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gtsummary|巧合-绘制多种数据汇总表“神器”

晚上想起上午时候提示我没有tbl_summary函数,查到是gtsummary,习惯性看了下包功能,这不是也可以绘制三线? 惊了,于是有了这篇分享。...1 下载R包,数据 使用内置数据集演示 #install.packages("gtsummary") library(gtsummary) #查看内置数据集 head(trial) ?...可以看到连续型变量使用是中位数(四分位数),分类变量使用 个数(比例)。 但是不是缺点什么? 文献中1,是不是会有分组?是不是会有总体描述?是不是会有P值?是不是会有mean(sd) ?...3 模型结果数据 3.1 逻辑回归模型 #构建逻辑回归mod1 <- glm(response ~ trt + age + grade, trial, family = binomial)t1 <-...好了,多谢“巧合”,发现了一个简单实用绘制多种统计方式。

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超强gtSummary ≈ gt + comparegroups ??

gtsummary包是专门用来画表格,高度自定义多种选项,快速绘制发表级表格。可用于总结汇总数据集、多种模型等。 快速绘制描述性统计表格、基线资料(例如医学期刊常见1!) 。...自动检测数据集中连续、多分类和二分类变量,选择合适描述性统计方法,还包括每个变量缺失值。 绘制回归模型结果。...自动识别常见回归模型,如逻辑回归和Cox比例风险回归,会在表格中自动填充适当列标题(即优势比和风险比)。 高度自定义表格。字体字号、增加P值,合并单元格等,通通支持自定义。...library(gtsummary) suppressPackageStartupMessages(library(tidyverse)) 使用自带trial数据集进行演示,这个数据集也是临床中常见数据类型...使用as_gt()函数转换为gt对象后们就可以使用gt包函数了。

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生信爱好者周刊(第 2 期):生信境界与道路

文章 1、在ggplot2散点图中自动添加回归系数或回归方程、R2、P值等 有时候使用ggplot2绘制散点图展示两组变量关系时,同时也做了一些描述二者关系统计,如相关性分析、回归分析等,并期望将相关系数或回归方程...3、gt[14] - 表格制作神器 使用gt包,任何人都可以使用R编程语言制作好看。gt哲学是:我们可以用一组内聚部件来构造各种各样有用。...这包括表头、存根、列标签和跨组列标签、主体和脚。 4、gtExtras[15] gtExtras目标是提供一些额外辅助函数来帮助使用gt创建漂亮。...主题 数据高亮 5、gtsummary[16] - 准备好演示数据总结和分析结果 gtsummary包提供了一种优雅而灵活方法来使用R编程语言创建可发布分析和汇总表。...gtsummary包总结了数据集、回归模型等等,使用了具有高度可定制功能合理默认值。 6、mathpix[17] - 图片转公式神器 好用公式提取工具。支持拷贝到Word和LaTex。

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【神经网络本质是多项回归】Jeff Dean等论文发现逻辑回归和深度学习一样好

---- 新智元报道 来源:Reddit;arXiv 作者:闻菲 【新智元导读】谷歌用深度学习分析电子病例重磅论文给出了一个意外实验结果,DNN与逻辑回归效果一样,引发了热烈讨论。...起因是以色列理工学院工业工程与管理学院助理教授 Uri Shalit 在 Twitter 上发文,指出这篇论文补充材料里,有一处结果非常值得注意:标准化逻辑回归实质上与深度神经网络一样好。 ?...Uri Shalit 表示,他由此得出结论是,在电子病例分析这类任务中,应该选择使用逻辑回归,而不是深度学习,因为前者更加简单,更具可解释性,这些优点要远远胜过深度学习带来微小精度提升。...换句话说,NN 可以被松散地视为多项回归一种。 实验结果多项回归在很多时候都优于神经网络 作者进行了很多实验来比较 PR 与 NN 性能。...在下面的各种结果中,PR 表示多项回归,PCA 表示在生成多项式之前用 90%总方差主成分分析降维。

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手把手教你R语言复现mindfulness_PTSS_COVID19文献结果

研究结果表明:有家人或朋友被诊断出COVID-19参与者在回避行为上得分更高。有家人或朋友被诊断出SARS或H1N1参与者在PTSS总分上得分更高。...文章对上述结论结果数据分析是使用SPSS软件,本教程将使用R语言对文章结果进行整体复现。因为文章没有给出每个维度规则,所以最后R计算得到结果会与文章存在部分偏差。...教程本教程提供了四种不同格式,HTML、PDF、word和epub,方便广大读者阅读。...文章结果 文章结果是由五个表格构成,它们分别是:Table1: Demographic characteristics of the sampleTable2: Analysis of differences...(Table5: Analysis of total, direct and indirect effects of trait mindfulness on PTSS)第7章:总结需要R包 需要使用

