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pandas使用

前言 提示:这里可以添加本文要记录大概内容: 例如:随着人工智能不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习基础内容。...---- 提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考 一、pandas是什么? 示例:pandas 是基于NumPy 一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建。...二、使用步骤 1.引入库 代码如下(示例): import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import...pd.read_csv( 'https://labfile.oss.aliyuncs.com/courses/1283/adult.data.csv') print(data.head()) 该处使用...---- 总结 提示:这里对文章进行总结: 例如:以上就是今天要讲内容,本文仅仅简单介绍了pandas使用,而pandas提供了大量能使我们快速便捷地处理数据函数和方法。

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目标检测干货 | 多级特征重复使用大幅度提升检测精度

今天分享干货,就有研究者提出了一种新轻量级框架,即多级特性重用检测器(MFRDet),它可以比两阶段方法达到更好精度。它还可以保持单阶段方法高效率,而且不使用非常深卷积神经网络。...该框架适用于深度和浅层特征图中包含信息重复利用,具有较高检测精度。...二、背景 (a)仅使用单尺度特征进行预测,(b)整合来自高级和低级特征图信息,(c)从不同尺度特征图生成预测,(d)就是今天分享多层特征重用模块可以获得不同尺度特征图。...zero-shot学习通常将视觉特征嵌入其他模态空间,或将多个模型空间映射到一个共同潜在空间,使用最近邻思想对看不见目标进行分类,这对目标检测器有很高需求。...一般情况下,每个单元会设置多个先验框,其尺度和长宽比存在差异,如图5所示,可以看到每个单元使用了4个不同先验框,图片中猫和狗分别采用最适合它们形状先验框来进行训练,后面会详细讲解训练过程中先验框匹配原则

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RepeatMasker:查找基因重复序列

RepeatMasker软件用于查找基因重复序列,默认情况下,会将重复序列原有的碱基用N代替,从而达到标记重复序列目的。...除此之外,也可以采用将重复序列转换为小写或者直接去除方式,来标记重复序列。 该软件将输入DNA序列与Dfam和Repbase数据库中已知重复序列进行比对,从而识别输入序列中重复序列。...在Sequence中输入或者上传FASTA格式DNA序列;Search Engine选择比对软件,Speed/Sensitivity选择运行模式,不同模式主要区别在于运行速度与敏感度差异,DNA.../configure 需要注意是,至少需要安装上述四种比对软件中任意一种。...运行完成后,会生成多个文件,后缀为masked文件为标记重复序列后文件,后缀为.out文件保存了重复序列区间信息。

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使用XP-CLR检测基因选择信号

检测基因选择信号方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用一种。...选择扫荡可以增加群体之间遗传分化,导致等位基因频率偏离中性条件下预期值。...XP-CLR 利用了两个群体之间多基因座等位基因频率差异(multilocus allele frequency differentiation)建立模型,使用布朗运动来模拟中性下遗传漂移,并使用确定性模型来近似地对附近单核苷酸多态性...Big Data Institute, University of Oxford Nick Hardin 使用 Python 重写了 XP-CLR计算工具,并且改正了当中存在小 bug。...可以克隆 GitHub 参考后使用 python setup.py install 安装,也可以直接在 bioconda 用conda install xpclr -c bioconda 安装。

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使用Python版XP-CLR检测基因选择信号

上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡(selective sweeep)似然方法。...XP-CLR 利用了两个群体之间多基因座等位基因频率差异(multilocus allele frequency differentiation)建立模型,使用布朗运动来模拟中性下遗传漂移,并使用确定性模型来近似地对附近单核苷酸多态性...牛津大学 Nick Hardin 使用 Python 重写了 XP-CLR计算工具,并且改正了当中存在 bug。...如果需要使用 XP-CLR 对大量样本分析,推荐使用这个重构 Python版。 Python版仓库地址为 https://github.com/hardingnj/xpclr。...使用 这个工具支持 hdf5,vcf 和 原版 XP-CLR 格式文件。

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高欣王建新课题NAR两连发-重复序列检测算法和数据库

1.重复序列识别框架LongRepMarker 重复序列在动物、植物、细菌等基因中普遍存在。例如,人类基因重复序列占比约为50%左右。...为了突破测序技术限制,克服现有检测方法在检测模式上不足,中南大学王建新课题和沙特阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)高欣课题在充分分析重复序列比对特性及其对序列组装过程影响基础上,基于多比对...综合来看,LongRepMarker不仅可以高效、全面、准确地定位基因重复序列,而且可以识别发生在重复序列内部结构变异。此外,其设计5种检测模式,可以轻松应对多种测序条件下重复序列识别。...然而,现在广泛使用重复序列数据库(如:Dfam和RepBase)受检测工具性能和可用数据规模影响,无论在元素精度,还是在覆盖物种范围方面都无法达到令人满意程度,这严重制约了该领域研究开展,研发全新多物种重复序列数据库迫在眉睫...高欣课题和王建新课题进一步基于LongRepMarker 检测框架构建了全新多物种重复序列数据库msRepDB(图2)。

