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使用GREATpeak进行功能注释

GREAT是一款peak区间进行基因注释的工具,除了给出peak对应的基因外,还集成了多种基因的功能分析,网址如下 http://great.stanford.edu/public/html/index.php...目前该在线工具只支持以下几个物种 Human Mouse Zebrafish 在使用时,还需要注意对应的基因组版本。...除此之外,还给出以下多种基因的功能分析 GO Molecular Function GO Biological Process GO Cellular Component Mouse Phenotype...Disorders PANTHER Pathway BioCyc Pathway MsigDB Pathway MGI Expression MgisDB Perturbation 不同于传统的费舍尔精确检验,功能富集分析的...以GO中MF这一类别的功能注释为例,示意如下 ? 通过GREAT可以方便的peak关联的基因功能进行探究。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧— 扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

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直播案例 | 使用PageRank全球机场进行排序

PageRank 算法最初提出来用于利用网页之间的链接关系来网页进行排序,从而优化搜索引擎的效果。如今,我们可以将 PageRank 算法用作网络中节点排序的一般算法。...在本案例中,我们使用一个全球机场之间航线的网络数据集,借助 Python 中的复杂网络分析库 networkx 中实现的 PageRank 算法,完成对全球机场的排序。 1 数据集介绍 文件 ....下面我们使用 nx.draw 函数,将网络进行可视化。...(1 - β) 表示在浏览过程不沿着边跳转,而是在所有点中随机挑选下一个点的概率。 实际试验证明 β 被设置成 0.85 时 PageRank 的计算结果最符合实际情况。...4 使用 PageRank 算法机场进行排序 在 networkx 中,使用 pagerank 函数即可计算网络中节点的 PageRank 值。

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map集合进行排序

今天做统计时需要对X轴的地区按照地区代码(areaCode)进行排序,由于在构建XMLData使用的map来进行数据统计的,所以在统计过程中就需要对map进行排序。...二、Map排序 TreeMap TreeMap默认是升序的,如果我们需要改变排序方式,则需要使用比较器:Comparator。...运行结果如下: d:ddddd c:ccccc b:bbbbb a:aaaaa 上面例子是根据TreeMap的key值来进行排序的,但是有时我们需要根据TreeMap的value来进行排序。...value排序我们就需要借助于Collections的sort(List list, Comparator c)方法,该方法根据指定比较器产生的顺序指定列表进行排序。...但是有一个前提条件,那就是所有的元素都必须能够根据所提供的比较器来进行比较。如下: ?

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LUAMap进行排序

Lua中最常见的数据结构就是Table, 用Table表示Map很容易, 但早期Lua没有提供一个针对Map数据结构的排序方法,下面用Moonscript实现了一个Map型数据结构排序函数方法。...其实实现的原理比较简单,就是用两个Table,分别存储Map的Key与Value,用比较简单的冒泡排序或是选择排序Key的Table结构进行排序,在排序的过程中移动Table中Key的存储位置的同时,...也安对应的下标移动Value数组的位置,这样当Key排序好的同时,Value也被排序好了。...下面的例子没有直接使用Lua实现,用了Moonscript实现了这个简单的过程,然后通过Moonc解释程序把Moonscript翻译成Lua, Moonscript天然支持类,并且用Moonscript...降序排序: ? 升序和降序的方法比较简单,直接将与max比较的“>”大于号,改成小于号,或是想反。 升序排序: ?

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使用 Python 波形中的数组进行排序

在本文中,我们将学习一个 python 程序来波形中的数组进行排序。 假设我们采用了一个未排序的输入数组。我们现在将对波形中的输入数组进行排序。...− 创建一个函数,通过接受输入数组和数组长度作为参数来波形中的数组进行排序使用 sort() 函数(按升序/降序列表进行排序)按升序输入数组进行排序。...例 以下程序使用 python 内置 sort() 函数波形中的输入数组进行排序 − # creating a function to sort the array in waveform by accepting...例 以下程序仅使用一个 for 循环且不带内置函数以波形输入数组进行排序 - # creating a function to sort the array in waveform by accepting...结论 在本文中,我们学习了如何使用两种不同的方法给定的波形阵列进行排序。与第一种方法相比,O(log N)时间复杂度降低的新逻辑是我们用来降低时间复杂度的逻辑。

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使用PythonExcel数据进行排序,更高效!

