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    UpSetPlot-让你使用Python轻松绘制upset图~~

    表格中的每个单元格表示该元素是否属于对应集合。常用的表示方法是使用1和0来表示属于和不属于。 「线性图」:线性图部分展示了各个集合之间的共享和差异情况。...理解和解读UPSet图需要注意以下几个方面: 数据集合的数量和交集关系:UPSet图的主要目的是展示多个数据集合之间的共同元素和交集关系。首先,观察UPSet图中的集合数量和它们之间的交集情况。...可以通过X轴上的面积大小来判断集合的大小,以及通过连接线的数量和位置来了解它们之间的交集关系。 交集元素的数量:UPSet图中的每个子集区域代表一个数据集合,而连接线表示这些数据集合之间的交集元素。...upset样图 UPSet图形可以提供以下信息: 共享元素:通过连线可以清晰地看到哪些元素同时存在于多个集合中。 集合大小:线性图中的条形长度反映了每个集合中元素的数量,从而可以对比集合的大小。...它可以帮助我们发现和分析多个数据集之间的交集和差异,从而揭示数据中的模式和关联关系。 那么,我们该如何绘制UPSet图形呢? 在Python中,可以使用UpSetPlot库来创建UPSet图形。

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    迄今为止最强大的upset plot R包,没有之一!

    和其他同类型R包的比较 安装 数据集 基础使用 挑选交集 交集选择模式 展示所有集合 添加图形 调整交集条形图(intersection size) 调整标签外观 增加颜色映射 调整高度比例 隐藏intersection...# conda install -c conda-forge r-complexupset 数据集 使用的还是来自IMDB中的电影数据。...可以挑选交集中的元素个数大于/小于某个值的集合展示,默认不包含没被用到的集合,可以使用keep_empty_group = T包括进来。 神奇的来了,支持拼图!...exclusive_intersection region: 选定集合的交集,但要去掉选定集合以外的集合中的元素,(简称: distinct), 默认是这一种; inclusive_intersection...region: 选定集合的交集 (简称: intersect); exclusive_union region: 选定集合的并集,但要去掉选定集合以外的集合中的元素; inclusive_union

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    集合的交集、并集和差集

    集合的表现形式是 {},但是需要注意,定义一个空集合的时候需要使用如下方法: myset = set() 如果你写了 {},对不起,这是一个空字典。...我们再简单的回顾一下它的相关操作: 添加元素使用 add和 update, add是将元素直接添加到集合中,而 update则是将传入的元素拆分,依次添加入集合中。...remove删除传入的元素,如果集合中有则删除,没有则报错;pop是随机删除集合中的元素;discard删除传入的元素,如果有则删除,没有不会报错。...回顾完基础知识之后,我们看一下今天的重点内容,那就是集合的交集、并集和差集: 我们先定义两个集合: In [6]: set1 = {1,2,3,4,5} In [7]: set2 = {3,4,5,6,7...优质文章推荐: 公众号使用指南 redis操作命令总结 前端中那些让你头疼的英文单词 Flask框架重点知识总结回顾 项目重点知识点详解 难点理解&面试题问答 flask框架中的一些常见问题

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    【Redis】有序集合的交集与并集

    HyperLogLog,其中使用频率相对较高的便是集合。...既然是集合,我们能想到操作就是,取交集,并集,差集。 1.zinterstore-交集 取这俩集合的交集,就可以完成上面的需求。...zinterstore 可以计算多个有序集合的交集(无序集合的score为0),并生成新的有序集合。 ZINTERSTORE destination numkeys key [key ...]...zinterstore article:score:1 2 article:type:1 article:score aggregate max 计算上面两个集合的交集,以取最大值的方式聚合。...如果有指定乘法因子的 执行聚合函数,aggregate(),默认SUM,还有MIN MAX ps:集合操作是要花费时间的,实际操作时,生成的集合key应该设置过期时间,短时间查询,应该不做交集或并集操作

