哈喽,我是学习生物信息学的阿榜!非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记,将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误,欢迎指正。让我们一起加油,一起学习进步鸭? 这份学习目录可以
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接,其实是对左边的数据框取子集
博客原文:https://suzan.rbind.io/2018/01/dplyr-tutorial-1/ 作者:Suzan Baert
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x)#检测字符串内的字符数,空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")str_split(y," ")str_split(y,"
写了一个月的博客,忽然感觉Markdown编辑器比较好用,于是就下载了一个本地的Markdown编辑软件学习了一下,刚好软件里自带了一篇英文的指示文档,顺便翻译了一下,通过这个过程也大致熟悉了Markdown语法,以后都会用Markdown来写文章了。 通过Markdown编辑器发布了几篇博客,发现以下几个标签比较常用: 标题标签 引用标签 嵌入代码标签 url标签 图片标签 都整理在正文里了。 本篇文章的Markdown文件我也放到了github上,地址在这里,里面也放了mac版的MWeb编辑器可供下载。
一、玩转字符串 stringr包 图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数 图片 图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_sp
[1] "The birch canoe slid on the smooth planks."
4月4日起,腾讯云容器团队将于每周三,推出从0到1—K8S技术培训,K8S线上实战课堂!
关于数据中台的概念定义,业内有各种各样的版本,尤其是涉及数据中台与数据仓库、数据平台等相关概念的差异一直争议不断,可谓一百个人眼中,就有一百个数据中台,千百万人眼中,就有千百万个数据中台。关于概念之争论,笔者无意逐一罗列,更无意参与其中,而是希望从工程实践者的视角,提供一种全新的关于数据中台定义的思考逻辑。本章内容围绕数据中台的定义,采用两种方法,三个视角,给大家阐述,在工程实践者的眼中,数据中台的概念定义。
个人近期做了一个WordPress站点,目前处于内测阶段,虽然公网还没部署起来,但是先在这学习整理一下安全防护的问题。
大学时的一道数学题 我大学的专业是数学。有一次,教授给出了《波斯公主选驸马》题「1」,如下: 波斯公主到了适婚年龄,要选驸马。候选男子100名,都是公主没有见过的。百人以随机顺序,从公主面前逐一经过。每当一位男子在公主面前经过时,公主要么选他为驸马,要么不选。如果选他,其余那些还没有登场的男子就都遣散回家,选驸马的活动也 over 了。如果不选,当下这名男子就离开,也就是 pass 掉此人,下一人登场。被pass 掉的,公主不可以反悔再从选。规则是,公主必须在这百人中选出一人做驸马,也就是说,如果前99
我大学的专业是数学。有一次,教授给出了《波斯公主选驸马》题「1」,如下: 波斯公主到了适婚年龄,要选驸马。候选男子100名,都是公主没有见过的。百人以随机顺序,从公主面前逐一经过。每当一位男子在公主面前经过时,公主要么选他为驸马,要么不选。如果选他,其余那些还没有登场的男子就都遣散回家,选驸马的活动也 over 了。如果不选,当下这名男子就离开,也就是 pass 掉此人,下一人登场。被pass 掉的,公主不可以反悔再从选。规则是,公主必须在这百人中选出一人做驸马,也就是说,如果前99人公主都看不中的话,
大学时的一道数学题 我大学的专业是数学。有一次,教授给出了《波斯公主选驸马》题「1」,如下: 波斯公主到了适婚年龄,要选驸马。候选男子100名,都是公主没有见过的。百人以随机顺序,从公主面前逐一经过。 每当一位男子在公主面前经过时,公主要么选他为驸马,要么不选。如果选他,其余那些还没有登场的男子就都遣散回家,选驸马的活动也 over 了。如果不选,当下这名男子就离开,也就是 pass 掉此人,下一人登场。被 pass 掉的,公主不可以反悔再从选。 规则是,公主必须在这百人中选出一人做驸马。也就是说,如果前9
i :代称,比如第一次循环则代表in后面向量的第一个元素;第二次则为第二个元素,直到完成in后面向量里所有元素的循环为止。如in后面的向量有8个元素,则8次循环。
y4 <- filter(deg, a>1 & b < 0.05);table(y4)
-(3)注意:之前提到过,矩阵的某一列不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型;或者把这列单独提取出来再转换其数据类型;
str_detect(x,"h")##是否含有关键词h,生成与X长度相等的逻辑值向量,可用于向量取子集;
关系正确返回TRUE 否则FALSE== 相等 != 不相等>大于< 小于 ps:字母多的字符串比少的大
碎碎念:这个没啥好仔细展示的,含义也很直观,主要是要记住有这个函数,等需要用的时候回来找
