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如何使用Python装饰器创建具有实例化时间变量函数方法

1、问题背景在Python,我们可以使用装饰器来修改函数或方法行为,但当装饰器需要使用一个在实例化时创建对象时,事情就会变得复杂。...例如,我们想要创建一个装饰器,可以创建一个函数/方法来使用对象obj。如果被装饰对象是一个函数,那么obj必须在函数创建时被实例化。...如果被装饰对象是一个方法,那么必须为类每个实例实例化一个obj,并将其绑定到该实例。2、解决方案我们可以使用以下方法来解决这个问题:使用inspect模块来获取被装饰对象签名。...如果被装饰对象是一个方法,则将obj绑定到self。如果被装饰对象是一个函数,则实例化obj。返回一个函数/方法,该函数/方法使用obj。...然后,dec装饰器会返回一个函数/方法,该函数/方法使用obj。请注意,这种解决方案只适用于对象obj在实例化时创建情况。如果obj需要在其他时间创建,那么您需要修改此解决方案以适应您具体情况。

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生信代码:数据处理( tidyverse包)

tidyverse 包是 Hadley Wickham 及团队集大成之作,是专为数据科学而开发一系列包合集, 基于整洁数据,提供了一致底层设计、语法、数据结构,包括数据导入,数据规整,数据处理,...在Rstudio中加载tidyverse包,可以看到该包下有8个子包,著名ggplot2包即是其中一个子集,我们先着重讲一下数据处理有关包——dplyr包。...1 mutate() mutate()与基础函数transform()相似,都可以添加一列,但是允许引用刚刚创建列: mydata <- tibble(x1=c(2,2,6,4),...) sd_english=sd(score) ) ##summarize返回一个数据框,如果后续要使用到,需要保存下来 5 arrange() R base...包涉及到排序包括 sort(),rank(),order(),而在dplyr包与排序相关是arrange()包,默认是从高到低进行排序,如果变换排序顺序则可以使用-(变量)或者desc(变量)。

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

数据集如果用于统计与绘图,需要满足一定格式要求,(Wickham, 2014) 称之为 整洁数据 (tidy data),基本要求是每行一个观测,每列一个变量,每个单元格恰好有一个数据值。...,后续参数是条件,这些条件是需要同时满足,另外,条件取 缺失值观测自动放弃,这一点与直接在数据框行下标中用逻辑下标有所不同,逻辑下标中有缺失值会在结果 产生缺失值。...2.8 mutate 可以为数据框计算变量,返回含有变量以及原变量数据框: mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) > head(test,...2.10 表格拆分与合并 将同一列内容分为两列内容。或将两列内容合并为同一列内容。 首先还是可以创建一个数据框。...对于待分离对象(col),不必加上引号;但对于即将创建列(into),需要使用引号,由于是两列,这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。

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「R」dplyr 列式计算

这使 「dplyr」 更容易使用(因为需要记住函数更少),也使我们更容易实现动词(因为我们只需要实现一个函数,而不是四个)。..._at() 函数是 「dplyr」 唯一你需要手动引用变量地方,这让它们比较奇怪且难以记忆。 为什么过了这么久才发现 across()?...它们已经有选择语义,所以通常以与 across() 不同方式使用,我们需要使用 rename_with() 代替。...现在,across() 等价于 all_vars(),然而没有 any_vars() 直接替代品,不过你可以自己创建一个: df <- tibble(x = c("a", "b"), y = c(1,...我们希望大家不会对这种行为感到惊讶: df <- tibble(x = 2, y = 4, z = 8) df %>% mutate_all(~ .x / y) #> # A tibble: 1 x

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R语言之 dplyr 包

其中结果变量 bwt 是新生儿体重(单位:g),变量 low 是将 bwt 取值以 2500g 为分点转换成一个二分类变量。...1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行 函数 filter() 可以基于观测值筛选数据框一个子集。第一个参数是数据框名,第二个参数以及随后参数是用来筛选数据框表达式。...4.使用 mutate( ) 添加变量 函数 mutate( ) 用于在数据框创建变量。...# 当然如果想要用变量替换原来变量,只需把变量命名为原来变量名: mutate(birthwt, lwt.kg = lwt*0.4536) 5.使用 summarise( ) 计算统计量 函数...相对于传统数据框,tibble 在很多方面具有优势,感兴趣读者可以参阅函数 tibble( ) 帮助文档。

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R tips:使用!!来增加dplyr可操作性

AST元素要么是Symbol,要么是常量,Symbol包括函数和变量。 比如对于语句:f(x, "y", 1),它AST如下图所示,其中f、x是Symbol,”y"、1是常量。 ?...一个代码在R console是直接运行到结束,如果想要获得其中间态:语句,可以使用expr函数来捕获它。...在mutate完成变量编程 假如想要在mutate使用变量变量进行设置,其结果并不会如愿,比如,将变量名var_name赋值为“gear_new",使用var_name进行mutate操作...告诉mutate,先对var_name求值,然后再赋值。这里有一个小改动,由于var_name求值后是一个Symbol,在baseR是无法将数据赋值给Symbol,因此需要将=替换为:=。...,可能更倾向于将四个变量放置到同一个数据框,可以如下操作: ### 添加函数 mutate_news <- function(.data, .vars) { data <- enexpr(

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R语言中生存分析Survival analysis晚期肺癌患者4例

第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量...我通常会自己做图,首先创建cuminc拟合结果整洁数据集,然后再绘制结果。

