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使用R包deconstructSigs根据已知signature进行比例推断

对wgs数据somatic突变文件自己推断denovosignature,可以使用SomaticSignatures 包identifySignatures函数,这个教程我在生信技能树分享过:使用...R包SomaticSignatures进行denovosignature推断,比如:0元,10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》 这个文献,研究者就是使用R包SomaticSignatures...R包SomaticSignatures进行denovosignature推断后11个signature 就是前面对每个样本,循环运行 whichSignatures 函数,判断每个样本signature...但是可以对比两次11个signature分解差异。 首先看看教程:使用R包deconstructSigs根据已知signature进行比例推断,比例情况: ?...然后看看教程:使用R包SomaticSignatures进行denovosignature推断,比例情况; ?

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如何在云计算平台使用R语言编程快速入门指南

在本文中,我们用信息图方式向大家介绍云计算概念,它重要性以及使用R语言和R studio基本设置等几部分内容。由于本文只是一篇快速学习攻略,你可能会遗漏一些概念方面的详细解释。...云计算全球市场规模预计将从2013年580亿美金,增长至2020年1910亿美金。 使用计算好处? 1.节约成本; 2.使用便捷; 3.扩展性强; 4.易于监控。...如何在云端使用R语言编程?...如何在云端使用RStudio来进行R编程? 1.通过sudo yuminstall R安装R 2.将RStudio服务器下载到你虚拟机上,并安装RStudio服务器。...IP地址 7.用你浏览器打开地址“IP地址:8787”,然后用刚才创建用户名和密码登陆 8.现在你可以在云端通过浏览器使用R了。

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从SAP最佳业务实践看企业管理(180)-国内成本会计一些概念

39、生产工人工资比例分配法:是按照计入各种产品成本生产工人实际工资比例分配制造费用方法。 40、机器工时比例分配法:按照各种产品生产所用机器设备运转时间比例分配制造费用方法。...41、年度计划分配分配法:是按照年度开始确定全年度适用计划分配分配费用方法 42、废品:是指不符合规定技术标准,不能按照原定用途使用,或者需要加工修理才能使用产品、半成品或产成品。...,月末在产品计算其所耗用原材料费用,不计算工资及福利费等加工费用,就是说产品加工费用全部由完工产品成本负担 54、约当产量比例法:采用这种分配方法时,将月末在产品数量按照完工程序折算为相当于完工产品产量...,然后按照完工产品产量与月末在产品产量比例分配计算完工产品费用和月末在产品费用 55、在产品完工产品计算法:采用这种分配方法时,在产品视同完工产品分配费用。...这种方法适用于月末在产品已经接近完工或者已经完工、只是尚未包装或尚未验收入库产品 56、在产品定额成本计价法:采用这种分配方法时,月末在产品各项费用各该费用定额计算,亦即月末在产品成本其数量和单位定额成本计算

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评价一个推荐系统指标详解!

使用这种方法有一个注意事项: 该方法假定用户权重一致,这在实际中很难应用,因为购买多次多个产品用户显然比只购买过几次产品用户重要。我们可以给用户分配权重,但如何确定权重并不容易。...比如测试集中 Item 分布不均衡,此时可以分别计算每个 Item RMSE 或 MAE,然后再求所有 Item 平均值。...Utility-based Ranking 第二种方法假设一列推荐结果效用是可加每个结果效用根据位置特定因子递减。...有些时候,可能需要较大比例(比如搜索)一组 Item,这时候需要一个较小位置递减因子,可以使用 Normalized Cumulative Discounted Gain(NDCG)进行评估,它是对数下降...一个简单方法是计算推荐给用户所有 Item 比例。另一个方法叫做 “sales diversity”,衡量使用特定推荐系统时不相同 Item 如何被用户选择。

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yarn公平调度详细分析(一)

,总体来说是根据每个队列权重值去分配,权重大队列分配资源更多,权重小队列分配到得资源少。...weight1.png computeSharesInternal方法概括来说就是通过二分查找法寻找到一个资源比重值R(weight-to-slots),使用这个R每个队列分配资源(在该方法里队列类型是...之所以要做这么复杂,是因为队列不是单纯按照比例分配资源(单纯权重比例,需要maxR,minR都不设置。maxR默认值是0x7fffffff,minR默认值是0)。...如果设置了maxR,minR,比例分到资源小于minR,那么必须满足minR。比例分到资源大于maxR,那么必须满足maxR。...//根据R值去计算每个队列应该分配资源 private static int resourceUsedWithWeightToResourceRatio(double w2rRatio,

