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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

require(dplyr))install.packages("dplyr",update = F,ask = F) if(!...length()数的是向量里面有多少个元素; rm(list = ls()) if(!...planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) length(x) 2. str_split(字符串,"拆分符号") 拆分字符串 图片 -(1)拆分之后成为了了列表,列表的每个元素对应原来的每个元素拆分的结果...; str_ends(x2,"e") #判断是否以某个元素结尾; 5. str_replace()、str_replace_all() 字符替换 -(1)str_replace() :只替换匹配到的第一个目标...%>%可以更加简洁明了;%>%表示向后传递,把管道符前面所有的东西作为后一个函数的第一个参数;管道符号永远在中间,后面一定有东西; # 连续的步骤 # 1.多次赋值,产生多个中间的变量 x1 = select

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R||R语言基础(三)_R包

今天继续学习R语言基础的R包使用,以R包:dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败,解决方法https://mp.weixin.qq.com...:102),] 这里的“,”怎么理解呢,在我们上一期推文中提到,提取元素时z[x,y]指代提取z中第x行,第y列,如果我们只需要提取行,则应该写作z[x,],同理,如果只需要提取列,应该写作z[,y]...的两个实用技能 1.count统计某列各元素出现的次数 count(test,Species) 2.管道操作 %>%(CTRL+SHIFT+M) 加载任意一个tidyverse包都可以使用管道符号...其核心包有ggplot、readr、tibble、purrr、 tidyr 、dplyr、ggplot、forcats 和stringr8个. 我们这里用的是dplyr包,因此可以使用管道

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

- "The birch canoe slid on the smooth planks." x str_length(x) # 引号内的单个字母/数字/符号数量 length(x) #检测向量内的元素数...第一个参数为向量名,第二个是检测的关键词 str_starts(x2,"T") #判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换...x2 str_replace(x2,"o","A") #每个元素里面只替换第一次出现的目标字符 str_replace_all(x2,"o","A") #替换元素中所有目标字符 1.6 字符删除 x...filter() 2.4.2 多重嵌套,代码不易读 pheatmap::pheatmap(head(as.matrix(select(iris,-5)),50)) # 从最里面的()向外一层层读 2.4.3 管道符号传递...的标度在每个版面都可以变化### ggplot2 分面相关设置(facet)详解 7.一些实操中的便捷函数 7.1 match() 函数 load("matchtest.Rdata") x y ## 把y的列名正确替换

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") ##在" "中只替换一个函数 str_replace_all(x2,"o","A") ##替换所有 图片 6. str_remove...c(1:2,51:52,101:102),] rownames(test) =NULL # 去掉行名,NULL是“什么都没有” test 图片 library(dplyr) arrange(test,...新增一列是两列数值的乘积 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 图片 图片 select和filter 筛选出来的结果是数据框 3.连续操作,优秀的管道符号...Sepal.Width) ##筛选x1数据中的Sepal.Length,Sepal.Width两列 x3 = arrange(x2,Sepal.Length) ##按照Sepal.Length给x2排序 # 2.管道符号传递...length(x)){ s=s+x[[i]] result[[i]] = c(x[[i]],s) } result do.call(cbind,result) ## 通过先生成空的列表list,使用下标循环

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R语言基础5(绘图基础)

geom_bar(mapping = aes(x = cut)) ggplot(data = diamonds) + stat_count(mapping = aes(x = cut)) #统计变换使用场景...2、搜索画图代码 3、仿制示例数据 4、套代码,调整细节 玩转字符串 str_length() length()#向量里面元素的个数 str_split() str_sub(x,5,9)#提取5-9的元素...a,只替换出现的第一个o; str_replace(x,"o|s","a")#将x中的o或者s替换为a,只替换出现的第一个o; str_replace_all(x,"o","a")#将x中的o替换为a,...嵌套,代码不易读 pheatmap::pheatmap(head(as.matrix(select(iris,-5)),50)) # 3.管道符号传递,简洁明了 iris %>% select(-...5) %>% as.matrix() %>% head(50) %>% pheatmap::pheatmap() ##将管道符前面所有的结果传递给后面的函数,作为他的第一个参数 #用之前需要加载

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tidyverse:R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

出版有《R for Data Science》(中文版《R数据科学》),这本书详细介绍了tidyverse的使用方法。...从文件中读取数据 purrr:(提供好用的编程函数 tibble:data.frame升级款 stringr:处理字符,查找、替换等 forcats:处理因子问题 ?...(类型)、%>%(管道)、dplyr(加减乘除)、tidyr(透视/反透视)、ggplot2(可视化) 01 — readr:数据导入/读取 readr comes with five parsers...,是弱类型的,同时与data.frame有相同的语法,使用起来更方便。...——将左侧的值应用到右侧数据data位置 管道函数在tidyverse中,管道符号是数据整理的主力,可以把许多功能连在一起,而且简洁好看,比起R的基本代码更加容易阅读!

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R语言学习笔记-Day6

按位置提取字符str_sub(x,5,9)1 "birch"#提取第5到第9个字符1.4 字符检测str_detect(x2,"h")对每个字符串内的字符进行检测,是否存在该字符(输出值为T或F)1.5 字符的替换...str_replace(x2,"o","A")只会对第一次出现的"o"替换成"A"#改进:str_replace_all(x2,"o","A")对所有的"o"替换成"A"1.6 字符删除str_remove...test$Sepal.Width#该语句运行完数据框列数即增加无需赋值2.4 筛选列、行select() #筛选列filter() #筛选行2.5 管道符号x1 = select(iris,-5)...k2,"tumor","normal")3.4 for循环for(i in x){CODE}#对x中的每个元素i执行相同的代码CODE#有几个元素则执行几次,函数本身不存在判断条件,可自行添加其它函数进行判断...i)}1 11 21 31 4e.g.2par(mfrow = c(2,2))for(i in 1:4){plot(iris,i,col = iris,5)}批量装包pks = c("tidyr","dplyr

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