图片 专题1 玩转字符串 图片 检测字符串长度 代码1 str_length(x) if(!require(stringr))install.packages('stringr') library(stringr) x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] 42 ### 1.检测字符串长度,包含空格和符号 le
这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。
step1 对matrix进行转置:使gene名变为列名,将样本名转化为data.frame中的第一列
问:对于码农来说,有哪些可以提高开发效率的技巧? 答:Ctrl+C、Ctrl+V。 (图片来源:知乎) AI科技评论发现:近日,麻省理工学院计算机科学与人工智能实验室(Computer Science
谁说程序员一定要熬夜加班 谁说程序员周末经常会被召唤回公司改bug 程序员,或者即将成为程序员的小伙伴们 可以浏览以下7条编程小贴士 没准儿能让咱们早下班个。。。 5分钟嘛 1 编程之前想一想 用10
每个研究领域都有自己语言和思考方式。经济学家也没有什么不同。供给、需求、弹性、比较优势、消费者剩余价值和无畏损失-- 这些术语是经济学家语言的一部分。
clusterProler包可以进行富集分析和可视化,对于富集结果它有一个goplot的绘图类型,用于绘制显著富集通路的有向无环图(DAG)。如下图所示的一个goplot是根据clusterProfiler的自带数据绘制,goplot可以展示富集通路的父通路,并最终定位到了cellular_component(CC)上(这是自然,因为就是进行的CC通路富集)。
我们不建议使用这种方式,因为一个无效测量不代表所有测量都是无效的。此外,如果数据质量不高,若对每个变量都采取这种做法,那么你最后可能会发现数据已经所剩无几!
·上下五条线的意思 中间的又黑又粗的—中位数;上下两条线是最大值和最小值;方框的上下两条线是75%和25%(四分位数);在外面的点-离群点
数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列
arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 desc()
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表,但是列表不能进行计算,对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
例如 y=c("nihaoa 11","niyehaoa 22","zhangsongwen 33")
梯度下降法是目前神经网络训练过程中最为核心的算法之一,配合链式求导可实现误差在神经网络中的反向传播,更新参数,优化模型。由于大部分深度学习框架事先将其进行了封装,使其使用起来变得相当方便。
GEO数据挖掘—2 四、代码分析流程 1. 下载数据并从中提取有用信息 gse_number = "GSE56649" eSet <- getGEO(gse_number, destdir = '.', getGPL = F) #(1)提取表达矩阵exp exp <- exprs(eSet) dim(exp) exp[1:4,1:4] 关于表达矩阵里的负值 取过log,有负值 —— 正常 没取过log,有负值 ——错误数据 有一半负值 ——做了标准化 获取实验分组和探针注释 # 生成Grou
ctrl+shift+m,把上一个运算的结果输入为下一个函数的第一个参数,可以省略很多中间变量
⚠️注意:str_spilt的第二个参数,写你想分割的符号,上面代码“hello world”的分割是空格,因此输入“ ”,同样也可以是其他符号。
自己使用的一些关于 Wordpress 的插件与主题推荐。(以前爱折腾这些,现在已经转投 Hexo 啦。)
梦晨 詹士 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI 一年一度特斯拉AI DAY, 开场就王炸! 马斯克只用3分钟简短热场,人形机器人擎天柱 (Optimus)直接登台亮相。 不同于去年概念PPT上光滑圆润的外形,今年的擎天柱金属与线缆裸露在外,就像是电影中的终结者。 现场这台擎天柱,展示了稳步行走、转体俯身、挥手与台下观众打招呼。 录像中的一台还真正走入特斯拉办公室,浇花、帮员工搬运快递。 换到汽车工厂,也有模有样地搬起了砖。 然鹅,马斯克表示这还不是擎天柱机器人的完全形态,只是试做版原型机
作者:T客汇 张苏月 关键词:VC SaaS 初创公司 网站:www.tikehui.com 核心提示:作为一个SaaS初创公司,想要获得投资者青睐,你必须能够达到7年内13%的月增长率。 下面是一
Lyric Analysis with NLP & Machine Learning with R
我在看过的一些 Nature 文章和 COSMIC 数据库中看到用点图来展示不同癌症类型下 TMB 的分布差异。在 R 包中,我有看到过 maftools 中可以绘制这样的图,用来表示新的数据队列与 TCGA 数据的比较,这也是应用于 TMB 分析。因为研究问题,我最近也想尝试使用改种图形来展示数据。而且,该图可以拓展到任意可以适应的场景下,所以我想基于 ggplot2 来创建一个通用的绘图函数。
消费者如果不推荐,怎么办?这是现实中很多企业面临的问题。部分公司选择用金钱激励用户推荐。用钱很有用,但成本高,所以解决推荐问题,从体验设计着手效果会更好。
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