在本指南中，我们想向您展示如何使用现在提供的一些奇妙，免费的工具和软件包编写美观，可重复的报告。这些工具将帮助您交流科学知识，并希望您再也不会复制和粘贴R输出。...为什么要使用Markdown？ 此Markdown的目标是“ 在可行的情况下尽可能易于阅读和编写 ”。...不仅如此，我越来越多地使用markdown进行笔记和报告写作。 因为它是纯文本，所以您可以在任何程序中编写markdown。但是，最好的测试编辑器还允许您以格式化的html格式查看代码。...它还可以在安装LaTeX的系统上产生PDF输出。”” 首先，您需要下载并 安装pandoc。安装后，您便可以使用pnadoc knitr软件包随附的 功能将生成的md文件转换为所需的任何格式。...pandoc("example.md", format = "docx") # converts md file into docx 可重复的研究 因此，有了它，您便可以使用一组工具在R中进行可重复的研究
安装 假设你已经安装了R[7]（R Core Team 2020）和RStudio IDE[8]。 不需要RStudio，但建议使用RStudio，因为它可使普通用户更轻松地使用R Markdown。...prompt和comment选项 prompt=TRUE 代码用R的大于号提示符开始。如果希望结果不用井号保护， 使用选项comment=''。...2.插入外部图形文件 如果一个图不是由一个R代码块生成的，你可以用两种方式包含它: 方法一 使用Markdown语法!...pander包的pander函数 其pander()函数可以将多种R输出格式转换成knitr需要的表格形式。如 pander::pander(lmr) ?...外部数据你可以不用markdown的形式输入，可以在R代码块使用 knitr::include_graphics() 具体可以见：和我的b站视频。 5.8.代码块的行号?
还有很多基于Bookdown的教程，一时也想不起来，欢迎大家补充。我们前面转录组和R培训的教案也是用bookdown写作的，后续再调整下格式，出一批电子书和纸质书，有意向和需求的欢迎联系。...下面分2步讲述，自己如何构建一个Bookdown书籍，第一部分是通过bookdown示例了解其基本功能和使用，第二部分是个人在使用过程中碰到的问题和解决方式。...Install Rstudio (version>1.0.0) (安装和使用见Rstudio) Install Pandoc (version>1.17.0.2)或者参照here。...Customize our bookdown 准备Rmd文件 基本规则 一个典型的bookdown文档包含多个章节，每个章节在一个R Markdown文件里面 (文件的语法可以是pandoc支持的markdown...这时可以使用Text Reference。当图或表的标题太长时，也可以使用Text Reference引用一段话作为图和表的标题。 Here is normal text.
bookdown是一款及其方便的编写技术文档或教材的工具，语法简洁，数据处理灵活。支持Rmarkdown或普通markdown通过pandoc软件转换为HTML或PDF。...文档包含多个章节，每个章节在一个R Markdown文件里面 (文件的语法可以是pandoc支持的markdown语法，但后缀必须为Rmd)。...这时可以使用Text Reference。当图或表的标题太长时，也可以使用Text Reference引用一段话作为图和表的标题。 Here is normal text....bookdown::pdf_book: template: ehbio.tex #使用自己定制的pandoc latex模板 includes: # or only customize part.../after_body.tex latex_engine: xelatex citation_package: natbib keep_tex: yes pandoc_args: --chapters
prompt和comment选项 prompt=TRUE 代码用R的大于号提示符开始。如果希望结果不用井号保护， 使用选项comment=''。...out.width和out.height选项指定在输出中实际显示的宽和高，如果使用如"90%"这样的百分数单位则可以自动适应输出的大小。...2.插入外部图形文件 如果一个图不是由一个R代码块生成的，你可以用两种方式包含它: 方法一 使用Markdown语法!...[caption](path/to/image)，你可以使用width和height属性来设置图像的大小，例如: !...pander包的pander函数 其pander()函数可以将多种R输出格式转换成knitr需要的表格形式。如 pander::pander(lmr) ?