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SAP中关于联产品和副产品处理

产品成本计算要考虑三个阶段:分离前、分离时、分离后。 1)分离前,在联合生产过程发生费用汇总后确定联合成本 2)分离时,就必须采用可行分配办法,将联合成本分配于各联产品。...有副产品计算成本时,由于副产品是次要产品,对企业收入和利润都影响甚微,通常确定副产品扣除价格从联合成本中扣除。...如果副产品在企业销售额中还能占据一定比例,可以按照联产品分配办法来分配联合成本,使副产品占少量成本,这种方法相对准确。副产品分配联合成本加上继续加工成本就是副产品成本。...对于by-product,应该是生产订单加工过程中,原材料或半成品使用时,未完全使用完,而剩下部分还可用于下次加工物料。生产订单完工后,使用531退入半成品(或原材料库)。...左边需要减去1000 ,但是减去这个1000需要按照结算规则中结算接受方来按照比例减,我们是比例减还是比例结?

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TAOCP|基本算法|顺序分配

传说中计算机圣经TAOCP,虽然我自己啃完这套书不太现实,但是还是先记录自己读书历程。本文主要记载了顺序分配线性表能力与局限。...栈 维护栈指针变量T,当栈空时,T=0, push Y: pop Y: (在计算机内部最有效方法是维护cT而不是T,我们这里c=1讨论) 队列 维持两个指针F和R,当队列为空时,F=R=0,...改进方法 每次重新分配内存时为多个新项腾出空间,根据上一次内存重新分配以来每个改变情况,进行全面的重新分配。扬·加威克使用了 来记录历史信息。...算法大意如下: 计算 为剩余可用内存量, 为内存增长量, 为栈增长量数组 10%内存被所有表平分,其余90%则根据上次分配后表增长量比例划分。...所有的栈计算基址,然后重新分配内存。顺序表重定位过程太繁琐,暂时略过。

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集群和负载均衡_分布式负载均衡

ip_hash 每个请求访问iphash结果分配,这样每个访客固定访问一个后端服务器,可以解决session问题。...fair(第三方) 后端服务器响应时间来分配请求,响应时间短优先分配。...监控进程根据收到全部结点负载信息来进行同步操作,即对将要分配任务按照权值比例重新进行分布。...则: W(Ni)/∑W(Ni)=T(Ni)/∑T(Ni) 表示任务分配是按照各个结点权值占权值总数比例来进行分配。...4.2 权值计算   当集群结点初次投入系统中使用时,系统管理员根据结点硬件配置情况对每个结点都设定一个初始权值DW(Ni)(通常根据结点硬件配置来定义,硬件配置越高结点默认值越高),在负载均衡器上也先使用这个权值

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OHEM 详解「建议收藏」

作者为了解决这个问题,使用了 NMS(非最大值抑制) 算法,先把损失高到低排序,然后选择最高损失,并计算其他 RoI 与这个 RoI IoU (交叉比),移除 IoU 大于一定阈值 RoI,然后反复上述流程直到选择了...(一)训练方式 ----   Fast R-CNN(上图)是使用SGD来优化模型每个RoI损失包括分类损失和回归 损失,其中不断降低分类损失使得模型分类更准确,不断降低回归损失使得 预测标注框更准确...作者发现,这样一个比例对 于Fast R-CNN性能是十分重要,增大或者减小这个比例,都会使模 型性能有所下降,但使用OHEM便可以把这个比例值去掉。...我们看到(a) 是只可读,只对所有 RoI 做前向计算,所以只需分配内存给前向计算 操作,(b) 既可读也可写,对被选择 hard RoIs 不仅做前向计算也做反向传播计算。   ...对于一次 SGD 迭代,计算过程如下:先计算出特征图,可读 RoI 网络对所有 RoI 执行前向计算计算每个 RoI 损失,然后选择 hard RoIs。