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12支持向量机6SVM总结

12.6SVM 总结 推荐使用成熟软件包 用以解决 SVM 最优化问题软件很复杂,且已经有研究者做了很多年数值优化。因此强烈建议使用高优化软件库中一个,而不是尝试自己落实一些框架。...有许多好软件库,NG 用得最多两个是 liblinear 和 libsvm 归一化处理 Note 无论使用使用何种模型进行拟合,原始输入数据都需要进行归一化处理 需要指定参数 即使用高度优化软件包...,即每个模型都把原始样本分为两类 目标类-其他类 逻辑回归和支持向量机 从逻辑回归模型,我们得到了支持向量机模型,在两者之间,我们应该如何选择?...n 为特征数(特征数可指为原始数据中属性值或人为够早特征),m 为训练样本数 如果相较于 m 而言,n 要大许多,即训练集数据量不够支持我们训练一个复杂非线性模型,我们选用逻辑回归模型或者不带核函数支持向量机...如果 n 较小,而 m 较大,例如 n 在 1-1000 之间,而 m 大于 50000,则使用支持向量机会非常慢,解决方案是创造、增加更多特征,然后使用逻辑回归或不带核函数支持向量机。

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腾讯数据科学家手把手教你做用户行为分析(案例:出行选择)

不同家庭会有不同选择,在选择表象下有着相似的决策逻辑。我们尝试置身于这个场景中,在大脑里构建一张类似图1-2打分。...DCM不是单一模型,而是一个模型簇,它包含了一系列应对不同选择场景模型,例如逻辑回归(Logistics Regression,LR)、多项Logit模型(Multinomial Logit Model...04 案例分析:使用逻辑回归分析自驾选择问题 基于前文介绍,相信读者已经迫不及待使用MNL或NL模型进行建模分析了,这里先从LR实操讲起。...LR是目前应用最广泛可解释二分类模型之一,深入了解LR对我们日常工作有很大帮助。 通过对案例数据进行一定处理,可以得到一份满足LR模型要求格式数据。...对于离散变量,我们使用k-1自由度的卡方检验,其中k为离散变量值个数;对于连续变量,比较简单分析方法是直接对单变量进行逻辑回归,查看回归系数显著性,根据AUC分析自变量对y解释能力。

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python数据分析——在python中实现线性回归

有许多可用回归方法。线性回归就是其中之一。而线性回归可能是最重要且使用最广泛回归技术之一。这是最简单回归方法之一。它主要优点之一是线性回归得到结果十分容易解释。...那么回归主要有: 简单线性回归 多元线性回归 多项回归 如何在python中实现线性回归 用到packages NumPy NumPy是Python基础科学软件包,它允许在单维和多维数组上执行许多高性能操作...scikit-learn scikit-learn是在NumPy和其他一些软件包基础上广泛使用Python机器学习库。它提供了预处理数据,减少维数,实现回归,分类,聚类等方法。...建模 接下来步骤就和之前类似了。其实多项回归只是多了个数据转换步骤,因此从某种意义上,多项回归也算是线性回归。...) predicted response: [15.46428571 7.90714286 6.02857143 9.82857143 19.30714286 34.46428571] 那么本次多项回归所有结果都在上面了

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SVMR语言实战

在R中,可以使用e1071软件包所提供各种函数来完成基于支持向量机数据分析与挖掘任务。请在使用相关函数之前,安装并正确引用e1071包。...图2 SVM分类结果使用第一种格式建立模型时,若使用数据中全部特征变量作为模型特征变量时,可以简要地使用“Species~.”中“.”代替全部特征变量。...其中,前三种是针对于字符型结果变量分类方式,其中第三种方式是逻辑判别,即判别结果输出所需判别的样本是否属于该类别;而后两种则是针对数值型结果变量分类方式。...一个经验性结论是,在利用svm()函数建立支持向量机模型时,使用标准化后数据建立模型效果更好。 根据函数第二种使用格式,在针对上述数据建立模型时,首先应该将结果变量和特征变量分别提取出来。...分类回归树算法---CART 11. EAG多目标进化算法 12. 蚁群算法(独辟蹊径进化算法) 13. 逻辑回归(LR)算法 14. 鸟群启发--粒子群算法 15. 模拟退火优化算法 16.

