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「R」ggplot2在R包开发中的使用

尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。.../ 234, "r" = 25 / 234 ), class = "discrete_distr" ) R中需要的类都有plot()方法,但想要依赖一个单一的plot()为你的每个用户都提供他们所需要的可视化需求是不现实的...一个很好的例子是ggdendro[3],它创建系统树图但同时计算出数据以方便用户干自己想要做的事情。...不应该停止你创建自己的函数可视化对象! 创建一个新的主题 当创建一个新的主题时,从已有主题出发总是好的实践(例如,theme_grey()),然后使用%+replace%替换需要该包的元素。

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跟着NatureGenetics学作图:R语言ggplot2柱形图饼图箱线图展示柑橘泛基因家族分析的结果

citrus fruits https://www.nature.com/articles/s41588-023-01516-6 柑橘泛基因组NG.pdf 论文中大部分作图数据都有,我们可以试着用论文中的数据来复现论文中的图...,今天的推文我们来复现论文中的Figure 3 a和b 首先是Figure3a 一个柱形图叠加一个饼图 论文中提供的柱形图的数据 image.png 一直没太看明白这个柱形图想展示的是什么意思,欢迎大家留言讨论...softcore"="#df94a0", "core"="#d97168")) p1 image.png (这个配色个人感觉是真难看) 然后是饼图的代码...()+ geom_scatterpie(data=dat2, aes(x,y,group=region,r=1), cols=..."Softcore"="#df94a0", "Core"="#d97168")) p2 image.png 把柱形图和饼状图组合到一起

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    跟着Nature Genetics 学画图:R语言ggplot2画地图并且叠加饼状图的简单小例子

    image.png 这篇论文的数据是公开的,我们可以试着用公开的数据复现一下论文中用来展示数据的图。第一个图是使用地图来展示实验样本的地理分布。...**因为地图数据用的是老外搞得,经常会出现问题。大家使用地图的时候要格外注意。...**那这次演示就不用带有国家边界的地图了,也可以直接画以洲为边界的地图 加载需要用到的R包 library(rnaturalearthdata) library(rnaturalearth) library...image.png 接下来是叠加饼图 有现成的函数可以做这个事情,参考如下链接 https://guangchuangyu.github.io/2016/12/scatterpie-for-plotting-pies-on-ggplot...image.png 这样就可以很方便的向地图上添加饼状图了 完整代码 #install.packages("rnaturalearth") #install.packages("rnaturalearthdata

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    R语言ggplot2:单元格为方块的热图简单小例子-2

    昨天公众号后台有人留言作图,示例图如下 image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和热图的拼接,右侧的热图可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色...基本的思路有了。...继续昨天推文的内容 R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置(点击蓝色字体直达昨天的推文) 今天的推文记录一下如何实现这个热图 首先构造一份数据集 set.seed("20200407...rownames(df)<-paste0("X",1:6) write.csv(df,file = "20210407_example.csv",quote = F) image.png 这样是宽格式数据,ggplot2...) ggplot(data=df2,aes(x=Sample,y=variable))+ geom_point(aes(size=abs(value_1), color

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    R语言ggplot2绘图单元格为方块的热图—1—调整图例的位置

    image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现,这个是箱线图和热图的拼接,右侧的热图可以借助geom_point()函数实现,将点的形状改为正方块,数值按照正负来映射颜色,按照一定的数值来映射大小...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=...image.png 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记

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    使用Python中的folium包创建热力密度图

    最近探索出来一个在Python中创建热力图非常高效的方法,使用folium包来创建热力图,实际效果非常赞,过程简单,代码量少。...folium包基于leaflet在线地图库封装,在R语言中leaflet的接口已经非常完善,如果你对R语言中的leaflet包api接口感兴趣,可以参考这几篇文章。...来了,从此动态地图又多了一些乐趣~~~ folium包支持多种类型的空间可视化形式,今天这一篇仅就其中的热力密度图进行分享。...创建基于folium热力图数据结构的数据对象: lon = np.array([i["lng"] for i in myaddress],dtype=float) lat = np.array([i["...以上数据是虚构的,整体效果也没有任何意义,接下来尝试着对全球城市发展报告中中国各个城市的gdp数据进行热力图展示。