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大型Kubernetes集群资源编排优化

Controller不支持为每个HPA进行单独个性化配置。...但是腾讯内部资源预算管理通常是产品维度,而一个产品可能会包括很多Namespace,显然ResourceQuota不太适合这种场景。...如下图所示产品1暂时不用配额可以借调给产品2临时使用。 [36zay7sxal.png] 当平台有多集群时候,产品配额需要如何分配。...为了简化配下发操作,如下图所示管理员在下发产品配额时候只需配置一个该产品配额总量,配额下发模块会根据产品目前在各集群使用情况比例分配到各个集群。...比如:上面提到产品配额管理,如果一个产品配额不足了,这时候业务有高峰需要进行HPA扩容,配额管理模块需要对这种扩容优化并放行。 [yg82r0lpip.png]

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CVPR 2020 | CenterMask : Anchor-Free 实时实例分割(长文详解)

SAG-Mask中空间注意模块(SAM)帮助遮罩分支将注意力集中在有意义像素上,并抑制无关紧要像素。 在提取每个RoI上特征以进行掩码预测时,应考虑RoI比例分配每个RoI池化。...Mask R-CNN提出了一个新赋值函数,称为RoIAlign,它不考虑输入比例。因此,我们设计了一种具有比例RoI分配函数,该函数考虑了输入比例,更加合适。...诸如Faster R-CNN、YOLO和RetinaNet之类最先进物体检测器都使用预定义anchor概念,该anchor需要进行复杂参数调整和与训练中IoU相关复杂计算。...由于RoI是根据特征金字塔网络(FPN)中不同级别的特征图预测,因此提取特征RoI Align应相对于RoI比例以不同特征图比例进行分配。...具体而言,必须将大规模RoI分配给更高特征级别,反之亦然。基于Mask R-CNNtwo-stage检测器使用FPN中公式1来确定要分配特征图( )。

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flexbox基本原理

然后给其中每一个孩子设置 `flex: [number]` 来让他们比例分配容器宽度。...其实应该说,如果一个孩子没有通过 flex: 1方式来定义宽度,那么会根据非flex方式来优先计算宽度,然后其他声明了flex孩子再按比例分配剩下宽度。...默认情况下,是 `1:1:1` 比例来砍,也就是每个孩子各砍下 “112/3=37.3“,所以默认每个孩子宽度是 100-37.3=62.7。...因为flexbox计算每个孩子宽度分两部分: 1,计算出孩子本身宽度 2,将剩余空白比例平分给每一个孩子。...假设每个孩子本身是 20px 宽度,那么这么定义之后,他们其实 1-2-1 平分了 140px 空白。加上自身宽度之后比例 显然不是 1-2-1。

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cvpr目标检测_目标检测指标

(a) 使用图像金字塔构建特征金字塔。特征是在每个图像尺度上独立计算,这很慢。 (b) 最近检测系统选择仅使用单尺度特征来加快检测速度。...快速计算特征图像金字塔也引起了极大兴趣。[6] 通过首先计算稀疏采样(比例)金字塔然后对缺失层级进行插值来演示快速金字塔计算。...我们还将 FPN 推广到第 6 节中实例分割提议。 我们方法将任意大小单尺度图像作为输入,并以完全卷积方式在多个级别输出比例大小特征图。...请注意,ground-truth box比例并未明确用于将它们分配给金字塔各个级别;相反,ground-truth box与已分配到金字塔级别的锚相关联。...Fast R-CNN 最常在单尺度特征图上执行。要将它与我们 FPN 一起使用,我们需要将不同比例 RoI 分配给金字塔级别。 我们将特征金字塔看作是从图像金字塔中产生

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计算广告笔记02-计算广告基础

在大多数广告产品中,可以通过计算优化主要是收入部分,而千次展示期望收入(expected Cost per Mille,eCPM)正是计算广告最为核心量化指标之一。...与广告信息传达过程相关,eCPM可以分解为点击率和点击价值乘积,这两个指标是各种广告产品计算过程中经常遇到。 广告有效性原理 广告转化有效性模型如图所示。 ?...媒体网站和广告主网站上行为对收入r进行分解,是实践中比较合理且容易操作方式: eCPM=r(a,u,c)=μ(a,u,c)∗v(a,u,c) eCPM = r(a,u,c)=\mu(a,u,c...结算方式与eCPM估计关系 对于大多数广告产品来说,需要计算给定(a,u,c)三元组eCPM以进行决策。但广告市场协作关系复杂,并非每个广告产品都可以对eCPM分解后两个变量作出合理估计。...这是一种比较极端结算方式,需求方只按照最后转化收益来结算,在最大程度上规避了风险。供给方或中间市场除了估计点击率,还要对点击价值作出估计,这样才能合理地决定流量分配

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