昨天我们给大家推送了如何用Origin做多因子组箱线图,那么今天我们来看看GraphPad如何绘制多因子图。 软件 GraphPad Prism 8 ?...数据 我根据同学提供的图,随便编了几个数据,包括均值和标准差以作练习用。 ? 图文教程 1. 打开 GraphPad Prism 8,创建模板,这里我们选择均值加减标准差的输入方式 ? 2....按照格式输入均值加减标准差,这里的N指的是使用了几个数据计算出来的均值和标准差,一般是需要填写的,我这里没有就先不写了。 ? 3. 点击Graphs里面的Data进行图形生成 ? 4....然后我们点击更换颜色,换成自然生成的颜色。当然,你也可以挨个点击柱子,选择自己喜欢的颜色 ? 6. 我们使用文字工具给图形添加显著性 ? 7....如果觉得星星太小,可以选择字体功能进行调大,就好了,图就做成了,直接导出就OK了。 ? 8. 如果你又需要另外一种,直接双击图中 ? 9. 选择第二个 ? 10. 看看效果 ? ? 11. 怎么样?
来源:宾夕法尼亚大学 论文名称:TagSLAM Robust SLAM with Fiducial Markers 原文作者:Bernd Pfrommer 使用AprilTag基准标记SLAM,TagSLAM...提供了一种方便、灵活和鲁棒性的方法。...通过一些简单的提取,TagSLAM为GTSAM因子图优化器提供前端,使得可以快速设计一系列基于标签的实验:full SLAM,无重叠视图的相机标定、地面实况视觉定位,闭环测量、姿态估计等。...本文中详细讨论了TagSLAM如何鲁棒的初始化因子图,并且作为一个应用实例表现闭环。 下面是论文具体框架结构以及实验结果: ? ? ? ? ?
菜鸟团公众号肯定讲过annovar的使用了。比如Nickier的vcf文件的注释及ANNOVAR的使用。 而在使用 ANNOVAR 之前,你应该知道和ANNOVAR 是如何注释 RS ID 的?...annovar最常使用的方式是这样的。...其实annovar提供了对indel不进行处理的方式,-keepindelref参数。 但是很怪,这个参数不能在table_annovar.pl里直接使用,所以注释分成更规范的两步。...多样本 直接使用table_annovar.pl注释多样本vcf时,会产生Otherinfo列非常多的问题。...添加自有数据库 官方的数据库列表包含了很多常用数据库,但是有时候会需要一些比较特殊的信息。比如亚洲人群的MAF信息。 在找到数据之后,就想利用annovar的注释机制将此信息也添加到注释结果中去。
鉴定、分类和注释转录因子以及分析转录因子的调控和功能等一直是研究的热点和基础,它们在生物体内形成一套指导基因表达的复杂系统引得众多科学家浓厚的研究兴趣。...图 Seq logo 在线绘制工具——Weblogo 一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点 2018 升级版Motif数据库Jaspar 下面介绍由华中科技大学生命科学与技术学院郭安源教授团队开发的动物转录因子注释和预测数据库...继续点击一个转录因子家族进入家族基因列表页面:表内显示其包含的家族成员的相关信息,此页面下面还显示了DBD的多序列比对(Multi-alignment),以及对这些TFs的多重比对weblogo图,还有该...点击结果表中的Ensembl ID可直接查看转录因子的基本信息,如:功能结构域、TFBS seqlogo图、互作网络以及表达等。 ? ? ? ? ? ? ? ? 3....使用这些矩阵扫描人类的比对序列,使用MEME Suite的检测功能(http://meme-suite.org/index.html) 来预测TF靶标。
使用因子图来可视化或许能为人们提供简洁直观的理解方式。Rajat Vadiraj Dwaraknath 近日发布了一篇文章,介绍了他在使用因子图可视化张量运算方面的心得。...尽管我最初是在图模型和消息传递的语境中遇到因子图的,但我很快就意识到它们体现了一种更通用和更简单的概念。在这篇文章中,我将主要在高层面介绍因子图,而不会涉及图模型或消息传递等算法的具体细节。...另外,你可以使用 numpy.einsum 在 Python 中轻松尝试这些。...注意,没有边的因子是 0 维张量,其实就是单个数值(轨迹就该是这样)。 可视化证明 使用简洁的可视化证明,我们不仅可以理解 numpy 运算,还能迅速搞定数学定理。...作为一个有趣的练习,你可以试试解读矩阵链乘法(matrix chain multiplication)过程,并使用因子图理解寻找一个链矩阵积的总计算成本是如何受乘法顺序影响的。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍如何使用「ggcoverage」来对各种测序数据进行分析,包括WGS、RNA-seq、ChIP-seq、ATAC-seq等,下面小编来简单介绍下,更多详细的案例内容请参考作者官方文档...gtf", package = "ggcoverage") gtf.gr = rtracklayer::import.gff(con = gtf.file, format = 'gtf') 添加基因注释
各个单细胞亚群特异性的转录因子热图 虽然转录因子分析作为单细胞转录组数据分析的3大高级分析之一名满天下,但是因为它太耗费计算资源导致绝大部分人敬而远之,我们其实也多次分享过细节教程: 张泽民团队的单细胞研究把...T细胞分的如此清楚 细胞通讯分析的背景知识 构建单细胞亚群网络(类似于细胞通讯分析) 细胞通讯分析结果的解读 SCENIC转录因子分析结果的解读 人人都能学会的单细胞聚类分群注释 对单细胞表达矩阵做gsea...分析 单细胞转录因子分析之SCENIC流程 如果你没有足够的计算资源,我们其实也推荐过一个简单版本的转录因子分析,就是 dorothea 这个R包,本质上是计算 Viper 得分,代码如下所示: ##...个转录因子的活性得分。...pheatmap ,效果如下所示: 各个单细胞亚群特异性的转录因子热图 如果你确实觉得我的教程对你的科研课题有帮助,让你茅塞顿开,或者说你的课题大量使用我的技能,烦请日后在发表自己的成果的时候,加上一个简短的致谢
