meta4diag程序包是R软件中专用于实现诊断准确性试验(diagnostic test accuracy,DTA) Meta分析的程序包,该程序包基于贝叶斯理论采用INLA(integrated nested Laplace approximation)法来对 单个研究效应值进行合并,同时,该程序包还提供了SROC(Summary Receiving Operation Characteristic) 曲线图的分析与绘制,然而其缺陷在于无法给出异质性检验及风险偏倚评估。本文以实例形式就 meta4diag程序包实现诊断准确性试验DTA Meta分析的数据准备与分析、结果汇总及图形绘制等功能作相 关简述。
使用到哪个包就去安装和加载,知道要用的函数以及简单使用规律,查看帮助文档入门,统计学学到一定的程度,不要默认值,去指定值,这个过程可以调试。
发现这款软件在小样本,常见的临床问题中可以快速的解决我们大部分问题,其简单操作界面以及菜单式操作方式成为很多人选择它的理由。但是,当我们遇到某些大数据,或者复杂统计运算时,如果还拿SPSS作为自己的救命稻草,那可能就是一出损招了,甚至会一度click到想要剁手。
在很多情况下,我们所关心的不仅仅是行或列变量本身,而是行变量和列变量的相互关系,这就是因子分析等方法无法解释的了。1970年法国统计学家J.P.Benzenci提出对应分析,也称关联分析、R-Q型因子分析,其是一种多元相依变量统计分析技术。它通过分析由定性变量构成的交互汇总表,来揭示同一变量各类别之间的差异,以及不同变量各类别之间的对应关系,这是一种非常好的分析调查问卷的手段。
听说最近大家都在看《欢乐颂》,这部热剧里,女性可谓是绝对的主角,22楼5个女房客的互动好像把男性角色们的风头都抢光了;但是热门剧中又总是不能缺了言情戏的点缀。所以,《欢乐颂》到底谁和谁堪称好闺蜜、谁和谁又最为般配呢?还是让文本挖掘为你揭晓吧…… 方法 要判断两个人的关系的密切程度,可以从他们接触的频率、交流的次数入手;反映到小说上,就是两个人出现在同一场景或同一事件里的次数很多。因此在实际分析时,我们假设一个段落是一个场景,出现在这个段落里的人物,彼此之间都是有关系的。基于这个假设,我们先对原著小说进行文
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作为图像处理的软件,halcon也有深度学习模块(同样是看不到内部代码的)。以下介绍深度学习模块的安装(以安装好的halcon20.11为例)
摘要的主要思想是找到包含整个集合的“信息”的数据子集。这种技术在今天的工业中被广泛使用。搜索引擎就是一个例子;其他的例子包括文档、图像集合和视频的汇总。文档摘要试图通过寻找信息最丰富的句子,对整个文档进行有代表性的总结或抽象,而在图像摘要中,系统会找到最具代表性和最重要的(或最显著的)图像来做代表。对于监控视频,则会从平平无奇的环境中提取出重要的事件。
下图总结了主要程序包,希望读者在日常练习和工作中遇到不同格式的文件时,能够瞬间反应出读取该格式所需的包及对应的函数。(限于篇幅,本文未包含图中“平面文档格式”这部分的内容,如果你有兴趣,可以继续关注大数据后续文章。)
最近一段时间的R语言学习笔记,以便于自己学习之用,特记录在博客中,感兴趣的人还可以看看。记录的东西也不一定正确,请大家指教,里面可能会引用到一些别人的资料等,作为学习之用 读书笔记 相关的函数记录与整理 1、source("文件名.r"):调取主程序的文件,在程序结构复杂的时候很有用,可以将一部分复杂的运算主程序放入其中。 2、install.packages("fields"):安装程序包 3、library(fields):导入程序包 4、t(x)转置函数,对于csv中横排的转置很有用 5、dev.o
R是一种流行的开源编程语言,专门用于统计计算和图形。它被统计学家广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R的优势之一是允许用户创作和提交自己的包,因此它具有高度且易于扩展的特点。众所周知,R社区非常活跃,并且因为不断为特定研究领域添加用户生成的统计软件包而着称,这使得R适用于许多研究领域。
R:为什么选择我?而不是其他高级语言,比如Python,Java,C,C++....那么多编程语言?