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r语言中对LASSO,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现

它符合线性,逻辑多项式,泊松和Cox回归模型。可以从拟合模型中做出各种预测。它也可以适合多响应线性回归。...glmnet算法采用循环坐标下降法,它连续优化每个参数上目标函数并与其他参数固定,并反复循环直至收敛。该软件包还利用强大规则来有效地限制活动集。...由于高效更新和技术,如热启动和主动集合收敛,我们算法可以非常快地计算解决方案路径。 该代码可以处理稀疏输入矩阵格式,以及系数范围约束。...该软件包还包括用于预测和绘图方法以及执行K倍交叉验证功能。...我们加载一组预先创建数据用于说明。用户可以加载自己数据,也可以使用保存在工作区中数据。

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【机器学习】第二部分上:线性回归

多项回归 什么是多项回归 线性回归适用于数据呈线性分布回归问题.如果数据样本呈明显非线性分布,线性回归模型就不再适用(下图左),而采用多项回归可能更好(下图右).例如: 多项式模型定义 与线性模型相比...,在线性回归模型中添加了新特征值.例如,要预测一栋房屋价格,有 三个特征值,分别表示房子长、、高,则房屋价格可表示为以下线性模型: 对于房屋价格,也可以用房屋体积,而不直接使用 三个特征...以上两个模型可以解释为: 房屋价格是关于长、、高三个特征线性模型 房屋价格是关于体积多项式模型 因此,可以将一元n次多项式变换成n元一次线性模型....多项回归实现 对于一元n次多项式,同样可以利用梯度下降对损失值最小化方法,寻找最优模型参 ​.可以将一元n次多项式,变换成n元一次多项式,求线性回归.以下是一个多项回归实现. # 多项回归示例...: 从逻辑上说,Lasso回归和岭回归都可以理解为通过调整损失函数,减小函数系数,从而避免过于拟合于样本,降低偏差较大样本权重和对模型影响程度.

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r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic Net模型实现

它符合线性,逻辑多项式,泊松和Cox回归模型。可以从拟合模型中做出各种预测。它也可以适合多响应线性回归。...glmnet算法采用循环坐标下降法,它连续优化每个参数上目标函数并与其他参数固定,并反复循环直至收敛。该软件包还利用强大规则来有效地限制活动集。...由于高效更新和技术,如热启动和主动集合收敛,我们算法可以非常快地计算解决方案路径。 该代码可以处理稀疏输入矩阵格式,以及系数范围约束。...该软件包还包括用于预测和绘图方法以及执行K倍交叉验证功能。...我们使用最基本模型glmnet。 fit=glmnet(x,y) “适合”是类一个对象,glmnet它包含拟合模型所有相关信息以供进一步使用。我们不鼓励用户直接提取组件。

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r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现|附代码数据

该算法非常快,并且可以利用输入矩阵中稀疏性 x。它适合线性,逻辑多项式,泊松和Cox回归模型。可以从拟合模型中做出各种预测。 它也可以拟合多元线性回归。...点击标题查阅往期内容 R语言自适应LASSO 多项回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析 01 02 03 04 glmnet 如果我们只是输入对象名称或使用print 函数,则会显示每个步骤路径...显示选定λ最佳值 cvmfit$lambda.min ## [1] 0.04732 cvmfit$lambda.1se ## [1] 0.1317 逻辑回归 当因变量是分类时,逻辑回归是另一个广泛使用模型...如果有两个可能结果,则使用二项式分布,否则使用多项式。 二项式模型 对于二项式模型,假设因变量取值为G = {1,2} 。表示yi = I(gi = 1)。...glmnet 除少数情况外,多项逻辑回归可选参数 与二项式回归基本相似。

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CRC校验FPGA实现

CRC-X,X为几,校验位就是Xbit,即生成多项最高次是几,校验结果就是几bit。以G(x)=x^5+x^3+1为例,其对应二进制为5’b101001,其中1代多项系数。...(并行运算此处不做展开说明,其实并行运算是最复杂,因为需要进行公式推导,但是好在多项式基本都有自己固定运算公式,非常固定,用就好了) 手算CRC 以信息码为[10_1011_1011]2 ,使用下面的生成多项式为例...: G(x)=X^4+x+1 a、首先,把信息位左移4bit,结果为[10_1011_1011_0000]2 ,然后做异或除法运算,关于为什么右移4bit,是因为CRC本质是一个取余运算,余数是最大位...设C0 C1 C2 C3初始值皆为0,信息码为10_1011_1011,将信息码从高位到低位逐次移入逻辑电路,计算CRC检验结果。...+data_valid控制比较好, 因为假设串行数据是不连续使用组合逻辑就容易发生错误 */ crc[0]<=crc[7]^data; crc[1]<=crc[0]^crc[7]^data

