使用sparklyr或dplyr获取组合组中的成员计数 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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什么是sparklyr

如下：使用dplry（https://github.com/tidyverse/dplyr）和SQL（通过DBI）交互式的操作Spark的数据。...读取数据 ---- 你可以使用dplyr的copy_to函数将R的data frames拷贝到Spark。（更典型的是你可以通过spark_read的一系列函数读取Spark集群中的数据。）...") batting_tbl <- copy_to(sc, Lahman::Batting, "batting") 使用dplyr ---- 针对集群中的表，我们现在可以使用所有可用的dplyr的verbs...函数与你在使用R的data frames时是一样的，但如果使用的是sparklyr，它们其实是被推到远端的Spark集群里执行的。...，我们可以使用print() 或 summary()来更多的了解拟合质量（quality of our fit）。

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如何使用 C 或 C++ 获取目录中的文件列表

问题如何使用 C 或 C++ 获取目录中的文件列表？我的程序不允许使用 ls 这样的命令。...回答 Linux 平台可以使用 opendir，如下， char dirname[] = "/usr/local" DIR *dir_ptr; struct dirent *direntp; dir_ptr

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如何使用CDSW在CDH集群通过sparklyr提交R的Spark作业

温馨提示：要看高清无码套图，请使用手机打开并单击图片放大查看。...1.文档编写目的 ---- 继上一章介绍如何使用R连接Hive与Impala后，Fayson接下来讲讲如何在CDH集群中提交R的Spark作业，Spark自带了R语言的支持，在此就不做介绍，本文章主要讲述如何使用...Rstudio提供的sparklyr包，向CDH集群的Yarn提交R的Spark作业。...包，你可以连接到Spark本地实例以及远程Spark集群，本文档主要讲述了R通过调用sparklyr提供的SparkAPI接口与Spark集群建立连接，而未实现在Spark中调用R的函数库或自定义方法。...挚友不肯放，数据玩的花！温馨提示：要看高清无码套图，请使用手机打开并单击图片放大查看。 ---- 推荐关注Hadoop实操，第一时间，分享更多Hadoop干货，欢迎转发和分享。

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如何使用CDSW在CDH中分布式运行所有R代码

这样可以让你用你最喜欢的R包来访问Spark里的数据，比如仅在R中实现的特定的统计分析方法，或者像NLP的高级分析，等等。...因为目前spark_apply()的实现需要在工作节点上也安装R环境，在这篇文章里，我们将介绍如何在CDH集群中运行spark_apply()。我们会介绍两种方法：1.使用Parcel。...然后你就可以在Cloudera Manager中添加Parcel的仓库地址。...在这个例子中，我们使用spacyr package（https://github.com/kbenoit/spacyr），这个包R绑定了spaCy（https://spacy.io），一个新的Python...你可以根据你想要的进行选择。如果需要稳定，可以选择选项1：Parcel的方法。如果需要灵活，则可以选择选项2：conda环境。不仅只是执行dplyr，同时你可以分发你本地的R代码到Spark集群。

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十个你不知道的功能

但在与计算机领域朋友的沟通中，R语言其实已经成长为一种多功能的编程语言，它的功能远不限于数据分析而已。但是，R语言的很多优秀特性并不为R语言社区以外的人所熟知。...4.通过使用R语言的dplyr/dbplyr，几乎各种数据库都可以连接使用dbplyr包，用R语言连接各种数据库，无论是本地的还是远程的，都非常方便。...5.本地或多个不同的数据存储，在R语言里可以利用相同的dblyr语法来操作当你学会如何利用dplyr来转换数据，本地和远程的数据库、数据存储都可以利用相同的代码来操作。...6.你可以用Keras和Tensorflow训练深度学习模型使用keras包或TensorFlow接口，你可以利用R语言来学习预训练或者开发全新的深度学习模型。...9.你可以直接通过R语言调用Spark集群来分析数据你想用大规模数据训练又大又复杂的机器学习模型么？R语言的sparklyr包帮助你在单机或者大型的Spark集群上直接完成这项任务。

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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

函数用于对数据框按照指定变量进行排序，可以根据一个或多个变量对数据进行升序或降序排列，帮助用户重新整理数据框中的观测顺序。...Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数，可以对指定变量进行计数，得到每个类别的观测数目，支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Rename columns rename 函数用于重命名数据框中的变量名，能够快速修改变量的名称，使得数据的列名更符合用户的需求和习惯。...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列，可以保留感兴趣的变量，并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片，能够从数据框中提取特定的行，支持根据行数或行号选择需要的行，也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数