本文将为你介绍什么是Python注释,以及Python注释的含义、作用、种类等。 Python注释 在程序代码中对程序代码进行解释说明的文字,被称为注释。...Python注释作用 注释是代码中的解释型语句,不是程序,不能被执行。只是对程序代码进行解释说明,让别人可以看懂程序代码的作用,能够大大增强程序的可读性。...Python注释种类及使用方法 Python分为单行注释和多行注释。 单行注释:以#开头,#右边 的所有文字当作说明,而不是真正要执行的程序,起辅助作用。一般用于一行或一小部分代码进行解释。...(#号和注释内容建议以一个空格隔开) # 注释内容 print(123) 多行注释:以 一对三个双引号 引起来(“”“注释内容”“”)来解释说明一段代码的作用使用方法。...""" 注释内容 注释内容 """ print(123)
1 注释方法 被@ModelAttribute注释的方法会在此controller每个方法执行前被执行,因此对于一个controller映射多个URL的用法来说,要谨慎使用。...1.1 注释void返回值的方法 ? 在获得请求/helloWorld后,populateModel在helloWorld之前被调用,它把请求参数 /helloWorld?...那么这个model属性的名称是account 1.3 注释返回具体类的方法 ?...@ModelAttribute注释的value属性,指定model属性的名称 model属性对象就是方法的返回值,无须要特定的参数 1.4 和@RequestMapping同时注释一个方法 ?...@ModelAttribute("user") User user注释方法参数,参数user的值来源于addAccount()方法中的model属性 此时如果方法体没有标注@SessionAttributes
两张图足以说明一切 第四步: 开始: 至此就ok了,辛辛苦苦做的图呢,赞我一下! oooo,我的Create是不是拼错了哈哈!
文件和gff3格式的基因组注释文件得到变异位点位于基因组的什么位置(外显子、内含子等)以及变异位点为同义突变或者为非同义突变的信息。...snpEff创建本地数据库 本文使用到的数据 GATK4.0和全基因组数据分析实践(上)完全重复这篇教程得到的vcf文件。...这篇教程是使用大肠杆菌的数据来介绍基因组重测序的分析流程,细致入微,强烈推荐!...gff3格式的注释文件,基因组序列放到genomes目录下,并重命名为ecoli.fa;gff文件放到ecoli目录下,并且重命名为genes.gff。...snpEff.jar build -gff3 ecoli构建数据库,成功的话在data/ecoli目录下会多出一个snpEffectPredictor.bin文件 准备工作完成,接下来就可以注释了 使用到的命令
很多数据库注释 如果仅仅是想做KEGG PATHWAY数据库注释,也是可以使用r代码的,借助这个 library(org.Hs.eg.db) 包即可: rm(list=ls()) library(org.Hs.eg.db...),在KEGG数据库注释中使用统计学方法,尤其是超几何分布检验,是为了识别差异基因集中富集的生物学通路。...结果解释:最后,根据校正后的P值确定哪些通路是显著富集的,并据此解释差异基因集中的生物学功能。 可视化:使用图表或富集图(如气泡图、条形图)来直观展示富集分析的结果。...dotplot(yy)使用dotplot()函数生成一个点图,这是一种常用于展示富集分析结果的图形。该图将展示每个显著富集的通路,以及与之相关的基因数量和显著性水平。...给y叔打call 终于回到了我们的主题,把kegg注释结果图分门别类,如果你还是比较早期的clusterProfiler包是没办法做到。
1写在前面 前面写了superheat的教程,今天写一下第二波,如何进行聚类以及添加注释图吧。 分分钟提升你的heatmap的颜值哦!...gears") set.seed(123) superheat(mtcars, scale = T, membership.rows = gears) 5注释图...-Scatterplots 我们可以在热图的旁边添加一些注释图,非常简单,比如yt (‘y top’)或者yr(‘y right’)。...per gallon", yr.cluster.col = c("black", "red", "orange"), yr.point.size = 4) 6注释图...yr.plot.type = "boxplot", yr.cluster.col = c("beige", "slategray1", "beige")) 10注释图坐标轴的调整
image 你还在忧心我前几天使用的图床软件,这个公司却不知不觉倒闭了嘛......你还在烦恼图床网站使用麻烦,又要打开网站又只能上传文件不能直接从剪贴板上传嘛 那你就看我这篇文章就没错了,感觉搞起来尤其是经常写博客的必须安排上~ 一 .我这里推荐我自己使用的俩图床软件搭配gitee图床仓库实现高效安全的图片存储...俩图床软件:upic,picGo ----两者都可以使用gitee作为图床仓库, 图床仓库:Gitee ---上传速度对比于Github这样的仓库极快,又不像阿里云oss等等仓库还要钱...,可以说极好了; 我这里直说优缺点和gitee仓库的配置,其他的咱就不说了,大差不差的; 1.upic 优点:简单好用又好看,易配置,仓库源支持的多; 缺点:只支持Mac os系统; upic配置gitee...,选中gitee图床仓库,拖动即可 image 4.也可以在picgo里设置默认使用仓库 5.另外提供一个高效传图方法 复制图片或者截图之后,然后使用剪贴板图片上传快捷键可以直接上传然后返回仓库里图片地址
