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Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

"正确地打开方式": [ "阅读", "置顶", "转发" ] } } 在Python...中解析JSON是通过如下代码完成的 import json file_fh = open("test2.json") ajsonD = json.load(file_fh) ajsonD {'公众号':...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...JSON结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON...文件,获得想要的Python脚本和解析结果

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Python 实现使用值进行赋值 None

0.摘要 在Python中,尤其是数组当中,对于一些异常值往往需要进行特殊处理。为了防止异常值与正常数据混淆,影响最终计算结果,常用的方法是将异常值置零或者置。...置零的方法较为简单,本文主要介绍如果对python中的数据进行置。 1.赋值为None 对于一般数据,可以直接为其赋值为None。...i = 1 i = None # int 型数据置 s = "string" s = None # 字符串型数据置 l = [1,2,3,4] l[2] = None # 列表中元素置...从最终结果上看,不论是np.nan,还是None,在numpy中都以nan的形式出现。...np.isnan(float("nan")) True np.isnan(float("inf")) False 以上这篇Python 实现使用值进行赋值 None就是小编分享给大家的全部内容了

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Python XML解析之Element

参考网址: http://www.runoob.com/python/python-xml.html https://docs.python.org/2/library/xml.etree.elementtree.html...DOM是一种跨语言的XML解析机制,通过将整个XML在内存中解析为一个树来操作,ElementTree未做太多介绍,你可以到官网网址查看其详细的方法释义。...ElementTree是Python中最快捷的XML解析方式,可以看做一个轻量级的DOM,本文主要讲ElementTree,ElementTree在解析XML时非常方便,DOM比较笨重但是功能齐全,例如...new_dict = {} for e in root_old.getiterator(): # 遍历proxool树的所有节点element,包含其作为父节点的自身 # text为时不能使用...ElementTree解析的XML文件很难美化,且不能处理注释,所以转用minidom处理XML文件了,详见《Python XML解析之DOM》

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Python 爬虫解析库的使用

解析库的使用--Beautiful Soup: BeautifulSoup是Python的一个HTML或XML解析库,最主要的功能就是从网页爬取我们需要的数据。...BeautifulSoup 安装与使用: Beautiful Soup是一个依赖于lxml的解析库,所以在安装之前要先确保lxml库已安装:pip install lxml 安装 BeautifulSoup...主要的解析器,以及它们的优缺点: 解析使用方法 优势 劣势 Python标准库 BeautifulSoup(markup, "html.parser") Python的内置标准库,执行速度适中,文档容错能力强...Python 2.7.3 or 3.2.2前的版本中文档容错能力差 lxml HTML 解析器 BeautifulSoup(markup, "lxml") 速度快 文档容错能力强 需要安装C语言库 lxml...,而且速度快,容错能力强,故推荐使用

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使用Python解析MNIST数据集

前言 最近在学习Keras,要使用到LeCun大神的MNIST手写数字数据集,直接从官网上下载了4个压缩包: ?...解析脚本 根据以上解析规则,我使用Python里的struct模块对文件进行读写(如果不熟悉struct模块的可以看我的另一篇博客文章《Python中对字节流/二进制流的操作:struct模块简易使用教程...IDX文件的解析通用接口如下: 1# 解析idx1格式 2def decode_idx1_ubyte(idx1_ubyte_file): 3""" 4解析idx1文件的通用函数 5:param...idx1文件路径 6:return: np.array类型对象 7""" 8return data 9def decode_idx3_ubyte(idx3_ubyte_file): 10""" 11解析...13======================== 14关于IDX文件格式的解析规则: 15======================== 16THE IDX FILE FORMAT 17the

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使用Python解析Redo log文件

解析Redo log文件是一项复杂的任务,它涉及到对Oracle数据库内部数据结构的深入理解和处理。...在这里,我提供一个示例代码框架,它使用了Oracle官方提供的LogMiner工具来解析Redo log文件。请注意,这只是一个简单的示例,你需要根据具体的需求和环境进行适当的修改和扩展。...logminer.end_session() redo_log_file = "/path/to/redo.log" analyze_redo_log(redo_log_file) 上述示例代码使用了...然后,通过start_session()方法启动LogMiner会话,使用get_next()方法循环读取Redo log记录。每个记录都可以根据需要进行解析和处理。...需要注意的是,LogMiner是Oracle数据库提供的功能,使用时需要确保你的数据库版本支持并启用了LogMiner功能。

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