<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <mx:Application xmlns:mx="http://www.adob...
Trimmomatic 软件可以对NGS测序数据进行质量过滤，其去除adapter的功能只是针对illumina的序列，从reads的3’端识别adapter序列并去除，相比cutadapt，少了几分灵活性...但是在过滤低质量序列时，采用了滑动窗口的算法，给定窗口长度和步长，如果该窗口内所有碱基的平均质量值低于阈值，则将该窗口及其以后的碱基全部去除。...序列，在查找时，首先执行一个seed match, 就是只在序列中查找adapter的前几个碱基，如果前几个碱基都找不到，就没必要在查找后面的碱基了，通过seed match可以加快运行速度，2表示在进行...seed match时，允许的最大错配数；当满足了seed match后，trimmomatic会将adapter 序列的全长与输入序列进行比对，从而识别adapter序列。...此时两种模式，palindromeClip模式允许查找adapter序列的反向互补序列，比如双端测序中，R2端序列会包含5’端adapter序列的反向互补序列，30表示该模式下至少需要匹配的碱基数，另外一种叫做
对于单端数据，用-i参数指定输入的序列文件，-o参数指定输出的序列文件；对于双端数据，用-i和-I分别指定R1端和R2端的序列。 该软件可以对数据进行以下几种过滤 1....去除低质量的碱基 fastp支持类似trimmomatic滑动窗口的方式，对序列中的低质量碱基进行过滤，但是它的算法运行速度更快。...默认情况下，是不会根据序列复杂度进行过滤的，如果想要进行过滤，需要添加-Y参数，同时使用-y参数指定复杂度的阈值，取值范围0-100， 默认值为30，复杂度低于30%的序列会被过滤掉。 8....根据index 对序列进行过滤 fastp支持根据index对序列进行过滤， --filter_by_index1参数指定一个index文件，该文件中每行是一个index，如果序列的index在该文件中...UMI 预处理 由于文件构建过程中，存在PCR的过程， 会影响定量结果的准确性，最近出现了UMI这样的技术，本质上对未扩增之前的片段进行标记，建库之后，拥有相同UMI标记的reads来自于同一份模板，在数据分析时
cutadapt软件可以对NGS数据进行质量过滤，FastQC软件可以查看NGS数据的质量分布，trim_galore将这两个软件封装到一起，使用起来更加的方便。...官网如下 https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ 该软件会对数据进行以下4步处理 1....去除reads 3’端的低质量碱基 illumina平台的测序数据，通常3’端质量较差。trim_galore首先会过滤掉3’端的低质量碱基，本质上是调用了cutadapt的质量过滤算法。...下图是过滤前后碱基质量的分布图 ? 可以看到，过滤掉低质量碱基后，序列的整体质量显著提高。 2....其它过滤 对于所有的输入序列，以上3个步骤是肯定会执行的。除此之，trim_galore还支持一些其他的过滤措施，以满足个性化的需求。
实际查询中，通常不会检索所有行，需要对数据进行筛选过滤，选出符合我们需要条件的数据。...sql中的数据过滤通过where子句中指定的搜索条件进行 where子句操作符 检查单个值 select prod_name, prod_price from products where prod_price..., 'BRS01'); not 操作符 select prod_name from products where not vend_id = 'DLL01' order by prod_name; 使用通配符进行过滤...使用like操作符进行通配搜索 %表示字符任意出现的次数，fish开头的字符 select prod_id,prod_name from products where prod_name like '...select prod_id,prod_name from products where prod_name like '__ inch teddy bear'; []通配符用来匹配字符集，必须匹配方括号中的某一个字符
今天遇到了一个坑，我想把mongodb数据库中的数据导入到tableau中，好利用tableau来学习数据分析，结果我一直没连上…....下载安装之后，打开tableau，如何没有激活码的话，可以免费使用15天，然后就得收费了，但是，我们可以利用学生信息去免费申请一个激活码：申请地址：https://www.tableau.com/zh-cn...要使tableau能连上mongodb数据库，需要三个条件，一个都不能少，至少我的是这样： 第一个条件 保证本地的mongodb服务的开启的，鼠标点击计算机右键—属性即可查看mongodb服务是否开启：...dbname：需要连接的数据库名 tablename：需要连接的集合名 schema.drdl：输出的文件名，后缀为drdl 这个时候就会多出一个schema.drdl文件 然后使用mongosqld.exe...把这个下载安装好之后，不需要进行额外的配置。 然后终于可以使用tableau连上mongodb数据库了~ ?
