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Python:关于有序序列元素查找

1 引言 有序序列元素查找python算法中典型且重要的技能,通过对有序序列元素查找的学习,我们可以更快的解决关于有序序列查找的相关问题,也可以更好的体现出我们的解题思维逻辑能力和提高代码水平。...查找元素。一般地,我们可以用for循环进行遍历,再用if语句进行查找。相对于for循环,二分法更加方便。...二分法思想 对于已按照关键字排序的序列,经过一次比较后,可将序列分割成两部分,然后只在有可能包含待查找元素的一部分中继续查找,并根据试探结果继续分割,逐步缩小查找范围,直至找到或找不到为止。...2 问题描述 示例:如何查找有序序列中某一的元素 输入:[1,2,3,4,5,6,……,100] 61 #查找的元素 输出:61 3 算法描述 在这里我们主要使用二分法查找。...然后反复地用这个方法排除多余的元素,直到剩下需要查找的元素(61)。 4 结语 有序序列中元素的查找有两种方法:一是用for循环进行遍历查找。二是二分法进行查找

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4️⃣ 核酸序列特征分析(8):重复序列查找

[序列比对和序列特征分析总目录](https://www.jianshu.com/p/878f2b2495ae 基因组序列主要构成成分是基因序列,重复序列和基因间序列。...基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别,为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。 什么是重复序列?...重复序列(repetitive sequence)是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段,一般不编码多肽。组织形式有两种:串联重复序列和分散重复序列。...分类 大致分三类: 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列 特点 GC含量低,AT含量高,3'和5'端有直接重复序列存在,有利形成环形结构。...常用数据库 GIRI的RepBase:常用的真核生物DNA重复序列数据库 RepeatMasker:常用的重复序列分析工具 ALU数据库:人和灵长类Alu重复片段 LINE-1数据库

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使用Python查找和替换Excel数据

标签:Python与Excel,pandas 这里,我们将学习如何在Python中实现常见的Excel操作——查找和替换数据。...准备用于演示的数据框架 让我们将Excel文件(注:你可以在知识星球完美Excel社群下载示例Excel文件find_replace.xlsx,以便于进行后续操作)数据加载到Python中,我们同样将使用...pandas库,这是Python中数据分析的标准。...图1 本文将演示在Python查找和替换数据的两种方法。第一个是称之为“直接替换”,第二个是“条件替换”。 使用.replace()方法直接替换 顾名思义,此方法将查找匹配的数据并用其他数据替换。...如果仍想在此处使用.replace(),可随意使用。然而,也可用另一种方式去做。还记得当我们介绍筛选时,实际上可以选择特定的列吗?

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STL中有序序列查找算法

1.binary_search() 二分查找一般比顺序搜索要快,但要求序列中的元素是有序的。 参数定义:binary_search() 实现了一个二分查找算法。...这个序列中的元素必须被排成升序序列或者至少相对于所查找元素是有序的。 返回值:如果找到第三个参数,这个算法会返回布尔值 true,否则返回 false。...另一个版本的 binary_search() 接受一个额外的参数,它是一个用于查找元素的函数对象;显然,它必须和用于对被查找序列进行排序的比较操作有相同的效果。...3.upper_bound() 在前两个参数定义的范围内查找大于第三个参数的第一个元素。对于这两个算法,它们所查找序列都必须是有序的,而且它们被假定是使用 < 运算符来排序的。...4.equal_range() 找出有序序列中所有和给定元素相等的元素。 参数定义:前两个参数是指定序列的两个正向迭代器,第三个参数是要查找的元素。

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使用 Ruby 或 Python 在文件中查找

对于经常使用爬虫的我来说,在大多数文本编辑器都会有“在文件中查找”功能,主要是方便快捷的查找自己说需要的内容,那我有咩有可能用Ruby 或 Python实现类似的查找功能?这些功能又能怎么实现?...问题背景许多流行的文本编辑器都具有“在文件中查找”功能,该功能可以在一个对话框中打开,其中包含以下选项:查找: 指定要查找的文本。文件筛选器: 指定要搜索的文件类型。开始位置: 指定要开始搜索的目录。...方法: 指定要使用的搜索方法,例如正则表达式或纯文本搜索。有人希望使用 Python 或 Ruby 类来实现类似的功能,以便可以在任何支持 Python 或 Ruby 的平台上从脚本运行此操作。...解决方案Python以下代码提供了在指定目录中搜索特定文本的 Python 脚本示例:import osimport re​def find_in_files(search_text, file_filter...上面就是两种语实现在文件中查找的具体代码,其实看着也不算太复杂,只要好好的去琢磨,遇到的问题也都轻而易举的解决,如果在使用中有任何问题,可以留言讨论。

