首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

使用fasterq-dump命令sra格式数据转换为fastq格式遇到问题

aws-http (下载速度超级快) 默认会将sra格式换为fastq格式使用工具是fasterq-dump这个工具,试了几次一直遇到报错,所以就将下载格式默认选择为sra 需要制定参数-f sra...想是后续再单独转成fastq格式 下载完成后转化fastq格式还是有问题使用fasterq-dump命令有时候可以成功,但是有时候就会卡住,卡住后按ctrl+c命令也不能退出,只能关掉窗口重新链接服务器..., 以fasterq-dump in cluster为关键词搜索,找到了一些关于这个问题讨论 https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/161 https://...github.com/ncbi/sra-tools/issues/463 大家问题基本都是一样 计算机集群,slurm这个命令提交系统 BeeGFS 这个存储系统 和我硬件情况一样 没有找到解决办法.../ 如果sra文件已经下载好了,-s参数后指定内容就是文件名,如果没有下载就指定 SRR5187763 不带后缀名sra 文件下载好以后转换起来还是相当快 大家如果遇到这个问题也可以试试这个替代方案

4.5K20

java 日期格式化– SimpleDateFormat 使用。字符串日期日期字符串

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 日期和时间格式日期和时间模式字符串 指定。...在 日期和时间模式字符串 中,未加引号字母 ‘A’ 到 ‘Z’ 和 ‘a’ 到 ‘z’ 被解释为模式字母,用来表示日期或时间字符串元素。文本可以使用单引号 (‘) 引起来,以免进行解释。...所有其他字符均不解释;只是在格式化时将它们简单复制到输出字符串 白话文讲:这些A——Z,a——z这些字母(不被单引号包围)会被特殊处理替换为对应日期时间,其他字符串还是原样输出。...private static void formatDataTest() { /* * 日期期望格式字符串 */ //HH 和 hh...上面的是:日期自己想要字符串格式,下面是字符串日期类型。

4.5K20
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

使用Pythonyaml模块JSON转换为YAML格式

之前介绍过读取yaml文件输出json,今天介绍下使用Pythonyaml模块JSON转换为YAML格式。...可以使用pip包管理器运行以下命令来安装它: pip install pyyaml JSON转换为YAML 一旦我们安装了yaml模块,就可以使用它来JSON数据转换为YAML格式。...我们使用yaml.dump()函数这个字典转换为YAML格式,并将结果存储在yaml_data变量中。最后,我们打印yaml_data值。...输出样式 default_flow_style是PyYAML库中dump()和dumps()方法可选参数之一。它用于控制PyYAMLPython对象转换为YAML格式时所使用输出样式。...default_flow_style参数,可以更好地控制PyYAML在Python对象转换为YAML格式时所使用输出样式。

69330

使用 Mencoder 视频转换为支持iOS和AndroidH.264视频格式

如何让你视频同时支持桌面网站,iOS,Android 这几种不同平台在线播放?H.264当然是不前最好选择,效果好,文件小(相比其他),平台支持好(对 于iOS和Android)。...这里顺便提一下视频格式转换不是简简单 单什么 MP3 3GP 就行了!...MP4或3GP,RMVB这些只是视频文件壳而已,真正视频格式是里面的东西,一遍常见是 H.263,H.264,MPEG4,XVID 等等...还有音频格式也是一个比较重要问题,如果格式不对,一样不能在某些平台上面播放...具体我还不是很清楚,毕竟不是专业。...来个简单转换方法,支持 桌面用 Flash播放器和 iOS,Android 在线播放,H.264格式,音频 ACC这是使用 MEncoder 在 Ubuntu 下面转换: $ sudo apt-get

1.9K30

如何使用libswscale库YUV420P格式图像序列转换为RGB24格式输出?

一.视频格式转换初始化   视频中图像帧按照一定比例缩放或指定宽高进行放大和缩小是视频编辑中最为常见操作之一,这里我们1920x1080yuv图像序列转换成640x480rgb图像序列,并输出到文件...视频图像转换核心为一个SwsContext结构,其中保存了输入图像和输出图像宽高以及像素格式等多种参数。...<<endl; return -1; } //选择输入视频和输出视频图像格式 if(!...<<endl; return -1; } return 0; } 二.视频图像帧循环转换   视频格式转换核心函数是sws_scale(),我们需要给出输出图像缓存地址和缓存宽度...  这里需要注意是,由于我们转换后图像格式是rgb24,是按packed方式存储,也就是红绿蓝三个通道交错地存储在一个平面内,在内存中是连续存储

