背景 Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合，里面包括了readr，tidyr， dplyr，purrr，tibble，stringr...《R 数据科学》电子书：https://r4ds.had.co.nz/ tidyverse 包重构了 R 语言处理数据的语法，比默认的 R 函数更加方便，相当于一套新的语法，使用起来更加方便...目前最新的版本中主要提供 pivot_longer，pivot_wider 等函数。...则称该矩阵为稀疏矩阵；与之相反，若非 0 元素数目占大多数时，则称该矩阵为稠密矩阵。...二、tidyr 使用案例 library(tidyverse) library(tidyr) tdata <- mtcars[1:10,1:3] tdata gather(tdata) tdata <-
CURL错误列表 curl_exec($ch);//执行curl if (curl_errno($ch)) { echo 'Curl error: ' . curl_error($ch);//出错输出错误...} curl_close($ch);//关闭curl 同理，像正则，Json，数据库这些出错时基本都会有提供有帮助的错误信息 CURL状态码列表 状态码 状态原因 解释 0 正常访问 1 错误的协议...并非所有的FTP 服务器支持PORT 命令，请 尝试使用被动(PASV)传输代替！ 31 FTP错误 FTP 无法使用REST 命令。REST 命令失败。此命令用来恢复的FTP 传输。...41 函数没有找到 功能无法找到。无法找到必要的LDAP 功能。 42 中止的回调 由回调终止。应用程序告知cURL 终止运作。 43 内部错误 内部错误。由一个不正确参数调用了功能。...56 衰竭接收网络数据 在接收网络数据时失败。 57 58 本地客户端证书 本地证书有问题。 59 无法使用密码 无法使用指定的SSL 密码。
代码使用Find方法来查找最后一行。 2. 由于要在已有数据中插入新行，因此使用从后向前的循环。 3. 注意Copy方法和Insert方法的使用方式。
Tidyverse补充 sunqi 2020/8/13 概述 休息了几天，罪过 tidyverse中的长款数据转换函数，类比于之前的reshape2包中的melt和dcast函数 代码 rm(list=...ls()) library(tidyverse) library(patchwork) # 建立示例数据框 df <- data.frame( Day = 1:5, type1 = c(0.6,...# 涉及分组绘图 # 对于type1和type2 # 因此需要长款转换 # 需要的函数 # pivot_longer 转换长 # pivot_wider 转换宽 long <- pivot_longer...# 长数据转换宽数据 # 此时又回到了之前的数据 long %>% pivot_wider( names_from = "type", values_from = "value" ) %>%...## 计数函数，类比table函数 iris %>% count(Species) ## Species n ## 1 setosa 50 ## 2 versicolor 50 #
安装 install.packages("tidyr") # 或者 install.packages("tidyverse") 加载 library(tidyr) # 或者 library(tidyverse...tidyr提供pivot_longer函数可以将宽数据变长。...tidyr中的pivot_wider与pivot_longer的操作正好相反，可以将长数据转换为宽数据。...pivot_wider( data, id_cols = NULL, id_expand = FALSE, names_from = name, names_prefix = "",...最后总结 tidyr包最重要的两个函数是： pivot_longer，将宽数据转换为长数据，就是将很多列变成两列。 pivot_wider，将长数据转换为宽数据，就是将两列变成很多列。
在所有线程之间共享单个堆，并使用互斥量以避免进行并发访问时发生数据损坏。每个堆实现都负责进行自己的锁定。 如果您提供了自己的分配器，它也必须进行自己的锁定。...Note 请注意，tmpnam() 也包含一个静态缓冲区，但仅在自变量为 NULL 时才使用它。 要确保 tmpnam() 使用是线程安全的，应提供您自己的缓冲区空间。 ...fprintf(), printf(), vfprintf(), vprintf(), fscanf(), scanf() 使用这些函数时： 标准 C printf() 和 scanf... isupper(),isxdigit(), tolower(), toupper(),strcoll(), strtod(), strtol(),strtoul(), strftime() 使用这些函数时...如果要在处理多字节字符串时确保线程安全，这些函数只能使用非 NULL 的 mbstate_t * 参数。
今天突然想起之前的一个网站博客，感觉还不错，但它是zblogasp的，所以想移植到zblogphp版本，但是把网站数据恢复之后登陆后台显示，数据库连接出错，因为asp+access类型，目录位置都对，所以可能是...为了验证这一理论，重新下载zblogasp2.2版本重新安装，左侧显示无法使用Access数据库，但服务器本身支持access数据库，找了下原因，是因为微软要放弃access了,所以就没开发access...win7是64位，同样也不能支持access，简单说下怎么解决windows2008r2-64位系统-支持access数据库问题： 首先打开IIS管理器，查看网站的高级属性： 应用程序池选项，记住当前使用的应用程序池名称...也可以在这里直接修改使用的应用程序池。...强调一下，无论使用哪个应用程序池都是可以成功启用Access的返回，点击左边应用程序池节点，查看刚才使用的应用程序池的高级属性（这里是DafaultAppPool) ?
