R语言的综合应用tidyverse：集成化R包转换-可视化-模型1 字符串"stringr"str_length()str_split()str_sub()1.1 检测字符串长度str.length()...#管道符号快捷键“Ctrl”+“shift”+“M”3 条件和循环*3.1 if语句if(1){ }1：为一个逻辑值，不能为多个逻辑值组成的向量#若为T，则继续执行后续语句；若为T，则不继续执行长脚本管理方式...*1if(F){...} #{}内所有代码被跳过if(T){...} #{}内代码执行#针对限速步骤可以将限速步骤保存为.Rdata，之后加载该文件即可#下载数据的代码，可保留但不反复运行*2分成多个脚本...0.365#输出为列表，包含四个向量5 两个数据框的连接5.1 交集inner_join()取交集5.2 全连接full_join()#保留全部主要信息5.3 左连接left_join()#保留左表主要信息...5.4 右连接right_join()#保留右表主要信息引用自生信技能树
undefined表格文件需要赋值，读取参数不同导致读取结果不同，不能在后续代码中同等处理。Rdata可以保存多个变量，下次使用只需要一次load可以的到多个数据。...2.3 if条件语句控制代码运行elseif(F){}啥都不敢if(F){}elese{}#运行else后的{}中的代码2.4 ifelse函数只有3个参数ifelse(x,yes,no)x：逻辑或逻辑值向量...加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集load("test1.Rdata")library(dplyr)merge1 <- merge(dat,ids,...生信实战中R语言的几个重点函数【小洁老师语录】编程能力，就是解决问题的能力，也是变优秀的能力R语言基础入门课程-到此结束7. 数据挖掘生信技能树小洁老师7.1 为什么数据挖掘？...表达矩阵：一行是一个基因在所有样品里的表达，一列是一个样本里所有基因的表达。在表达矩阵中，寻找在不同组有表达差异的基因。
###没有赋值，所以修改后的test还是5列 图片 2.4 连续的步骤 select() 筛选列 filter() 筛选行 2.4.1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...，以右边的表为标准进行连接。...）对左边的表取子集，取右边表中存在的子集 anti_join(test1,test2,by="name") ###反连接，左边表里在右边表里没有的会被留下来。...) = x$ID # 2.一些搞文件的函数---- dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt...，按共同的列取交集 x=merge(dat,ids,by = "probe_id") x2=inner_join(dat,ids,by = "probe_id") # 1.读取group.csv,从第二列中提取圈出来的信息
-（2）列表使用不方便——simplify = T简化结果，简化成矩阵 -（3）注意：之前提到过，矩阵的某一列不能单独转换数据类型，需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型；或者把这列单独提取出来再转换其数据类型...；管道符号永远在中间，后面一定有东西； # 连续的步骤 # 1.多次赋值，产生多个中间的变量 x1 = select(iris,-5) #取iris除了第5列的所有列 x2 = as.matrix(x1...if语句控制一段代码的运行；且使用if语句，后面大括号里的代码可以折叠； 实例：用if(F){}注释掉暂时不想运行但以后还可能运行的代码（运行时把F改为T即可）；直接删掉的话下次想用就得重新写；用#号大段大段注释不能折叠...★★ 1. iner_join 两个表格按照共同的一列取交集，连接的结果是二者交集 2.left_join 以左边的表格为主，左右都有的连接保留，右边没有的用NA填充 3. right_join 以右边的表格为主...加载test1.Rdata，将两个数据框按照probe_id列连接在一起，按共同列取交集 #2.