第4章 过滤数据 4.1 WHERE 子句 根据需要提取表数据的子集，需要指定搜索条件（search criteria）。...在 SELECT 语句中，数据根据 WHERE 子句中指定的搜索条件进行过滤。 WHERE 子句在表名（FROM 子句）之后给出。...屏幕快照 2018-05-27 10.58.20.png 第5章 高级数据过滤 5.1 组合 WHERE 子句 SQL 允许给出多个 WHERE 子句，这些子句有两种使用方式，即以 AND 子句或 OR...5.2 IN 操作符 IN 操作符用来指定条件范围，一组由逗号分隔括在圆括号中的合法值，范围中的每个条件都可以进行匹配，与 OR 功能相同。...通配符可在搜索模式中的任意位置使用，并且可以使用多个通配符。
一、Like操作符 之前介绍的所有的操作符都是针对已知值进行过滤。不管匹配一个值还是多个值,检验大于还是小于已知值,或者检查某个范围的值,其共同点是过滤中使用的值都是已知的。...需求：现在需要检索ItemName中包含"心率"的行记录,这个时候使用简单的比较操作符肯定不行,必须使用通配符。...搜索模式:由字面值、通配符或两者组合构成的搜索条件。 而使用通配符搜索模式,必须使用LIKE操作符，LIKE指示DBMS(数据库管理系统)，后跟的搜索模式利用通配符匹配而不是简单的相等匹配进行比较。...下面再次更改上面的需求,检索ItemName列值中以'心'开头,以'定'结尾的行数据。...2、注意搜索模式'心%定 '，发现定后面有一个空格,而这个空格恰好改变了我们的检索的初衷,这时候DBMS回去匹配以'定 '结尾的行数据,所以在使用通配符匹配数据的时候,一定要注意空格。
总结一些从数据库表中提取子集的过滤方式 WHERE 样例 select * from student where id > 3; where后面跟逻辑语句，筛选出符合条件的子集 WHERE子句操作符...or 通过or运算符可以连接多个过滤条件,过滤出满足其中至少一个条件的子集。...from products where (vend_id = 1002 or vend_id = 1003) and prod_price >= 10; IN操作符 IN操作符用来指定条件范围，范围中列举的每个条件都可以进行匹配...通配符 当对搜索的值不明确时，适合使用通配符来进行模糊匹配。 通配符：用来匹配值的一部分的特殊字符。通配符本身实际是SQL的where子句中有特殊含义的字符。...使用通配符的技巧 首先，通配符搜索的处理一般要花费比前面其它搜索更多的时间。所以，如果其它搜索能达到目的就尽量不要用通配符。
Mendel error 可能的原因有以下3种： 基因分型错误 不论时父本分型错误，还是子代分型错误，都可能导致allel不符合遗传规律的情况 父母信息不正确 该个体的父母信息搞错了，所以分型结果对应不上...de novo 突变 子代发生了新突变 在分析家系遗传病相关的SNP位点时，Mendel error 通常作为SNP位点过滤的一种手段。...在plink 中，在读取家系分型数据时，会通过Mendel error过滤样本和SNP位点，用法如下 plink --file mydata --me 0.05 0.1 --me参数指定的就是mendel...error 的阈值，第一个参数0.05用于过滤样本，如果某个样本中有5%以上的mendel error SNP位点，则去除该样本；第二个参数对SNP位点进行过滤，如果该SNP位点所有样本的分型结果中，...需要注意的是，只有在分析家系相关遗传病时，才会进行这个过滤。因为de novo 突变不可能与遗传病相关。
不断提高的人均可支配收入将提升家庭的消费意愿，2015年中国母婴行业市场规模有望达到2万亿。...trade表中的buy_mount是我们关注的重要标签，从描述性统计以及图像上来看，该数据的均值为2.5，标准差64，存在异常值，所以我们保存距离均值3个标准差内的数据，即[0,195]。 ?...数据清洗 查看有无缺失值异常值，并进行处理。 trade中的auction_id未指定是什么属性，我们就将他默认改为item_id。...整个数据集中共6个商品大类，662个商品分类，28394件商品，29915名用户。 ? 这是两年多经过删减的数据，由于缺少部分数据，所以我们只能根据这份数据集进行分析。主要是思路。...由于数据统计到2015/2，所以我们假定分析日期为2015/3，购买母婴商品的用户中，婴儿年龄主要集中在0-3岁。 ? 购买母婴产品的用户家庭中有47.1%是男婴，52.9%是女婴。 ?
