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让ChatGPT编写交互式网页应用的临床预测模型

临床决策R Shiny可以用于以下方面: 数据可视化:医生可以使用R Shiny构建交互式图表和图形,以更好地展示和解释患者的病情和治疗效果。...临床预测模型:R Shiny可以帮助医生构建和验证临床预测模型,以便更好地了解患者的风险和预测未来病情的可能性。...那么,结合R强大的数据分析能力,医学领域Shiny有哪些应用呢?这里给出了介绍。...image.png 在这个示例程序使用了numericInput和selectInput函数创建输入变量,使用actionButton函数创建计算患病概率的按钮。...Server端,使用reactive函数创建数据data和逻辑回归模型model。 image.png 一个大致的界面就完成了,而且出现了一些错误,所以ChatGPT也并不是完美的。

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shiny资源汇总

六年前还在上海工作的时候,机缘巧合接触了使用R语言的shiny体系搭建网页工具的技术,就一直身体力行的我们生物信息学圈子里面推广它。...展示反应过程 Reactivity Visualizer for shiny • reactlog 展示使用记录 dreamRs/shinylogs: Logs for Shiny apps Packrat...纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行 一些文章和书 他们也许因为软件版本的迭代,操作环节有一点点过时 亚马逊服务器上部署 DS4B 202A-R: Expert Shiny Developer with...开发者视频讲座 Shiny Developer Series 一个shiny例子集合 dreamRs shiny gallery jsshiny的运用 JavaScript 4 Shiny - Field...tips and walk-through a real example 什么是模块化 A beginner's guide to Shiny modules | Emily Riederer R的js

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学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入。...rmarkdown :用于创建可重复性报告和动态文档 knitr:用于PDF和HTML文档嵌入R代码块 flexdashboard:基于rmarkdown,可以轻松的创建仪表盘 bookdown...自动化分析 以下R用于创建自动化分析结果的数据科学产品: shiny:一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。...shinyjs:用于Shiny应用程序执行常见的JavaScript操作 miniUI:提供了一个UI小部件,用于R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io:为创建的Shiny应用程序提供托管服务...drat:一个用于创建和使用备选R库的工具 testthat:单元测试,让R稳定、健壮,减少升级的痛苦。 roxygen2:通过注释的方式,生成文档,远离Latex的烦恼。

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学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入。...rmarkdown :用于创建可重复性报告和动态文档 knitr:用于PDF和HTML文档嵌入R代码块 flexdashboard:基于rmarkdown,可以轻松的创建仪表盘 bookdown:以...自动化分析 以下R用于创建自动化分析结果的数据科学产品: shiny:一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。...shinyjs:用于Shiny应用程序执行常见的JavaScript操作 miniUI:提供了一个UI小部件,用于R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io:为创建的Shiny应用程序提供托管服务...drat:一个用于创建和使用备选R库的工具 testthat:单元测试,让R稳定、健壮,减少升级的痛苦。 roxygen2:通过注释的方式,生成文档,远离Latex的烦恼。

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Nucleic Acids Research 在线发表癌症miRNA组学数据库CancerMIRNome

miRNA组学(miRNome) 分析方法TCGA以及循环miRNA数据集中非常类似。最大的不同是TCGA数据可以做生存分析和预后模型。...另外,CancerMIRNome数据库收集的所有数据 (miRNA表达数据和样本表型数据) 都以ExpressionSet的形式存储.RDS文件,用户可以非常方便的下载这些数据并在R读取用于更个性化的分析...关于Shiny app开发 是否要选择使用Shiny开发数据库/网页工具 我自己只会用Shiny,看到其他人用更“高端”的工具开发数据库也会着实羡慕一下。尤其是UI,简直太好看了。...另外有很多针对advanced Shiny app开发的R可以直接拿来学习和使用。...分享一下我经常用到的可以让网页看起来更专业的R: shinythemes dashboardthemes shinydashboard shinydashboardPlus shinyjs shinyWidgets

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学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

R和python上都可使用 readr:实现表格数据的快速导入。...rmarkdown :用于创建可重复性报告和动态文档 knitr:用于PDF和HTML文档嵌入R代码块 flexdashboard:基于rmarkdown,可以轻松的创建仪表盘 bookdown...自动化分析 以下R用于创建自动化分析结果的数据科学产品: shiny:一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。...shinyjs:用于Shiny应用程序执行常见的JavaScript操作 miniUI:提供了一个UI小部件,用于R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io:为创建的Shiny应用程序提供托管服务...drat:一个用于创建和使用备选R库的工具 testthat:单元测试,让R稳定、健壮,减少升级的痛苦。 roxygen2:通过注释的方式,生成文档,远离Latex的烦恼。

