欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法，那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」，小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用...Il15", "Il34")) 数据可视化 plot_data %>% ggplot(aes(x = log2(fold_change), y = -log10(adj_p_val))) + # 绘制基础散点图...size = 1) geom_point(aes(color = gene_type), alpha = 0.6, shape = 16, size = 1) + # 从 up_genes 数据框中绘制特定形状的散点图...geom_point(data = up_genes, shape = 21, size = 2, fill = "red", colour = "black") + # 从 down_genes 数据框中绘制特定形状的散点图
约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集，使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布，代码比较简单： 首先导入我们需要的几个 R 包： library(ggplot2) library(sf...worldmap % st_transform(crs = 4326) 把疫情数据读取进来并根据经纬度坐标把这个数据框转换成 sf 对象，同样使用...colnames% st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326) -> con_df 最后绘制地图...Novel Coronavirus (COVID-19) Cases, provided by JHU CSSE\nhttps://github.com/CSSEGISandData/COVID-19\n绘制
绘制条形图，简单调整柱子的宽度以及加上 x，y 轴标题。...这里的细节调整包括：使用 ggthemes 包中的 theme_tufte() 主题，viridis 包的 scale_fill_viridis() 离散配色。...注意：这里将柱子按照类别进行填充，当然你也可以使用另一个变量进行填充（下面会给例子）。...主要细节调整：geom_col() 中的 aes(fill = score)，连续性变量填充使用 scale_fill_gradient2() 以及加上了图例。...当然这种技巧也可以使用其他图形中。读者如有需求，可以自行探索。
1绘制 ggplot(mydata) + + geom_bar(aes(x=a, y=b),width = 1,stat="identity", + colour = "black...(size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图
计算Bonferroni校正后的显著性阈值。这是通过将0.05除以GWAS数据中的行数（即测试的总数）来实现的，用于调整多重比较的影响。
本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。...一 载入数据集和R包 library(ggplot2) pathway = read.csv("KEGG.csv",header=TRUE,check.names = FALSE) head(pathway...二 绘制KEGG气泡图 2.1初始化数据并绘制散点图 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY)) + geom_point() ?...四 参考资料 ggplot2：数据分析与图形艺术 好了，更换成自己的数据集即可以自己动手绘制KEGG通路气泡图了。
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制嵌套圆形图，图形绘制倒也简单主要是细节的调整结果仅供参考❞ 加载R包 library(tidyverse) 导入数据 bytes_total <- read_csv
>% arrange(-age) %>% mutate(g_rank = row_number(), name = fct_reorder(name, age)) %>% ungroup() 绘制一个基础图...cent_bee$g_rank ) %>% arrange(x) %>% # 根据x坐标排序 mutate(id = row_number()) # 为每行添加一个唯一的id 调整点的位置 # 使用...circleRepelLayout函数调整点的位置，以避免重叠 pp_repel <- circleRepelLayout(pp_df, wrap = FALSE, sizetype = "area") # 使用
我们在下面使用 mutate 来创建宽度，并使用case_when来分配宽度。后者在SQL用户中是众所周知的。在此上下文中，如果满足条件，它会根据宽度列分配一个值。 # 2....边界框 在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东，因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...好了，伙计们，我们准备绘制欧洲河流的地图了。...我们首先绘制河流线，并根据定义的宽度根据类和宽度分配特定颜色。 由于我们的目标是将视野缩小到欧洲，因此我们使用coord_sf根据预定义的边界框设置纬度和经度限制。...我们将使用蓝色阴影来绘制我们的河流类。此外，我们将大小限制定义为从 0 到 0.3 的数值范围。我鼓励你玩这个范围，看看你会得到什么。
上一篇教程介绍了绘制完整地图的方法：R 语言绘制十段线地图，给特定省份填色，今天我们将继续探索分省市地图的绘制。 本文的所有代码以及数据可以在公众号后台回复 [中国地图绘制] 免费获得。...library(rgdal) library(ggplot2) library(maptools) library(mapproj) library(ggsn) library(readxl) library...然后，使用 left_join() 合并数据。...= `geometry`), color = 'Black',size=2)+ xlab("Long (°E)") + ylab("Lat (°N)") + ##更改图形颜色，不加这个语句使用随机配色...合并数据 小编使用的是 xlsx 格式的数据，因为可以创建多个 sheet，调用起来比较方便。
❝本节来绘制一个简单的绘图案例；暂且称之为轨道图；下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图；关于此图的实践应用以后在做介绍 加载R包 library(tidyverse) library(systemfonts
❝本节来介绍如何使用分面来绘制热图并填充特殊字符，下面通过一个小例子来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) library(ggforce) 数据清洗...❝此处使用case_when来根据数值大小进行特殊字符的转换 ❞ df % mutate( CL_evolution_sign = case_when
❝本节来介绍如何对常见的柱状图稍加改造绘制成一张美观的面积图，下面通过一个小例子来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <-...ggplot(aes(x = year, y = mean_probability, fill = legend_text)) + geom_area(alpha = 0.95)+ # 也可使用...geom_col()来绘制条形图 geom_line(position = "stack", size = 0.1, color = 'gray40') + # 给面积添加灰色轮廓
suppressMessages(library(tidyverse)) ## Warning: package 'tidyverse' was built under R version 4.2.1 改个名字方便使用...element_line(color = "black",size = 1.1) ) fig2a Fig1 最开始想用complexheatmap画，但是发现是长数据，可以直接用ggplot2
tidyverse) library(GGally) library(patchwork) library(ggpubr) # 载入 ggpubr 包，提供了添加统计注释的功能 ggpairs绘制配对关系散点图...ggpairs(iris, columns=1:4, aes(color=Species), upper = "blank") + theme_minimal() # 使用最小主题 iris...`~"), group=1), color="black", label.x.npc = "left") + # 添加统计相关性标签 theme_classic() + # 使用经典主题...= "black", label.x.npc = "left", label.y.npc = "top", size=3) + # 添加统计相关性标签 theme_classic() + # 使用经典主题
欢迎关注R语言数据分析指南 案例图 仿图 绘图思路 ❝此图用R绘制难点有两处 (1)在于绘制连接处并进行渐变色填充 (2)绘制独立的甜甜圈图进行拼图 目前ggplot2 3.5已经能指定为图形进行渐变色填充...❞ 有需要学习数据可视化的朋友，欢迎到小编的「淘宝店铺」 「R语言数据分析指南」下单购买，内容主要包括各种「高分论文的图表分析复现以及一些个性化图表的绘制」均包含数据+代码。...markdown注释文档+文档清单」 library(tidyverse) library(geomtextpath) library(ggnewscale) load("da.Rdata") # 加载数据 绘制旭日图...element_blank(), panel.background =element_blank(), plot.background=element_blank()) 绘制甜甜圈图
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍使用ggplot2绘制多组面积线图来展示趋势变化，下面小编就通过一个案例来进行展示,数据无实际意义仅作图形展示用，希望各位观众老爷能够喜欢。...group 列设为 stock_symbol 的值 stock_symbol = .x # 将 stock_symbol 列设为当前迭代的值 .x ) }) |> # 使用...companies 进行左连接操作 left_join(companies,by="stock_symbol") 数据可视化 df_base |> ggplot() + # 添加线图，使用...列用于区分不同的股票 geom_line(aes(date, close, group = group),alpha = 0.5,size = 0.1,colour = "grey") + # 添加面积图，使用...close, colour = stock_symbol, fill = stock_symbol), prices, alpha = 0.2, size = 0.5) + # 使用
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