来源于：R学习笔记(4): 使用外部数据 博客：心内求法 鉴于内存的非持久性和容量限制，一个有效的数据处理工具必须能够使用外部数据：能够从外部获取大量的数据，也能够将处理结果保存。...R中提供了一系列的函数进行外部数据处理，从外部数据的类型可以分为文件、数据库、网络等；其中文件操作还可以区分为导入/导出操作和流式操作。...对于列表和数据框，其中的元素通常称为分量（components）。 因为外部数据的处理涉及到数据框，这里对列表和数据框进行更详细的说明。...函数 sqlSave 会把 R 数据框复制到一个数据库的表中， 而函数 sqlFetch 会把一个数据库中的表拷贝到 一个 R 的数据框中。 通过sqlQuery进行查询，返回的结果是 R 的数据框。...但是从外部获取的数据会被R放到内存中，在处理大数据时，就会遇到问题。在处理大数据时，可以采用一下的方法： 使用数据库 每次从数据库中读取一部分数据进行处理。
例如要将外部数据（速度和压力）插值导入到fluent中 ?...根据文档说明，3D的数据格式如下，如速度和压力分布，则： 3 3 1990000 4 pressure x-velocity y-velocity z-velocity ( ) ( ) ( ) ( )...此时导入数据： ? 插值瞬间就搞定了，如果搞不定那是因为数据格式有误，一顿操作后，绘图如下： ? 这个格式和我十几年前用的fluent6.3格式好像不一样，那时候不需要括号的。...《(计算)流体力学》中的几个小程序，可在微信中点击体验： Blasius偏微分方程求解速度边界层 （理论这里） 理想流体在管道中的有势流动 （源码戳这） 涡量-流函数法求解顶驱方腔流动...顺便，《(热工过程)自动控制》中关于PID控制器的仿真可点击此处体验：PID控制演示小程序，（PID控制相关视频见：基础/整定/重要补充）。动画如下： ? （正文完！）
警告外部资源不在我们的控制之内，可以在我们不知情的情况下进行更改和/或修改。在执行之前，请务必自行查看第三方网站的代码。...集群的所有节点必须位于同一数据中心; 它们不能跨越多个数据中心，因为它们将使用专用网络流量进行通信。...如果群集管理器节点是在从群集节点不同的Linode的数据中心，它使用公共主机名和公共IP地址进行通信集群节点。...集群的所有节点必须位于同一数据中心; 它们不能跨越多个数据中心，因为它们将使用专用网络流量进行通信。...如果群集管理器节点是在从群集节点不同的Linode的数据中心，它使用公共主机名和公共IP地址进行通信集群节点。
Tableau数据可视化 地理空间数据动态可视化 学习可视化的时候我觉得光学会怎么画图没什么意义，还是要想明白可视化是为什么需求服务的。于是我琢磨了一下之前作业的企业财务数据源。...第一种，修改数据源，需要编写很复杂的sql语句，或者用Tableau Prep进行清洗整合，用整合后的数据分别完成几种属性条件下的单独筛选。...第二种，使用日期筛选器，可以对一段日期内的销售额利润额进行累加，以体现随时间变化的销售额利润额，但是会影响到使用同字段的其他图。 所以这里使用第三种办法，通过参数新建计算字段。...这个语句的意思是，如果利润额列中的某值所在行的订单日期小于截止日期，那么这个利润额被复制入新字段。 然后把省份拖动到列，累计利润额拖动到行，当截止日期变化时，对应的总利润也会变化。...部分学习指引： 深圳大学计算机与软件学院《可视化信息处理导论》课程 深圳大学传播学院《数据可视化》课程 浙江大学《大数据可视化》网络教学资源 免责声明：Tableau地图源无法修改，此视频仅供学习交流参考
为此，Tableau在本月18日发布的最新版本2019.3中宣布了Explain Data的普遍可用性，该版本分析了语料库，并强调了驱动任何给定数据点的最相关因素。...——Tableau Catalog是一个功能套件，旨在提供tableau中使用的所有数据的概述，Tableau Server Management Add-On则是一个帮助管理企业范围的服务器部署产品。...简单来说，Explain Data就是利用统计方法评估所有可用数据中的数百种模式，并在几秒钟内提供潜在解释。用户选择他们想要分析的数据点，然后他们可以在交互可视化中查看结果。...在解释数据的过程中，Explain Data需要考虑语料库的每一个维度，以降低人类偏见导致错误的风险，这与传统的解决方案正好相反——传统的解决方案通常会受到人类自身预先假设的限制。 ?...“随着数据量的增加和决策速度的加快，对数据管理的需求从来没有像现在这样至关重要，”Ajenstat表示，“通过Tableau 2019.3，我们将数据管理直接集成到分析体验中，让客户更容易整理和准备分析所需的全部数据