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    可视化—Upset图绘制

    可视化—Upset图绘制我们在可视化集合之间关系的时候,常常会绘制韦恩图。但随着集合的增多,韦恩图显示的关系会越来越复杂,很难一眼看出其中的信息。...这种情况下我们需要使用 UpSetR 包来反映集合间的关系。...1 数据导入把你需要展示的集合做成一个list即可,我这里是需要展示的集合存在各个Rdata中,故用下述代码导入该文件夹中所有的Rdata数据。...text.scale 参数值的顺序为:- 柱状图的轴标签和刻度- 条形图的轴标签和刻度- 集合名称- 柱子上方表示交集大小的数值2.展示所需要的集合upset(fromList(input_list),...,为 FALSE 则会在柱子上添加带有随机扰动的点4.1 内置交集查询我们使用内置的交集查询:intersects,用来寻找或显示特定的交集,并将找到的交集进行上色upset(fromList(input_list

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    最强大的upset plot包之二

    前面我们已经介绍了迄今为止最强大的upsetplot包的部分内容,今天继续介绍剩下的功能,这个包绝对是目前画upset plot的最强大的R包,没有之一!...迄今为止最强大的upset plot R包,没有之一! 无论是从功能、易用性、美观度等方面,都是最强大的!...调整集合面板 修改标签和刻度 修改geom 添加标签 修改位置和颜色映射 隐藏set size面板 调整交集矩阵面板 交集矩阵条带 添加标题 背景色半透明 交集矩阵的更多调整 主题 对不同的面板使用不同的主题...交集矩阵条带 使用upset_stripes函数调整交集中的矩阵面板。...(查询query) 和UpsetR中的query差不多,查询符合条件的交集,然后高亮显示。

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    「R」使用modules包来组织R的函数集合

    安装和使用 直接从CRAN下载即可: 1install.packages("modules") 使用了解2个函数的使用就可以了。 一是import(),用于替换library()加载包。...use()将代码文件加载为模块 最近使用GitHub page的时候发现它的访问速度相当可观,哪怕GitHub主站点本身网络我们国内访问时好时坏。...4[1] "TCGA-55-7913-01B-11D-2237-01" 目前放置的几个代码文件都可以在代码库https://github.com/BioSisyphus/Rlib中查看。...这里一个对绝大部分读者有用的函数是install(),它之前被放在R包wfun中。我前几天把它重新进行了迁移和修改。...代码核心其实 就是各种情况的检查,优先使用适合的包和函数进行下载、安装。它的存在就是方便国内使用者,特别是 初学者简便地下载、安装包。

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    ggVennDiagram | 更好用的韦恩图绘制工具...

    「ggVennDiagram」-韦恩图也可以快速绘制~ 今天在整理我们的R语言可视化课程相关的资料时,发现了一个绘制韦恩图的可视化工具-「ggVennDiagram」,赶紧分享给大家~~ 韦恩图的含义...它由英国逻辑学家约翰·韦恩(John Venn)于1880年提出,常用于逻辑学、统计学和信息可视化领域。 韦恩图通常由多个圆形或椭圆形区域组成,每个区域代表一个集合,而各种组合区域表示集合之间的交集。...通过观察韦恩图,可以快速了解各个集合之间的重叠情况和关系,从而有助于进行数据分析、分类和可视化。 韦恩图常用于以下场景: 「展示数据集之间的交集和差异」:比较不同数据集之间的共有元素和独立元素。...「展示分类结果的重叠」:用于显示分类结果之间的重叠情况,例如基因表达实验中不同基因集的交集。 「逻辑推理和集合运算」:帮助理解逻辑运算中的交集、并集和补集等概念。...ggVennDiagram 介绍 ggVennDiagram包可以绘制2~7个数据集合的韦恩图且结果可直接用于出版使用。

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    R语言实现高级的韦恩图可视化

    韦恩图大家应该都不陌生,主要用来展示不同事物或者组之间的数学或逻辑关系,主要用于集合的运算结果展示。今天给大家介绍一个在R语言中更加高级的展示形式,实现此功能的R包是UpSetR。...首先看下包的安装: install.packages("UpSetR") 接下来我们直接通过实例来看下如何进行数据的可视化: ##载入包 library(UpSetR) library(ggplot2...Genre Intersections", sets.x.label = "Movies Per Genre", text.scale =c(1.3, 1.3, 1, 1, 2, 0.75)) ##自定义交集的组...= "on", order.by = "freq") ##利用不同的颜色显示重要的信息 upset(movies,queries = list(list(query = intersects, params...data rating)}#row数据源,release,rating指的是parms中的第一

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