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python使用pickle,marshal进行序列化、反序列及JSON的使用

Pickle序列化         python的pickle模块实现了基本的数据序列和反序列化。...通过pickle模块的序列化操作我们能够将程序中运行的对象信息保存到文件中去,永久存储;通过pickle模块的反序列化操作,我们能够从文件中创建上一次程序保存的对象 JSON(JavaScript Object...JSON采用完全独立于语言的文本格式,但是也使用了类似于C语言家族的习惯(包括C, C++, C#, Java, JavaScript, Perl, Python等)。...marshal         marshal并不是一个通用的模块,在某些时候它是一个不被推荐使用的模块,因为使用marshal序列化的二进制数据格式还没有文档 化,在不同版本的Python中,marshal...也就是说,用python2.5序列为一个对象,用python2.6的程序反序列化 所得到的对象,可能与原来的对象是不一样的。

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python使用pickle,marshal进行序列化、反序列及JSON的使用

Pickle序列化         python的pickle模块实现了基本的数据序列和反序列化。...通过pickle模块的序列化操作我们能够将程序中运行的对象信息保存到文件中去,永久存储;通过pickle模块的反序列化操作,我们能够从文件中创建上一次程序保存的对象 JSON(JavaScript Object...JSON采用完全独立于语言的文本格式,但是也使用了类似于C语言家族的习惯(包括C, C++, C#, Java, JavaScript, Perl, Python等)。...marshal         marshal并不是一个通用的模块,在某些时候它是一个不被推荐使用的模块,因为使用marshal序列化的二进制数据格式还没有文档 化,在不同版本的Python中,marshal...也就是说,用python2.5序列为一个对象,用python2.6的程序反序列化 所得到的对象,可能与原来的对象是不一样的。

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使用Python实现时间序列预测模型

时间序列预测是一种重要的数据分析技术,它可以帮助我们预测未来的趋势和模式。在本文中,我们将介绍时间序列预测的基本原理和常见的预测模型,并使用Python来实现这些模型。 什么是时间序列预测?...在Python中,我们可以使用statsmodels库来实现ARIMA模型: import pandas as pd from statsmodels.tsa.arima.model import ARIMA...在Python中,我们可以使用statsmodels库的SARIMAX类来实现SARIMA模型: import pandas as pd from statsmodels.tsa.statespace.sarimax...,并使用Python实现了ARIMA和SARIMA模型。...希望本文能够帮助读者理解时间序列预测模型的概念和实现方法,并能够在实际应用中使用Python来进行时间序列预测。

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RepeatMasker:查找基因组上的重复序列

RepeatMasker软件用于查找基因组上的重复序列,默认情况下,会将重复序列原有的碱基用N代替,从而达到标记重复序列的目的。...除此之外,也可以采用将重复序列转换为小写或者直接去除的方式,来标记重复序列。 该软件将输入的DNA序列与Dfam和Repbase数据库中已知的重复序列进行比对,从而识别输入序列中的重复序列。...在Sequence中输入或者上传FASTA格式的DNA序列;Search Engine选择比对软件,Speed/Sensitivity选择运行模式,不同模式的主要区别在于运行速度与敏感度的差异,DNA...软件基本用法如下 RepeatMasker -pa 5 -small -species human chrM.fa -pa指定线程数,只有输入文件大于50Kb时才发挥作用;-small表示将重复序列转换为小写...运行完成后,会生成多个文件,后缀为masked的文件为标记重复序列后的文件,后缀为.out的文件保存了重复序列区间信息。

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Tandem Repeats Finder:串联重复序列查找工具

Tandem Repeats Finder, 简称TRF, 是一款串联重复序列查找工具,repeatmasker 程序中就整合了这个软件,官网如下 https://tandem.bu.edu/trf/trf.html...点击Basic链接,跳转到如下页面,上传对应的fasta格式的序列文件,或者在文本框中粘贴对应的序列,然后点击Submit sequence按钮,进行提交 ?...所有序列的结果汇总 在该页面会列出所有检测到了重复序列区域的序列ID, 点击每条序列的名称,会跳转到该序列的详细页面 ? 2....一条序列上的所有重复区域汇总 在该页面,会以表格的形式,给出一条序列上所有重复序列的汇总情况,点击Table Explanation, 可以查看表头的详细解释;点击第一列的重复区域的ID, 可以跳转到详细页面...重复序列详细页面 在该页面,会给出重复区域的序列信息,示意如下,可以看到,是一段以ACTC作为motif的重复区域 ?

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