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R语言中生存分析Survival analysis晚期肺癌患者4例

第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量...我通常会自己做图,首先创建cuminc拟合结果整洁数据集,然后再绘制结果。

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「R」Shiny:案例研究:急诊室受伤情况分析

后台机器人关了,没时间搞懂用法,反而是一种干扰,如果之前有打扰到读者,抱歉抱歉~ 在之前推文中我们学习了一堆知识与概念,为了帮助大家吸收,接下来我们将一起通过创建一个探究有趣数据集 Shiny...这是一种合理通用模式:我们可以在数据分析创建变量,以将分析分解为多个步骤,并避免多次重新计算,而响应式表达式在 Shiny 应用程序扮演相同角色。...在这里,我选择使用 selectInput(),因为它可以使两个状态都明确显示,并且将来可以轻松添加状态: fluidRow( column(8, selectInput("code...在之前 R 代码,我们一次采样了多个叙述,但没有理由在可以进行交互式浏览应用中进行该操作。 解决方案分为两部分。首先,我们在 UI 底部添加一个行。...我们使用一个动作按钮来触发一个叙述故事,然后将叙述内容放入 textOutput() : fluidRow( column(2, actionButton("story", "Tell

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【视频】R语言生存分析原理与晚期肺癌患者分析案例|数据分享|附代码数据

在数学上它可以由以下公式表示  其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。 我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量

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【视频】R语言生存分析原理与晚期肺癌患者分析案例|数据分享

在数学上它可以由以下公式表示 其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。 我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量

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在数学上它可以由以下公式表示  其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。 我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量

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在数学上它可以由以下公式表示  其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。 我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量

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非线性回归nls探索分析河流阶段性流量数据和评级曲线、流量预测可视化

使用流域面积比,通过将面积比与日流量相乘,日流量从一个流域转移到另一个流域: 其中, 是预测盆地 y 和时间 t 流量, 是测量盆地 x 和时间 tt 处流量,和 是盆地面积比...但是,如果主要输出包括每日流量估计,则具有具有相同流量超出概率时间候选量具更为重要。 基于经验回归方法需要一段时间测量流量和一些预测变量来估计径流因变量。...## 制作要导入文件列表 list.files(path = here("Data ##创建一个空白tibble来填充 tibble() ## 遍历文件路径以读取每个文件...## 制作要导入文件列表 file_paths <- paste0(he ".csv")) ##创建一个空白tibble来填充 iq <- tibble() ## 遍历文件路径以读取每个文件 for...nRMSE 是一个基于百分比指标,用于描述预测和测量排放值之间差异: 其中 其中 Qt 是在时间 t 观察到流量, 是 t 时刻估计排放量,n是样本数, 和 是观察到最大和最小排放量

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RNA-seq 详细教程:可视化(12)

在本课,我们将让您开始使用探索差异基因表达数据时常用一些基本和更高级图,但是,其中许多图也有助于可视化其他类型数据。...我们将使用我们在前面的课程创建三个不同数据对象:样本元数据(数据框):meta每个样本每个基因归一化表达数据(矩阵):normalized_counts上一课中生成 DESeq2 结果...Tibble 版本:res_tableOE_tb 和 res_tableKD_tb首先,让我们从数据框创建一个元数据 tibble(不要丢失行名!)...ggplot2 绘制单个基因表达如果您想更改此图外观,我们可以将 plotCounts() 输出保存到指定 returnData=TRUE 参数变量,然后使用 ggplot():# Save...,我们可以在其中指定我们刚刚创建基因标签列。

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RNA-seq 详细教程:可视化(12)

在本课,我们将让您开始使用探索差异基因表达数据时常用一些基本和更高级图,但是,其中许多图也有助于可视化其他类型数据。...我们将使用我们在前面的课程创建三个不同数据对象: 样本元数据(数据框):meta 每个样本每个基因归一化表达数据(矩阵):normalized_counts 上一课中生成 DESeq2 结果...Tibble 版本:res_tableOE_tb 和 res_tableKD_tb 首先,让我们从数据框创建一个元数据 tibble(不要丢失行名!)...ggplot2 绘制单个基因表达 如果您想更改此图外观,我们可以将 plotCounts() 输出保存到指定 returnData=TRUE 参数变量,然后使用 ggplot(): # Save...,我们可以在其中指定我们刚刚创建基因标签列。

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在数学上它可以由以下公式表示 其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致时间相关协变量

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在数学上它可以由以下公式表示  其中 S(t) 是一个生存函数,其中 T 是一个连续随机变量,是一个事件时间。F(t) 是区间[0,∞) 上累积分布函数。 我们也可以用风险函数来写生存函数。...第一步是确保将这些格式设置为R日期。 让我们创建一个示例数据集,其中sx_date包含手术日期和last_fup_date上次随访日期变量。...我们可以使用coxph函数拟合生存数据回归模型,该函数Surv在左侧使用一个对象,而在右侧具有用于回归公式标准语法R。...BMT数据没有ID变量,这是创建特殊数据集所必需,因此请创建一个名为变量my_id。 将tmerge函数与event和函数一起使用tdc可创建特殊数据集。...tmerge 为每个患者不同协变量创建一个具有多个时间间隔长数据集 event 创建事件指示器,以与新创建时间间隔一致 tdc 创建与时间相关变量指标,以与新创建时间间隔一致 时间相关协变量

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