使用geom_col更改ggplot的轴中断/限制 - 腾讯云开发者社区

这边我命名为 example_1.csv 读入数据 df<-read.csv("example_1.csv",header=T) df 最基本的直方图使用geom_col()函数 ggplot(df...image.png 更改柱子的填充颜色用到的是fill参数 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(width = 1,color="black",fill="grey"...image.png 更改x轴和y轴的标题，可以用labs()函数 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(width = 1,color="black",fill="grey...image.png 加上x轴和y轴的线条 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(width = 1,color="black",fill="grey")+ labs...image.png 最后是添加一些文本注释，使用的是annotate()函数 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(width = 1,color="black",fill

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R语言 | 条形图绘制

这里我将填充色更改为亮黄色，边框线为黑色。注意，颜色要用""引起来哦！...ggplot(pg_mean,aes(x = group,y = weight)) + geom_col(fill="lightyellow",colour="black") 2绘制簇状条形图演示数据...ggplot(cabbage_exp,aes(x = Date,y = Weight,fill = Cultivar)) + geom_col(position = 'dodge') Tips：最基本的条形图通常只对应一个绘制在...x轴上的分类变量和一个绘制在y轴上的连续型变量。...有时候，我们想额外添加一个分类变量跟x轴上的分类变量一起对数据进行分组。此时，可通过将该分类变量映射给fill参数来绘制簇状条形图，这里的fill参数用来指定条形的填充色。

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这个方法无需旋转就可使得横轴坐标不重叠！

坐标轴重叠是常见的绘图问题，常规的解决方式是增加图形的宽度、降低字体大小、坐标轴文字旋转。还有 2 个新的方式，自动错位排列和隐藏重叠坐标轴。...TPM))+ geom_col() 坐标轴刻度错位排列采用guide_axis函数。...# 2行交替 ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=TPM))+ geom_col() + scale_x_discrete(guide = guide_axis(n.dodge...(n.dodge=3)) 隐藏重叠的坐标轴标记 ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=TPM))+ geom_col() + scale_x_discrete(guide...ggplot(data=df, aes(x=Gene, y=TPM))+ geom_col() + scale_x_discrete(guide = guide_axis(angle = 45

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了解绘制条形图和折线图的细节

本章将以ggplot2为主进行学习啦~~ ---- 3.1 绘制基本条形图 Q:当你有一个包含两列的数据框，一列为x轴上的位置，一列为y轴上的对应高度，基于此如何绘制条形图？...,aes(x=group,y=weight))+geom_col()# 是不是很简单啊，寥寥几句的代码即可： #时间是连续性变量，此时会在x轴上介于最小值和最大值之间所有可能的取值范围处绘制条形 ggplot...'dodge'时使用的为0.9的默认值 ggplot(cabbage_exp,aes(x=Date,y=Weight,fill=Cultivar))+ geom_col(width=0.5,position...调整vjust，但是有可能使数据标签位于绘图区范围之外 #(2)增加ylim调整y轴范围，只是数值竖直调整的幅度取决于y轴范围 #增加y轴上限 ggplot(ce,aes(x=interaction(...$Weight)*1.05) #设置标签的y轴坐标 ggplot(ce,aes(x=interaction(Date,Cultivar),y=Weight))+geom_col()+ geom_text

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R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果

如果是研究比较多的物种，可以直接使用R语言包clusterProfiler做富集分析当然是最好，最后可以很少的代码拿到很漂亮的结果图。...今天的推文介绍一下相关的R语言ggplot2作图代码 clusterProfiler能出的图有柱形图、气泡图、网络图、热图等今天的推文只介绍柱形图和气泡图，网络图和热图相对比较复杂。...library(ggplot2) ggplot(dat01,aes(x=Input.number/500,y=Term))+ geom_col(aes(fill=Corrected.P.Value.../500)))+ geom_col(aes(fill=Corrected.P.Value)) 接下来是对细节的一些调整，包括更改配色，图例的标题等等 library(see) ggplot(dat01...), limits = c(0,0.65))+ theme(panel.grid = element_blank()) 这里还会经常遇到一个问题就是y轴的文字如果比较长

