气泡图 气泡图是一种多变量图表，是散点图的变体，也可以认为是散点图和百分比区域图的组合[1]。气泡图最基本的用法是使用三个值来确定每个数据序列，和散点图一样。...使用ggplot2，可以通过geom_point()函数构建气泡图。aes()设定至少三个变量:x、y和size。其实就是散点图绘制的升级版吧，aes()中多了一个参数。...美化气泡图 一些经典的改进 使用viridis包的调色板：（scale_fill_viridis(discrete=TRUE, guide=FALSE, option="A")） 使用hrbrthemes...包的theme_ipsum() 使用xlab和ylab自定义轴标题 为圆添加描边：将形状改为21，并指定颜色(描边)和填充 library(hrbrthemes) library(viridis) #...如果不喜欢圆形的气泡图，可以将代码中的shape=21进行更改，正方形是shape=22，得到的图如下： ?
其实多组间的两两比较还可以考虑用校正后的P值，可以使用rstatix包进行计算： stat.test% group_by(Type) %>% t_test(Expression...remove.bracket = T,hjust=1)+ labs(x= NULL,y="Gene expression")+ theme_bw() + mytheme p4 写在最后 其实我的ggplot2...功底也不是很好，没有很系统的去钻研ggplot2的语法和结构。...因为我认为我只要会修改别人的ggplot2绘图代码，然后把自己想要绘制的各种元素，能转化为语言去进行网络搜索，这样想绘制的图，基于上都可以根据百度谷歌和工具书去实现。...绘图当然很重要，但是科研节奏这么紧张，ggplot2的学习到底应该投入多少时间（当然也看悟性），这点见仁见智。最后给大家分享一本我经常翻阅的ggplot2工具书 - END -
其中，aes() 用于将数据中的变量映射为对象的视觉属性； 可选的元素，如标尺、标题、标签、图例和主题等。 我们可以使用 geom_sf() 函数和一个简单特征对象（ sf 类）来创建地图。...更多设置 在 ggplot() 中，离散变量的默认色标是 scale_*_hue() ，这里 * 表示颜色（为点和线等特征着色）或填充（为多边形或柱状图着色）； scale_*_grey() 用来改变灰色颜色的默认比例...， scale_*_distiller()、 scale_*_brewer() 使用 RColorBrewer 包的颜色(Neuwirth 2014)，scale_*_viridis 使用 viridis...图像保存 要保存用 ggplot2 绘制的图，我们可以使用 ggsave() 函数。...R可视乎｜棒棒糖图 R可视乎｜合并多幅图形 R可视乎|等高线图 R可视乎|气泡图
2.2 气泡图 1. 安装所需要的包 ? 2. 载入安装包 ? 3....最基本的气泡图 geom_point() data % filter(year=="2007") %>% dplyr::select(-year) # Most basic...用 scale_size() 我们需要在上一张图表上改进的第一件事是气泡大小。scale_size()允许使用range参数设置最小和最大圆圈的大小。请注意，您可以使用来定制图例名称name。...变得漂亮 一些经典的改进： 使用viridis包装获得漂亮的调色板 使用的theme_ipsum()所述的hrbrthemes包 定制轴职称xlab和ylab 将笔划添加到圆圈：更改shape...为21并指定color（笔划）和fill # Libraries library(ggplot2) library(dplyr) library(hrbrthemes) library(viridis
❝本节来介绍如何使用ggplot2来给常见的气泡图添加一点新的元素,下面通过1个案例来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) 数据清洗 df %>% read_csv('data.txt
之前的推文介绍了画柱形图展示富集分析的结果R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果，今天的推文介绍一下画气泡图展示富集分析结果的代码。气泡图就是散点图的一个变种。...多了一个变量映射给点的大小，富集分析里通常是用来映射基因的数量。比如下图 image.png 示例数据集还是之前的KEGG富集分析结果。...library(tidyverse) dat %>% filter(Corrected.P.Value dat01 dim(dat01) dim(dat) 最基本的图 library...(ggplot2) dat01$GeneRatio<-dat01$Input.number/200 ggplot(dat01,aes(x=GeneRatio,y=Term))+ geom_point...(aes(size=Input.number,color=Corrected.P.Value)) image.png 接下来是美化 包括更改配色，给点排序 修改图例的标题等 #install.packages
image.png 之前有人在公众号留言问这幅图的实现办法，这个是气泡图，用ggplot2很方便能够实现，但是这个图比较特殊的是横坐标还有对应的图片，当然出图以后用其他软件来编辑是可以实现的，但是对齐之类的可能会比较麻烦...如果能用代码实现就能节省一些时间，正好最近看到一个ggplot2的扩展包 叫做 ggimg 对应的github的主页是 https://github.com/statsmaths/ggimg 下面我们就来试试能不能用这个包来实现推文开头的图...(ggimg) library(ggplot2) ggplot()+ geom_point_img(data=df, aes(x=x,y=y,img=img),...size=5)+ scale_x_continuous(limits = c(0.5,3.5))+ theme_minimal() image.png 接下来我们把职业生涯三分命中率的数据加进来用来做气泡图...vjust = 1)+ coord_cartesian(clip = "off") dev.off() 结束语：不知道威少搭配詹姆斯最后能出一个什么效果，之前记得有一个记录是 同一个队一场比赛中两个人同时拿三双
