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如何将awk脚本移植到Python【Programming(Python)】

如果您的目标是使通用库容易将awk移植到Python,请考虑这样做。但是编写一个循环,使您能够准确地得到特定情况下所需要的内容容易,也容易理解(因此也容易维护)。...这将返回一个字符串列表,在任意数量的连续空格上分割该行: line.split() 如果需要另一个字段分隔符,比如使用’:’ 和’;’,则需要 rstrip 方法来删除最后一个换行符: line.rstrip...在 awk 的 $0中是整个——相当于 line.rstrip("\n") ,而且awk的NF (字段数)容易作为len(parts)检索。...在Python中移植awk字段 作为一个示例,让我们将《如何用 awk 删除文件中的重复》中的一代码转换为 Python。 最初的 awk 是: awk '!...与其计算访问次数(我们不使用这个,除了知道我们是否看到了一),为什么不记录被访问的呢?

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Linux基础——正则表达式

接着处理下一,这样不断重复,直到文件末尾。文件内容并没有改变,除非你使用重定向存储输出。...如果需要对同一文件作多次修改,可以使用"-e" 选项 ? 取得eth0 网卡 IP 地址: ? 2、删除:d命令 从某文件删除包含 "how" 的所有 ?...2、shell脚本方式 将所有的 awk命令插入一个文件,并使 awk 程序可执行,然后 awk 命令解释器作为脚本的首,以便通过键入脚本名称来调用。相当于 shell 脚本首的:#!...⑤当一条输入记录比较了所有的awk_cmd后,awk读取输入的下一,继续重复步骤③和④,这个过程一直持续,直到 awk读取到文件尾。...(如8K),那么它的内容将被倒换到另一个文件中,并清除原有文件中的内容.

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资源 | 简单快捷的数据处理,数据科学需要注意的命令行

. | sort | uniq -c | sort -nr 使用基本正则表达式的另一个例子是: 可选参数: tr -d 删除字符 tr -s 压缩字符(将连续重复的字符用一个字符表示) \b 空格 \...可选参数: wc -c 打印 Bytes 数目 wc -m 打印出字符数 wc -L 打印出最长的字符数 wc -w 打印出单词数目 SPLIT(把一个文件分割成小文件的命令) 文件大小可以使用这个命令大幅度改变...SORT & UNIQ(sort:文件排序;uniq:报告或忽略文件中的重复,与 sort 结合使用) 这两个命令提供了唯一的单词计数,这是因为 uniq 仅仅在重复的相邻上运行。...另一个值得注意的现象是- e 标志,如果找到丢失的字段,它可以用来替换值。...}' filename.csv 打印出现两次的awk -F, '++seen[$0] == 2' filename.csv 删除重复使用内置函数 gsub() 替换多值: awk '{gsub

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【linux工具】多行文本转一处理技巧

以下是 tr 的常见用法和示例: 字符转换: 使用 tr 可以将一个字符集中的字符转换为另一个字符集中的对应字符: echo "hello" | tr 'a-z' 'A-Z' 这将输出 “HELLO...字符压缩: 使用 -s 选项可以将重复的字符压缩为单个字符: echo "hello world" | tr -s ' ' 这将输出 “hello world”,连续的空格被压缩为一个。...对于多字符模式或复杂的替换,你可能需要使用 sed、awk 等工具。 当提供的两个字符集长度不一致时,tr 会将第一个字符集的最后一个字符扩展,使其与第二个字符集的长度匹配。...要获取详细的信息和选项,你可以查阅其手册页,使用 man tr 命令。...4 paste命令 paste -sd "|" tmp.txt 效果: 图片 命令说明: paste 是一个将多个文件或标准输入的合并为单行的工具。

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shell脚本扩展「建议收藏」

接着处理下一,这样不断重复,直到文件末尾。文件内容并没有改变,除非你使用重定向存储输出。...如果需要对同一文件作多次修改,可以使用 “-e” 选项 2.删除:d命令 将/etc/passwd的内容显示并找印行号,同时将2~5删除 附:nl命令在linux系统中用来计算文件中行号。...2.shell脚本方式 将所有的awk命令插入一个文件,并使awk程序可执行,然后awk命令解释器作为脚本的首,以便通过键入脚本名称来调用。 相当于shell脚本首的:#!...5 当一条输入记录比较了所有的awk_cmd后,awk读取输入的下一,继续重复步骤③和④,这个过程一直持续,直到awk读取到文件尾。...(如8K),那么它的内容将被倒换到另一个文件中,并清除原有文件中的内容.