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    温故而知新,ggplot2 饼图的几点笔记

    对于为什么 ggplot2 中没有专门用于饼图绘制的函,有人说:“柱状图的高度,对应于饼图的弧度,饼图并不推荐,因为人类的眼睛比较弧度的能力比不上比较高度(柱状图)。”...关于饼状图被批评为可视化效果差,不推荐在 R 社区中使用的文章在网络也有不少,感兴趣的可以去搜一下。 不管怎么说,学习一下总不是坏事,趁着一些客户刚好对饼图有需求,重温一下。...coord_polar coord_polar() 是 ggplot2 中的极坐标函数,它可以弯曲横纵坐标,使用这个函数做出蜘蛛图或饼图的效果。...饼图中添加文字的位置控制 - 借助公式 绘制饼图的过程中,利用 ggplot2 的 geom_bar 结合 coord_polar 实现。...文章的最后,提个问题:有没有通用的 R 包或者函数,可以得到下面效果的饼图?

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    体验R和python的不同绘制风格

    下面是ggplot2绘图体系的一些关键概念: 数据:ggplot2使用数据框作为数据输入的基本单位。数据框是一个二维表格,其中每一列代表一个变量,每一行代表一个观察值。...图层(Layer):图层是ggplot2中最基本的组成单元。每个图层都由数据、图形属性和统计变换组成。通过将多个图层叠加在一起,可以创建复杂的图形。...几何对象(Geom):几何对象是图层中的图形元素,用于表示数据的形状、大小、颜色等属性。ggplot2提供了多种几何对象,如点、线、条形、面积等。...matplotlib是Python中最常用的绘图库之一,它提供了广泛的绘图功能,可以创建各种类型的图形,包括线图、散点图、柱状图、饼图、等高线图等。...那我们接下来体验一下使用R的ggplot2和Python的matplotlib绘制一张饼图吧!

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    R语言在地图上绘制散点饼图可视化

    p=22537 在本文我们在ggplot2中制作的饼实际上是一个条形图转换为极坐标。如果我们想制作一个像上面截图那样的地图,这就很困难了。 相关视频 但在地图上绘制饼图时,它也有自己的缺点。...首先,当我们绘制大量的饼图时,它以光栅图像的形式渲染,使得它的渲染速度很慢。 本文创建了一个封装函数,使其更容易绘制一组饼图。 例如,假设我们有以下数据。...set.seed(123) long <- rnorm(50, sd=100) lat <- rnorm(50, sd=50) 在地图上绘制饼图。...ggplot(map_data('world'), aes(long, lat) +pie(aes(x=long, y=lat, group=region, r=radius 这是一个简单应用,我发现很多人喜欢它...他们要求我实现饼的大小图例。我实现了一个legend层为饼的大小添加了一个图例,如上图所示。

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    R语言在地图上绘制散点饼图可视化

    p=22537 在本文我们在ggplot2中制作的饼实际上是一个条形图转换为极坐标。如果我们想制作一个像上面截图那样的地图,这就很困难了。 相关视频 但在地图上绘制饼图时,它也有自己的缺点。...首先,当我们绘制大量的饼图时,它以光栅图像的形式渲染,使得它的渲染速度很慢。 本文创建了一个封装函数,使其更容易绘制一组饼图。 例如,假设我们有以下数据。...set.seed(123) long <- rnorm(50, sd=100) lat <- rnorm(50, sd=50) 在地图上绘制饼图。...ggplot(map_data('world'), aes(long, lat) +pie(aes(x=long, y=lat, group=region, r=radius 这是一个简单应用,我发现很多人喜欢它...他们要求我实现饼的大小图例。我实现了一个legend层为饼的大小添加了一个图例,如上图所示。