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分组、离断式坐标轴

ggplot2已经非常好用了，但是大家对美的追求是永无止境的，比如对于坐标轴，有人可能更喜欢base r那种，base r的很多默认图形，坐标轴都是分离的，比如这种： barplot(c(20,30,40,50,60...Prism的图形风格的，非常好用，我前面专门介绍过，传送门：让ggplot2变成Graphpad Prism样式：ggprism（01）让ggplot2变成Graphpad Prism样式：ggprims...众所周知，ggplot2现在默认支持双坐标轴了，ggh4x为第2条坐标轴添加了更多自定义选项。...(df, aes(interaction(item, type), amount)) + geom_col() # 使用ggh4x修改 p2 ggplot(df, aes(interaction...ggplot(df, aes(weave_factors(item, type), amount)) + geom_col() + guides(x = "axis_nested") + theme

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如何使用 ggplot2 绘制双轴分离图？

绘制条形图，简单调整柱子的宽度以及加上 x，y 轴标题。...ggplot(df1, aes(p.val, term)) + geom_col(width = 0.6) + labs(x = '-log(BH p value)', y =...'Terms') 低配版条形图高配版条形图使用 geom_rangeframe()将 x,y 轴分离。...在此之前，创建一个新的数据框，根据你的 x 值，手动划分 x 轴尺度范围。...主要细节调整：geom_col() 中的 aes(fill = score)，连续性变量填充使用 scale_fill_gradient2() 以及加上了图例。

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86-R可视化18-自定义分类或连续数据坐标轴文本

)[1] 前言最近遇到一个问题，如何将ggplot 连续性数据的坐标轴文本，自定义成想要的分类数据，比如1:10 的数值替换成 id1, id2...id10，实现以假乱真的效果。...这里主要谈的还是标签，关于坐标的范围限定，可以参考：[[57-R可视化6-ggplot2三部曲最终之进阶为菜鸟]] 连续与分类数据的处理无论是y 还是x 轴，都对应scale_**_discrete/...continuous，比如x轴如果是分类数据，则使用函数scale_x_discrete。...： ggplot() +geom_col(data = my_data2, aes(id, counts), fill = "red") + labs(x = NULL) + scale_x_continuous...，我们仅仅希望坐标添加上额外的标记，这时候就可以借助函数了: ggplot() +geom_col(data = my_data2, aes(id, counts), fill = "red") + labs

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图形添加文本-ggfittext

今天是大年初三，想必小伙伴们都放假在家陪着爸爸妈妈，吃着家乡的饭，和家人一起过节，小编在这里给大家拜个年~祝大家新年新气象，新年好运气有福气，工作顺利，身体健康~ 接下来小编向大家介绍一个相对简单的绘图添加文本的...") + geom_fit_text(grow = TRUE) #字的大小随数值改变 # reflow=TRUE ,文字重排以适应格子 (3)改变文字的位置 ggplot(...的添加文本geom_bar_text() (1)默认参数 ggplot(altitudes, aes(x = craft, y = altitude, label = altitude)) + geom_col...= "stack", grow = TRUE, reflow = TRUE) #position = "stack",堆叠展示 (3)坐标轴转换 ggplot(coffees, aes(x...y轴互换 3.

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78-R可视化14-不同分组差异基因数目的上下柱状图显示

前言在上一节中[[77-R可视化13-多个ggplot图象映射实现以假乱真的dodge+stack效果]]，我们提到了这张图：下面是本来要复现的图：有同学给我说了，这个图其实是有它的道理的，它其实显示的是...，堆叠在一起的OM 与YM 的差异基因，各自有50多，合计对应Y 轴上的内容。...这种基本的misunderstanding 可是数据科学家可视化的禁忌啊！你明明有更好的选择，比如将另一个对比分组调整到坐标轴的负轴。...() + geom_col(data = a2, aes(type1, counts, fill = type2), position = "dodge") + geom_col...，还需要一个坐标轴告诉你差异基因的数目吗？