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《Linux与unix Shell编程指南》 总结

在按照文件长度查找文件时,一般使用这种以字节表示的文件长度,在查看文件系统的大小,因为这时使用块来计量容易转换。...tail -f 命令可用于监视另一个进程正在写入的文件的增长。 -k Number 从 Number 变量表示的 1KB 块位置开始读取指定文件。...: -------- # 显示通篇文档,除了两个正则表达式之间的内容 sed '/Iowa/,/Montana/d' # 删除文件中相邻的重复(模拟“uniq”) # 只保留重复中的第一,其他删除...P; D' # 删除文件中的重复,不管有无相邻。注意hold space所能支持的缓存 # 大小,或者使用GNU sed。...*\n\1/d; s/\n//; h; P' # 删除重复外的所有(模拟“uniq -d”) sed '$!N; s/^.∗.

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Linux指令入门-文本处理

word 重复一个搜寻的动作 :n 从第一到最后一寻找word1字符串,并将该字符串取代为word2 :1,$s/word1/word2/g或 :%s/word1/word2/g 使用示例 在本示例将使用...,只显示一的空白 命令使用示例: 将一个自增序列写入test.txt文件中。...字符串 向上搜索字符串 n 重复一个搜索 N 反向重复一个搜索 b或pageup键 向上翻一页 空格键或pagedown键 向下翻一页 u 向前翻半页 d 向后翻半页 y 向前滚动一 回车键 向后滚动一...接着处理下一,这样不断重复,直到文件末尾。 注意: sed命令不会修改原文件,例如删除命令只表示某些不打印输出,而不是从原文件中删去。 如果要改变源文件,需要使用-i选项。...参数说明: 参数 说明 -c 反选指定字符 -d 删除指定字符 -s 将重复的字符缩减成一个字符 -t [第一字符集] [第二字符集] 删除第一字符集较第二字符集多出的字符,使两个字符集长度相等 命令使用示例

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管道相关命令

sort -r 使次序颠倒 sort -t 指定字段分隔符 sort -k 根据那一列排序 wc wc 文件名 显示指定文件 字节数, 单词数, 行数 信息 wc -c 字节数 wc -w...单词数 wc -l 行数 uniq 命令用于检查及删除文本文件重复出现的,一般与 sort 命令结合使用 tee 命令结果 | tee 文件1 文件2 文件3 通过 tee...10k 文件 将大文件切分成若干10KB的小文件 split -l 1000 文件 将大文件切分成若干1000 的小文件 awk awk ‘/zhangsan|lisi/’ score.txt 模糊查询...eld-separator 使用 指定字符 分割 + 数字 ? 获取第几段内容 0 ? 获取 当前行 内容 NF ?eld 表示当前行共有多少个字段 NF ? 代表 后一个字段 (NF-1) ?...代表 后一 -n ? 仅显示处理后的结果 -e 根据表达式 进行处理 -i 替换原有文件内容 d 删除指定内容 i 目标前面 插入内容 a 目标后面 追加内容

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生信入门必须掌握的 30 个 Linux 命令

cat的一个作用是查看文件,一般是比较小的文件,行数小于一个屏幕,最多不要超过两个屏幕,否则会刷屏; cat另一个作用是合并多个文件,一般配合重定向合并为一个文件或者将一个文件内容追加到另一个文件结尾...$ less -S nt.tar.gz 13. head / tail 这两个命令比较简单,只是取一个文件的头部和尾部多少,默认 10 ,可以加-n进行设置,利用管道可以取文件中间。...删除空白; sed -e '/^\s*$/d' seq.fna #删除文件中的空白; #案例四:寻址 sed -n '/ref/p' seq.fna #输出文件中包含ref关键字的;...y/ATCG/atcg/' seq.fna #DNA序列反向互补配对,并修改大小写 20. awk awk也是非常强大的文本处理工具,awk本身也是一门编程语言; #案例1:输出一个列表任意awk...#案例13:去重复 awk '!($0 in a) {a[$0];print}' input.txt # 打印不重复,类似uniq的功能; awk '!

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性能工具之linux三剑客awk、grep、sed详解

文件的第一开始,grep 将一复制到 buffer 中,将其与搜索字符串进行比较,如果比较通过,则将该行打印到屏幕上。grep将重复这个过程,直到文件搜索所有。...另一个有趣的参数是 -v,它会打印出相反的结果。...AWK非常复杂,所以这不是一个完整的指南,但应该给你一个知道什么 awk 可以做。它使用起来比较简单,强烈建议使用AWK 基础知识 awk 程序对输入文件的每一进行操作。...sed 基础 sed 可以在命令行或 shel l脚本中使用,以非交互方式编辑文件。 也许最有用的功能是对一个字符串进行 “搜索和替换” 到另一个字符串。...因此,如果你想删除文件的前10以外的所有,您可以使用 sed -e '11,$ d' sampler.log 你还可以使用模式范围表单,其中第一个正则表达式定义范围的开始,以及第二站。

