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Python使用交叉验证进行SHAP解释

例如,集成方法如XGBoost随机森林将许多个体学习器的结果结合起来生成它们的结果。尽管这通常导致更好的性能,但它使得很难知道数据集中每个特征输出的贡献是多少。...另一个不足之处是,我所找到的所有指南都没有使用多次重复的交叉验证来计算它们的SHAP值。虽然交叉验证在简单的训练/测试拆分上是一个重大进步,但最好的做法是使用不同的数据拆分多次重复进行交叉验证。...重复交叉验证 使用交叉验证大大增加了工作的稳健性,特别是对于较小的数据集。然而,如果我们真的想做好数据科学,那么交叉验证应该在数据的许多不同拆分上重复进行。...该数据帧将每个交叉验证重复作为一行,每个X变量作为一列。现在,我们使用适当的函数并使用axis = 1来每列进行平均、标准差、最小值最大值的计算。然后将每个值转换为数据帧。...嵌套交叉验证 这一切都很棒,但还有一件事缺失:我们的随机森林处于其默认模式下。尽管默认参数在这个数据集上表现相当不错,但在其他情况下可能不是这样。而且,为什么我们不尝试最大化我们的结果呢?

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交叉验证超参数调整:如何优化你的机器学习模型

在第2部分中,我们看到使用随机森林xgboost默认超参数,并在验证集上评估模型性能会导致多元线性回归表现最佳,而随机森林xgboost回归的表现稍差一些。...交叉验证 简单训练、验证测试分割的缺点 在本文的第2部分中,我们将数据分为训练、验证测试集,在训练集上训练我们的模型并在验证集上模型进行评估。...如果我们把这个过程分解为多次训练验证测试,每次训练评估我们的模型都是在不同的数据子集上,最后在多次评估中观察模型的平均表现会怎么样呢?这就是K-fold交叉验证背后的想法。...在K-fold CV中,我们在每次迭代后模型进行评分,并计算所有评分的平均值。这样就可以更好地表示该方法与只使用一个训练验证集相比,模型的表现是怎样的。...Python中的K-fold交叉验证 因为Fitbit睡眠数据集相对较小,所以我将使用4折交叉验证,并将目前使用的多元线性回归、随机森林xgboost回归这三种模型进行比较。

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R语言决策树、随机森林、逻辑回归临床决策分析NIPPV疗效交叉验证

在临床医疗实践中,许多事件的发生是随机的,个体患者来说治疗措施的疗效、远期预后常常是不确定的不可准确预测的,究竟何种选择最好很难简单做出决定。...结论进行敏感性分析 由于临床实践中的事件发生概率值及健康状态的效用值等都可能在一定范围内变动,需要进行敏感性分析。...的算下错率 预测分类号 输出结果到excel **brules.table**(CARTmodel2)[,**c**("Subrule","Variable","Value")] 变量重要程度 随机森林...筛选样本*   test=**as.data.frame**(data[index,]) *#训练集* *#正确率* precisek/k ## [1] 0.7285714 随机森林交叉验证.../k ## [1] 0.8424495 逻辑回归交叉验证 (cv.err <- **cv** summary(cv.err) 十折交叉验证 *#正确率* precisek/k ## [1]

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R语言决策树、随机森林、逻辑回归临床决策分析NIPPV疗效交叉验证

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使用sigstore容器映像进行签名验证

的注册表中) 在本文中,我将cosign项目中的部分以及如何使用它来签名验证容器映像(以及其他受支持的对象)。...的理念 cosign是使签名验证过程成为 开发人员不可变的基础设施 。 安装构建 cosign 在此示例中,我将cosign在基于 macOS 的系统上进行安装。...$ docker login docker.io Login Succeeded 签署验证容器镜像 在我签署验证任何图像之前,我需要生成一个公钥私钥。...然后我使用这个私钥对对象进行签名,然后使用相应的公钥进行验证。我还应该使用强密码来保护密钥。理想情况下,出于安全审计目的,此密码会存储在保险库中。...最简单的使用方法cosign是将其包含到您的 SDLC 管道中,作为 Jenkins 或 Tekton 工具的示例。使用cosign,我可以将其包含在构建过​​程中以对我的软件进行签名验证

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Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测变量选择|附代码数据

为了建立一个可靠的模型,我们还实现了一些常用的离群点检测变量选择方法,可以去除潜在的离群点使用所选变量的子集来 "清洗 "你的数据步骤建立PLS回归模型PLS的K-折交叉验证PLS的蒙特卡洛交叉验证...PLS的双重交叉验证(DCV)使用蒙特卡洛抽样方法进行离群点检测使用CARS方法进行变量选择。使用移动窗口PLS(MWPLS)进行变量选择。...Ypred:预测值Ytrue:真实值RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。PLS的双重交叉验证(DCV)说明如何PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...(局部加权回归)季节趋势分解(STL)进行时间序列异常检测PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MRS)自回归模型分析经济时间序列R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据可视化分析基于