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使用RShiny创建数据可视化仪表盘的详细教程

R语言与Shiny框架的结合,使得创建交互式数据可视化仪表盘变得轻松而灵活。在这篇博客,我们将深入介绍如何使用RShiny创建一个简单而实用的数据可视化仪表盘。...步骤1:安装和加载必要的首先,确保你已经安装了以下Rshiny、ggplot2、dplyr。...如果没有安装,可以通过以下命令进行安装:RCopy codeinstall.packages(c("shiny", "ggplot2", "dplyr"))然后,R脚本中加载这些:RCopy codelibrary...以下是一个简单的Shiny应用的框架:RCopy code# app.R# 加载必要的library(shiny)library(ggplot2)library(dplyr)# 定义UI界面ui <-...应用在R运行Shiny应用:RCopy codeshinyApp(ui, server)这将启动Shiny应用,你可以浏览器访问http://127.0.0.1:XXXX(XXXX为端口号),查看创建的数据可视化仪表盘

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R」Rmarkdown与Shiny

,它能够使数据的单元格显示更多的比较信息: install.packages("formattable") 下面使用看看: library(formattable) formattable(toys...一般的图非常简单,和平常写R代码一样,不过不在.R写,而是.Rmd写,将你的代码写入如下的代码使用Control+Alt+i可以直接插入一个代码。...嵌入交互图 前面演示的都是静态的,现在咱们来玩动态的。 ggvis是RStudio开发的一个交互图扩展,她利用Vega作为后端支持。...创建Shiny交互式应用程序 shiny由RStudio开发,不同于前面的动图,它可以web浏览器运行。...无论是文本,图形还是表格,计算都是render*函数完成,目前有下面一些: shiny_vars[grep("^render", shiny_vars)] #> [1] "renderDataTable

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R语言实例:利用css对shiny页面优化及htmlwidgets创建控件

摘要 本演讲将介绍如何利用CSS对shiny页面进行个性化设计及在网页嵌入视频;并通过一个详细案例介绍了利用htmlwidgets开发HTML控件,基于D3.JS库创建简单的交互桑基图,包括控件创建...由于Shiny应用程序用户界面(UI)是一个HTML文档,可以使用CSS来控制Shiny应用程序的外观。 要用CSS美化应用程序,常用的有三种方式。...创建新 创建一个新名为myd3plus,将会生成treemap.R、treemap.ymal和treemap.js三个文件。...修改treemap.R的文件配置 treemap.R删除message=message命令,增加data=data命令。...安装 运行devtools::install()对myd3plus进行安装。 运行treemap函数 构建简单数据,运行treemap函数,查看效果。

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R」第一个Shiny应用(一) hello world

Shiny 是一个开源的 R ,它为使用 R 构建 Web 应用提供了一个优雅有力的 Web 框架。Shiny 帮助你不需要前端知识的条件下将数据分析转变为可交互的 Web 应用。...创建 Shiny 应用前,我们需要安装和载入 Shiny 。...使用下面命令进行安装: install.packages("shiny") 然后将载入当前 R 会话: library(shiny) Hello world 示例 几种创建 Shiny 应用的方式...使用 shinyApp(ui, server) 构建和启动一个 Shiny 应用。 如何运行 如果使用 RStudio: 点击文档工具栏的 Run App 按钮。...停止 运行后 R 会话会处于忙碌状态,需要用以下方式停止: RStudio 中点击工具栏的停止图标。 R 控制台中键入 Ctrl + C。 关闭 Shiny 应用窗口。

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【译文】怎样学习R(下)

dplyr包在处理数据的对象(在内存和外存)的时候是一个非常棒的,而且结合了直观形式的语法结构以加快运行速度。...幸运的是,这里有zoo、xts和quantmod。查阅一Eric Zivot写的教材可以让你更容易明白怎样使用这些,而且也让你更容易处理R的时间序列数据。...如果你处理数据的时候遇到相关问题,查看15个容易解决数据库问题的解决方案。 数据可视化操作 有一样东西使得R成为一个强大的工具就是强大的数据可视化能力。...R markdown是基于knitr和pandoc的。R markdownR产生了一个最终的文档,并代替了R代码作为最终的结果。...你甚至可以通过使用Shiny来创建一个交互式R mardown文档。

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软件开发|如何用 R 语言的 Shiny 库编写 web 程序

我这个月写一些更加长的文章,所以你们可以几周后再来看看。本月,我想简要地提下我自己一直玩的一个很棒的R库。 我的一个亲密朋友最近在用R编写东西。...Shiny是一个来自RStudio的工具,它让创建web程序变得更容易。它能从R控制台轻松安装,只需要一行,就可以加载好最新的稳定版本来使用。...Shiny的授权是GPLv3,源代码可以GitHub上获得。...,textInput("textOut","Resultswillbeprintedinthisbox"))shinyApp(uiui,serverserver)当你输入输入文字时,它会被复制到输出中提示语后...包括Shiny的Bootstrap有了大量样式和主题,所以在学习了一点后,就能用R创建大量功能丰富的web程序。使用附加可以将功能扩展到更高级的JavaScript程序、模板等。

