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数据科学 IPython 笔记本 8.16 地理数据和 Basemap

有用是这里显示地球不仅仅是一个图像; 它是一个功能齐全 Matplotlib 轴域,它可以理解球面坐标,这使我们可以轻松在地图上绘制数据!...这个选项很重要:例如,在全局地图上设置高分辨率边界可能非常慢。 这是绘制/海洋边界,以及分辨率参数效果示例。我们将创建苏格兰美丽斯凯岛低分辨率和高分辨率地图。...此处使用数据下载于 2016 年 6 月 12 日,文件大小约为 9MB: # !...gunzip gistemp250.nc.gz 数据采用NetCDF格式,可以通过netCDF4库在 Python 中读取。....nc') 该文件包含不同日期许多全球温度读数;我们需要选择我们感兴趣日期索引 - 这里是 2014 年 1 月 15 日: from netCDF4 import date2index from

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Basemap系列教程:读取WRF模式数据

Basemap 特别擅长绘制数值天气模式输出数据,比如 WRF。WRF [注1] 模式是广泛使用数值预报模式,只要变量名合适,大部分情况下都可以使用其它模式输出来运行。...译注: 读取 NetCDF文件也可以使用 netcdf4 库 绘制域 from osgeo import gdal from mpl_toolkits.basemap import Basemap import...读取文件时,它使用是调用 subdatasets 即,子数据集方式,因此每个变量都像是单独文件 XLONG 和 XLAT 包含是矩阵中每个点经纬度信息。...使用 Basemap 时这些信息是非常重要 绘图时,仅使用每个变量第一条带,这是因为longitudes, latitudes 和temperature 都有多条带(译注:因为每个变量都有多个时刻输出...注意:由于这些变量都是 numpy 数组,因此计算起来很容易。

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地图可视化绘制 | R-ggplot2 NC地图文件可视化

在推出两期数据分享之后,获取数据小伙伴们也知道,数据格式都是NetCDF(nc) 格式网格数据,虽然我在推文分享中说明使用Python、R或者GIS类软件都是可以进行 处理和可视化绘制,但是,还是有小伙伴咨询使用编程软件...Python或者R处理nc数据,正好也想分享一期关于nc网格数据可视化绘制过程,这里我们使用R包进行nc数据处理(Python处理较为简单,将放在空间插值系列资料中,该部分正在加快进程中哦~~),...nc_open(): Open a netCDF File(打开nc文件)。 ncvar_get(): Read data from a netCDF file(读取nc文件变量数据)。...nc数据可视化绘制 由于我们使用是ggplot2进行绘制,所以我们直接使用raster包进行nc文件读取(其实也是调用ncdf4包进行处理),数据我们就使用昨天分享数据数据:数据(代码)分享 |...总结 这一期我们还是分享了可视化绘制技巧,希望对大家绘制空间nc网格数据有所帮助,而Python 处理及可视化绘制操作打算和空间插值放在一起,尝试使用视频形式分享给大家~

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Python数据分析入门(十六):绘制散点图

通过观察散点图上数据点分布情况,我们可以推断出变量相关性。...如果变量之间不存在相互关系,那么在散点图上就会表现为随机分布离散点,如果存在某种相关性,那么大部分数据点就会相对密集并以某种趋势呈现。...那些离点集群较远点我们称为离群点或者异常点。 ? 示例图如下: ? 绘制散点图: 散点图绘制使用是plt.scatter方法,这个方法有以下参数: x,y:分别是x轴和y轴数据集。...通过以上运动员散点图分析,我们总体上可以看出来是满足线性回归,因此可以在图上绘制一个线性回归线条。...想要绘制线性回归线条,需要先按照之前数据计算出线性方程,假如x是自变量,y是因变量,那么线性回归方程可以用以下几个来表示: y = 截距+斜率*x+误差 只要把这个方程计算出来了,那么后续我们就可以根据

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实现基于股票收盘价时间序列统计(用Python实现)