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    R可视乎|圆环图

    对于饼图,上一次学习《R语言数据可视化之美》的时候主要利用graphics包和ggplot包(可见R可视乎|饼图)。这几天的学习中发现还有一个更加简便的方法——ggpie包。...其他俩常用参数可自行加入以上基础饼图中,这里不做大篇幅介绍。接下来介绍圆环图的各种方式绘制(圆环图和饼图的意义其实差不多,都是给出各数据的比重,只不过,圆环图中间少了一块,变成环状)。...主要有两个包:ggpubr包(推荐使用)与ggplot2包。 ggpubr包绘制圆环图 ? 利用该包中的ggdonutchart()可非常方便的绘制环状图,数据还是使用前面的数据。...ggplot2包绘制圆环图 在[R可视乎|饼图]中ggplot2包绘制饼图的基础上,只要再加一条代码即可完成:xlim(c(0, 5)),即将x轴范围控制在0-5。...可以看到:ggpubr包绘制圆环图十分方便,而ggplot2绘制则需要很多代码,这里不建议使用。 这是今天R可视化的学习笔记,我们下次再见。

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    看看程序员大佬都推荐的几大Python库…

    可以使用Matplotlib创建图,条形图,饼图,直方图,散点图,误差图,功率谱图,干图以及您想要的任何其他可视化图!...Seaborn还具有各种工具来选择可以显示数据中图案的调色板。 GGplot Ggplot是一个Python数据可视化库,它基于为编程语言R创建的ggplot2的实现为基础。...Ggplot可以使用高级功能创建数据可视化,例如条形图,饼图,直方图,散点图,错误图等。 API。可在单个可视化中添加不同类型的数据可视化组件或层。...数据可视化专家可以使用bokeh为现代Web浏览器创建各种交互式图,该bokeh可用于交互式Web应用程序,HTML文档或JSON对象。Bokeh具有3个级别可用于创建可视化。...Geoplotlib Geoplotlib为创建地图或使用地理数据提供支持,安装之前需要NumPy和pyglet,它可以使用许多不同类型的地图,例如点密度图,区域索引,符号图等。

    2.8K10

    R可视乎|饼图

    饼图通过将一个圆饼按照分类的占比划分成多个切片,整个圆饼代表数据的总量,每个切片(圆弧)表示该分类占总体的比例,所有切片(圆弧)的加和等于100%。 下面会介绍两种在R中实现饼图的方法。...graphics包绘制饼图 library(RColorBrewer) library(dplyr) library(graphics) library(ggplot2) init.angle可设定饼图的初始角度...首先我们构造一个模拟数据,如下所示,并用dplyr包中的arrange()进行排序(默认从小到大),faction表示数值所占比例,ymax进行累积占比,总值为1。...ggplot2 包绘制饼图 使用R中ggplot2包的geom_bar()函数绘制堆积柱形图,然后将直角坐标系转换成极坐标系,就可以显示为饼图,但还是需要使用geom_text()函数添加数据标签。...但是可以看到:由于缺乏饼图与数据标签之间的引导线,总感觉美观度不够,所以推荐使用graphics包的pie()函数绘制饼图。 代码以及资料存在我的github上,可见文末原文链接。

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    如何在CDSW中使用R绘制直方图

    本文档主要讲述如何在CDSW中使用R语言绘制直方图和饼图,并使用Hive数仓作为数据源。...内容概述 1.创建R工程 2.工程启动及示例运行 3.R直方图示例代码 4.R饼图示例代码 测试环境 1.CM和CDH版本为5.11.2 2.RedHat7.2 3.CDSW1.1.1 前置条件 1.CDH...集群正常 2.Impala/Hive中已有TPC_DS相应的表和数据 3.CDSW安装且正常运行 2.创建R工程 ---- 1.登录CDSW平台 [xiw46ji311.jpeg] 2.点击“New Project...”创建R工程,输入工程名称,选择模板为R [n8f83cv0ip.jpeg] 3.点击“Create Project”,完成R工程创建 [5m3snqf9jh.jpeg] 创建工程选择Template模板时会附带...---- 编写R绘制饼图代码 ## 加载R运行依赖包 library(ggplot2) library(gcookbook) library(data.table) library(DBI) library