expand-reading.html R 编程基础 https://shixiangwang.gitee.io/geek-r-tutorial/base.html 内容： 基础语法 控制与循环结构 函数与包...*与 write.* load 与 save readRDS 与 saveRDS 数据操作流程 放本小抄在身边，随时查阅 Tidyverse https://github.com/tidyverse/...tibble tribble, enframe as_tibble, is_tibble 缺失值 drop_na fill replace_na 长转宽 pivot_wider, spread ?...write_* data.table 与 base 数据导入 fread 数据导出 fwrite data.table 语法 dt[i, j, by] 数据过滤与合并等操作与 R 基础语法一致，也可以使用...tidyverse 处理 整数索引 逻辑索引 命名索引 进一步的学习参考小抄、文档和《R 语言编程指南》 后几期主题 本期未讲述的内容？？？
加载R包 library(tidyverse) library(psych) library(pheatmap) library(magrittr) # devtools::install_github...("thomasp85/scico") library(scico) 导入数据 # 读取环境数据文件并存储到env变量中，使用tab作为分隔符，第一列作为行名，不检查列名的合法性 env <- read.delim...("env.xls", header = TRUE, sep = "\t", row.names = 1, check.names = FALSE) # 读取物种数据文件并存储到genus变量中，使用...pheatmap绘图，因此在此需要将长数据转换为宽表 #将相关系数矩阵转换为宽格式，行名为环境变量，列名为物种，值为相关系数 rvalue % select(1, 2, 3) %>% pivot_wider...column_to_rownames(var = "env") # 将显著性符号矩阵转换为宽格式，行名为环境变量，列名为物种，值为显著性符号 pvalue % select(1, 2, 5) %>% pivot_wider
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友询问如何使用「pheatmap」绘制相关性热图，小编之前已经写过各种ggplot2风格的热图，但是对于pheatmap却是很少涉及，这一节就来介绍一下「pheatmap...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(psych) library(pheatmap) library(magrittr) # devtools::install_github...("env.xls", header = TRUE, sep = "\t", row.names = 1, check.names = FALSE) # 读取物种数据文件并存储到genus变量中，使用...绘图，因此在此需要将长数据转换为宽表 ❞ #将相关系数矩阵转换为宽格式，行名为环境变量，列名为物种，值为相关系数 rvalue % select(1, 2, 3) %>% pivot_wider...column_to_rownames(var = "env") # 将显著性符号矩阵转换为宽格式，行名为环境变量，列名为物种，值为显著性符号 pvalue % select(1, 2, 5) %>% pivot_wider
0 前言 在数据分析过程中，不同的软件通常对数据格式有一定的要求，例如R语言中希望导入的数据最好是长格式数据而不是宽格式数据，而SPSS软件经常使用宽格式数据。...3 长转宽函数 Python实现 两种方法： 1 pandas库中的pivot()和privot_table()函数； 2 dfply库中的spread()函数； 方法一： ##构造数据...这里不能使用透视表pivot_table()函数，因为pivot_table()函数对value进行计算（求和、平均等），但这里Message列都是字符型的，无法进行计算；若value为数值型数据，可以使用...pivot_wider()library(tidyverse)library(dplyr)library(tidyr)long_data %>% pivot_wider(id_cols = Player...中使用dfply库中函数，R中使用tidyr包中函数，因为key键和value值比较明确。
这里使用pivot_longer()将数据变长，具体见后面函数详情。...岁 5564 = 55 – 64岁 65 = 65岁或以上 替换数据 我们需要对列名称的格式进行较小的修正：将new_rel替换为newrel（很难在这里找到它，但是如果您不修正它，我们将在后续步骤中出错...stocks %>% pivot_wider(names_from = year,values_from = return) ? separate() 该函数可将字符进行分割,具体案例如上....他还有一个功能,当sep=2时，可通过第二个位置进行分割，使用在省份市级，等数据上。...unite 是separate()的反函数，这里做个补充。 ? 默认情况下，sep='_'如果我们不需要任何分隔符可以使用sep=''。
参考：李东风老师的R 语言实战 1. tidyverse 系统简介 假设数据以 tibble 格式保存。...我们可以使用tidyverse 系统来操作，其中包括了magrittr 包，readr 包，dplyr 包和 tidyr 包等。...按列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名 如果想要用向量来存放希望筛选的列名，需要使用函数 one_of 来存放该向量。...= "(x|y)([[:digit:]])", names_to = c(".value", "time") ) %>% knitr::kable() 对应的长变宽的函数有pivot_wider...对于待分离的对象（col），不必加上引号；但对于即将创建的新列（into），需要使用引号，由于是两列，这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。