博主作为一个经常写些东西的笔记爱好者，已经成为了 markdown 的拥趸，甚至为了方便自己使用，自定义了很多类 markdown 语法从而形成了自己的个人博客。...然而，markdown 这个看似简单轻量的标记语言，却支持非常强大的绘图功能，使用起来十分方便，本文我们就来详细介绍下 markdown 语言如何绘制流程图、饼图、序列图、甘特图。...2. markdown 绘图块 启用 markdown 绘图块与代码块非常像： ```mermaid ··· 绘图指令 ··· ``` 3....流程图 3.1 流程图声明 绘制流程图的第一行是流程图的声明，包含关键字 graph 和流程图方向。...时序图 用来描述两个或更多模块之间的交互过程首选就是时序图，markdown 也同样提供了绘制时序图的功能。 绘制时序图的关键字是 sequenceDiagram。
今天的主角为R-grafify包,其包含5大类共19种可视化图表，舒适和符合出版要求的配色更是为这个可视化包填色，下面就通过以下两个方面介绍下整个优质可视化工具。...R-grafify介绍 R-grafify样例介绍 R-grafify介绍 这一部分小编重点放在R-grafify可绘制的5大类可视化图表和颜色搭配上，内容如下： 5大类可视化图表 R-grafify包可绘制的...颜色搭配 R-grafify 包有其自己独有的颜色搭配设计，这里直接列出其所有的颜色条，如下图所示： R-grafify包所能使用的颜色条示例 你可以像使用ggplot2种的scale_fill......和scale_colour... 函数一样使用R-grafify包的颜色名称进行颜色选择和设置。...更多关于该包参数和使用方法等介绍可参考R-grafify包官网[1] 系统学习可视化 当然，在学习数据可视化的道路上，你也有很多问题得不到解答，也可以加入我们的可视化课程后，在学员群里和大家一起谈论，一起进步
swiss-army knife Pandoc 可以很方便地将文档在主流的文档格式间转化 下面分享一下 Pandoc 的基础安装操作 参考 Installing pandoc Tip: 当前版本 pandoc.../pandoc-2.1/bin/pandoc -h pandoc [OPTIONS] [FILES] -f FORMAT, -r FORMAT --from=FORMAT, --read=FORMAT...[root@C7-x64 ~]# 使用 [root@C7-x64 markdown]# ls pandoc.md [root@C7-x64 markdown]# ...../pandoc-2.1/bin/pandoc -s -f markdown -t docx pandoc.md -o pandoc.docx [root@C7-x64 markdown]# ls pandoc.docx...pandoc.md [root@C7-x64 markdown]# 其它Demo 其它使用方式可以参考 Pandoc官方示例
UG建模教程概述 中使用了UG软件的一个新指令“拔模”，具体操作步骤如下 UG建模步骤 1、绘制零件的底台；在草图中先画一个矩形，然后使用对称中心线命令，做到草图对称，然后再根据所绘图形的尺寸进行标注；...2、拉伸切剪零件；以拉伸实体的一端为草绘平面，然后绘制如下图所示的草图，进行图形上斜面的创建。...3、布尔运算；与第一步创建的实体执行布而运算求差操作； 4、图形重定义；通过检查图纸，发现我们不应该使用建模下的倒圆角，而要在草图中倒R角，此时要对刚才的截面重新编辑，编辑后的图形截面如下图： 5、...增加拔模角度；零件两侧有单边15度的角度，要使用拔模命令创建完成。...6、绘制半圆柱型截面；进入到UG草绘中以后，按下图进行二维设计； 7、完成零件设计；使用图层工具，隐藏坐标，此时绘图窗口就比较清爽了，画出的三维图形如下； 8、下图为此零件的尺寸图，需要学习的朋友请按图