标签:Python与Excel,pandas 表排序是Excel中的一项常见任务。我们对表格进行排序,以帮助更容易地查看或使用数据。...然而,当你的数据很大或包含大量计算时,Excel中的排序可能会非常慢。因此,这里将向你展示如何使用PythonExcel数据表进行排序,并保证速度和效率!...准备用于演示的数据框架 由于我们使用Python处理Excel文件中的数据,几乎在默认情况下,我们都将使用pandas库。...图2 按索引对表排序 我们还可以按升序或降序对表进行排序。 图3 按指定列排序 我们已经看到了如何按索引排序,现在让我们看看如何按单个列排序。让我们按购买日期对表格进行排序。...在下面的示例中,首先顾客的姓名进行排序,然后在每名顾客中再次“购买物品”进行排序

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使用Comparable和ComparatorJava集合对象进行排序

在现实生活中,我们可能会遇到需要对集合内的对象进行排序的场景,比如,有一个游戏得分排行榜,如先按照分数的高低由高到低排序,在分数相同的情况下,按照记录创建的时间由早到新的顺序排序。...在Java语言中,要实现集合内对象的排序,咱们可以采用如下两种方式来完成: 使用Comparable来实现 使用Comparator来实现 接下来,我们先使用Comparable和Comparator...、结合示例来完成集合内对象排序功能,然后,这两种方式进行比较;最后,结合多属性排序的话,给出相对较好的实践方法。...,然后我们要做的就是GameRecord对象的集合类进行排序即可,集合的排序可以采用java.util.Collections类的sort方法完成。...采用Comparator的方法,是一种类外部的实现,不需要对需要排序的类(如GameRecord)进行改变,保持原有状态即可。

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Python中list进行排序

很多时候,我们需要对List进行排序,Python提供了两个方法 给定的List L进行排序, 方法1.用List的成员函数sort进行排序 方法2.用built-in函数sorted进行排序(从2.4...开始) 这两种方法使用起来差不多,以第一种为例进行讲解: 从Python2.4开始,sort方法有了三个可选的参数,Python Library Reference里是这样描述的 cmp:cmp specifies...stable sort >>>A.sort() >>>L = [s[2] for s in A] >>>L >>>[('a', 1), ('b', 2), ('c', 3), ('d', 4)] 以上给出了6中List...排序的方法,其中实例3.4.5.6能起到以List item中的某一项 为比较关键字进行排序....L是仅仅按照第二个关键字来排的,如果我们想用第二个关键字 排过序后再用第一个关键字进行排序呢?

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【Python】使用 pyecharts 模块绘制动态时间线柱状图 ① ( 列表排序 | 使用 sorted 函数容器进行排序 | 使用 list.sort 函数列表进行排序 | 设置排序函数 )

一、列表排序 1、使用 sorted 函数容器进行排序 在之前的博客 【Python】数据容器总结 ② ( 数据容器元素排序 | 字符串大小比较 | 字符大小比较 | 长短一样的字符串大小比较 | 长短不一样的字符串大小比较...) 中 , 介绍了使用 sorted 函数 容器中的元素进行排序 ; sorted 函数语法如下 : sorted(iterable, key=None, reverse=False) iterable...list.sort 函数列表进行排序 在数据处理中 , 经常需要对 列表 进行排序 ; 如果在排序的同时 , 还要指定排序规则 , 那么 就不能使用 sorted 函数 了 , 该函数无法指定排序规则...list.sort 函数列表进行排序 - 设置排序函数 list.sort 函数 的 key 参数 , 需要传入一个排序函数 , 该函数的规则如下 : 指定的排序函数应该 接受一个参数 并 返回一个值...list.sort 函数列表进行排序 - 设置 lambda 匿名排序函数 list.sort 函数 的 key 参数 , 需要传入一个排序函数 , 该函数的规则如下 : 指定的排序函数应该 接受一个参数

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如何python的字典进行排序

可是有时我们需要对dictionary中 的item进行排序输出,可能根据key,也可能根据value来排。到底有多少种方法可以实现dictionary的内容进行排序输出呢?...python容器内数据的排序有两种,一种是容器自己的sort函数,一种是内建的sorted函数。...: #按照key进行排序 print sorted(dict1.items(), key=lambda d: d[0]) 2 按照value值排序 #来一个根据value排序的,先把item的key...: # 按照value进行排序 print sorted(dict1.items(), key=lambda d: d[1]) 知识点扩展: 准备知识: 在python里,字典dictionary是内置的数据类型...到此这篇关于如何python的字典进行排序的文章就介绍到这了,更多相关python的字典进行排序方法内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

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使用 Python 按行和按列矩阵进行排序

在本文中,我们将学习一个 python 程序来按行和按列矩阵进行排序。 假设我们采用了一个输入的 MxM 矩阵。我们现在将使用嵌套的 for 循环给定的输入矩阵进行逐行和按列排序。...− 创建一个函数sortingMatrixByRow()来矩阵的每一行进行排序,即通过接受输入矩阵m(行数)作为参数来逐行排序。 在函数内部,使用 for 循环遍历矩阵的行。...使用另一个嵌套的 for 循环遍历当前行的所有列。 使用 if 条件语句检查当前元素是否大于下一个元素。 如果条件为 true,则使用临时变量交换元素。...Python 给定的矩阵进行行和列排序。...此外,我们还学习了如何转置给定的矩阵,以及如何使用嵌套的 for 循环(而不是使用内置的 sort() 方法)按行矩阵进行排序

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