31520

VBA技巧:工作表中文本框里数字转化为日期格式并输入到工作表单元格

标签:VBA,ActiveX控件 如下图1所示,工作表中有一个名为“TextBox1”文本框,要将其中输入数字放置到工作表单元格B8中并转换成日期格式。...图1 可以使用下面的代码: Worksheets("Sheet3").Cells(8, 2) = Format(Worksheets("Sheet3").OLEObjects("TextBox1").Object.Value...Sheet3") .Cells(8, 2) = Format(.OLEObjects("TextBox1").Object.Value, "yyyy-mm-dd") End With 反之,如果要想工作表中文本框显示单元格中日期...,可使用下面的代码: With Worksheets("Sheet3") .OLEObjects("TextBox1").Object.Value = Format(.Cells(8, 2), "yyyy-mm-dd...看着有点简单,但主要是理解工作表中ActiveX控件是如何进行引用,文本框控件中值是如何转换格式,既可以熟悉ActiveX控件在VBA属性使用,也增加了处理类似情形经验。

10310

Excel应用实践03:使用Excel进行个人计划执行记录与统计分析

于是,制作了一个简单计划执行情况统计分析表,加上少量VBA代码,以方便自已每周检视计划执行情况,提醒自已哪些没做,要赶快补上。 下面,创建过程与大家分享。...输入日期后,单击其右侧“更新”按钮,自动统计这两个日期之间相应数据。该按钮关联了下文所讲用于实现自动统计VBA程序。...单元格区域C7:D21是输出区域,通过VBA程序自动生成各分类上花费时间和做次数。 单元格区域B7:B21除作为上文介绍分类下拉列表项来源外,还设置了条件格式,如下图5所示。...当统计次数不符合要求时,相应分类字体会显示红色。 ? 图5 在VBA代码中,使用了高级筛选功能。...如果工作表中分类或列数据有增减,要作相应修改。 代码图片版如下: ? 结语:不必拘束于代码优雅,也不必在意通用性,只要能够解决问题,快速实现自已目的,适合自已就行,这就是VBA最大好处。

1.8K20

带公式excel用pandas读出来都是空值和0怎么办?——补充说明_日期不是日期

之所以另 起一篇,是因为 ①频繁修改需要审核比较麻烦 ②这个问题是数据源头错误,不常碰到,而且可控,楼主这里是因为积攒了大批数据,去改源头之前也改不了,还是要手动,比较麻烦 先说问题,读取excel...时候,日期不是日期格式是数字或常规,显示是四个数字,python读取出来也是数字,写入数据库也是数字而不是日期 附上读取带公式excel正文链接: https://blog.csdn.net.../mm/dd"#excel VBA语法 #添加到循环之前,2行3列对应C2是数字格式日期 处理这个问题,楼主本人电脑是可以跑通完全没问题,注意打印出来date,看下格式,跟平常见不是太一样!...这时已经可以读出来了,但是处理时候还是有点儿问题,先转化成字符串str,再去处理 注意把整列转换成字符串,否则iloc有可能会提取不出来, date=data[[0]].astype(str).iloc...[1,0][:10] 第一次运行时直接iloc出来了,再第二遍时候就又不行了,所以考虑①excel里面,②dataframe里 方法①没成功,有想到办法可以评论里写出来, 再贴一下定义读取excel

1.5K20

VBA代码:水平单元格区域转换成垂直单元格区域

标签:VBA 下图1所示是一个常见需求,在多个列中放置着每个月份数据,需要将月份移到单个列中,同时保留报表中所有描述性信息。...图2 这可以使用一个简单VBA程序来实现。首先,需要两个数组,一个保存原始数据,另一个格式数据放在其中。...第一个数组变量称为ar,此数组数据存储在许多列中。它拾取已使用单元格区域: ar=ws.UsedRange Data工作表中所有数据都存储这个变量中。...ar变量中这15列转换为输出变量var中5列数据集,然后数据输出到Output工作表。...var(4, n) = ar(1, j) 查看日期并将其从第1行转换为所有其他行。变量(var)第一部分等于var(4,n),其中4是日期所在列号,n是从2增长到单元格区域底部行号。

1.3K30

Java 编程问题:三、使用日期和时间

本章介绍基本问题非常有助于了解日期-时间 API 整体情况,并将像拼图中需要拼凑起来部分一样解决涉及日期和时间复杂挑战。 问题 使用以下问题来测试您日期和时间编程能力。...我强烈建议您在使用解决方案和下载示例程序之前,先尝试一下每个问题字符串转换为日期和时间:编写一个程序,演示字符串和日期/时间之间转换。... Unix 时间戳转换为日期时间:编写 Unix 时间戳转换为java.util.Date和java.time.LocalDateTime程序。...-8601 日历系统中,有 UTC/GMT 偏移日期时间) OffsetTime(在 ISO-8601 日历系统中与 UTC/GMT 有偏移时间) 为了通过预定义格式化程序String转换为LocalDate...本章提供了使用日期和时间信息全面概述。广泛应用必须处理这类信息。因此,这些问题解决方案放在你工具带下不是可选