之前的博客有介绍过R和Geoda计算莫兰指数的方法,考虑到有时候我们需要自定义空间权重矩阵来计算莫兰指数,那以上两种方法显得有点复杂。所以,今天来分享Stata计算莫兰指数的方法~
对文献解读的第三篇文章==Identification of Key Genes and Pathways in Triple-Negative Breast Cancer by Integrated Bioinformatics Analysis== 的分析过程进行重复
大数据文摘作品,欢迎个人转发朋友圈;其他机构、自媒体转载,务必后台留言,申请授权。 来源|DataCamp 编译|于婷婷 魏子敏 康欣 小小编辑| Ivy 如果你是数据分析领域的新兵,那么你一定很难抉择——在进行数据分析时,到底应该使用哪个语言,R还是Python?在网络上,也经常出现诸如“我想学习机器语言,我应该用哪个编程语言”或者“我想快速解决问题,我应该用R还是Python”等这类问题。尽管两个编程语言目前都是数据分析社区的佼佼者,但是它们仍在为成为数据科学家的首选编程语
在科学研究中,设立对照是一项基本原则,如病例对照研究的病例组和对照组、队列研究中的 暴露组和非暴露组,临床随机对照试验的试验组 和对照组。
本文由经管之家CDA数据分析师独家整理,转载请注明来源 前不久,经管之家邀请到了吉林大学数据学院概率统计系教授朱复康博士参与了论坛的线上互动问答,与广大坛友就时间序列分析、保险精算等内容进行了交流,小编将问答内容整理如下,以飨读者。 本期嘉宾 朱复康博士,吉林大学数学学院概率统计系教授,研究方向为时间序列分析、保险精算,主要教授时间序列分析、多元统计分析与线性模型、统计软件、概率统计、数理统计、多元统计分析、统计基础等研究生和本科课程,新加坡南洋理工大学访问学者, 美国佐治亚理工学院博士后,现兼任吉林省工业
开源R软件不再是学术机构的独宠或专有工具。经过多年来的持续演进,它现在已成为数据科学家、业务分析师和数据挖掘人员的理想分析软件。 Rexer Analytics发布的2013年数据挖掘人员调查显示,7
近年来基于严格设计的随机对照试验(RCT)已经被公认为评价干预措施疗效的最佳手段,这种比较所采用的针对两组研究结果比较的定量综合方法,被称为传统的 Meta 分析方法。传统 Meta 分析通过合并多个直接比较的研究而得到一个综合的评估结果,从而克服了单个研究样本量不足的缺陷,提高了研究的检验效能,特别是研究结果出现不一致时,运用 Meta 分析对判断某种干预措施的有效性与否发挥了重要作用。当欲开展两种干预措施利弊比较(A vs B)的 Meta 分析,但不能找到 A vs B 直接比较的 RCT,却可找到 A vs C与 B vs C 进行比较的 RCT,我们可以将 C 作为共同对照,通过 A vs C 与 B vs C的比较结果来间接得到 A vs B 的疗效比较,这种方法叫做间接比较(indirect comparison)。在实际的临床工作中,临床医生常常需要同时比较多种干预措施,权衡利弊以进行临床决策,这时证据网络中既存在直接证据,又存在间接证据,这种综合直接及间接证据的分析方法即为网状 Meta 分析(Network Meta-analysis, NMA)。 网状 Meta 分析可以同时比较三个或三个以上干预措施的疗效,因而被认为是传统 Meta 分析的扩展及延伸,即 NMA 可基于严格设计 RCT 同时比较多个干预措施,对直接及间接比较进行综合性分析。当无直接比较的研究存在时,间接比较成为提供有价值的卫生决策信息的有效途径;当有直接比较的研究存在时,综合直接比较与间接比较的研究结果能够提高结果的精度。不仅如此,NMA 还能够就不同干预措施的疗效进行排序,提供每一个干预措施是最佳干预措施的概率。关于 Meta 分析方法的研究迄今已经有 30 多年的时间,NMA作为一门新崛起的、一种循证医学统计学方法,越来越受到流行病学家、统计学家、临床研究者及药学家的关注及青睐。
开源R软件不再是学术机构的独宠或专有工具。经过多年来的持续演进,它现在已成为数据科学家、业务分析师和数据挖掘人员的理想分析软件。 Rexer Analytics发布的2013年数据挖掘人员调查显示,70%的数据挖掘人员使用R软件进行分析工作,其中有24%将其用作主要工具。这些结果类似于2013 年KDnuggets调查的结果,该调查指出有61%的响应者表示使用R处理分析、数据挖掘和数据科学工作。相比前一年,这一比例上升了16%。 R 是什么? R 是在用户数量和分析功能方面增长最快的分析工具。它也被称为“
