数据 [ 系列文章篇 ] Python 地图篇 - 使用 pyecharts 绘制世界地图...这是省份: 这是城市: 第一章:疫情信息下载与数据提取 ① 爬取页面数据到本地 通过 BeautifulSoup 库解析代码,将疫情信息内容下载到本地 txt 文件用于数据分析使用...② json 字符串正则表达式分析 通过分析文件查找到 需要数据 json 字符串前关键词 "try { window.getAreaStat = " json 字符串后关键词 }...: 第二章:疫情信息数据分析 ① 提取 json 字符串里省份疫情数据并显示 方法里所传入数据是上面返回 json 字符串。

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Kaggle八项大奖斩获其6:用于筛选和分析文献paperai

就是在这样一项比赛中,这个paperai,获得了8项任务大奖中6项: 创建了与肺炎相关的人口研究汇总表; 创建了与肺炎相关患者描述汇总表; 创建了与肺炎相关模型和未决问题汇总表;...创建了与肺炎相关材料研究汇总表; 创建了针对肺炎诊断汇总表; 创建了与肺炎相关风险因素汇总表。...句嵌入索引分析CORD-19 简单来说就是,该模型就是句嵌入索引和带有文章SQLite数据组合。 首先,每篇文章都被解析成句子,并与文章元数据一起存储在SQLite中。...最后,检索出来句子,会通过过TextRank算法进行分析和运行,以便在最终报告中,以高亮形式框出。 以上图为例,在目标进行检索后,系统会输出文献基本信息,如日期、研究方向、期刊等。...CSV,输出CSV报告。 注释,从文章中提取结果,并在原始PDF文件上进行注释。 目前,该项目已经在Github开源获取,感兴趣小伙伴可以点击下面链接访问获得。

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#榜样力量#中诚信征信肺炎全国疫情感染场所实时查询平台丨数据战“疫”公益策划

“该项目案例由中诚信征信提交申报,参与数据猿推出《寻找战“疫”,中国数据智能产业先锋力量》公益主题策划活动。...大数据产业创新服务媒体 ——聚焦数据 · 改变商业 ---- 新年伊始,一场突如其来病毒肺炎“抗疫战”拉开了序幕。万众一心,众志成城,如何打赢这场没有硝烟阻击战,成为举国上下最刻不容缓事。...应用场景 肺炎全国疫情场所实时查询平台(NCPS),由中诚信征信智能风控部独立研发,利用“大数据+AI”技术手段,收集汇总来源于全国各地卫健委发布肺炎确诊患者行动轨迹、旅居史等,最终形成“列表...数据处理层:对应用层三种采集方式采集数据进行提取分析、转换去重等处理,最终存储到数据层中,供ncps应用服务使用。...应用效果 中诚信征信结合各地卫生健康委员会、疾控机构以及权威媒体公开信息,独立研发上线“肺炎全国疫情场所实时查询平台”,覆盖34省,263市,疫情感染场所9808多家。

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Pandas疫情探索性分析

在第一篇案例中我们基于网易实时疫情播报平台,使用Python对疫情数据进行了爬取。 1. 数据及Pandas工具介绍 在第一篇案例中我们基于网易实时疫情播报平台,使用Python对疫情数据进行了爬取。...本篇案例主要内容是肺炎疫情数据探索性分析,包括中国各省和世界各国实时数据,及中国和世界各国历史数据。...专注于数据分析Python库。...2.2 全国各省实时数据探索性分析 下面让我们一起来分析国内肺炎疫情情况。...总结 本案例使用基于网易实时疫情播报平台爬取数据进行肺炎疫情数据探索性分析。其中数据预处理主要包括特征列重命名、缺失值处理、查看重复值、数据类型转换等操作。

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flask + pyecharts 疫情数据分析 搭建交互式动态可视化肺炎疫情地图(附代码实现)

该项目是浙江大学地理空间数据库课程作业8:空间分析中,使用 flask + pyecharts 搭建简单肺炎疫情数据可视化交互分析平台一部分,完整实现包含疫情数据获取、态势感知、预测分析、舆情监测等任务...; 包含完整代码、数据集和实现github地址: https://github.com/yunwei37/COVID-19-NLP-vis 项目分析报告已部署到网页端,可点击http://flask.yunwei123...,完整代码可在github中获取: 实现基本原理是采用ajax方式,通过页面响应向后端flask发送请求,用pyecharts渲染地图,然后返回前端进行动态刷新: 先定义一个渲染当前国内确诊人数函数...,全国平均死亡率在4%,湖北死亡率达到4.7左右; 在四月中旬补统计了一下之前因为去世但未计入死亡率数据死亡人数,最后湖北死亡率为6.6,国内平均死亡率在5.5 国外死亡率数据分析:...; 虽然非洲等某些不发达国家疫情报告数据较少,但死亡率较高;可能表明了对于轻症患者,并没有良好检测能力; 死亡率较高国家显著集中在欧洲地区,表明了医疗资源相对短缺;墨西哥死亡率也较高;

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