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分组表达量矩阵的层次聚类组合pca分析

在生信技能树公众号看到了练习题在:9个小鼠分成3组后取36个样品做转录组测序可以做多少组合的差异分析,需要读取这个表达量矩阵完成里面的层次聚类组合pca分析。...上游的定量过程是需要服务器的,这里省略,我们主要是演示一下多分组表达量矩阵的层次聚类组合pca分析。...读取表达量矩阵以及样品分组信息 读取上游定量结果 # 魔幻操作,一键清空 rm(list = ls()) options(stringsAsFactors = F) library(data.table...此外,由于基因命名的变化,一个基因可能有多个别名,因此在使用Gene Symbol时要特别小心。...在生物信息学基因表达分析中,层次聚类可以帮助研究者根据基因表达模式将基因或样本分组,从而揭示不同样本间的相似性差异性。

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lodash源码阅读-----由zipunzip实现的数组的分组合

用法 zip方法接收传入多个数组,它会创建分组元素的数组,第一个数组包含给定数组的第一个元素,第二个元素包含给定数组的第二个元素,依此类推,最后返回这个数组。...unzip方法zip方法的用法近似相反,只是它接受一个分组数组元素并创建一个数组,将元素重新组合到它们的预压缩配置。...isArrayLikeObject(group)) { length = Math.max(group.length, length) return true } }) 该循环使用...underfined : object[index] }) 总结 zipunzip方法可以实现数组的分组和合并,源码实现并不难,还是主要通过两层的遍历实现的,但是考虑了很多的边界条件。...想到了一个使用场景:假如现在有一个数组存了每个学生的年龄,一个数组存了每个学生的姓名,现在需要拆分成单个的学生对象,那就可以用unzip来进行分组,之后再转化为对象,就不用多次的遍历。

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mysql分组排序同时使用时查询数据异常

问题背景: 每个地点每天新增一条数据,要根据地点分组查询出每个设备最新的数据(按创建时间倒序)。...FROM record GROUP BY Addr_Id ORDER BY Create_Time DESC; 这样查询会发现查询出来的数据并不是最新的,没有得到我们需要的结果,这是因为group by ...order by 一起使用时,会先使用group by 分组,并取出分组后的第一条数据,所以后面的order by 排序时根据取出来的第一条数据来排序的,但是第一条数据不一定是分组里面的最新的数据。...解决方案: 方案一: 使用子查询,先排序查出结果后作为临时表在分组。这里有个坑,必须要加limit,如果没有加,有些版本的数据库也无法查处正确数据。...Max()函数,根据地址分组查出每个地址最新数据的时间,然后将查询结果关联原表查出正确的数据。

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使用Python进行交易策略投资组合分析

并将开发一个简单的动量交易策略,它将使用四种资产类别:债券、股票房地产。这些资产类别的相关性很低,这使得它们成为了极佳的风险平衡选择。...所以我们还可以通过在接近顶部时使用止损或追踪止损来退出交易,而不是在15日线图下跌或持平时再进行操作。 投资组合分析 到目前为止,我们已经用Python创建了一个交易策略。...MARKOWITZ 均值-方差优化 1952,马科维茨(MARKOWITZ)提出均值-方差投资组合理论,又称现代投资组合理论。投资者可以使用这些概念来构建基于给定风险水平的最大化预期回报的投资组合。...最好使用热图来查看这些信息。热图可以让我们看到证券之间的相关性。 returns.plot_corr_heatmap() 最好在你的投资组合中拥有相关性较低的资产。...总结 通过分析绘制的所有数据进行资产配置,可以建立一个投资组合,极大地改变基础投资的风险特征。还有很多我没有提到的,但可以帮助我们确定交易策略价值的起点。我们将在后续文章中添加更多的技术性能指标。

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java agentbyte-buddy组合的简单使用

一、java agentbyte-buddy组合使用场景 java agent开了一扇门,bytebuddy在开的这扇门中打开了一片新的天地。...Javassist: Javassist是一个开源的分析、编辑创建Java字节码的库。它已经被许多其他的Java类库工具使用,包括HibernateSpring。...使用这个API,你可以实现自己的类加载器,并在类被加载到JVM时修改其字节码。...HotSwapAgent基于Java Instrumentation API,并提供了更多的功能,如条件断点、类变量查看修改等。...三、基于java agentbyte-buddy组合简单使用 首先需要准备好premain,然后基于premain中定义的转换器,在转换器中,添加需要拦截的方法,拦截的规则,最终将其安装到Instrumentation