1 用rolling方法计算移动平均值 当时间序列样本数波动较大时,从中不大容易分析出未来发展趋势时候,可以使用移动平均法来消除随机波动影响。...在这个范例中,用到了matplotlib可视化控件,具体而言,在通过第5行代码从csv文件得到数据后,先是通过第8行plot方法,依次连接df对象里每天收盘价点,从而绘制了描述“收盘价”折线。...在第3行里,引入了计算自相关系数statsmodels库,在第5行里,从指定文件里读到股票收盘价数据,并在第6行,通过stats.graphics.tsa.plot_acf方法来计算绘制收盘价相关性系数图表...范例中,将首先从网络接口里抓取指定股票数据,在此基础上计算股票间相关度,并以热力图形式直观展示不同时间序列间相关性效果。...在得到数据后,会在第22行和第24行代码里,两两计算各股间相关性,并绘制成热力图,并在右边显示图例性质颜色刻度条。运行本范例,能看到如下图所示效果。 ? ? ​

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NumPy 基础知识 :6~10

图表下部是带有红线傅里叶变换,其中 x 轴表示频率, y 轴代表振幅频谱。 在下一节中,我们将简单介绍不同类型信号波,并使用numpy.fft模块计算傅立叶变换。...Python 是一种解释型语言,它在优化函数调用方面做得并不出色,但是可以使用 C 或 Cython 很好优化它们: 这种装箱和拆箱不是免费,需要花费宝贵计算时间。...前面的代码有很多“松散结果”,可以当作练习来解决 Python性能问题,并在采用 Cython 方式之前先最佳使用 NumPy。...众所周知netCDF4是一种自我描述文件格式; 您可以创建和访问存储在变量任何用户定义属性,尽管最常见是standard_name,它告诉我们该变量代表降水通量。...完成netCDF4文件创建后,最后一步是关闭文件连接: In [31]: output.close() 上面的代码向您展示了 Python netCDF4 API 用法,以便读取和创建netCDF4

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空间学术网格数据绘制,配色超赞!!

小编研究生期间处理过葵花卫星nc网格数据,前一段时间也有其他同学咨询Python处理nc数据问题,这次就简单说一下哈,内容如下: Python-netCDF4库处理nc数据 在选择完使用葵花卫星nc数据进行绘制后...,我们使用Python-netCDF4库 进行nc格式数据处理(这里仅介绍读取和数据维度选择)。...以上就解决了我们数据来源问题,也顺带说了下nc数据python读取方法,更过关于Python处理nc格式数据可在我直播时候进行详细介绍或者参考:Python-netCDF4官网[1] Python/...获取parula颜色系 这里我们首先使用Python-Matplotlib进行图表绘制,首先要解决就是设计出MATLAB默认colormap-parula。...默认colormap 接下来,我们使用colormaps.py文件parula颜色系进行绘制,如下: import matplotlib.pyplot as plt from colormaps import

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NASA数据集—— 1987-2012 年期间北极极地脆弱性实验(ABoVE)核心域中火灾数据集

该数据集包含 328 个数据文件,每个 ABoVE 瓦片两个:164 个 GeoTIFF(*.tif)格式文件和 164 个 netCDF(*.nc)格式文件。...变量是收集数据类型("ABoVE_disturbance_agents "或 "dTC"),以及 ext 是文件扩展名("tif "或 "nc")。...单元值是扰动因子类别(表 2)。无数据值为 255,数据类型为字节。 netCDF 文件包含用于检测干扰缨帽指标的栅格。...每个 netCDF 包含六个变量(表 3),年值为 1985 年至 2013 年。无数据值为 -32767。...针对该时间序列年际变化计算了亮度、绿度和湿度缨帽指数(表 3),并在本数据集 netCDF 文件中提供了 1985-2013 年数据。