既然是基础入门系列,让大家下手写代码或命令简直是不可容忍的,虽然等过了入门阶段你会义无反顾地抛弃图形界面。R的图形化操作界面有多个,既包含基本统计分析的功能,又覆盖了高阶的数据挖掘功能。我们今天先来安装其中之一——R Commander,一个基本的统计分析图形界面,并同时顺带介绍一下程序包的安装过程。 要想安装R的数以千计的社区程序包,首先要选择好距离最近的镜像站点,以提高安装的速度。打开RStudio,点击主菜单上的“Tools”—“Global Options”,然后在弹出的界面中左边选择“Packge
作者:NSS 翻译:杨金鸿 术语校对:韩海畴 全文校对:林亦霖 本文约3000字,建议阅读7分钟。 本文为带大家了解R语言以及分段式的步骤教程! 人们学习R语言时普遍存在缺乏系统学习方法的问题。学习者不知道从哪开始,如何进行,选择什么学习资源。虽然网络上有许多不错的免费学习资源,然而它们多过了头,反而会让人挑花了眼。 为了构建R语言学习方法,我们在Vidhya和DataCamp中选一组综合资源,帮您从头学习R语言。这套学习方法对于数据科学或R语言的初学者会很有用;如果读者是R语言的老用户,则会由本文了解
原文:Some R Packages to Keep In Mind(原文见文末链接)
R中缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值的函数有两个,最基本的函数是is.na()它可以应用于向量、数据框等多种对象,返回逻辑值。
上一次给大家介绍了如何用R语言进行主成分分析,今天介绍的主角也是PCA的好朋友噢,掌声欢迎我们的第二位小伙伴——冗余分析(RDA)。
在当下,人工智能的浪潮席卷而来。从AlphaGo、无人驾驶技术、人脸识别、语音对话,到商城推荐系统,金融业的风控,量化运营、用户洞察、企业征信、智能投顾等,人工智能的应用广泛渗透到各行各业,也让数据科学家们供不应求。Python和R作为机器学习的主流语言,受到了越来越多的关注。数据学习领域的新兵们经常不清楚如何在二者之间做出抉择,本文就语言特性与使用场景为大家对比剖析。 一.Python和R的概念与特性 Python是一种面向对象、解释型免费开源高级语言。它功能强大,有活跃的社区支持和各式各样的类库,同时具
搜集银行业上市公司的财务数据分析股票价格的财务影响因素,观测流动比率、净资产负债比率、资产固定资产比率、每股收益、净利润、增长率、股价和公布时间等数据。首先描述性分析对银行业上市公司的财务数据进行基础性描述,以便对整个行业形成直观的印象,然后利用因子分析提取对银行业上市公司股价影响较为明显的因素,分析银行业上市公司股价的决定因素,最后利用回归分析方法确定这些因素对股票价格的影响方向和强弱。 统计方法 描述性分析 因子分析 回归分析 具体分析 本案例为了研究的准确性和普遍性,一共搜集了23家上市的金融银
分布是描述一个样本数据最核心、最重要的方式。R内嵌了很多常用的统计分布,提供了四类函数:概率密度函数(density),累积分布函数(probability)、分位数(quantile)和伪随机数(random)。在R中分别用d,p,q,r表示这4个项目,后面接分布的英文名称或缩写。
R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的解释型语言。最初S语言的实现版本主要是S-PLUS。S-PLUS是一个商业软件,它基于S语言,并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。后来新西兰奥克兰大学的Robert Gentleman和Ross Ihaka及其他志愿人员开发了一个R系统。由“R开发核心团队”负责开发。R可以看作贝尔实验室(AT&T BellLaboratories)的RickBecker,JohnChambers和AllanWilks开发的S语言的一种实现。当然,S语言也是S-Plus的基础。所以,两者在程序语法上可以说是几乎一样的,可能只是在函数方面有细微差别,程序十分容易地就能移植到一程序中,而很多一的程序只要稍加修改也能运用于R。
前两篇分别介绍了使用Mfuzz包、TCseq包在具有时间序列特点的转录组、蛋白质组数据中分析基因或蛋白表达的时间趋势,并将具有相似表达模式的基因或蛋白划分聚类。这两种方法都是R语言程序包。但如果您不习惯用R,但仍期望实现类似的功能(时间趋势分析、聚类以及可视化作图等),本篇再继续介绍一个图形界面程序,短时间序列表达挖掘器(Short Time-series Expression Miner,STEM),它在很多文献中也常见到。
R是一种流行的开源编程语言,专门研究统计计算和图形。它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名,这使其适用于许多领域。