ABB TC520 容器进行过滤和数据聚合图片一种越来越多地被讨论的工业物联网堆栈架构变体在边缘提供了两个级别。在顶部，AWS物联网Greengrass运行MQTT代理，向AWS发送数据。...在底层，Kubernetes是一个广泛使用的开源容器编排系统，它运行不同的容器实例，这些实例提供了与生产资产的南向连接。Kubernetes(和其他类似的工具)允许高度的定制和自我开发的容器管理系统。...这种方法最大限度地减少了边缘云供应商的束缚，帮助公司保持更大的灵活性。...在我们的案例中，一家汽车OEM使用Softing的edgeConnector系列在Kubernetes中协调，从PLC和CNC机器中收集数据，并通过MQTT协议转发。...这种两层边缘方案为客户提供了OT/IT集成方面的额外多功能性(底层)，同时简化了向云(上层)可靠、安全传输数据的工作和开销。
图片在ClickHouse中，可以自定义数据字典，以便更好地管理和优化数据存储。自定义字典可以定义和存储属性与值之间的映射关系，例如将外部数据源中的字符串值映射到整数值。...在ClickHouse中使用外部扩展字典时，字典中的数据发生更改时，ClickHouse不会自动实时更新相关数据。ClickHouse的字典功能主要用于加载静态数据并进行查询，而不是用于实时数据更新。...要更新外部扩展字典中的数据，需要手动触发字典的刷新或重新加载。ClickHouse提供了以下两种更新机制：刷新（refresh）：刷新操作会重新加载字典的元数据和部分数据，但不会加载全部数据。...刷新操作可以使用以下命令执行：ALTER TABLE UPDATE DICTIONARY 这样做的好处是速度快，因为只加载了被修改的数据以及相关元数据...根据字典的配置，可以使用定时任务或其他外部工具定期执行一系列的刷新和重载操作，以保证字典中的数据与外部数据源保持同步。
tableau 作为一个数据分析从业者，不但要从杂七杂八的数据中提取有用的数据，而且还要生成漂亮的图表展示出来。 为什么数据可视化如此重要？...目前大部分时间都花在数据的可视化上面，这其中Tableau成了最趁手的工具。...Tableau支持各种各样的数据源，包括Excel，Json，Mysql，Hive等等等等，只需要简单的拖拉就可以生成漂亮的图表，国内的很多BI工具可以说都是对Tableau拙劣的模仿。...tableau数据源 Tableau支持各种各样的图表，支持生成自定义字段，支持自定义过滤条件，对中文支持友好，文档齐全。...当然，尝试使用Tableau并且爱不释手之后，也有一个坏处，那就是让你的excel技能退步。
本文首先介绍了ABP内置的软删除过滤器(ISoftDelete)和多租户过滤器(IMultiTenant)，然后介绍了如何实现一个自定义过滤器，最后介绍了在软件开发过程中遇到的实际问题，同时给出了解决问题的一个未必最优的思路...一.预定义过滤器 ABP中的数据过滤器源码在Volo.Abp.Data[2]包中，官方定义了2个开箱即用的过滤器，分别是软删除过滤器(ISoftDelete)和多租户过滤器(IMultiTenant)...二.自定义过滤器 自定义过滤器是比较简单的，基本上都是八股文格式了，对于EFCore来说，就是重写DbContext中的ShouldFilterEntity和CreateFilterExpression...三.遇到的实际问题 假如在SaaS系统中，有一个主中心和分中心的概念，什么意思呢？就是在主中心中可以看到所有分中心的User数据，同时主中心可以把一些通用的资料(比如，科普文章)共享给分中心。...abp/6.0/Multi-Tenancy[8]ASP.NET Boilerplate中文文档：https://www.kancloud.cn/gaotang/abp/225819[9]详解ABP框架中数据过滤器与数据传输对象使用
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