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Linux之文件管理及文本处理

文件增加别名 创建符号链接/硬链接: ln cc ccAgain :硬连接;删除一个,将仍能找到; ln -s cc ccTo :符号链接(软链接);删除源,另一个无法使用;(后面一个ccTo...Bash快捷输入或删除 快捷键: Ctl-U 删除光标到首的所有字符,在某些设置下,删除全行 Ctl-W 删除当前光标到前边的最近一个空格之间的字符 Ctl-H backspace...-type f -user root -exec chown weber {} \; 注:{}是一个特殊的字符串,对于每一个匹配的文件,{}会被替换成相应的文件名; 将找到的文件全都copy到另一个目录...消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt...中语句块; 2.从文件或stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数的print

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史上最全的 Linux Shell 文本处理工具集锦,快收藏!

; eg:将找到的文件全都copy到另一个目录: find ....消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt | uniq -d...9' //获取文件中所有数字cat file | tr -d -c '0-9 ' //删除非数字数据 tr压缩字符 tr -s 压缩文本中出现的重复字符;最常用于压缩多余的空格 cat file |...stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -e...'{print $2, $3}' file 统计文件的行数: awk ' END {print NR}' file 累加每一的第一个字段: echo -e "1 2 3 4 " | awk 'BEGIN

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Linux文本处理工具,看这篇就够了。

; eg:将找到的文件全都copy到另一个目录: find ....消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt | uniq -d...9' //获取文件中所有数字cat file | tr -d -c '0-9 ' //删除非数字数据 tr压缩字符 tr -s 压缩文本中出现的重复字符;最常用于压缩多余的空格 cat file |...stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -e...'{print $2, $3}' file 统计文件的行数: awk ' END {print NR}' file 累加每一的第一个字段: echo -e "1 2 3 4 " | awk 'BEGIN

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搞定Linux Shell文本处理工具,看完这篇集锦就够了

; eg:将找到的文件全都copy到另一个目录: find ....消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt |...| tr -c '0-9' //获取文件中所有数字 cat file | tr -d -c '0-9 \n' //删除非数字数据 tr压缩字符 tr -s 压缩文本中出现的重复字符;最常用于压缩多余的空格...stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -...: awk '{print $2, $3}' file 统计文件的行数: awk ' END {print NR}' file 累加每一的第一个字段: echo -e "1\n 2\n 3

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搞定 Linux Shell 文本处理工具的操作命令

; eg:将找到的文件全都copy到另一个目录: find . ...消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt | uniq -d...'   //获取文件中所有数字 cat file | tr -d -c '0-9'  //删除非数字数据 tr压缩字符 tr -s 压缩文本中出现的重复字符;最常用于压缩多余的空格 cat file |...stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行,使用不带参数的print时,会打印当前行; echo -e ... '{print $2, $3}' file  #统计文件的行数: awk ' END {print NR}' file  #累加每一的第一个字段: echo -e "1 2 3 4 "| awk

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linux运维中的命令梳理(三)

如果在行尾匹配单词j e t 0 1,操作如下:j e t 0 1 $ 如果只返回包含一个字符的,操作如下:^ . $ 4、使用*匹配字符串中的单字符或其重复序列 使用此特殊字符匹配任意字符或字符串的重复多次表达式...2.shell脚本方式 将所有的awk命令插入一个文件,并使awk程序可执行,然后awk命令解释器作为脚本的首,一遍通过键入脚本名称来调用。 相当于shell脚本首的:#!...-d选项,删除文件中所有在string1中出现的字符。 -s选项,删除文件重复并且在string1中出现的字符,只保留一个。...就是将重复的换行符去掉,只留一个。 六,删除字符 -d选项和-s选项类似,只不过-d选项会删除所有出现的字符。...也就是说,为了使uniq起作用,所有的重复必须是相邻的。

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Linux文本处理详细教程

-type f -user weber -print// 找用户weber所拥有的文件 找到后的后续动作 删除 删除当前目录下所有的swp文件: find ....-type f -user root -exec chown weber {} \; 注:{}是一个特殊的字符串,对于每一个匹配的文件,{}会被替换成相应的文件名; 将找到的文件全都copy到另一个目录...消除重复 sort unsort.txt | uniq 统计各行在文件中出现的次数 sort unsort.txt | uniq -c 找出重复 sort unsort.txt | uniq -d...stdin中读入一,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数的print时,会打印当前行 echo -e "...awk '{print $2, $3}' file 统计文件的行数 awk ' END {print NR}' file 累加每一的第一个字段 echo -e "1\n 2\n 3\n 4\n" |

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