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最强大netCDF处理工具

ncra—netCDF Record Averager ncra对一系列输入文件记录变量进行统计计算,比如计算均值。进行统计计算时也可以给定权重信息,进行加权平均。...这意味着对于所有输入文件给定变量而言,使用打包规则压缩数据必须使用相同打包参数(即scale_factor和add_offset),否则连接后数据集无法正确解包。...ncwa—netCDF Weighted Averager ncwa可以对单个输入文件中任意维度变量执行统计计算,可以给定权重、掩膜信息或归一化。...NCO也提供了Python封装版本[1],但功能可能没有直接使用NCO命令行工具强大,感兴趣可以直接查看github链接。...除了NCO之外,还有一个用于处理netCDF文件命令行工具--CDO,也有对应Python封装版本,感兴趣可以查看。 此次仅对上述命令进行简要介绍,下次再详细介绍常用命令使用方法。

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xarray | 序列化及输入输出

netCDF在大多数平台上都支持,因此科学程序语言几乎都支持解析 netCDF 文件。最近 netCDF 版本基于更广泛使用 HDF-5 文件格式。了解更多netCDF文件格式 [注1]。...为了读取或写入 netCDF 文件,需要安装 scipy 或 netcdf4-python。...当要在一个文件中写入多个组时,传入 mode = 'a' 给 to_netcdf ,从而确保每一次调用都不会删除文件。 除非执行一系列计算操作,否则 netCDF 文件值是不会加载到内存中。...这些信息会保存为 netCDF 变量编码信息,从而使得 xarray 能够更准确读取编码数据。 注意: 是否使用编码选项是可选。...如果不指定编码信息的话,xarray 会使用默认编码属性信息;如果指定的话,这会更有利于额外处理操作,尤其是压缩操作。 当存储文件时,这些属性信息会保存为每一个变量属性。

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使用Python处理NetCDF格式文件

NetCDF 数据特性包括: 自描述性:即 netCDF 文件包括关于其中所含数据信息,如捕获数据元素时间以及使用测量单位。...可移植性:或称跨平台性,即在一种操作系统上创建 netCDF 文件通常可被其他操作系统上软件读取。 可扩展性:即可有效读取一个大 netCDF 文件一个小子集,而无需读取整个文件。...NetCDF 文件处理工具 其中列出ncdump可以查看NetCDF文件变量和属性等信息,ncview,panoply可以对NetCDF文件变量进行简单可视化,如果需要对NetCDF文件进行裁剪...复杂数据处理工作和二维可视化可以使用matlab,python或NCL,三维可视化可以使用VisAD,Vis5d,IDV等。 处理nc文件工具很多,此次仅利用python来讲一下如何处理nc文件。...目前Python中最受欢迎处理NetCDF数据库是netCDF4-python。此外,scipy.io模块也提供了NetCDF文件接口,可以用来读取NetCDF文件

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使用Seaborn和Pandas进行相关性分析和可视化

要想了解这些故事展开,最好方法就是从检查变量之间相关性开始。在研究数据集时,我首先执行任务之一是查看哪些变量具有相关性。这让我更好地理解我正在使用数据。...这也是培养对数据兴趣和建立一些初始问题来尝试回答好方法。简单说,相关性是非常重要Python最大好处就库多,有很多库已经为我们提供了快速有效查看相关性所需工具。...让我们简要地看看什么是相关性,以及如何使用热图在数据集中找到强相关性。 什么是相关性相关性是一种确定数据集中两个变量是否以任何方式关联方法。关联具有许多实际应用。...让我们使用以上数据绘制3个散点图。我们将研究以下3种关系:年龄和体重,年龄和乳牙以及年龄和眼睛颜色。 年龄和体重 ? 当我们观察年龄和体重之间相关性时,图上点开始形成一个正斜率。...如果这种关系显示出很强相关性,我们会想要检查数据来找出原因。 使用Python查找相关性 让我们看看一个更大数据集,并且使用Python库查找相关性

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地图可视化绘制 | R-ggplot2 NC地图文件可视化

nc数据文件R包读取 nc数据可视化绘制 nc数据文件R包读取 在R中读取nc文件,我们首选ncdf4包,其使用参考网址如下:https://rdrr.io/cran/ncdf4/。...这里简单介绍下主要函数: print.ncdf4: Print Information About a netCDF File(输出nc文件基本信息)。...nc_open(): Open a netCDF File(打开nc文件)。 ncvar_get(): Read data from a netCDF file(读取nc文件变量数据)。...nc数据可视化绘制 由于我们使用是ggplot2进行绘制,所以我们直接使用raster包进行nc文件读取(其实也是调用ncdf4包进行处理),数据我们就使用昨天分享数据数据:数据(代码)分享 |...总结 这一期我们还是分享了可视化绘制技巧,希望对大家绘制空间nc网格数据有所帮助,而Python 处理及可视化绘制操作打算和空间插值放在一起,尝试使用视频形式分享给大家~