5.3K20

银行数据库迁移至MySQL,竟被时间字段这玩意耍了……

背景介绍 笔者在工作中曾遇到SyBase数据库迁移至MySQL时一个问题使用bcpSyBase中数据导出为csv文件时,datetime数据类型默认导出格式与MySQL不兼容。...解决方式 解决此问题方式不外乎两种:一是修改导出后csv文件,令其时间字段数据格式兼容MySQL;二是修改SyBase数据库中时间字段数据格式,使其直接能通过bcp导出兼容MySQLcsv文件...值指定为111,再使用str_replace()函数,convert()转换来字符串中’/’转换为’-’,即可满足MySQL中对datetime类型格式要求(yyyy-mm-dd);同理,format-style...tmp中数据使用bcp命令导出为csv文件; 4)csv文件中数据导入MySQL数据库对应表中。...至此,解决了SyBase中datetime类型字段默认导出格式与MySQL不兼容问题

1.6K20

VBA一维表二维表

前面说过了二维表一维表,现在来看看一维表二维表。 1、需求: 1个一维表格转换为二维表格: ? 2、实现方法: 数据透视表 要实现这个方法,其实熟练数据透视表处理起来是非常简单: ?...SQL语句 会SQL语句处理起来也很简单,只要明白SQL语句就可以: transform sum(数据) select 项目 from [Sheet1$] group by 项目 pivot 姓名...VBA代码实现 使用VBA代码来实现自然也是没有问题使用字典来分别记录行和列序号,然后输出到1个二维数组就可以: Sub TarnsTable2() Dim drow As Object...Dim dcol As Object Set drow = VBA.CreateObject("Scripting.Dictionary") Set dcol = VBA.CreateObject...Cells.Rows.Count, 1).End(xlUp).Row arr = Range("A1").Resize(i_row, 3).Value '记录项目的行号、姓名列号

1.7K30

使用R或者Python编程语言完成Excel基础操作

数据格式设置:了解如何设置数据格式,包括数字、货币、日期、百分比等。 条件格式:学习如何使用条件格式来突出显示满足特定条件单元格。 图表:学习如何根据数据创建图表,如柱状图、折线图、饼图等。...合并文本:使用CONCATENATE函数或“&”运算符多个单元格文本合并为一个。 宏和VBA编程 录制宏:自动记录一系列操作,以便重复执行。 VBA编程:编写VBA代码实现自动化和定制化功能。...R代码 # 读取数据 sales <- read.csv("sales_data.csv") # 日期列转换为日期类型 sales$Date <- as.Date(sales$Date) # 转换为每月总销售额...", header = TRUE) # 日期列转换为日期类型 sales$Date <- as.Date(sales$Date) # 创建月份列 sales$Month <- format(sales...Python代码 import pandas as pd # 读取数据 sales = pd.read_csv('sales_data.csv') # 日期列转换为日期类型 sales['Date

12310

EXCEL必备工具箱17.0免费版

EXCEL必备工具箱--WordExcel功能,最大程度保留word原有格式,直接Word文档excel文档2019年新版全年一次性奖个税筹划指南,发年终奖再也不怕多交个税 EXCEL必备工具箱-...Excel必备工具箱--高清截图功能,解决QQ截图图像模糊且不能截取右键菜单问题 EXCEL必备工具箱--二维码和条形码功能,批量制作带Logo二维码和各种格式条形码,并提供识别功能 EXCEL必备工具箱...Excel必备工具箱--统一日期格式功能,所选区域不规范日期统一为同一格式。...EXCEL必备工具箱--跨表提取行功能,帮你从相同格式多张表格中提取关键字一样行到一个表中 EXCEL必备工具箱--强制读取VBA代码,绕过EXCEL安全机制,无论采用何种保护措施,都可以直接读出VBA...Excel必备工具箱在线帮助关于使用了“禁用宏就关闭文档功能”出现问题解决 EXCEL必备工具箱--区域文本重排功能,圆你用excel写大段文章梦想 Excel必备工具箱--汉字拼音功能,汉字批量转换成拼音

5.1K40

使用Python转换PDF,WordExcelPPTmdHTML都能

今天讲的是各位一定会接触到PDF转换,关于各种格式文件转换为PDF有很多第三方工具与网站可以实现,但是使用Python好处不仅可以批量转换,同时一旦脚本写完了以后就可以一键执行,彻底解放双手,那么本文就来盘一盘如何使用...Python来Word/Excel/PPT/Markdown/Html等各种格式文件转换为PDF!...WordPDF WordPDF应该是最常见需求了,毕竟使用PDF格式可以更方便展示文档,虽然在Word中可以直接导出为PDF格式,但是使用Python可以批量转换,更加高效。...目前在Python中针对Word转换为PDF库有很多,比如win32就可以调用word底层vbaword转成pdf,或者comtypes等,但是这些常用库仅能在Windows机器上运行,所以为了照顾...因为大多数博客使用是markdown格式使用这些库可以很好博客文章批量转换为PDF文档存储。

8.1K70
领券