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【Python科学计算】使用NumPy水平组合数组垂直组合数组

1 水平数组组合 通过hstack函数可以将2个或多个数组水平组合起来形成一个数组,那么什么叫数组的水平组合呢?下面先看一个例子。 现在有两个3*2的数组AB。...数组A 0 1 2 3 4 5 数组B 6 7 8 4 1 5 现在使用hstack函数将两个数组水平组合的代码如下。 hstack(A,B) hstack函数的返回值就是组合后的结果。...下面的例子通过reshape方法以及乘法运行创建了3个二维数组(行数相同),然后使用hstack函数水平组合其中的两个或三个数组。...ab print(hstack((a,b))) print('----------------') # 水平组合a、bc print(hstack((a,b,c))) 程序运行结果如图1所示。...图1 水平组合数组 2 垂直数组组合 通过vstack函数可以将2个或多个数组垂直组合起来形成一个数组,那么什么叫数组的垂直组合呢?下面先看一个例子。 现在有两个3*2的数组AB。

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【MySQL】学习并使用聚合函数DQL进行分组查询

常见的聚合函数 函数 功能 count 统计数量 max 最大值 min 最小值 avg 平均值 sum 求和 注意:null值不参与所有聚合函数运算。...聚合函数使用语法 SELECT 聚合函数(字段列表)FROM 表名; 聚合函数Exercises 1.统计该企业员工数量 select count( * )from emp;...分组查询的语法 SELECT 字段列表 FROM 表名 [ WHERE 条件 ] GROUP BY 分组字段名 [ HAVING 分组后过滤条件 ]; where having...分组之后,查询的字段一般为聚合函数分组字段,查询其它字段无任何意义。...Exercises 1.根据性别分组,统计男性员工女性员工的数量 select gender , count(*) from emp group by GENDER; 2.根据性别分组,统计男性员工

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多摄像头实时目标跟踪计数使用YOLOv4,Deep SORTFlask

通过查看被跟踪目标的路径与计数线的交叉点对目标进行计数。 因此,那些跟丢了但用相同的ID重新跟踪的仍然会被计数使用低置信度滤波进行跟踪,来自上面同样的论文。 提供更低的假阳性率。...可以使用多个IP摄像头。 方向计数可以配置为基于角度。 每一小时的间隔记录计数。 总的计数 基于类别的计数 记录每个计数目标的交叉详细信息。 交叉时间 交叉点坐标 交叉角度 可以托管在云服务器上。...目标计数 这个项目最初打算成为一个应用程序,用于使用我自己的智能手机计算当前在多个房间的人数,服务器被远程托管。下面展示了对人和汽车的检测、跟踪计数。 ?...训练你自己的机动车跟踪模型 我使用DETRAC训练带有v3标注的数据集训练了YOLOv4Deep SORT模型。...当然,这在很大程度上取决于流分辨率以及用于检测跟踪的帧数。 YOLO v3 vs. YOLO v4 当我第一次开始目标计数项目时,我使用YOLOv3,跟踪帧率大约是10FPS,很难一次运行多个流。

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Google Earth Engine——使用 R、dplyr ggplot 可视化科罗拉多州丹佛市的每小时交通犯罪数据

丹佛市在其开放数据目录中公开保存过去五的犯罪数据。在本教程中,我们将使用 R 访问可视化这些数据,这些数据本质上是具有犯罪类型、社区等特征的时空参考点。 首先,我们将加载一些稍后会用到的包。...library(dplyr) library(ggplot2) library(lubridate) 然后,我们需要下载包含原始数据的逗号分隔值文件。...下面的代码使用dplyr包对数据进行子集化以仅包括交通事故犯罪 ( filter(...))...,并解析日期/时间列,以便我们可以提取诸如小时-分钟(以评估一天中的模式)、当天周(例如,1 = 星期日,2 = 星期一,...)(一中的哪一天?)...hr = hour(datetime), dow = wday(datetime), yday = yday(datetime)) 最后,我们将按小时星期几对数据进行分组