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H3C路由交换链路聚合篇

聚合组：是一组以太网接口的集合。聚合组是随着聚合接口的创建而自动生成的，其编号与聚合接口编号相同。根据聚合接口加入以太网接口的类型，可以将聚合组分为二层聚合组和三层聚合组。...用户需要通过手工配置的方式保持各端口上的这些配置一致。当聚合组中某成员端口的端口属性配置或第二类配置发生改变时，该端口或该聚合端组内其它成员端口的选中状态可能会发生改变。...对于静态聚合模式，用户要通过配置保证在同一链路上处在两台不同设备中的端口的Selected状态要保持一致，否则聚合功能不能正确使用。...group [number] 用户删除静态聚合端口时，系统会自动删除对应的聚合组，且该聚合组中的所有成员端口将全部离开该聚合组。...对于动态聚合模式，系统两端会自动协商同一条链路上的两端端口在各自聚合组中的Selected状态，用户只需保证一个系统中在一起的端口的对端也同样聚合在一起，聚合功能即可正常使用。

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GMSB文章九：微生物的相关关系组间波动

secom_linear 函数可以评估不同分组（例如，健康组与疾病组）中微生物分类群之间的线性相关性，帮助研究者理解不同分类群如何相互作用以及它们在不同状态下的相互关系。...tax_level: 指定使用的分类水平，例如“Phylum”（门）。pseudo: 伪计数，用于稳定稀疏矩阵的计算。prv_cut: 用于过滤掉低丰度的物种的阈值。...，这可能表明不同状态下，微生物之间的相关关系不一样或意味着不同的微生物模式。...Nonlinear correlationssecom_linear 函数是 ANCOMBC 包中的一个函数，用于在微生物组数据中进行线性相关性的稀疏估计。...tax_level: 指定使用的分类水平，例如“Phylum”（门）。pseudo: 伪计数，用于稳定稀疏矩阵的计算。prv_cut: 用于过滤掉低丰度的物种的阈值。

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Eth-trunk 链路聚合技术_eth-trunk配置

b）静态汇聚组中的端口状态在静态汇聚组中，端口可能处于两种状态：Selected 或Standby。...说明：在一个汇聚组中，处于Selected 状态且端口号最小的端口为汇聚组的主端口，其他处于Selected 状态的端口为汇聚组的成员端口。...动态 LACP 汇聚是一种系统自动创建/删除的汇聚，不允许用户增加或删除动态LACP 汇聚中的成员端口。只有速率和双工属性相同、连接到同一个设备、有相同基本配置的端口才能被动态汇聚在一起。...动态汇聚中，端口的LACP 协议处于使能状态。 b）动态汇聚组中的端口状态在动态汇聚组中，端口可能处于两种状态：Selected 或Standby。...在一个汇聚组中，处于Selected 状态且端口号最小的端口为汇聚组的主端口，其他处于Selected 状态的端口为汇聚组的成员端口。

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【组合数学】排列组合 ( 集合组合、一一对应模型分析示例 )

文章目录一、集合组合、一一对应模型分析示例排列组合参考博客 : 【组合数学】基本计数原则 ( 加法原则 | 乘法原则 ) 【组合数学】集合的排列组合问题示例 ( 排列 | 组合 | 圆排列 | 二项式定理...| 选取问题 | 多重集组合问题 | 不定方程非负整数解问题 ) 【组合数学】排列组合 ( 两个计数原则、集合排列示例 | 集合排列、圆排列示例 ) 一、集合组合、一一对应模型分析示例 ---- 将..., 每组只能放 2 个元素 ; 原始的简单模型 , 如分类 ( 加法 ) , 分步 ( 乘法 ) , 集合排列 , 集合组合 , 多重集排列 , 多重集组合 , 没有对应的模型 , 无法直接使用...; 不是简单的选取问题 ; 这里需要考虑组有区别 , 组没有区别两种情况 ; 分组有区别的话 , 分成 n 组 , 先放第 1 组 , 选 2 个人 , 再放第 2 组 , 选...该问题不是简单的使用原始的简单模型 , 如分类 ( 加法 ) , 分步 ( 乘法 ) , 集合排列 , 集合组合 , 多重集排列 , 多重集组合 ; 而是将不可计算的模型 , 对应到一个可计算的模型中