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    R语言在地图上绘制月亮图、饼状图数据可视化果蝇基因种群

    p=23322 月亮图和饼图 饼图把一个圆分成多个部分,这些部分的弧长(以及面积)代表一个整体的比例。...月亮图也是如此,它把一个圆分成多个部分,这些部分的面积代表整个圆的比例,但在月亮图中,这些部分被画成圆的月牙形,就像月相。 ? 使用月亮图而不是饼图背后的动机主要是审美的选择。...用法 ggplot2数据可视化包,为R语言中的月亮图提供支持。它们的绘制方式与ggplot2中的点最为相似:它们的位置由一个x和一个y坐标定义,它们的大小与坐标系无关,所以它们总是保持圆形。...x和y维度已经致力于地图坐标,所以像柱状图这样的比例可视化就比较困难。这是一个尝试月形图的绝佳机会! 饼图地图在人口遗传学中很流行,所以让我们看一下该领域的一个例子。...Harvey balls哈维球分析法 "哈维球 "本质上是用于定性比较的饼图,通常以表格形式出现。我们可以使用月形图来达到同样的目的。 首先,让我们获取一些数据。 ? 哈维月亮的图表。

    1.9K30

    R 可视化 | 华夫饼图

    作者:庄闪闪 前言 华夫饼图(waffle chart)分为块状华夫饼图和点状华夫饼图。华夫饼图是展示总数据的组类别情况的一种有效图表。...ggplot 包绘制 块状华夫饼图 块状华夫饼图的小方格用不同颜色表示不同类别,适合用来快速检视数 据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较,让 人更容易找出当中模式。...点状华夫饼图 点状华夫饼图(dot matrix chart)以点为单位显示离散数据,每种颜色 的点表示一个特定类别,并以矩阵形式组合在一起,适合用来快速检视数据 集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较...堆积型华夫饼图 这里还有一种比较有趣的华夫饼图。.../0.7.0/topics/waffle 往期推荐 R可视化 | 混合多个图形 R可视化 | 马赛克图 R可视化 | 复合饼图系列 R可视化 | 分面一页多图 R可视化 | 圆环图 R可视化 | 饼图

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    文献配套GitHub发表级别绘图之饼图

    下面是去年实习生的分享 author: "ylchen" ggplot2是R语言最流行的第三方扩展包,是RStudio首席科学家Hadley Wickham读博期间的作品。...此外,图形中还可能包含数据的统计变换(statistical transformation,缩写stats),最后绘制在某个特定的坐标系(coordinate system,缩写coord)中,而分面(...下面首先来复现Fig.1a(pie chart& rose chart),用饼图呈现出不同组织的数量 Fig.1 一、数据载入 library(ggplot2) library(scales...y变量的值 scale_fill_manual(values = Colors) #设置填充的颜色 三、转换成饼图 coord_polar将圆形转成极坐标 ggplot(data,...#coord_polar极坐标转换,可以做饼图或玫瑰图或雷达图 coord_polar(theta = "y", #theta 可以选择x或y,表示外延的坐标

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    【直播回顾】轻松入门数据可视化

    我们可以方便的从多种数据源导入数据,使用Dax创建计算字段,创建多种样式的交互式图表,并发布共享。...局部整体型 局部整体型图表能显示出局部组成成分与整体的占比信息,主要包括饼图、圆环图、旭日图、华夫饼图、矩形树状图等。...饼图是用来呈现部分和整体关系的常见方式,在饼图中,每个扇区的弧长(以及圆心角和面积)大小为其所表示的数量的比例。但要注意的是,这类图很难去精确比较不同组成的大小。...R语言数据可视化方法 如需绘制这些不同类型的图表,我们主要使用R ggplot2及其拓展包extension,比如ggrepel、ggally、ggalluvial等包;也还会使用lattice、plot3D...R中ggplot2包的geom_path()和geom_polygon()等函数,结合地理空间坐标系可以使用DataFrame格式的数据,绘制不同投影下的世界与国家地图。

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