遇到这个问题是在使用ggtree可视化展示进化树的时候，我想给进化树的枝分组映射颜色，对应的推文是跟着Nature Genetics学画图：R语言ggtree给进化树的枝分组映射颜色 第一步是准备进化树文件...image.png 加载需要用到的R包 library(treeio) library(ggtree) library(ggplot2) 读取树文件和分组信息 tree<-read.tree("practice.tree...image.png 这个结果右侧的图例最下方式有一个NA的，如果不想要那个NA加一行代码 scale_color_discrete(na.translate=FALSE) 参考链接是 https://stackoverflow.com...自定义颜色 colors<-c("#3cb346","#00abf0","#d75427","#2e409a") ggtree(tree_1)+ geom_tree(aes(color=group...geom_tiplab(offset = 0.1)+ scale_color_manual(values=colors, na.translate=FALSE) 将图例的线更改的粗一点
然后使用 px.scatter（） 方法创建散点图。数据帧中的“考试 1 分数”和“考试 2 分数”列分别用作 x 轴和 y 轴。“性别”列用于使用颜色参数对图中的标记进行颜色编码。 ...最后，使用 fig.update_layout（） 方法自定义图的图例。...要创建散点图，使用了 Plotly Express 中的 px.scatter（） 函数，并将数据集中的“total_bill”和“tip”列指定为图的 x 轴和 y 轴。...这些参数控制图上显示的图例的颜色和字体大小。 最后，使用 Plotly 中的 show（） 函数显示绘图。...生成的图显示了餐厅顾客的总账单和小费金额之间的关系，标记的大小由另一个变量调整，并由支付账单的人的性别着色。图例字体颜色设置为绿色，字体大小设置为 14 以提高可读性。
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一款R包「gguidance」，其主要可以用来自定义设置图例及刻度条，在实际操作中非常的实用，下面小编来简单介绍几个案例来做展示，希望各位观众老爷能够喜欢，更多详细文档请参考作者官方文档...p + aes(colour = paste(cyl, year)) + guides(colour = "legend_cross") 设置图例颜色 p + aes(colour = class...) + guides(colour = "legend_string") 设置图例两端形状 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c(guide...= "colourbar_cap") 设置图例为小提琴 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c(guide = guide_colour_violin...(density = mpg$cty)) 设置图例为直方图 p + aes(colour = cty) + scale_colour_viridis_c( guide = guide_colour_histogram
简介 ggridges包主要用来绘制山峦图。尤其是针对时间或者空间分布可视化具有十分好的效果。...` (反引号)括起，是因为列名字中存在空格和特殊字符，需要特殊对待 # fill = ..x..， double dots是ggplot2的一种特殊识别符，用来区分定义的和计算的美学参数 # 这里指用横轴的数据着色...cyclinal scales 为了使得ggridges绘制的图形可视化效果最好，同时为了减少用户对颜色设置的困难，作者提供了cyclinal scales用于颜色轮转映射。...默认的，cyclinal scales为了防止误解是不绘制图例的，但是可以通过选项guide="legend"添加图例。...跟ggplot2一样，图例是可以修改的,其他参数比如大小、透明度、形状等都是可以通过cyclinal scales修改。
点九图介绍 这一块是对点九图的简单介绍，如果对这块已经有了解的话，可以直接跳到2，看看聊天气泡中如何使用点九图。...不需要安装额外的环境和工具3. 可能会误操作，比如颜色不是纯黑等，导致输出了错误的点九图 Draw9patch工具(推荐) 1....1.4 Android 点九图的基本使用 Android中使用点九图，主要有三种形式，使用res文件夹中的点九图，使用assets文件夹中的点九图以及使用网上拉取的点九图，下面分别看看它们如何使用。...聊天气泡中使用点九图 2.1 遇到的问题和解决方案 先简单说下从网上拉取点九图的过程，首先使用url请求网络数据，并将结果缓存为本地文件，再使用文件流创建Bitmap，接着使用Bitmap创建drawable...再看看上面1.5的解析原理，它会带来一个坑，由于聊天气泡需求需要使用url从网络上拉取点九图，如果这个点九图没有经过编译的过程，将其周围的黑线标记放入到png中的一个辅助chunk中，那么在使用这个图作为背景时
目 正文 自定义ggplot2图的图例。这里我们要修改非数据组件，通常通过theme（）命令来完成。 此页面受到ggplot2（？theme）帮助页面的强烈启发。...另外，请访问非常强大的ggplot2文档以获取更多信息。...image.png 修改图例中的分类名字 basic+labs( colour = "name1", shape = "name2" ) ?...image.png 删除图例中的一类 basic + guides(shape=FALSE) ?...# 设置图例中的标题 basic + theme(legend.title = element_text(face = "bold")) ?