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对链路聚合Eth-Trunk最佳总结，非本文也！

链路聚合接口可以作为普通的以太网接口来使用，与普通以太网接口的差别在于：转发的时候链路聚合组需要从成员接口中选择一个或多个接口来进行数据转发。...成员接口间M:N备份 LACP模式链路聚合由LACP确定聚合组中的活动和非活动链路，又称为M:N模式，即M条活动链路与N条备份链路的模式。...选出主动端后，两端都会以主动端的接口优先级来选择活动接口，两端设备选择了一致的活动接口，活动链路组便可以建立起来，从这些活动链路中以负载分担的方式转发数据。...从N条备份链路中选择优先级最高的链路接替活动链路中的故障链路。优先级最高的备份链路转为活动状态并转发数据，完成切换。链路聚合负载分担方式：背景：数据流是指一组具有某个或某些相同属性的数据包。...当成员接口加入Eth-Trunk后，学习MAC地址或ARP地址时是按照Eth-Trunk来学习的，而不是按照成员接口来学习。删除聚合组时需要先删除聚合组中的成员接口。

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对链路聚合Eth-Trunk最佳总结，非本文也！

链路聚合接口可以作为普通的以太网接口来使用，与普通以太网接口的差别在于：转发的时候链路聚合组需要从成员接口中选择一个或多个接口来进行数据转发。...成员接口间M:N备份 LACP模式链路聚合由LACP确定聚合组中的活动和非活动链路，又称为M:N模式，即M条活动链路与N条备份链路的模式。...选出主动端后，两端都会以主动端的接口优先级来选择活动接口，两端设备选择了一致的活动接口，活动链路组便可以建立起来，从这些活动链路中以负载分担的方式转发数据。...从N条备份链路中选择优先级最高的链路接替活动链路中的故障链路。优先级最高的备份链路转为活动状态并转发数据，完成切换。链路聚合负载分担方式：背景：数据流是指一组具有某个或某些相同属性的数据包。...当成员接口加入Eth-Trunk后，学习MAC地址或ARP地址时是按照Eth-Trunk来学习的，而不是按照成员接口来学习。删除聚合组时需要先删除聚合组中的成员接口。

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如何在Ubuntu 14.04第1部分上查询Prometheus

输出应如下所示：右侧表格列中显示的数值是每个时间序列的当前值。可以随意绘制输出图形（单击“ 图形”选项卡并再次单击“ 执行”）以获取此查询和后续查询，以查看值随时间的变化情况。...第5步 - 计算利率和其他衍生物在本节中，我们将学习如何计算度量标准的速率或增量。您将在Prometheus使用的最常用功能之一是rate()。...Prometheus支持以下聚合运算符，每个运算符都支持一个by()或without()子句来选择要保留的维度： sum：汇总聚合组中的所有值。 min：选择聚合组中所有值的最小值。...在两组系列之间使用二元运算符时，Prometheus会自动匹配操作左侧和右侧具有相同标签集的元素，并将运算符应用于每个匹配对以生成输出序列。...结论在本教程中，我们设置了一组演示服务实例，并使用Prometheus对其进行监视。然后，我们学习了如何对收集的数据应用各种查询技术来回答我们关心的问题。

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DESeq2差异表达分析(二)

为了探索样本的相似性，我们将使用主成分分析(PCA)和层次聚类方法进行样本级质量控制。样本级的质量控制使我们能够看到我们的重复聚在一起有多好，以及观察我们的实验条件是否代表了数据中的主要变异源。...当使用这些无监督聚类方法时，计数的归一化和log2变换提高了可视化的距离/聚类。...DESeq2使用中位数比率法进行计数归一化，并对样本级QC的归一化计数进行regularized log transform(rlog)，因为它缓和了平均值之间的方差，从而改善聚集性。 ?...由于大多数基因没有差异表达，样本之间通常有很高的相关性(值高于0.80)。低于0.80的样品可能表示您的数据和/或样品污染中存在异常值。层次树可以基于归一化的基因表达值来指示哪些样本彼此更相似。...然后，它将估算基因离散度，并缩小这些估计值，以生成更准确的离散度估计值，从而对计数进行建模。最后，DESeq2将拟合负二项模型，并使用Wald检验或似然比检验进行假设检验。

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数据分析：宏基因组数据的荟萃分析

禁止商业或二改转载，仅供自学使用，侵权必究，如需截取部分内容请后台联系作者!...数据分析：宏基因组数据的荟萃分析介绍宏基因组数据的荟萃分析是一种综合多个独立宏基因组研究结果的方法，目的是揭示不同人群或样本中微生物群落的共同特征和差异。...固定效应和随机效应模型：根据异质性的大小，选择使用固定效应模型（假设所有研究共享相同的效应量）或随机效应模型（允许不同研究有不同的效应量）。...荟萃分析结果的合并：使用加权平均或基于模型的方法将不同研究的效应量合并，得出综合效应量估计。置信区间和显著性检验：计算合并效应量的置信区间，并进行显著性检验，以评估组间差异是否具有统计学意义。...获取该模型中微生物物种的效应值和效应值误差，它们将用于后续荟萃分析。

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R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