小伙伴们非要私信要R语言的统计可视化工具，推给你~~ 今日小编继续给大家推荐优质绘图工具，帮助小伙伴们更好的是实现不同领域中可视化作品的快速绘制。...R-grafify介绍 R-grafify样例介绍 R-grafify介绍 这一部分小编重点放在R-grafify可绘制的5大类可视化图表和颜色搭配上，内容如下： 5大类可视化图表 R-grafify包可绘制的...颜色搭配 R-grafify 包有其自己独有的颜色搭配设计，这里直接列出其所有的颜色条，如下图所示： R-grafify包所能使用的颜色条示例 你可以像使用ggplot2种的scale_fill......和scale_colour... 函数一样使用R-grafify包的颜色名称进行颜色选择和设置。...更多关于该包参数和使用方法等介绍可参考R-grafify包官网[1] 总结 今天的推文小编简单介绍了R-grafify包的各种图表类型和颜色搭配，希望感兴趣的小伙伴可以进行相关科研图表 的绘制和对其颜色搭配
它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，通常应用于能源、材料成分、金融、零售等数据的可视化分析(来源于网络)。接下来小编就带你如何使用R轻松绘制桑基图。...R-ggalluvial绘制实例 得益于ggplot2 强大的绘制功能，在R绘图生态系统中也存在一个包专门用于绘制桑基图-ggalluvial，也是ggplot2的拓展包，大家使用起来也十分方便。...(),这里小编用的比较多的就是is_alluvia_form()和to_lodes_form()两个函数。...data(majors) head(majors,8) image.png long data 接下来的绘图则与通常的ggplot2绘制相似，如下： data(majors) majors$curriculum...其他工具绘制 在选择使用ggalluvial包进行绘制之前，我也查阅了其他绘图工具，如R-easyalluvial和R-networkD3等包，下面我给出其官网的部分可视化结果供大家参考。
Flat Surface Shader 是一个超炫的 3D 模拟照明效果，可以配置使用基于 Canvas 的 2D 上下文或者基于 SVG 多边形数组绘制三角形。...所有这些效果都是只需要单一的标签，必要的时候使用 before 和 after 伪元素。...Reveal.js 做 PPT 的优点是可以使用 markdown 语言直接写静态的文本，并可以加入各种 html 语言支持的交互动画，然后由 Pandoc 直接转化成 PPT。...缺点是使用 markdown 时对单个 HTML 元素操作不够灵活。 这个攻略会记录一些使用 Reveal.js 做 PPT 的心得以及经验教训。...为了简单化，会尽力使用 Markdown 做静态页面，在动画演示部分使用 p5js。 16.
markdown转pdf是比较常见的需求，有许多成熟的工具可以实现，比如pandoc和wkhtml2pdf，很多工具都是对这些的进一步包装。...字符串转pdf的示例代码如下，pandoc底层调用了texlive。...'rb') as pdf_file: pdf_bytes = pdf_file.read() return pdf_bytespdfkitmarkdown转pdf的流程如下：使用markdown...，转换后可以删除。...这在处理非标准编码的文件或确保使用特定编码时非常有用。# 而 open() 函数在没有提供 encoding 参数时，会使用默认的系统编码。
但是在一些场景下，我们还是会在本地的 Office 软件上写有很多文档，或者历史遗留了很多本地文档。 如果我们需要将其上传到各大平台，直接复制粘贴，大概率是会造成文档内容结构和样式的丢失。...于此我们需要将其转换为 Markdown 语法。 很多桌面软件（比如 Typora）都提供了导入 Word 文件的功能，这类功能一般是通过 Pandoc 这个软件来扩展实现的。...Pandoc 是瑞士军刀一般的存在，能够较好的处理各类的文档格式转换，但是如果我们需要自己写程序，调用 Pandoc 则需要额外的安装 Pandoc 才行，并且也不方便自定义。...幸而，在 Python 中有很多第三方模块提供了此类文档格式的转换功能。今天，我们来实现一下比较频繁使用到的 Word 文档转 Markdown 文档。...docx_to_md.md 是 HTML 转换为 Markdown 后的文档： ? 最后是另存为的图片： ?
