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「R」用purrr实现迭代

一起复习一下吧~ 函数有3个好处: 更容易看清代码意图 更容易对需求变化做出反应(改变) 更容易减少程序bug 除了函数,减少重复代码另一种工具是迭代,它作用在于可以对多个输入执行同一种处理,比如对多个多个数据集进行同样操作...使用purrr函数替代for循环目的是将常见列表问题分解为独立几部分: 对于列表单个元素,我们能找到解决办法吗?如果可以,我们就能使用purrr将该方法扩展到列表所有元素。...每种类型输出都有一个相应函数: map()用于输出列表 map_lgl()用于输出逻辑型向量 map_dbl()用于输出双精度型向量 map_chr()用于输出字符型向量 每个函数使用一个向量(注意列表可以作为递归向量看待...当使用函数目的是向屏幕提供输出将文件保存到磁盘——重要是操作过程而不是返回值,我们应该使用游走函数,而不是映射函数。...本节就是对它们进行简单介绍 预测函数 一些函数可以与返回TRUEFALSE预测函数一同使用

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R 数据整理(十一: 用purrr包实现更花样匿名函数使用

JSON、YAML等格式转换为R对象就经常具有这种嵌套结构。一般这种类型数据,导入R 后就表现为嵌套列表格式,也就是列表每个元素也都是列表。...输入类型和输出类型两两搭配, purrr包提供了27种map类函数。...比如用cat查看输出数据框中变量类别: walk(d.class, ~ cat(typeof(.x), "\n")) ## character ## character ## double #...使用示性函数泛函 some some(.x, .p),对数据列表向量.x每一个元素用.p判断, 只要至少有一个为真,结果就为真;every(.x, .p)与some类似,但需要所有元素结果都为真结果才为真...其他有用函数 比如keep, 可以专门用来选择数据框各列表元素中满足某种条件子集, 这个条件用一个返回逻辑值函数来给出。

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Day4:R语言课程(向量和因子取子集)

数据检查函数列表 已经看到函数head()和str()可以查看data.frame内容和结构。以下是一个非详尽函数列表,用于了解数据内容/结构。...:返回数据集中列名称 3.使用索引和序列选择数据 在分析数据时,我们经常要对数据进行分区,以便只处理选定行。...R中逻辑运算符完整列表如下所示: 操作符号 描述 > 大于 > = 大于等于 < 少于 <= 小于等于 == 等于 != 不等于 & 和 | 使用逻辑表达式来确定特定条件是真还是假。...虽然逻辑表达式将返回相同长度TRUE和FALSE值向量,但我们可以使用该which()函数输出值为TRUE索引。...关于嵌套函数注意事项: idx我们可以将逻辑运算和/函数放在括号中,而不是先创建idx对象。 age[which(age > 50 | age < 18)] 与 age[idx]上面相同。

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R-Purrr使用,加速数据处理

R-Purrr使用,加速数据处理 Tidyverse中包含一个purrr程序包,之前在看数据处理分析时候,一直看到别人code中,涵盖purrr,map函数,但是一直不知道这个是干什么,现在发现purrr...Purrr 主要是替换for循环使用Purrr引入了map函数以及一些用于操纵list函数。cheatsheet可以速查一些关于Tidyverse使用方法。...apply()函数是一组超级有用base-R函数,可用于vectorlist条目迭代执行操作,而无需编写for循环。...,每个映射函数第一个参数始终是要映射数据对象,第二个参数始终是要迭代地应用于输入对象每个元素函数。...匿名函数是一个临时函数(您定义为映射function参数)。 在这里,我使用了参数名称.x,但我可以使用任何参数。