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Python Pandas 使用——Series

参考链接: 访问Pandas Series元素 Python Pandas 使用——Series   Pandas是一个强大分析结构化数据工具集;它使用基础是Numpy(提供高性能矩阵运算)...Pandas 安装  官方推荐安装方式是通过Anaconda安装,但Anaconda太过庞大,若只是需要Pandas功能,则可通过PyPi方式安装。  pip install Pandas 2....Pandas 数据结构——Series  使用pandas前需要先引入pandas,若无特别说明,pd作为Pandas别名通用写法  import pandas as pd    2.1 Series...]方式访问Series是一维,但能够存储不同类型数据每个Series都有一索引与数据对应,若不指定则默认为整型索引 不显式指定index  # Series 默认索引(不显式指定index,则Series...如果python版本 >= 3.6 并且 Pandas 版本 >= 0.23 , 则通过dict创建Series索引按照dict插入顺序排序   如果python版本 < 3.6 或者 Pandas

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目标检测干货 | 多级特征重复使用大幅度提升检测精度(文末附论文下载)

今天分享干货,就有研究者提出了一种新轻量级框架,即多级特性重用检测器(MFRDet),它可以比两阶段方法达到更好精度。它还可以保持单阶段方法高效率,而且不使用非常深卷积神经网络。...该框架适用于深度和浅层特征图中包含信息重复利用,具有较高检测精度。...二、背景 (a)仅使用单尺度特征进行预测,(b)整合来自高级和低级特征图信息,(c)从不同尺度特征图生成预测,(d)就是今天分享多层特征重用模块可以获得不同尺度特征图。...zero-shot学习通常将视觉特征嵌入其他模态空间,或将多个模型空间映射到一个共同潜在空间,使用最近邻思想对看不见目标进行分类,这对目标检测器有很高需求。...一般情况下,每个单元会设置多个先验框,其尺度和长宽比存在差异,如图5所示,可以看到每个单元使用了4个不同先验框,图片中猫和狗分别采用最适合它们形状先验框来进行训练,后面会详细讲解训练过程中先验框匹配原则

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PandasApply函数具体使用

Pandas最好用函数 Pandas是Python语言中非常好用一种数据结构包,包含了许多有用数据操作方法。而且很多算法相关库函数输入数据结构都要求是pandas数据,或者有该数据接口。...,但是我认为其中最好用函数是下面这个函数: apply函数 apply函数是`pandas`里面所有函数中自由度最高函数。...假如我们想要得到表格中PublishedTime和ReceivedTime属性之间时间差数据,就可以使用下面的函数来实现: import pandas as pd import datetime...函数多了两个参数,这样我们在使用apply函数时候要自己传递参数,代码中显示三种传递方式都行。...PandasApply函数具体使用文章就介绍到这了,更多相关Pandas Apply函数内容请搜索ZaLou.Cn以前文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

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Numpy和pandas使用技巧

ndarray,它是一系列同类型数据集合 1、创建数组,将序列传递给numpyarray()函数即可,从现有的数据创建数组,array(深拷贝),asarray(浅拷贝); 或者使用arange...]] = X[['Global_active_power',"b"]].astype('float64') 查看dataframe统计信息 a.describe() 获取dataframe部分列(必须使用...,inplace = True, regex = True) a.replace('%','',inplace = True, regex = True) Dataframe copy import pandas...Python pandas数据分析中常用方法 https://blog.csdn.net/qq_16234613/article/details/64217337 重置索引 import pandas...Ctrl+Shift+- #将代码块合并:使用Shift选中需要合并框,Shift+m #在代码块前增加新代码块,按a;在代码块后增加新代码块,按b; #删除代码块,按dd #运行当前代码块,Ctrl

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pandasresample重采样使用

Pandasresample,重新采样,是对原样本重新处理一个方法,是一个对常规时间序列数据重新采样和频率转换便捷方法。...降采样:高频数据到低频数据 升采样:低频数据到高频数据 主要函数:resample()(pandas对象都会有这个方法) resample方法参数 参数 说明 freq 表示重采样频率,例如‘M’、‘...00:00:00 3 2000-01-01 00:03:00 12 2000-01-01 00:06:00 21 Freq: 3T, dtype: int64 降低采样频率为三分钟,但是每个标签使用...00:01:00 1 2000-01-01 00:01:30 NaN 2000-01-01 00:02:00 2 Freq: 30S, dtype: float64 增加采样频率到30S,使用...resample重采样使用文章就介绍到这了,更多相关pandas resample重采样内容请搜索ZaLou.Cn以前文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

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Python开发之Pandas使用

一、简介 Pandas 是 Python 中数据操纵和分析软件包,它是基于Numpy去开发,所以Pandas数据处理速度也很快,而且Numpy中有些函数在Pandas中也能使用,方法也类似。...Pandas 为 Python 带来了两个新数据结构,即 Pandas Series(可类比于表格中某一列)和 Pandas DataFrame(可类比于表格)。...二、创建Pandas Series 可以使用 pd.Series(data, index) 命令创建 Pandas Series,其中data表示输入数据, index 为对应数据索引,除此之外,我们还可以添加参数...除此之外,还可以使用函数reset_index()重置数据集index为0开始计数数列。...(axis = 1, how = 'all')#只删除所有数据缺失列 #删除重复值 drop_duplicates(inplace = True) #更改某行/列/位置数据 用iloc或者loc直接替换修改即可

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