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Python使用系统聚类算法随机元素进行分类

系统聚类算法又称层次聚类或系谱聚类,首先把样本看作各自一类,定义类间距离,选择距离最小的一元素合并成一个新的类,重复计算各类之间的距离并重复上面的步骤,直到将所有原始元素分成指定数量的类。...from random import randrange def generate(s, m1, m2): '''生成形式如[('a', (1,5)), ('b', (3,6))]的随机坐标'''...ch, (randrange(m1), randrange(m1))) for ch in s] return x def xitongJulei(points, k=5): '''根据欧几里得距离points...进行聚类,最终划分为k类''' points = points[:] while len(points)>k: nearest = float('inf') # 查找距离最近的两个点...,进行合并 # 合并后的两个点,使用中点代替其坐标 for index1, point1 in enumerate(points[:-1]): position1

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Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测变量选择|附代码数据

步骤建立PLS回归模型PLS的K-折交叉验证PLS的蒙特卡洛交叉验证(MCCV)。PLS的双重交叉验证(DCV)使用蒙特卡洛抽样方法进行离群点检测使用CARS方法进行变量选择。...与K-fold CV一样,MCCV是另一种交叉验证的方法。...Ypred:预测值Ytrue:真实值RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。PLS的双重交叉验证(DCV)说明如何PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...(局部加权回归)季节趋势分解(STL)进行时间序列异常检测PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MRS)自回归模型分析经济时间序列R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据可视化分析基于

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解决Fit Failed Warning: Estimator fit failed. The score on this train-test partiti

可以尝试以下方法进行参数调整:使用网格搜索或者随机搜索来寻找最佳的参数组合。进行参数敏感度分析,找出哪些参数模型的性能影响最大,并进行调整。4....下面是一个使用随机森林算法进行分类的示例代码,同时介绍了如何解决拟合失败的问题:pythonCopy code# 导入必要的库from sklearn.ensemble import RandomForestClassifierfrom...交叉验证通过反复划分数据集并进行模型训练评估,以准确评估模型在不同数据集上的性能。 交叉验证的基本原理是将数据集划分成K个互斥的子集,被称为折叠。...常见的交叉验证方法有以下几种:K折交叉验证K-fold Cross-validation):将数据集划分为K个折叠,每次使用其中K-1个折叠作为训练集,剩下的一个作为测试集。...对于参数调优,我们可以在交叉验证过程中使用网格搜索等方法来搜索最佳参数组合。 在Python的​​scikit-learn​​库中,提供了方便的交叉验证功能。

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数据分享|python分类预测职员离职:逻辑回归、梯度提升、随机森林、XGB、CatBoost、LGBM交叉验证可视化

了解数据集的分布 划分训练集测试集 以样本中测试集占比百分之二十的比例训练模型 summary(dftrain) 建模 使用Stratified K-Fold交叉验证进行模型评估 def cross_valtion...,采用了多种机器学习算法进行分类预测,包括逻辑回归、梯度提升、随机森林、XGBoost、CatBoostLightGBM,并进行交叉验证可视化。...这些模型在数据集上进行了训练评估,并采用了交叉验证技术来评估模型的性能稳定性。 其中,逻辑回归模型采用了L2正则化来防止过拟合,并使用了网格搜索技术来优化超参数。...通过交叉验证可视化技术,我们可以评估模型的性能稳定性,并为实际应用提供可靠的预测结果。 关于分析师 在此Shilin Chen对本文所作的贡献表示诚挚感谢,她专注可视化分析、统计分析领域。...擅长Python、SQL。 本文选自《数据分享|python分类预测职员离职:逻辑回归、梯度提升、随机森林、XGB、CatBoost、LGBM交叉验证可视化》。

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机器学习实战:模型评估优化

因此,把模型的训练数据直接当作验证数据是一件非常危险的事情。 使用训练数据的注意事项 用同一份训练数据来拟合模型评价模型,会使得你模型的效果过于乐观。...最容易的规避方法是分别准备训练测试的两个子数据集,训练子集仅用于拟合模型,测试子集仅用于评估模型的准确率。 这个方法被称作是holdout方法,因为随机地选择一部分训练数据仅用于训练过程。...K-Fold交叉验证 一种更好,但是计算量更大的交叉验证方法是K-fold交叉验证。如同Holdout方法,K-fold交叉验证也依赖于训练数据的若干个相互独立子集。...主要的区别在于K-fold交叉验证一开始就随机把数据分割成K个不相连的子集,成为folds(一般称作K折交叉验证,K的取值有5、10或者20)。每次留一份数据作为测试集,其余数据用于训练模型。...对于训练预测速度很快的模型,可以使用leave-one-out的教程验证方法(即K=数据样本个数)。 交叉验证方法(包括HoldoutK-fold方法)假设训练数据的分布能代表整体样本的分布。