2.6 arrange 按照数据框里的某列或某几列，对所有行进行排序。可以使用 desc 产生倒序，或写入多个列使其按照多个列进行排序。...2.10 表格的拆分与合并将同一列中的内容分为两列内容。或将两列内容合并为同一列内容。首先还是可以创建一个数据框。...extract 除了seperate 外，函数 extract() 可以按照某种正则表达式表示的模式从指定列拆分出对应于正则表达式中捕获组的一列或多列内容。...image.png n() 进行计数： > CO2 %>% group_by(Type) %>% summarise( + count=dplyr::n(), + mean.uptake=mean...，获取指定组别不同类型内容的统计数值。

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如何基于CDSW基础镜像定制Docker

温馨提示：要看高清无码套图，请使用手机打开并单击图片放大查看。 1.文档编写目的 ---- CDSW中提供的基础镜像中已有R的环境，但是在真实使用过程中往往需要安装更多R的包。...进入R的控制台安装包,我们这里安装了sparklyr和h2o包，为了方便我这里就偷懒直接使用外网环境安装的包，具体R的私有源使用可参考如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...和对应镜像的Repository:Tag，获取到容器的ID执行如下命令将该容器保存为新的镜像。...4.使用library加载sparklyr和h2o包 [cm5o3n83s1.jpeg] 在没有安装sparklyr和h2o包的情况下，能够正常加载这两个包。...在这个需要定制化的镜像中，本文讲述了如何修改R的私有源地址，但为了方便依旧采用了公网预安装需要的sparklyr和h2o，具体如何制作R的私有源，请参考如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。

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「R」数据操作（七）：dplyr 操作变量与汇总

这些函数的一个关键属性就是向量化的：它必须使用一组向量值作为输入，然后返回相同长度的数值作为输出。我们没有办法将所有的函数都列举出来，这里选择一些被频繁使用的函数。...，看看变种row_number()、dense_rank()、percent_rank()、cume_dist()和ntile()，查看他们的帮助页面获取使用方法。...这个操作会将分析单元从整个数据集转到单个的组别。然后，当你使用dplyr动词对分组的数据框进行操作时，它会自动进行分组计算。...让我们看另一个例子：棒球运动中击球手的平均表现与上场击球次数的关系。这里我们使用来自Lahman包的数据计算每个选手平均成功率（击球平均得分数，击球数/尝试数）。...有用的汇总函数仅仅使用均值、计数和求和这些函数就可以帮我做很多事情，但R提供了许多其他有用的汇总函数：位置度量我们已经使用过mean()函数求取平均值（总和除以长度），median()函数也非常有用

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提高网络可用性、性能和可扩展性的三大法宝：MLAG、堆叠、LACP

工作原理：堆叠通常使用专用堆叠电缆连接多个交换机。一台交换机被指定为主交换机，其他交换机成为成员。主交换机负责管理和分配资源，成员交换机执行主交换机的指令。...如果主交换机故障，成员交换机中的一台将自动升级为新的主交换机，确保继续正常运行。记忆技巧：交换机堆叠允许多个交换机在物理上连接在一起，形成一个堆叠。...工作原理：设备之间配置LACP后，它们会交换LACP数据包以协商可用的链路并建立聚合组。 LACP会监视链路的状态，如果某个链路故障或被添加，它会相应地更新聚合组。...下面是何时使用LACP的一些情况：自动化配置和维护：LACP提供了更自动化的方法来配置和维护链路聚合组（LAG）。启用LACP的端口可以自动配置到LAG中，无需手动干预。...这意味着当您添加或删除成员链路时，LACP会自动适应变化，而不需要重新配置整个组。跨供应商兼容性：LACP是一个IEEE标准（802.3ad），因此它在不同供应商的网络设备之间具有更广泛的兼容性。

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跟着Seurat 官网学单细胞转录组分析

10X 读取 cellranger 管道的输出，返回唯一的分子识别（UMI）计数矩阵。...请注意，最新版本的 cellranger 现在也使用 h5 文件格式输出，可以使用 Seurat 中的函数读取该格式。...3、线粒体基因比例：线粒体 reads 比例高可能表示低质量或垂死细胞。工具和方法： 1、使用 PercentageFeatureSet() 函数计算线粒体基因的 reads 百分比。...默认情况下，比较单个聚类与所有其他聚类的差异，也可以比较聚类组之间或与所有单元的对比。相关功能：使用FindAllMarkers()自动执行所有聚类的标记基因发现。...使用FindMarkers()测试特定的聚类组之间的差异。性能优化（Seurat v5）： min.pct：设置基因在群体中的最小表达比例。 logfc.threshold：设置最小对数差异阈值。

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