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「R」数据可视化19：环状条形图

当厌倦普通的条形图的时候或者空间有限但是要展示较多样本的时候，都可以考虑使用环状条形图。...如何作环状条形图 1）需要什么样的数据我们这次使用的数据以及代码来源Azandis的博客[1]。我根据最终的图片，整理了所需要的数据。...ggplot 函数进行作图，首先我们来看看怎么把普通的柱状图变成环形的。...排序后的环形图然后我们在之前的基础上标记上数值： ggplot(TP, aes(x = reorder(State, RankOrder))) + geom_col(aes(y = Trees),...根据原图添加了相关的坐标轴名称等，然后把两张图拼接在了一起。（有一些细节比如左上角还根据地理位置对点进行了划分，我就忽略啦） ? 今天的分享就到这里啦。

2.7K5 0

R中优雅的处理长标签文本

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝在使用ggplot2包绘制图形时，若轴文本标签过长则非常难受需要经过处理才能完美的嵌合图形。...scale_x_discrete ❝这种方法直接在坐标轴设置中处理长标签，优点是代码更简洁，无需修改原始数据。...❞ p1 ggplot(df, aes(x, y)) + geom_col() + scale_x_discrete(labels = scales :: label_wrap(15)) 案例2...❝使用mutate和str_wrap，这种方法在数据预处理阶段处理长标签。...❞ p2 % mutate(id=str_wrap(x,width =15)) %>% ggplot(aes(id, y)) + geom_col() p1+p2

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可能会用到的30个R语言包~第四期

的图，坐标轴好多可选 4 r3dmol 在 YuLabSMU 公众号看到的推文在R中对分子结构进行3D可视化 5 epiR 该包集合了流行病学中诸多描述性分析的函数。...image.png 8 ggThemeAssist 通过鼠标点点点的方式更改ggplot2作图的一些细节主页 https://github.com/calligross/ggthemeassist，我个人还是还是不太喜欢这种形式...image.png 20 lemon 可以很方便的操作ggplot2的图例和坐标轴参考 https://cran.r-project.org/web/packages/lemon/vignettes/...github主页 https://github.com/eliocamp/ggnewscale 比如两组数据同时画到一张图上，每组数据都分别映射颜色，这个时候如果要用scale_color_manual()更改颜色的话是不能按照不同的数据集来修改的...[1:4]) df2<-data.frame(A=4:1, B=LETTERS[5:8]) ggplot()+ geom_col(data=df1,aes(x=B,y

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让执着成为一种习惯——仿网易数独玫瑰气泡图

图表整体难度中等，使用ggplot2来写代码，主要考察关于极坐标转换与应用。（ggplot2系统中，两个较为高阶的用法分别为：极坐标系、地理空间的多边形填充）。...FALSE,check.names = FALSE) 仔细观察该图，你会发现，玫瑰图内侧并非底边对齐，而是靠上下中心对齐，要想做到这种效果，必须将一个细分维度转化为负值（柱形图堆积时会自动将负值堆积在负坐标轴上...circle_point_data$Class<-factor(circle_point_data$Class,levels=c("General","Very","Raito"),order=TRUE) #构造气泡图模拟Y轴：...<-ifelse(circle_point_data$Class=="Raito",circle_point_data$Value,0.3*circle_point_data$Value) （这里没有使用气泡图对应真实值作为气泡大小...) ###极坐标化前的柱形图和气泡图 ggplot()+ geom_linerange(data=circle_bubble,aes(x=State,ymin=-150,ymax=140),size=.25

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R绘图|转录组上游分析结果可视化-双向柱状图

) ggplot(longdata, aes(SampleName, value, fill = Group)) + geom_col(position = position_dodge(width...library(ggplot2) library(ggsci) library(ggbreak) ggplot(longdata, aes(SampleName, value, fill = Group...)) + geom_col(position = position_dodge(width = 0.5), width = 0.5, size = 0.3, colour =...我对其进行以下操作去掉右侧多余的坐标轴调整左侧Y轴点的个数添加截断标志和0线调整字体为Times New Roman，颜色为黑色，部分加粗加红框突出其他微调最终图如下：参考资料：《...R 中的 scale_y_continuous 函数》https://www.delftstack.com/zh/howto/r/scale_y_continuous-in-r/ 《ggbreak：你们要的坐标轴截断