，传到第一参数位置条件语句if(一个逻辑值，不可以是多个逻辑值组成的向量){代码}(1)只有if没有else，那么条件是FALSE时就什么都不做i = -1if (i0){+ print('+')+ } else if (i==0) {+ print('0')+...lapply(list, FUN, …)lapply(list, FUN, …) ：对列表/向量中的每个元素实施相同的操作两个数据框连接inner_join():交集full_join(): 全连接left_join...()：左连接right_join()：右连接表达矩阵画箱线图一些好用的函数 1.match-----load("matchtest.Rdata")xy## 如何把y的列名正确替换为x里面的ID？...ID# 2.一些搞文件的函数----dir() # 列出工作目录下的文件dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件file.create("douhua.txt") #用代码创建文件
因为没有赋值 > test$new=test$Sepal.Length*test$Sepal.Width #以这种方式才是真正的添加新的一列 -------注意：R语言中的修改，都要赋值，没有赋值就没有发生过...将两个数据框按照probe_id列连接在一起 练习7-2 1.读取group.csv,从第二列中提取圈出来的信息 > a=read.csv("...../R_04/group.csv") > a ID title 1 GSM1052615 A375 cells 24h Control...#每次都在列表里面加一个元素 } result #一列表的形式储存了结果 [[1]] [1] 5 5 [[2]] [1] 6 11 [[3]] [1] 0 11 [[4]] [1] 3 14...；cbind是按列拼接起来（向量长度得是相同的） 长脚本管理方式 if(T){} #运行{}中的代码;可折叠 if(F){} #跳过{}中的代码 专题四 表达矩阵画箱线图 表达矩阵 set.seed(10086
本文开始介绍sql2java-excel的使用spring 支持的部分 Spring Web导出 快速入门 以下是基于Spring Web的数据库导出最简示例： import static gu.sql2java.Managers.instanceOf...SELECT WHERE条件查询语句导出数据 基于上面的exportDevices服务方法改造示例如下： /** * 设备表导出EXCEL * 查询参数说明: * ...定义在类上，代表定义类中成员的导出配置,可以定义多个。 定义在类成员(Field)上代表定义当前成员的导出配置,只能定义一个成员字段配置注解，可以定义多个子成员字段配置注解...., 单位为字符 maxWidth 32 导出时在excel中每个列的最大宽度, 单位为字符 defaultValue 当值为空时,字段的默认值 includeColumns {} 字段输出白名单,在此名单中的字段会被输出...而color,filleColor字段在三个位置定义的注解中并不冲突，所以遵循合并原则 关于sql2java-excel的入门使用说明参见上一篇博客： 《sql2java-excel(一):基于apache
");k2 ifelse(k2,"normal","tumor") 图片 多个条件的if判断 #### (3)多个条件 i = 0 if (i>0){ print('+') } else if (i...list，使用下标循环，可以将每次循环的结果都保存到列表中 ## cbind 按列拼接 a = rnorm(10) b = 1:10 cbind(a,b) ##do.call() 函数是对列表 list...操作的函数，批量操作 图片 图片 分批次将运行结果保存为R.data格式便于管理数据 图片 大段代码暂时不运行可以进行折叠，并加入一个if 判断或者注释掉 表达矩阵箱线图 表达矩阵 R 语言作图要求将宽数据的表达矩阵转变成长数据后昨天...，以左侧的表的行为准构成新的数据框（第一个写的数据框），右表中多余的数据舍去，没有的数据显示缺失值 right_join(test1,test2,by="name") ##右连接，以右侧的表的行为准构成新的数据框...（第二个写的数据框），左表中多余的数据舍去 full_join(test1,test2,by="name") ##取全集 semi_join(test1,test2,by="name") ##半连接，对左边表格取在右边表格住存在的子集
多次赋值，产生多个中间的变量x1 = select(iris,-5)x2 = as.matrix(x1)x3 = head(x2,50)pheatmap::pheatmap(x3) 2....if(一个逻辑值){ } 如果()中的条件T成立，{}中的函数被运行，如果F不成立，则不执行if条件语句：如果...就...否则...if(一个逻辑值){ CODE1} else{CODE2...}重点：ifelse函数ifelse(x,yes,no)x：逻辑值或逻辑值向量yes：逻辑值为TRUE时的返回值no：逻辑值为FASLE时的返回值多个条件ifelse(i>0,"+",ifelse(i<...) #对1:4中的每个元素进行rnorm操作5.数据框的连接inner_join #取交集连接full_join #全连接left_join(test1,test2,by="name") #左连接...，左边表中的name为连接标准right_join(test1,test2,by="name") #右连接，右边表中的name为连接标准