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-01

上面是shiny团队的稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) 的R 一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素的...shiny app界面 只需要两行代码就能画出来,记得安装和载入shiny哦 # install.packages("shiny") library(shiny) runExample("01_hello...当shiny app启动后,R的会话会变成忙碌状态,不能运行任何其他代码,R会监控app并处理app的反应。...会话的右上角的红色stop可以停止进程 3....Shift+Enter) 点击灰色的向下展开小箭头还有更多惊喜哦 一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名的路径(文件夹) 保存app.R到myapp文件夹 使用runApp

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rmarkdown+flexdashboard制作dashboard原型

但是shiny是有服务端支持的,可以实现动态传参、动态刷新。除此之外shiny的ui定制化程度更好,因为具备html+css+js嵌入功能(当然需要具备开发能力)。...flexdashboard支持故事版功能(很好用的功能,与tableau的故事版如出一辙)。 flexdashboard同时也支持将shiny部件嵌入文档来实现可视化的动态更新。...{r} dygraph(fdeaths) ``` R Graphics 使用renderPlot输出的shiny图形组件,可以直接dashboard的控件布局,直接输出的R内置图形可以支持自定义单个图形的长款尺寸...Tabular Data —— 表格 表格输出一般有两种情况,仅输出原生表格或者使用shiny的renderTable函数封装动态更新的表格。...### Cars ```{r} knitr::kable(mtcars) ``` ? Data Table DT输出的表格支持动态筛选和分页功能,交互体验很有特色。

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十个超级好用的R语言编程技巧,一般人绝不知道!

3. flexdashboard 如果想要创建一个能快速启动和高效运行的Shiny仪表盘,可以选择flexdashboard。这个提供简单的HTML快捷方式,可以简化侧边栏创建和构建行列展示。...R Shiny的req函数和validate函数 R Shiny常常让人崩溃,特别是弹出一般性错误提醒而程序员又一头雾水的时候。...如此,用R语言系统工作时,便无需代码输入就可以随时使用这些凭证。(注意有凭证权限的人。)...参数转换 8. revealjs revealjs内嵌R代码,可以使用直观的幻灯片导航菜单在HTML创建赏心悦目的演示文稿。...R Shiny的HTML标签(以Shiny应用程序播放音频为例) R Shiny中有110种HTML标签,可以为各种各样的HTML命令,如格式化,提供快捷方式。

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69-R可视化12-用easylabel轻松手动添加标记

参考: easylabel (r-project.org)[1] 前言 先前我介绍过ggrepel 这个:[[67-R可视化11-用ggrepel更加美观的添加标记(火山图的实现)]] 其实现的文本标记更加美观...,且个性化程度远远优于:[[66-R可视化10-自由的ggplot上添加文本(柱状图加计数)]] 那么我们可不可以直接指哪打哪,连代码都不用呢?...基于shiny 的easylabel 或许是你的选择。 这里我以火山图为例。...这里因为以火山图为例,先使用火山图绘图函数easyVolcano :需要注意这里的数据的行名需要是基因名 # 开始之前修改一下数据 DEG$new_P <- -log10(DEG$P_value)...交互添加了: shiny 界面,你还可以对标签的位置进行个性化设置: 此外,除了图上标记,还有一个非常有意思的筛选框,你可以通过输入基因名的方式标记: 还有一个非常简单的shiny 数据模块

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R语言游戏数据分析与挖掘》新书推荐

作者:谢佳标 微软中国MVP,多届中国R语言大会演讲嘉宾,目前梦天地担任高级数据分析师一职, 作为梦天地数据挖掘组的负责人,带领团队对游戏数据进行深度挖掘,主要利用R语言进行大数据的挖掘和可视化工作...,对用户和收入进行深度挖掘,这些实战案例的解决方案具有行业通用性,可以很好地将思路移植到其他行业领域中;提高篇又分为rattle和shiny,rattle是一款优秀的R语言数据挖掘工具,shiny是RStudio...基础篇包括游戏数据分析理论、R常用技巧和绘图技巧,R基础软件下载安装、扩展(package)的安装,并详细介绍了如何将文本文件、excel文件、MySQL数据库数据、网络数据读入到R,最后R三大绘图系统...渠道用户质量分析一章,书中借鉴时间管理理论中一个非常重要的四象限法则,对渠道用户进行象限划分,进而研究不同渠道的用户质量情况。...提高篇详细介绍了R语言数据挖掘工具Rattle,此工具能够一个图形化的界面上完成数据导入、数据探索、数据可视化、数据建模和模型评估整个数据挖掘流程;最后一章介绍了Web开发框架shiny,使得R使用者不必太了解

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