kickstart是一个利用Anconda工具实现服务器自动化安装的方法;通过生成的kickstart配置文件ks.cfg,服务器安装可以实现从裸机到全功能服务的的非交互式(无人值守式)安装配置。ks.cfg是一个简单的文本文件,文件包含Anconda在安装系统及安装后配置服务时所需要获取的一些必要配置信息(如键盘设置,语言设置,分区设置等);Anconda直接从该文件中读取必要的配置,只要该文件信息配置正确无误且满足所有系统需求,就不再需要同用户进行交互获取信息,从而实现安装的自动化。
本文主要介绍自动段指导(Automatic Segment Advisor)任务的内容进行详细介绍。
本文译自Stephen Wolfram 博士- Wolfram CEO 3月18号的博客
R本身提供了超过50个数据集,同时在功能包(包括标准功能包)中附带了更多的数据集。R自身提供的数据集存放在自带的datasets程序包中。
本示例使用Python和SAS分析了预防高危药物研究的结果。这个社交网络有194个节点和273个边,分别代表药物使用者和这些使用者之间的联系。
因为一些网络素材引用不规范,我们的这个笔记被网络吞掉了一次。很多朋友在公众号后台催更,还好鲍志炜抽空抢救回来了,不负大家的等待。
在学习了之前的 MapReduce 概念之后,我们应该已经知道什么是 Map 和 Reduce,并了解了他们的工作方式。
估算缺失值的方法的选择在很大程度上影响了模型的预测能力。在大多数统计分析方法中,按列表删除是用于估算缺失值的默认方法。但是,它不那么好,因为它会导致信息丢失。
机器学习是一门多领域交叉学科,涉及概率论、统计学、逼近论、凸分析、算法复杂度理论等多门学科。专门研究计算机怎样模拟或实现人类的学习行为,以获取新的知识或技能,重新组织已有的知识结构使之不断改善自身的性能。它是人工智能的基础,更是我们现在社会进步的源泉。
异常处理汇总-开发工具 http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4522988.html 协助开发里面总有几个是极简爱好者,但是呢删了不该删的就会影响项目开发,下面看下完
(1)在分析过程中,难免会产生很多中间变量,它们会占用大量内存。书中提到通常会将所有的临时中间变量命名为temp,只需要保证下一个temp出现之前,临时变量不会再延用就可以了。
在 Nuget 中没有 -version 和 -v 和 --version 等写法,只需要直接输入 nuget 在第一行就会显示版本号
编译|丁雪 校对丁一 对于那些对R语言还不熟悉的朋友,我先来做一个简单的介绍。首先,R是非常吸引人的一门语言。如今它已成为求职简历上让人眼前一亮的一门技能,部分原因是R语言的使用人数大大提升。如今它正
概述:比赛中用的比较少,要设计发放问卷,可能来不及,但实际上做研究用的比较多。 原理: 找多个人对同一个模糊概念进行描述,用隶属频率去定义隶属度 例子:
编译:丁一 黄念 丁雪 校对:席雄芬 姚佳灵 程序验证:郭姝妤 序言 在Python中调用R或在R中调用Python,为什么是“和”而不是“或”? 在互联网中,关于“R Python”的文章,排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点,而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的:这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看,尽管把两者分割开来是因为教育背景:统计学家们倾向用R,而程序员则选择了Python语言。然而,随着数据科学家的增加,这种区别开始变得模糊
在Python中调用R或在R中调用Python,为什么是“和”而不是“或”? 在互联网中,关于“R Python”的文章,排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点,而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的:这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看,尽管把两者分割开来是因为教育背景:统计学家们倾向用R,而程序员则选择了Python语言。然而,随着数据科学家的增加,这种区别开始变得模糊起来: 数据科学家就是这样一种人:软件工程师中最懂统计学,统计学家中最会编程的人。
之前基本上已经将路由协议讲完,每篇文章可以说是呕心创作,也得到了大家的支持,现在还剩最后一个动态路由协议:BGP。
投资组合优化方面的文献已经有数十年的历史了。在今天的推文,我们将介绍一些传统的投资组合优化模型。总体目标是从考虑的所有可能的具有定义的目标功能的投资组合中选择资产的投资组合。
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