}重点 ifelse函数ifelse(x,yes,no)x:逻辑值或者逻辑值向量yes:逻辑值为TRUE时的返回值no:逻辑值为FALSE时的返回值ifelse函数支持单个逻辑值，也支持多个逻辑值组成的向量...,"normal");k2ifelse(k2,"normal","tumor")ifelse()可以满足多个条件的嵌套i = 0if (i>0){ print('+')} else if (i==0)...{ print('0')} else if (i0,"+",ifelse(i<0,"-","0"))3.2 for循环语句3.2.1 对向量中的每一个元素进行循环对...，按列拼接成为一个矩阵 do.call完成批量操作4 表达矩阵画箱线图4.1 表达矩阵的概念基因表达的数据通常使用表达矩阵来表示其中矩阵的行代表某个基因在不同样本（不同处理，或时间点等）中的表达水平列表示某个样本中各个基因的表达水平...，其实是对左边的数据框取子集7 一些顶呱呱的函数7.1 match()7.2 一些处理文件的函数dir() # 列出工作目录下的文件dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件
内联接使用比较运算符根据每个表共有的列的值匹配两个表中的行。例如，检索 students和courses表中学生标识号相同的所有行。 2、外联接。...FROM 子句中的表或视图可通过内联接或完整外部联接按任意顺序指定；但是，用左或右向外联接指定表或视图时，表或视图的顺序很重要。有关使用左或右向外联接排列表的更多信息，请参见使用外联接。 ...自然连接无需指定连接列，SQL会检查两个表中是否相同名称的列，且假设他们在连接条件中使用，并且在连接条件中仅包含一个连接列。...下面总结一下两表连接查询选择方式的依据： 1、 查两表关联列相等的数据用内连接。 2、 Col_L是Col_R的子集时用右外连接。 3、 Col_R是Col_L的子集时用左外连接。...4、 Col_R和Col_L彼此有交集但彼此互不为子集时候用全外。 5、 求差操作的时候用联合查询。 多个表查询的时候，这些不同的连接类型可以写到一块。
定义基本表 CREATE TABLE （ [ ] [， [ ] ] … [，...] ）； 如果完整性约束条件涉及到该表的多个属性列，则必须定义在表级上，否则既可以定义在列级也可以定义在表级。...> ] ] [ ORDER BY [ ASC|DESC ] ]； 单表查询 选择表中的若干列 选择表中的若干元组 ORDER BY子句 可以按一个或多个属性列排序 升序...对多个属性构成的码只有一种说明方法 定义为表级约束条件 插入或对主码列进行更新操作时，RDBMS按照实体完整性规则自动进行检查。...短语］ 使用ALTER TABLE语句修改表中的完整性限制 SQL支持域的概念，并可以用CREATE DOMAIN语句建立一个域以及该域应该满足的完整性约束条件。
索引是对数据库表中一列或多列值进行排序的 一种结构。类似书籍的目录 #参照完整性：参照的完整性要求关系中不允许引用不存在的实体。...*查询语句中可以使用多个表，表之间使用逗号分隔，并使用where语句是定查询条件 *select命令可以读取一条或多条记录 *可以使用（*）来代替其他字段，select语句会返回表的所有字段数据 *可以使用...操作符用于连接两个以上的select语句的结果组合到一个结果集合中。...注：#在MySQL中只有使用了innodb数据库引擎的数据库或表才支持事务 #事务处理可以用来维护数据库的完整性，保证成批的SQL语句要么全部执行，要么全部不执 行 ...单列索引：一个索引只包含一个列，一个表可以有多个单列索引，但不是组合索引。
R语言中，select函数用于选择数据框中的列，可以使用列名或者向量来指定要选择的列。...例如，若要选择数据框df中的列x和y，可以使用以下代码：library(dplyr)，df 10且y 10 & y < 5)，与select函数类似，filter也可以使用多个逻辑条件组合...# [7] "5_隐式循环.R" "6_两个数据框的连接.R" ## [9] "7_一些顶呱呱的函数.R" "8_exercise.R"...## [5] "4_表达矩阵画箱线图.R" "5_隐式循环.R" ## [7] "6_两个数据框的连接.R" "7_一些顶呱呱的函数.R" ## [9] "8_exercise.R
1.连接层(Connectors) 最上层是一些客户端和连接服务，包含本地socket通信和大多数基于客户端/服务端工具实现的类似于tcp/ip的通信。...主要完成一些类似于连接处理、授权认证、及相关的安全方案。在该层上引入了线程池的概念，为通过认证安全接入的客户端提供线程。同样在该层上可以实现基于SSL的安全链接。...2、索引分类 – 聚集索引和非聚集索引 Ⅰ、单值索引：即一个索引只包含单个列，一个表可以有多个单列索引； Ⅱ、唯一索引：索引列的值必须唯一，但允许有空值； Ⅲ、复合索引：即一个索引包含多个列...如果建立索引，不但不会提高查询效率，反而会严重降低更新速度。 （5）当唯一性是某种数据本身的特征时，指定唯一索引。使用唯一索引能够确保定义的列的数据完整性，提高查询速度。 ...Ⅴ、possible_keys 显示可能应用在这张表中的索引，一个或多个。查询涉及到的字段上若存在索引，则该索引将被列出， 但不一定被查询实际使用。 Ⅵ、key 实际使用的索引。