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使用 Python 对相似的开始结束字符单词进行分组

在 Python 中,我们可以使用字典循环等方法、利用正则表达式实现列表推导等方法对具有相似统计结束字符的单词进行分组。该任务涉及分析单词集合并识别共享共同开始结束字符的单词组。...方法1:使用字典循环 此方法利用字典根据单词相似的开头结尾字符对单词进行分组。通过遍历单词列表并提取每个单词的开头结尾字符,我们可以为字典创建一个键。...如果找到匹配项,我们分别使用 match.group(1) match.group(3) 提取开始结束字符。然后,我们按照与方法 1 中类似的过程,根据单词的开头结尾字符对单词进行分组。...列表推导提供了一种简洁有效的方法,可以根据单词的开头结尾字符对单词进行分组。...我们使用三种不同的方法对单词进行分组使用字典循环,使用正则表达式使用列表理解。

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电脑键盘快捷键组合键功能使用大全

电脑键盘快捷键组合键功能使用大全 键盘快捷键使用大全所谓快捷键就是使用键盘上某一个或某几个键的组合完成一条功能命令,从而达到提高操作速度的目的。下面为大家介绍一些常用快捷键的使用功能。...善用快捷键,可以更快捷的使用电脑。 (图为标准键盘示意图) 下面来看看各种电脑快捷键大全组合键的功能大全。...一、最常用的电脑快捷键大全 二、电脑快捷键大全键组合键功能大全   Ctrl+1,2,3… 功能:切换到从左边数起第1,2,3…个标签 Ctrl+A 功能:全部选中当前页面内容 Ctrl...(输入法选项) irprops.cpl—-无线链接 joy.cpl——–游戏控制器 lusrmgr.msc—-本机用户组 logoff———注销命令 main.cpl——-鼠标 mem.exe——–显示内存使用情况...想要详细了解电脑快捷键大全组合键功能使用大全,可以继续关注键鼠的最新动态。

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使用柯里化(Currying)组合函数后,摸鱼时间又长了 !!!

这样更便于我们后期对代码的维护复用那么我们是否就可以将每次传入的参数在单一的函数中进行处理,处理完后在下一个函数中再使用处理后的结果;比如上面的案例我们进行一个修改:传入的函数需要分别被进行如下处理第一个参数...tos-cn-i-k3u1fbpfcp/823ffb1366de442cb13c7d4631634589~tplv-k3u1fbpfcp-zoom-1.image" alt="在这里插入图片描述" />理解组合函数组合...(Compose)函数是在JavaScript开发过程中一种对函数的使用技巧、模式。...比如我们现在需要对某一个数据进行函数的调用,执行两个函数fn1fn2,这两个函数是依次执行的。...这个过程就是对函数的组合,我们称之为组合函数(Compose Function)<img src="https://p3-juejin.byteimg.com/tos-cn-i-k3u1fbpfcp

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2018-7-16python中四种组合数据类型pycharm的安装使用

pycharm中在本行直接ctrl+D是复制本行到下一行 ctrl+x是删除本行                        梳理4种组合数据类型 1.列表(list) 列表:是一种可以存储多个有顺序并且可以是重复数据的组合数据类型...->将会造成当前程序的BUG 迫切需要一种列表类似,但是不能修改数据的组合数据类型:元组 2.元组(tuple) 元组:是一种可以存放多个有顺序的并且可以是重复的但是数据不可改变的一种组合数据类型....intersection(n2):求集合n1集合n2一样的地方 n1.difference_update(n2):求集合n1集合n2不一样的数据(差集),并把数据赋值给n1 n1.intersection_update...(n2):求集合n1集合n2一样的数据(交集),并把数据赋值给n1 n1.union(n2):求集合n1集合n2的并集,并完直接显示出并集之后的结果 n1.clear() 清空集合 在集合中增加数据...查看函数的使用方式函数内定义的方法: dir()/help() 编程开发:熟能生巧:套路

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