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Numpy 简介

许多方法在最外层NumPy命名空间中映射函数,让码农们可以完全自由地按照自己习惯编写合适代码。...一般有6个机制创建数组: 从其他Python结构(例如,列表,元组)转换 numpy原生数组创建(例如,arange、ones、zeros等) 从磁盘读取数组,无论是标准格式还是自定义格式 通过使用字符串缓冲区从原始字节创建数组...使用特殊库函数(例如,random) 复制、join或以其他方式扩展改变现有数组方法。...加入数组 concatenate((a1, a2, …)[, axis, out]) 沿现有轴加入一系列数组。 stack(arrays[, axis, out]) 沿新轴加入一系列数组。...block(arrays) 从嵌套列表中组装nd数组。 拆分数组 split(ary, indices_or_sections[, axis]) 将数组拆分为多个子数组。

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「r」dplyr 里 join 与 base 里 merge 存在差异

今天在使用连接操作时发现:虽然都是合并操作函数,dplyr 包里 *_join() 和基础包里面的 merge() 存在差异,不同数据结构,结果也会存在偏差。...构造数据集 下面是一个可重复例子,构造两个数据集,一个是基于 data.frame 列表,另一个是就要 data.table 列表: x <- list( a = data.frame(r1...所以使用 dplyr 提供连接函数报错是正常,但有意思是,基础包提供 merge() 函数可以完成连接操作,真是优秀(感兴趣朋友可以看下测试下 merge 函数源代码)!...如果 be_join 不为空,进行如下循环: 如果存在,则将这个子集和 to_join 按共同合并 如果不存在,使用循环位移一位,将当前 be_join 第 2 个子集移动为 第 1 个。...2 S1 S2 S2 S1 S2 更新 在后面的一些使用过程中发现基础包 merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题结果,所以建议使用小伙伴仔细检查结果。

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Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

`map`系列函数 purrr包map()提供了一系列函数,它是tidyverse中一个包。参阅R for Data Science一书。...该族包括几个函数,每个函数输入都是向量,输出是指定类型向量。例如,用这些函数对向量中每个元素数据框中列表每个组件执行某些任务/函数,依此类推。 map() 创建一个列表。...图直线达到点是除异常值外最小值和最大值。 使用四分位值(IQR)确定异常值,IQR定义为:Q3-Q1。低于Q1高于Q3超过1.5 x IQR任何值都被视为异常值,表示为竖线上方下方点。...R提供选择pngpdf等格式,选择要存放图片目录。还提供了决定输出图像大小和分辨率选项。 第二种方法是使用R函数并将写入文件编码到脚本中。...这种方法允许用户从头到尾运行脚本自动执行该过程(不需要人工点击操作来保存)。在R术语中,输出被定向到特定输出设备,指示输出文件格式。

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一文让你入门CNN,附3份深度学习视频资源

卷积网络对四维张量处理如下所示(请注意嵌套数组)。 ? Python Numpy中NDArray和 “张量” 同义互换使用。...设想在图表中间有一条既高且窄钟形曲线。曲线下区域是积分。设想该曲线附近有第二条较短较宽钟形曲线从图表左侧向右侧缓慢漂移。这两个函数沿X轴各点重叠部分之积,即是其卷积。...也就是说,过滤器覆盖了图像通道表面积十分之一。 我们使用这块图像通道得到过滤器点积。如果两个矩阵在相同位置均具有较高值,则点积输出会很高。反之,则输出会很低。...激活映射图上宽度(数)与过滤器在底层图像上移动步数一致。因为步幅越大,步数越小,所以步幅大则激活映射图小。...如卷积方法一样,将激活映射图每次一个片块地输入降采样层。最大池化仅取图像一个片块最大值,将之置于存有其他片块最大值矩阵中,放弃激活映射图中所载其他信息。 ?

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R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

包括两个方面,一方面是写快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理快,内部处理步骤进行了程序上优化,使用多线程,甚至很多函数使用C写,大大加快数据运行速度。...将一个R对象转化为data.table,R可以时矢量列表data.frame等,keep.rownames决定是否保留行名或者列表名,默认FALSE,如果TRUE,将行名存在"rn"行中,keep.rownames...,类字符矢量,用于罕见覆盖而不是常规使用,只会使一变为更高类型,不能降低类型; integer64,读如64位整型数; dec,小数分隔符,默认"."...(x, v)] #取DTx,v列上x="b",v=3行 j 对数据框进行求值输出   j 参数对数据进行运算,比如sum,max,min,tail等基本函数输出基本函数计算结果,还可以用n输出第...(a = .(), b = .())] 输出一个a、b数据框,.()就是要输入a、b内容,还可以将一系列处理放入大括号,如{tmp <- mean(y);.