：也称记录，行，对应于数据库数据中的条记录即数据 -- 属性：关系表中一列即代表一个属性，属性只能有一个属性名，而关系可以有多个属性，一般在表中称为字段 -- 域(domain)：即数据类型的取值范围...，候选键只有一个属性或者全部属性才能构成一个候选键 6.关系数据库的数据完整性 -- 实体完整性 --即主键值唯一且不能为空值 -- 参照完整性 --一个表的外键值要么为空要么就是其他表中的某一个主键值...考虑更一般的情况 R(X,Y)和S(Y,Z) $R\div S$即返回X的属性列，即与S中Y都相同的元组的X属性组的取值 --总结一下，除法的运算，主要是考虑到一种需求，如果我们想要某个属性组中的值与给定表中的相同的元组...alter table student add check(age between 15 and 30) check 约束中可以使用系统自带的函数 但不能使用子查询 不能使用其他表的字段 一般采用and...，数据都在视图sql语句中的基表当中 --故视图在下列情况下不能被更新 1.使用分组 2.使用连接 3.使用子查询 4.使用并操作 5.使用聚集函数 6.使用distinct 7.使用计算列 --这些数据本质上都是由基表计算出来的
自然连接无需指定连接列，SQL会检查两个表中是否相同名称的列，且假设他们在连接条件中使用，并且在连接条件中仅包含一个连接列。...下面总结一下两表连接查询选择方式的依据： 1、 查两表关联列相等的数据用内连接。 2、 Col_L是Col_R的子集时用右外连接。 3、 Col_R是Col_L的子集时用左外连接。...4、 Col_R和Col_L彼此有交集但彼此互不为子集时候用全外。 5、 求差操作的时候用联合查询。 多个表查询的时候，这些不同的连接类型可以写到一块。...31.使用基于游标的方法或临时表方法之前，应先寻找基于集的解决方案来解决问题，基于集的方法通常更有效。 32.尽量避免大事务操作，提高系统并发能力。...通过存储过程可以使相关的动作在一起发生，从而可以维护数据库的完整性。 6. 增强安全性。 a) 通过向用户授予对存储过程（而不是基于表）的访问权限，它们可以提供对特定数据的访问。
如果子句结果作为一个集合使用，即where子句中是in操作，则结果可以是一个字段的多个记录。 查询过程 通过之前的学习看到，一个完整的select语句内容是很丰富的。...having语句存在弥补了where关键字不能与聚合函数联合使用的不足,where只能操作表中实际存在的字段。...索引操作 ⭐️概述 索引是对数据库表中一列或多列的值进行排序的一种结构，使用索引可快速访问数据库表中的特定信息。能够加快数据检索速度,提高查找效率。...注：约束是一种限制，它通过对表的行或列的数据做出限制，来确保表的数据的完整性、关联性 外键约束分主表和从表：若同一个数据库中，B表的外键与A表的主键相对应，则A表为主表，B表为从表。...如果多个表存在一定关联关系，可以多表在一起进行查询操作，其实表的关联整理与外键约束之间并没有必然联系，但是基于外键约束设计的具有关联性的表往往会更多使用关联查询查找数据。
(Sepal.Length)x定义为iris数据集——筛选出数据集中Sepal.Width大于3的值——将这些值的Sepal.Length和Sepal.Width列输出——从小到大排序三、条件语句和循环语句专题...1）if 条件语句基本格式：if (i>1) {print("+")else{print( "-")}2)‼️重点函数：ifelse（）ifelse(x,yes,no)x:逻辑值或逻辑向量yes：逻辑值为...>0){print("+")}else if (i==o) {print("0")else if (i0,...Petal.Length Petal.Width 4.9500000 3.3833333 1.4500000 0.2333333 2)对列表中的元素进行操作的 lapply（...blood_type1 jimmy A2 nicker B3 Damon O6）anti_join( ) 反连接 （输出前一个数据中除外共同列名的数据
5.4 控制流 语句（statement）是一条单独的R语句或一组复合语句（包含在花括号{ } 中的一组R语 句，使用分号分隔）； 条件（cond）是一条最终被解析为真（TRUE）或假（FALSE...：ifelse(cond,statement1,statement2) #cond=TRUE 执行statement1；FALSE时执行statement2 3.switch结构 根据一个表达式的值选择语句执行...5.6整合与重组 （aggregate & reshape） 5.6.1转置 使用函数t()即可对一个矩阵或数据框进行转置。对于后者，行名将成为变量（列）名。...5.6.2整合数据 在R中使用一个或多个by变量和一个预先定义好的函数来折叠（collapse）数据是比较容易的。...例： Library（reshape） Md<-melt(mydata,id=(c(“id”,””time”)))) 2、 重铸 cast()函数读取已融合的数据，并使用你提供的公式和一个（可选的）用于整合数据的函数将其重塑
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