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netcdf4-python 模块详解

python中提供了多种方式来处理netcdf文件,这里主要讲一下常用 netcdf4-python 模块。 netcdf4-pythonnetCDF4 C库python模块。...netcdf变量 netcdf变量就像 numpy 模块中 python 多维数组。然而,不像 numpy 数组,可以在一个或多个无限维添加netcdf 变量。...如果文件格式是 NETCDF4, 无符号整型和64位整型可以使用。 维度本身也可以被定义为变量,称为 坐标变量。...netcdf 文件属性 netcdf 文件中包含了两种类型属性:全局属性和变量属性。前者提供是组或整个数据集信息,后者提供是组中变量信息。...从多个netcdf数据集中获取数据 如果你想从多个文件中获取一个变量数据,可以使用 MFDataset 类进行数据获取。

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【xarray库(二)】数据读取和转换

", np.arange(5)), "b": (("x", "y"), np.ones((5, 4)))} ) ds 对象ds to_series:将多变量数据DataSet使用多重索引,将相应DataArray...数据结构推荐方法是 NetCDF(Network Common Data Form),这是一种二进制文件格式,用于起源于地球科学自描述数据集。...文件后缀为.nc。Xarray 基于 netCDF 数据模型,因此磁盘上 netCDF 文件直接对应于数据集对象。...这种数据格式对于并行计算是非常友好。 Zarr 能够以多种方式存储阵列,包括内存、文件和基于云对象存储,如 Amazon S3 和谷歌云存储。...pip install pytest python -m pytest -v --pyargs zarr 大致会得到以下结果 以及对应路径下(此处以 D 盘根目录为例)临时文件(运行完毕可以删除

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如何使用Python创建NetCDF文件

之前介绍过如何使用Python处理NetCDF格式文件,这次介绍一下如何创建NetCDF文件。...使用netcdf4-python创建netCDF格式文件通常按照如下流程: 1) 打开/创建netCDF文件对象 2) 定义数据维度 3) 基于定义维度创建变量 4) 存储数据到变量 5) 为变量和数据集添加属性...然后需要指定文件格式format,目前netCDF4-python支持以下格式:NETCDF3_CLASSIC, NETCDF3_64BIT_OFFSET, NETCDF3_64BIT_DATA, NETCDF4...对应文件格式数据类型为:f,d,h,s,b,B,c,i,l。 定义变量时可以定义单个变量或者使用形式定义变量,单个变量定义只需要给定变量名即可,如上例所示。...全局属性是对应整个文件属性,顾名思义,变量属性就是对应每个变量属性。 在创建nc文件时,属性是可选。但是为了更为明确表述文件变量信息通常要添加属性,也建议添加属性。

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真・WRF模式后处理之Python

而NCL是由NCAR开发脚本语言,近些年来用户颇多,其主要应用与地学领域,其中包含了大量气象相关脚本,很多气象要素计算函数,以及气象常用图形绘制函数,官网也给出了大量示例,在气象领域中应用广泛...关于python不作过多介绍,这也不是重点。重点是使用python进行WRF后处理。...Python进行WRF模式后处理,主要使用三个库:matplotlib(python中最火可视化库),netCDF4(处理nc文件),Basemap(处理地图投影)。...当然关于处理 nc 文件库还有不少,这里主要以 netCDF4为主,cartopy库也可以处理地图投影(之前也有介绍过)。这里不作过多介绍,有兴趣可以搜索一下。...as nc # wrfpost 为个人编写库,其中 sharexy用于设置共享 x-y轴,之前例子有提及 from wrfpost import sharexy 然后,读取文件并获取变量: fip

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