❝今天来介绍一款新包ggPlantmap，专门用于绘制植物相关的图形。基于ggplot2开发，因此ggPlantmap继承了ggplot2的语法和功能，但增加了针对植物数据的特定功能。...「定制和扩展」：由于ggPlantmap基于ggplot2，用户可以利用ggplot2的功能进一步定制和扩展图形，例如更改颜色、添加图例和标题等。...主要函数： ggPlantmap.plot(): 这是包中的主要函数，用于绘制植物组织和发育阶段的图形。它接受一个数据集和一些绘图参数，并返回一个ggplot对象。...) + scale_fill_brewer(palette="Paired") # 使用`ggPlantmap.plot`函数绘制`ggPm.At.leaf.topview`数据的图形，并设置颜色调色板...`ggPlantmap.heatmap`函数绘制热图 ggPlantmap.heatmap(quant.data,AT5G47670.expression) # 更改渐变颜色并绘制热图 ggPlantmap.heatmap
github.com/emilmalta/30daychartchallenge/blob/master/script/22_animation.R 这个代码是利用gganimate这个R包做了一个动态的气泡图...，结果非常惊艳 今天的推文主要学习其中做气泡图的代码和非常舒服的配色 加载需要用到的R包 library(tidyverse) library(gganimate) library(ggplot2)...读取数据集 这里我只选取原始代码数据集中的一小部分 dat01<-readr::read_csv("20220522.csv") 准备配色 cols <- c( "Africa" = "#34a186
小提琴图是通过使用密度曲线描述一组或多组的数值数据分布。每条曲线的宽度对应于各区域数据点的近似频率。...的主题和相关组件包 library(viridis) #是Matplotlib的新默认颜色映射 ggplot(diamonds, aes(x=cut, y=price)) + geom_violin..." #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法...#小提琴图的宽 color="black", #小提琴图外框线的颜色 size=2, #小提琴图外框线的粗细 linetype...=2, #小提琴图外框线的类型 fill="yellow" #fill=c("yellow","red") #小提琴图内部填充的颜色
关系（四）利用python绘制气泡图 气泡图（Bubble plot）简介 气泡图是散点图的变种，可以利用圆的大小来可视化第三个变量。...自定义气泡图一般是结合使用场景对相关参数进行修改，并辅以其他的绘图知识。...通过seaborn绘制多样化的气泡图 seaborn主要利用scatterplot绘制气泡图，可以通过seaborn.scatterplot[1]了解更多用法 import matplotlib.pyplot...，可以展示第四个变量 palette="viridis", # 采用调色板分配颜色 edgecolors=...和matplotlib的scatter快速绘制气泡图，并通过修改参数或者辅以其他绘图知识自定义各种各样的气泡图来适应相关使用场景。
image.png 我选择使用R语言的ggplot2来实现，这个是箱线图和热图的拼接，右侧的热图可以借助geom_point()函数实现，将点的形状改为正方块，数值按照正负来映射颜色，按照一定的数值来映射大小...基本的思路有了。今天的推文记录一个小知识点是 如何将图例远离主图并且给放到右上角去 首先是构造一份数据 df<-data.frame(x=LETTERS[1:4],y=1:4) df ?...image.png 正常做一个柱形图 library(ggplot2) ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes(fill=x)) ?...image.png 拉大图例与主图的距离 使用theme()函数中的legend.box.margin参数来调节 ggplot(data=df,aes(x=x,y=y))+ geom_col(aes...image.png 还有另外两个知识点是调节图例的标题和图例的距离以及图例的文本和图例的距离 分别需要用到legend.spacing.y和legend.spacing.x参数 ggplot(data=
今天公众号的一位读者留言说要做气泡图。他的数据如下 ? image.png ID是X，log2FC用作y，class是分类变量用来填充颜色 范围是A到I。P值用来映射点的大小。...image.png 气泡图将透明度设置低一点可能会好看一点 ggplot(df,aes(x=ID,y=log2FC, color=Class,size=pvalue))+...image.png 根据自己的想法来填充颜色 首先准备 11个颜色，class有多少个类别就准备多少个颜色 cols<-c("#0055AA","#C40003","#00C19B","#EAC862"...image.png 最后导出pdf文件手动修改pvalue的图例 ? image.png -log2好像变换不太合适，暂时想不到比较好的办法了。...最终图反映的信息是，圆点代表p值小于0.05，圆点越大，p值越小。叶色映射的是不同的分类 欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本
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