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r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现

该算法非常快,并且可以利用输入矩阵中稀疏性 x。它适合线性,逻辑多项式,泊松和Cox回归模型。可以从拟合模型中做出各种预测。它也可以拟合多元线性回归。 glmnet 解决以下问题 ?...显示选定λ最佳值 cvmfit$lambda.min ## [1] 0.04732 cvmfit$lambda.1se ## [1] 0.1317 逻辑回归 当因变量是分类时,逻辑回归是另一个广泛使用模型...如果有两个可能结果,则使用二项式分布,否则使用多项式。 二项式模型 对于二项式模型,假设因变量取值为G = {1,2} 。表示yi = I(gi = 1)。我们建模 ? 可以用以下形式写 ?...惩罚逻辑回归目标函数使用负二项式对数似然 ? 我们算法使用对数似然二次逼近,然后对所得惩罚加权最小二乘问题进行下降。这些构成了内部和外部循环。...glmnet 除少数情况外,多项逻辑回归可选参数 与二项式回归基本相似。

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回归

')#添加纵轴标签 plt.show() 图片 逻辑回归 实现方面,逻辑回归只是对对线性回归计算结果加上了一个Sigmoid函数,将数值结果转化为了0到1之间概率(数值越大,函数越逼近1;数值越小,...#逻辑回归 #例7-5 生成具有两个特征二元分类样本,分类别绘制原始样本集散点图, #使用样本集训练逻辑回归模型,用训练好模型对样本集进行分类,观察分类结果 import numpy as np from...该类将数据集变换为具有高次项特征数据集,将原始问题转化为线性回归问题。 用户再使用线性回归方法对转化后数据集进行训练,从而间接进行多项回归分析。...输出形状为(n_samples,3), 格式为[1, x,x2]数据集。 这时,新数据集将是一个线性回归问题。使用线性回归方法对其拟合,既可以得到回归模型。...使用变换后数据集拟合线性回归模型 #生成均匀分布、排序测试集,排序便于绘制曲线 x_test=np.sort(np.random.uniform(-10,15,100)) #使用拟合多项式模型变换测试集

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十二.机器学习之回归分析万字总结全网首发(线性回归多项回归逻辑回归

我们目的是使最小化,从而最好将样本数据集进行拟合,更好地预测新数据。 多项回归逻辑回归相关知识将在后面介绍。...predict(X) 使用训练得到估计器或模型对输入X数据集进行预测,返回结果为预测值。数据集X通常划分为训练集和测试集。...---- 3.多项回归预测成本和利润 本小节主要讲解多项回归分析实例,分析数据集是17.1提供企业成本和利润数据集。下面直接给出线性回归多项回归分析对比完整代码和详细注释。...下面给详细介绍使用逻辑回归对这个数据集进行分析代码。...---- (4).逻辑回归分析鸢尾花 讲解完线性回归分析之后,那如果用逻辑回归分析结果究竟如何呢?下面开始讲述。

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数据分享|SQL Server、Visual Studio、tableau对信贷风险数据ETL分析、数据立方体构建可视化

数据浏览: 数据清洗 a) 缺失值删除 由于数据量巨大,且数据中部分行数据值不全,故对数据不全数据进行删除。 b) 格式转换。 i. 日期转换:通过 SQL 语言进行文本格式转换 ii....依次进行贷款、借贷者、位置、时间ETL 通过 multidimensional 和 analysis service 进行数据立方体构建 i....Bagging,增强树 R语言用逻辑回归、决策树和随机森林对信贷数据集进行分类预测 spss modeler用决策树神经网络预测ST股票 R语言中使用线性模型、回归决策树自动组合特征因子水平...GAM ,样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类 R语言ISLR工资数据进行多项回归和样条回归分析 R语言中多项回归、局部回归、核平滑和平滑样条回归模型 R语言用泊松Poisson回归、GAM...和xgboost销售量时间序列建模预测分析 R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析 R语言用主成分PCA、 逻辑回归、决策树、随机森林分析心脏病数据并高维可视化

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