今天,给大家详细地介绍一下PyComplexheatmap(https://github.com/DingWB/PyComplexHeatmap) 中annotation的使用方法,也就是如何用python...此外,在注释文字(比如Bovidae)与热图之间曲线的形状和颜色都会随着文字的旋转角度和颜色一起变化,会自动调整角度,使之与注释文字的角度相匹配。...值得注意的是,「热图与图例之间的间隙是自动调节」的,比如,当row_names_side='right'时,热图右边有了文字,图例就自动往右边挪了,不用我们额外设置。...【行】注释(annotation bar)的高度,可以通过height (mm)参数来设置,比如,在上图的anno_simple中,我们将Family这个bar图的高度设置成了5mm,而Tissue的高度仍然是默认...注释信息放在热图「左方」 #Put annotations on the left row_ha = HeatmapAnnotation(label=anno_label(df_cols.Family,
在编写代码的时候,使用@Autowired注解是,发现IDE报的一个警告,如下: ?...翻译: Spring建议”总是在您的bean中使用构造函数建立依赖注入。总是使用断言强制依赖”。...我们知道:@Autowired 可以对成员变量、方法以及构造函数进行注释。那么对成员变量和构造函数进行注释又有什么区别呢?...@Autowired注入bean,相当于在配置文件中配置bean,并且使用setter注入。而对构造函数进行注释,就相当于是使用构造函数进行依赖注入了吧。莫非是这两种注入方法的不同。...User user){ this.user = user; this.school = user.getSchool(); } 可以看出,使用构造器注入的方法,可以明确成员变量的加载顺序。
${TIME} * @modified By ${USER} in ${DATE} ${TIME} * @description AddDescriptionHere */ idea 模板使用的...3.修改快捷键(缩略词) 针对在接口中或普通类的方法外使用模板注释不带参数的情况 假如触发的快捷键为doc, ★在类中输入 "/doc" 触发方法注释可以带参数, ★但是下方的template text...开头要去掉"/" 为了符合注释习惯,可以将快捷键设为 * 或 **, ★在类中输入 /*或者/**可以触发带参数的方法注释 ★对应的,在template text 开头要去掉 /或者/* 相当于将快捷键替换为...}; return result", methodParameters()) 7.应用保存 参考: idea 自动生成类注释和方法注释的实现步骤...-脚本之家 使用groovy脚本生成idea方法注释参数格式对齐 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:https://javaforall.cn/179201.html原文链接:https://javaforall.cn
虽然最基本的注释(annotation)类型可能只是坐标轴标题与图标题,但注释可远远不止这些。让我们可视化一些数据,看看如何通过添加注释来更恰当地表达信息。...为日均出生人数统计图添加注释 在用这样的图表达观点时,如果可以在图中增加一些注释,就更能吸引读者的注意了。...虽然有一个 plt.arrow() 函数可以实现这个功能,但是我不推荐使用它,因为它创建出的箭头是 SVG 向量图对象,会随着图形分辨率的变化而改变,最终的结果可能完全不是用户想要的。...带注释的日均出生人数 让我们用前面的美国出生人数图来演示一些箭头注释 fig, ax = plt.subplots(figsize=(12, 4)) births_by_date.plot(ax=ax)...到此这篇关于Python之Matplotlib文字与注释的使用方法的文章就介绍到这了,更多相关Matplotlib文字与注释内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 今天写代码发现最新版的VSCode使用Ctrl+/无法注释,打开设置发现原来是快捷键更改了。...1、打开VSCode左下角的设置,点击命令面板(Ctrl+Shift+P也行) 2、在弹出的窗口输入注释,然后瞄准添加行注释和删除行注释,点击后面的齿轮即可更换快捷键 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处
// autoplay: { // // delay: 1000, // 停留的时间...{ el: '.swiper-pagination' }, // 下方的滚动条...; } }, computed: { swiper() { //计算属性,获得可以操作的swiper...hover到分页器的小圆点后自动触发其本身的click事件 // $(".swiper-pagination-bullet").hover(function() {...// $(this).click(); //鼠标划上去之后,自动触发点击事件来模仿鼠标划上去的事件 // },function() { //
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