❝本节分享如何基于差异基因分析的结果来绘制热图，主要还是基于ggplot2体系来实现，针对以往的代码风格，这次小编通过拆分数据定义每一部分的函数来编写新的代码，希望对各位观众老爷能有新的帮助，数据和代码已经被打包并上传到小编的...❞ 关注下方公众号下回更新不迷路 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(aplot) library(scico) 读取并处理数据 process_data...df % pivot_longer(-id) %>% filter(id %in% gene) %>% pivot_wider...element_blank(), axis.text.x = element_blank(), plot.background = element_blank()) } 主函数
TIDYVERSE Dplyr Arrange rows Dplyr Count the observations Dplyr Distinct keep unique rows Dplyr Join...Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数，可以对指定变量进行计数，得到每个类别的观测数目，支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Rename columns rename 函数用于重命名数据框中的变量名，能够快速修改变量的名称，使得数据的列名更符合用户的需求和习惯。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片，能够从数据框中提取特定的行，支持根据行数或行号选择需要的行，也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据，能够将数据框中的一列分成多个列，根据指定的列名进行展开，使得数据以更直观的宽格式形式呈现
做新专辑排序的需求时，需要对专辑的时间进行排序，由于目前该字段是字符串类型的日期，在排序函数中要转成标准的UNIX时间戳来进行对比，大概代码如下： struct tm tm1; strptime(string...因此想到，是否对于未做初始化的struct tm，strptime()函数并不会去给每个值赋值。...因此，解决方法就是在使用strptime()之前，对结构体进行零初始化（zero-initialize） struct tm tm1 = {0}; ... struct tm tm2 = {0};
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友需要绘制环状热图叠加多层注释，本节来通过一个例子来简单介绍一下如何实现，主要通过「ggtreeExtra」来实现，聚类分析使用「ape」包来进行更加适用于生物信息相关的数据...❞ 加载R包 library(tidyverse) library(ggtree) library(treeio) library(ape) library(magrittr) library(ggnewscale...>% group_by(id,Phylum) %>% summarise(across(where(is.numeric), ~ sum(.x, na.rm=TRUE))) %>% pivot_wider
低遗传力和高遗传力同时进行多性状分析时，低遗传力性状收益更多。而且多性状模型分析时，因为考虑了性状间的残差协方差，所以增加了评定的准确性。...「构建模型：」 这里使用个体动物模型，双性状模型：BWT和TARSUS两个性状。固定因子为SEX，随机因子为加性效应。...~ (V2+V6)/sqrt((V1+V5)*(V3+V7))) Estimate SE rp 0.4534364 0.03175156 「遗传相关和表型相关的显著性」 这里使用似然比检验...*","",rownames(blup)))) %>% select(ID,Trait,effect) %>% pivot_wider(ID,names_from = Trait,values_from...*","",rownames(blup)))) %>% select(ID,Trait,effect) %>% pivot_wider(ID,names_from = Trait,values_from
欢迎关注R语言数据分析指南 加载R包 library(tidyverse) # devtools::install_github('erocoar/ggpol') library(ggpol) 导入数据...ungroup() %>% # 解除分组 unite(col = "status_gender", gender, status, sep = "_") %>% # 将性别和选举状态合并成一个新的列 pivot_wider...gender == "male" ~ "Male candidates")) 数据可视化 ggplot() + geom_point(data = results, # 添加点图层，使用处理后的选举数据...映射选区、y值和主导性别 shape = 19,size = 4) + geom_blank(data = dummy_constituency, # 添加空白图层，使用虚拟选区数据
.2101056118 牛PNAS2021.pdf 论文的代码链接 https://github.com/AnimalGenomicsETH/bovine-graphs 论文中用6个牛的基因组做了一些泛基因组相关的分析，使用的软件是...使用到的软件是mash。 mash这个软件直接用conda就可以安装 conda install mash 论文中提供了这部分分析的代码，重复一下这个分析。...数据使用的是6个拟南芥的基因组 计算遗传距离的代码 论文中提供的代码链接是 https://github.com/AnimalGenomicsETH/bovine-graphs/blob/main/subworkflows...https://github.com/AnimalGenomicsETH/bovine-graphs/blob/main/scripts/phylo_tree_assembly.R library(tidyverse...A-z0-9]+")) -> datdis datsel % select(anim1c,anim2c, distr) datwide % pivot_wider
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