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PythonR中使用交叉验证方法提高模型性能

为了找到正确的答案,我们使用验证技术。 什么是交叉验证? 在给定的建模样本中,拿出大部分样本进行建模型,留小部分样本用刚建立的模型进行预测,并求这小部分样本的预测误差,记录它们的平方。...在这种情况下,应使用带有重复的简单 k倍交叉验证。 在重复的交叉验证中,交叉验证过程将重复 n 次,从而产生 原始样本的n个随机分区。将 n个 结果再次平均(或以其他方式组合)以产生单个估计。...(**xgb_params, seed = 10) 使用步骤4中计算出的概率训练集进行排序,并选择前n%个样本/行作为验证组(n%是要保留在验证组中的训练集的分数)val_set_ids 将从训练集中获取...一旦测试集的分布发生变化,验证集可能就不再是评估模型的良好子集。 6.时间序列的交叉验证 随机分割时间序列数据集不起作用,因为数据的时间部分将被弄乱。...如果要评估模型来进行多步预测,可以使用此方法。 ? 7.自定义交叉验证技术 如果没有一种方法可以最有效地解决各种问题。则可以创建基于函数或函数组合的自定义交叉验证技术。 如何测量模型的偏差方差?

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Scikit-learn 秘籍 第五章 模型后处理

第五章 模型后处理 作者:Trent Hauck 译者:飞龙 协议:CC BY-NC-SA 4.0 5.1 K-fold 交叉验证 这个秘籍中,我们会创建交叉验证,它可能是最重要的模型后处理验证练习...我们会在这个秘籍中讨论 k-fold 交叉验证。有几种交叉验证的种类,每个都有不同的随机化模式。K-fold 可能是一种最熟知的随机化模式。...从 Python 的角度看,交叉验证对象拥有一个迭代器,可以通过in运算符来访问。通常,对于编写交叉验证对象的包装器来说比较实用,它会迭代数据的子集。...我们会查看如何使用 Sklearn 自带的交叉验证,但是我们也可以使用一个辅助函数,来自动化执行交叉验证。...这类似于 Sklearn 中其它对象,如何被辅助函数流水线包装。 准备 首先,我们需要创建样例分类器,它可以是任何东西,决策树、随机森林,以及其他。我们来说,它是随机森林

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模型评估、过拟合欠拟合以及超参数调优方法

2.2.2 k-fold 交叉验证(Cross Validation) k-fold 交叉验证 的工作流程: 将原始数据集划分为 k 个大小相等且互斥的子集; 选择 k-1 个子集作为训练集,剩余作为验证进行模型的训练评估...2.2.4 自助法 在留出法 k-fold 交叉验证法中,由于保留了一部分样本用于测试,因此实际训练模型使用的训练集比初始数据集小,这必然会引入一些因为训练样本规模不同而导致的估计偏差。...同时,它也是随机森林算法中用到的方法。 它的做法就是样本数量为 N 的数据集进行 N 次有放回的随机采样,得到一个大小是 N 的训练集。...这里并没有验证集来做超参数的选择。所有测试集的测试误差的均值作为模型的预测能力的一个估计。 使用 k-fold 交叉的原因是:样本集太小。...4.2 调整原则 1.通常先超参数进行粗调,然后在粗调中表现良好的超参数区域进行精调。 2.超参数随机搜索,并不意味着是在有效范围内随机均匀取值。需要选择合适的缩放来进行随机选取。

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机器学习(十二)交叉验证实例

1 交叉验证简介 1.1 交叉验证是什么 交叉验证的基本思想是把在某种意义下将原始数据(dataset)进行分组,一部分做为训练集(train set),另一部分做为验证集(validation set...适应的过程是模型的参数进行调整,以使模型尽可能反映训练集的特征。 如果从同一个训练样本中选择独立的样本作为验证集合,当模型因训练集过小或参数不合适而产生过拟合时,验证集的测试予以反映。...交叉验证重复K次,每个子样本验证一次,平均K次的结果或者使用其它结合方式,最终得到一个单一估测。...这个方法的优势在于,同时重复运用随机产生的子样本进行训练验证,每次的结果验证一次,10次交叉验证是最常用的。 ?...4 参考资料 K折交叉验证评估模型性能 · Python机器学习 Random Forest & K-Fold Cross Validation | Kaggle Improve Your Model

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