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python导入excel数据画散点图_excel折线图怎么做一条线

以及data值,这里需要嵌套列表 print("读取指定行数据:\n{0}".format(data)) 5:获取所有行指定 df=pd.read_excel('lemon.xlsx') data...:获取行号打印输出 df=pd.read_excel('lemon.xlsx') print("输出行号列表",df.index.values) 输出结果是: 输出行号列表 [0 1 2 3] 7:...plt.scatter(x_values,y_values,c=(0,0,0.8),edgecolor=’none’,s=20)为由浅蓝色组成散点图 6)使用颜色映射 颜色映射是一系列颜色,它们从起始颜色渐变到结束颜色...,使用参数cmap告诉pyplot使用哪个颜色映射。...print("数据行数:" , len(df)) ''' 由于只有一数据我们使用 excel 行号作为 x 值列表 用range()函数来创建一个列表 [1,24) range()函数 遍历数字序列

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字典

一,使用字典 1.在Python中,字典用放在花括号{}中一些键-值对表示。每个键都与一个值相关联,可以使用键来访问与之相关联值。可将任何Python对象用作字典中值。...2.5按顺序遍历字典中所有键 要以特定顺序返回元素,一种办法是在for循环中对返回键进行排序。使用函数sorted()来获得按特定顺序排列列表副本。 ? 输出: ?...集合类似于列表,但每个元素都必须时独一无二。 ? 输出: ? 三,嵌套 将一系列字典存储在列表中,列表作为值存储在字典中,这称为嵌套。可在列表嵌套字典、在字典中嵌套列表、在字典中嵌套字典。...1.3使用for循环和if语句来修改值。 ? 输出: ? 1.4在字典中存储列表 需要将列表存储在字典中,不是将字典存储在列表中。 ? 输出: ? 列表和字典嵌套层级不应太多。...输出: ? 字典中包含键应相同,这样嵌套字典处理起来更容易。 四,集合、函数、方法、元组、列表、字典区别?

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RNA-seq入门实战(三):在R里面整理表达量counts矩阵

大家开始根据我ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战,其中几个小伙伴让我非常惊喜,不需要怎么沟通和指导,就默默完成了一个实战!...,若还想转化为FPKMCPM可参见Counts FPKM RPKM TPM 转化与 获取基因有效长度N种方法 #### counts,TPM转化 #### # 注意需要转化是未经筛选counts...geneid), "efflen"] ### 计算 TPM 公式 #TPM (Transcripts Per Kilobase Million) 每千个碱基转录每百万映射读取...table(duplicated(symbol)) #统计重复基因名 ###使用aggregate根据symbol相同基因进行合并 counts <- aggregate(counts...counts矩阵 需要用到tximport包从salmon输出文件中获取counts矩阵,在tximport函数中输入quant.sf文件路径、转换类型type = "salmon"、以及转录本与基因名

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「R」tidyverse 中公式函数

本文写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数(单侧公式)不太熟悉,所以通过本文分享一下我心得。...公式生成匿名函数 利用公式这一特点,tidyverse 系列包有很多函数支持用单侧公式替换函数。如果你仔细阅读过相关文档,例如 ?...公式函数用法 核心是什么 公式函数优点在于提供了一种构造匿名函数简洁方式。而核心在于在同一行代码表示如何使用输入构造出输出。...基本用法 假设我们要对 df 中 x 和 y 进行归一化处理,在不使用 scale() 函数情况下,我们可能会手写一个函数: scale2 <- function(x) { (x - mean...2 次,使用公式函数结合 purrr 可以写出更简洁代码: df3 <- purrr::map_df(df, ~ (.x - mean(.x)) / sd(.x)) 我们检查下两种操作是否结果相同:

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R语言数据清洗实战——高效list解析方案

好在确实有开发者在针对list数据结构进行操作上优化,任坤老师大作——rlist就是一个强大list解析神器,它可以让我们像在dplyr、data.table操作data.frame一样,使用rlist...在R语言环境中,我们最常遇到list操作场景大概有以下三类(当然不含全部): 1、统计模型输出结果: 因为统计模型在跑完之后,通过会输出系列各种指标,比如及置信区间、判定指标和拟合值等,这些对象因为大小和长度不等...mydara name year actors producers budget academy_award_ve 映射(mapping) list.map函数提供了list中元素映射功能。...mylist对象有三个子list,每一个长度都为10,按照其实际意义,可以按合并为data.frame。...list按照进行合并, #使之成为规整矩阵或者数据框(其意义与作用于cbind函数并无不同)。

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一文看懂用R语言读取Excel、PDF和JSON文件(附代码)

此时字符串向量会被用作列名,而原数据文件第一将被保存到数据集第一。如果有默认列名的话,则会发出警告,自动赋值成X1、X2、X3等,但不会影响读取进程。...下面的代码演示函数嵌套方法,这种嵌套代码书写方式能够在一定程度上简化代码和减少命名中间产物频率。不过嵌套过多会使可读性变差,一般推荐只嵌套两层。...函数可以直接调取已经建立连接数据库中指定数据,保存为tibble格式数据集。...最好办法是将读取内容使用jsonlite包转换成json列表格式进行显示,以帮助理解文档架构。...4个元素即代表共有4个值,每一个值都以列表形式返回。 当JSON格式原始数据文件有多重嵌套时,可以通过设置参数来查看数据结构和正确读取数据。

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Sketch 94 mac,草图94中文最新版支持M1,支持macOS Ventura 13

Sketch 是一款专业矢量图设计软件,深受许多设计师青睐,非常适用于图标设计、网页设计等矢量图设计场合使用,为您设计增添更棒视觉效果,现为大家带来Sketch 94最新版本,需要朋友别错过哦~详情...您现在可以用另一种颜色颜色变量覆盖符号内任何图层颜色。在符号实例中选择图层使用 Command-click 快速选择符号实例中可覆盖层,例如文本、颜色嵌套符号。...首先,您现在可以通过沿选择框边缘任意点拖动来水平垂直调整大小。其次,如果选择太小而无法舒适地调整大小,则选择框会显得稍大,以便更容易拖动其边缘。...将鼠标悬停在文本层上,按T,单击它输入。您现在可以像使用任何其他图层一样隐藏和显示嵌套符号 - 点击退格键将隐藏嵌套符号而不是删除它。...层列表现在显示符号中每个层(而不仅仅是那些应用了样式层)——继续更改不是符号未应用任何样式属性。发生了什么变化:我们改变了双击符号工作方式。

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R语言-基础

R使用 在Rstudioy中新建项目(R project) File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat...数据结构(向量、数据框、矩阵、列表) 字符型向量必须加引号(单双皆可)不能为中文值 逻辑型(logical)包括TRUE(T)、FALSE(F)、 NA(缺失值) 判断数据类型函数class() 数据框单独拿出来一是向量...= 4),1:4) #无空格连接 赋值+输出一齐实现方法 (x <- c(seq(1,10,2))) # 法一 1 1 3 5 7 9 x <- c(seq(1,10,2));x # 法二 1...,无嵌套从左到右 sort(x)[x<0] #与下面的相同 #y <- sort(x) #y[x<0] (1:10)[c(T,F)] #循环补齐 T,F 3.2 数据结构 用class() is(...)族函数进行判断数据结构 新建数据框 data.frame(colname=data) Error:no such file or dirextory #可能是工作目录不对,找不到这个文件 data.frame

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