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R绘图练习 | 突出显示个别条形的重叠条形图

专注R语言在生物医学中的使用首先是加载R包和数据 library(tidyverse) library(ggtext) library(showtext) showtext_auto() load(...(df_animals_sum, aes(cal_year,n))+ # 第一层条形 geom_col(aes(fill= cal_year == 2020), width...= 0.8 )+ # 第2层条形 geom_col(data = df_animals_agg %>% filter(animal_group_aggregated...nudge_y = 12, vjust = 0, lineheight = 0.8 )+ # 底部坐标轴的标签...包和技巧： ggplot2修改坐标轴详细介绍超详细教程：修改ggplot2图例让你的ggplot2主题支持markdown和css 让你的ggplot2支持markdown语法

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跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画图如何让坐标轴以科学计数法显示

今天的推文是昨天推文的延续跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画柱形图如何让屁股朝右。...disorders中的 figure2B image.png image.png 但是有一个细节没有能够实现，就是让坐标轴以上图样子的科学计数法显示，昨天的推文发出后有读者留言了对应的解决办法，今天在推文中记录一下...ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col() image.png image.png 默认是以小数形式加上如下函数 ggplot(df,aes(x=x,y=y))...另外的方式是 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col()+ scale_y_continuous(labels = c(expression(italic(0)),...接下来简单的美化一下 ggplot(df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x))+ scale_y_continuous(labels = c(expression

2.8K2 1

R中轻松绘制南丁格尔图

/span>", "Season 3")) 数据可视化 ggplot...(df, aes(x = Episode_order)) + # 为y轴的值添加文本注释 annotate('text', x = 34.5, y = c(12, 22, 32, 42,...geom_col(aes(y = F_count_RK, fill = as.factor(Season)), show.legend = FALSE) + # 添加富文本，用于显示季节标签...= 8) + # 手动设置填充颜色 scale_fill_manual(values = c("#788FCE","#E6956F","#A88AD2")) + # 设置y轴的范围和间隔...scale_y_continuous(limits = c(0, 52), breaks = seq(0, 50, 10)) + coord_polar() + # 使用极坐标

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87-R可视化19-利用其他图层映射自由的控制背景的颜色

在[[57-R可视化6-ggplot2三部曲最终之进阶为菜鸟]] 中我也提到过主题中的panel.background 参数，比如下图：但是，它并不能让我们满意的生成不同的背景颜色，尤其是，最好可以根据不同的组别...参见：R 数据可视化 —— ggplot 色块图 - 简书 (jianshu.com)[1] 这里需要强调一下rect 的aes 图层需要接受四个参数作为映射，这里我们仅仅通过自己的判断，将数值进行选择...： aes(xmin = 4.5, xmax = 9.5, ymin = -Inf, ymax = Inf) 不难看出，这种柱状图其实是一个分类数据（x轴）的展示：...("a","b"), each = 5) ) ggplot() + geom_col(data = my_data2, aes(id, counts), fill = "red") 调整x 轴标记...，以假乱真主要是之前的[[86-R可视化18-自定义分类或连续数据坐标轴文本]] 中的知识点： scale_x_continuous(breaks=seq(0,9,1),

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ggplot2_总纲

ggplot2 介绍语法构成 GGPlot2是一个强大而灵活的R包，由HadleyWickham实现， ggplot2中的gg表示Grammar of graphics，ggplot通过使用“语法”来描述图形...chart geom_jitter() Dot plot geom_dotplot() Bar chart geom_bar() or geom_col() Line plot geom_line...# 更改点的大小颜色形状 ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width))+ geom_point(size = 1.2, color = "...# Change the default color manually. # 使用scale_color_manual() 函数更改配色方案 p ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length...# 更改图例的位置theme # 上下左右位置left”, “top”, “right”, “bottom”, “none” p + theme(legend.position = "top") ?

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跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2画直方图

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