/github.com/rstudio/bookdown) 是继knitr和rmarkdown扩展包之后， 另一个增强markdown格式的扩展， 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表、文献自动编号和引用等适用于编写书籍的功能...在bookdown的管理下一本书的内容可以按章节分解成多个Rmd文件， 其中可以包含可执行的R代码， R代码生成的统计汇总结果、表格、图形可以自动插入到生成的内容中， 表格和图形可以是浮动排版的。...程序都在一个单独的R会话中独立地运行，避免了不同Rmd文件之间同名变量和同名标签的互相干扰。...3.apa-6th-edition-no-ampersand.csl 是gitbook和epub_book处理文献使用的风格文件; 4.preamble.tex是处理(编译)bookdown文件经pandoc...每一章可以有若干节与子节，分别用markdown的二级标题(二个#开始)和三级标题(三个#开始)编写。
Pandoc还可以通过LaTeX、Groff ms或HTML生成PDF输出。 上面只是介绍了部分转换，更详细的可以通过Pandoc官网介绍进行了解和查询。 2....意思就是是否为这个电脑的所有用户都安装Pandoc。简单理解就是安装完毕后是不是所有登录用户都可以使用Pandoc软件。 我们的自己的电脑通常是只有一个账户的。可以选择可以不选择。...选择完毕后，执行安装就可以了。 安装完毕后出现的成功界面如下： 在这个结束界面中，已经说明了我们的Pandoc安装到了C:\Program Files\Pandoc 目录下。...它没有一个窗口界面让我们通过鼠标点击进行执行的，它只有命令模式。 2.1 使用 Pandoc 安装完毕后，我们就可以通过命令行操作pandoc了。...选择：pandoc.exe 文件后，点击确认就可以将Pandoc配置完毕了。 配置完毕的效果如下： 之后，我们就可以正常的使用Typora进行各种文件的导出了。
在分享完即可统计又可可视化绘制的优秀可视化包后(具体内容可看统计绘图 | 既能统计分析又能可视化绘制的技能 。就有小伙伴私信问我“需要绘制出版级别的可视化图表有什么快速的方法？“。...鉴于我是一个比较宠粉的小编，几天就给大家推荐一个技巧，让你快速绘制出符合出版要求绘图技能。...主要内容如下： R-ggpubr包主要类型函数介绍 R-ggpubr包主要案列展示 R-ggpubr包主要类型函数介绍 虽然在Python中我们也可以通过使用Matplotlib定制化出符合出版要求的图表...，但这毕竟对使用者的绘图技能要求较高，当然也是还有部分轮子可以用的，详细请参考这篇：因为配图，SCI多次返修！？...」实现极少代码绘制出符合期刊要求的可视化图表，极大省去了绘制单独图表元素的时间，为统计分析及可视化探索提供非常便捷的方式，感兴趣的小伙伴可探索更多的绘图函数哦~~
在分享完即可统计又可可视化绘制的优秀可视化包后(具体内容可看统计绘图 | 既能统计分析又能可视化绘制的技能 。就有小伙伴私信问我“需要绘制出版级别的可视化图表有什么快速的方法？“。...鉴于我是一个比较宠粉的小编，几天就给大家推荐一个技巧，让你快速绘制出符合出版要求绘图技能。...主要内容如下： R-ggpubr包主要类型函数介绍 R-ggpubr包主要案列展示 R-ggpubr包主要类型函数介绍 虽然在Python中我们也可以通过使用Matplotlib定制化出符合出版要求的图表...，但这毕竟对使用者的绘图技能要求较高，当然也是还有部分轮子可以用的，详细请参考这篇：因为配图，SCI多次返修！？...table2 总结 今天推文我们介绍了「R-ggpubr」实现极少代码绘制出符合期刊要求的可视化图表，极大省去了绘制单独图表元素的时间，为统计分析及可视化探索提供非常便捷的方式，感兴趣的小伙伴可探索更多的绘图函数哦
Rmarkdown 简介 Rmarkdown 是 R 语言环境中提供的 markdown 编辑工具，运用 rmarkdown 撰写文章，既可以像一般的 markdown 编辑器一样编辑文本，也可以在...markdown 的教程以及对应的编辑器介绍可见：R沟通｜markdown编辑器—Typora 这一期主要介绍 Rmarkdown。...官网截图 其他参考资料可见这一期推文：R分享｜Rmarkdown参考资料分享和自制视频教程预告 knitr 的详细文档参见网站knitr 文档[2]。...关于 R Markdown 可参考专著(Xie, Allaire, and Grolemund 2019[3])和(Xie, Dervieux, and Riederer 2020[4])。...RStudio 网站提供了一个 R Markdown 使用摘要下载：(rmarkdown-2.0.pdf)[rmarkdown-2.0.pdf]。Pandoc 的文档见pandoc 网站[5]。
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